Genes within 1Mb (chr6:137646115:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 6.01e-01 0.0526 0.1 0.139 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0211 0.0788 0.139 B L1
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 3.40e-01 0.113 0.119 0.139 B L1
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00644 0.0787 0.139 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.60e-01 0.089 0.0631 0.139 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0427 0.0883 0.139 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 1.99e-01 -0.128 0.0993 0.139 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 2.95e-01 0.069 0.0657 0.139 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0525 0.0754 0.139 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 8.04e-01 0.0264 0.106 0.139 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 7.68e-01 -0.021 0.0712 0.139 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 2.16e-01 0.0825 0.0665 0.139 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 6.09e-01 0.026 0.0508 0.139 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0125 0.084 0.139 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 9.91e-01 0.000814 0.075 0.139 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00854 0.0803 0.139 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 5.00e-01 0.0844 0.125 0.139 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 2.32e-01 0.0978 0.0815 0.139 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 6.02e-02 0.118 0.0626 0.139 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 3.01e-01 0.069 0.0665 0.139 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 8.55e-01 0.017 0.0927 0.139 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 5.91e-01 0.0497 0.0923 0.142 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0721 0.0874 0.142 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 9.33e-02 -0.218 0.129 0.142 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0991 0.0985 0.142 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 8.39e-01 0.0208 0.102 0.142 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 5.23e-01 0.0644 0.101 0.142 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 862070 sc-eQTL 2.41e-01 -0.157 0.133 0.142 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 4.90e-01 0.053 0.0766 0.139 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 1.82e-01 -0.083 0.062 0.139 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 4.50e-01 0.0976 0.129 0.139 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.31e-01 0.0982 0.0647 0.139 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 4.60e-01 0.0562 0.0759 0.139 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 7.62e-01 0.0244 0.0806 0.139 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 862070 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0876 0.0918 0.139 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 4.14e-01 0.0687 0.084 0.139 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0018 0.0963 0.139 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 8.33e-02 -0.224 0.129 0.139 NK L1
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0145 0.0818 0.139 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.62e-03 0.218 0.0684 0.139 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 5.43e-01 0.0611 0.1 0.139 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 2.23e-01 0.121 0.0989 0.139 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 4.27e-01 0.0635 0.0797 0.139 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 1.07e-01 -0.136 0.0841 0.139 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0419 0.13 0.139 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 1.61e-01 0.146 0.104 0.139 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 6.51e-02 0.0914 0.0493 0.139 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 2.56e-01 -0.109 0.0956 0.139 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 8.54e-01 0.0182 0.0986 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0782 0.13 0.145 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 3.64e-02 0.265 0.126 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 1.37e-01 -0.189 0.127 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0734 0.0658 0.145 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 3.49e-01 0.12 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 4.57e-01 -0.107 0.143 0.145 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 5.28e-01 0.0708 0.112 0.145 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0928 0.116 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 5.31e-01 0.0544 0.0868 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 9.07e-01 0.0142 0.121 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0376 0.111 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0214 0.0868 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 7.94e-01 0.0275 0.105 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 9.88e-01 0.00178 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0124 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0817 0.0962 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 3.52e-01 -0.119 0.127 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 4.55e-01 0.0899 0.12 0.14 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 4.68e-01 0.0601 0.0826 0.14 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0352 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 8.05e-02 0.215 0.122 0.14 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 5.05e-01 0.0665 0.0997 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0342 0.0849 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 5.14e-01 0.086 0.132 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0701 0.115 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.44e-01 0.0976 0.0665 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0433 0.0938 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 4.74e-01 -0.075 0.105 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 2.07e-01 0.152 0.12 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 3.65e-01 0.0724 0.0798 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 5.75e-01 0.074 0.132 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0322 0.0961 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 7.05e-01 0.0364 0.096 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 8.57e-01 0.0185 0.102 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 2.10e-01 -0.156 0.124 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 3.25e-01 0.113 0.115 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 2.37e-01 -0.126 0.106 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 4.86e-02 -0.251 0.126 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 6.16e-01 -0.065 0.129 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.25e-02 0.187 0.0743 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 4.92e-01 0.0829 0.12 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0627 0.117 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 3.13e-01 0.0629 0.0623 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0964 0.0733 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 2.48e-01 0.136 0.117 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00463 0.0972 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 2.45e-01 0.0793 0.068 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 8.84e-01 0.00733 0.0501 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0175 0.0883 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 2.11e-01 0.109 0.087 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 9.81e-01 0.00211 0.0864 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0359 0.128 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 4.59e-01 0.0803 0.108 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.69e-01 0.0864 0.0626 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 5.84e-01 0.0393 0.0716 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0474 0.0881 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 4.65e-01 0.0723 0.0988 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0915 0.0887 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 3.33e-01 -0.124 0.127 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 5.26e-01 0.0656 0.103 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.59e-02 0.157 0.0648 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 2.18e-01 0.125 0.101 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 6.96e-01 0.0411 0.105 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 2.85e-01 0.0963 0.0898 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 4.45e-01 0.0729 0.0953 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 1.64e-01 0.172 0.123 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 1.16e-01 0.187 0.118 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.19e-02 0.189 0.0746 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 2.70e-01 0.118 0.107 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 4.59e-02 0.212 0.106 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 8.14e-01 -0.021 0.0892 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0231 0.0818 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 2.33e-01 -0.154 0.129 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 1.07e-01 -0.158 0.0977 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.08e-01 0.112 0.0694 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 6.77e-01 0.0345 0.0827 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0374 0.103 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 2.44e-01 -0.136 0.117 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 2.63e-02 0.22 0.0984 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0173 0.134 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0196 0.132 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 4.69e-02 0.126 0.0628 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 4.42e-01 0.0871 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 2.63e-01 -0.13 0.116 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 2.61e-01 -0.128 0.113 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 3.97e-01 -0.101 0.119 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 6.29e-01 0.0632 0.131 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 1.53e-01 0.194 0.135 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 6.57e-02 0.154 0.083 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 5.30e-01 0.0814 0.129 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 2.87e-01 0.132 0.124 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 8.63e-01 0.0157 0.0903 0.141 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0917 0.0964 0.141 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 7.72e-01 0.0355 0.122 0.141 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 1.50e-01 0.183 0.127 0.141 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 3.42e-02 0.128 0.0601 0.141 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0243 0.106 0.141 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 6.39e-01 0.0529 0.112 0.141 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 5.32e-01 0.0627 0.1 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 9.17e-01 0.0114 0.109 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0547 0.13 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 2.80e-01 0.126 0.117 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.86e-01 0.0986 0.0743 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 5.81e-01 0.0626 0.113 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 2.22e-01 0.145 0.118 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 1.59e-01 0.11 0.0776 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0415 0.105 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 2.97e-02 -0.291 0.133 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0371 0.0944 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.37e-02 0.18 0.0724 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0965 0.106 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 5.75e-01 0.0618 0.11 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 1.82e-01 0.134 0.1 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0946 0.117 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 9.42e-01 0.00938 0.128 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0892 0.104 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.02e-01 0.13 0.0794 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 8.16e-01 0.0296 0.127 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 6.54e-01 0.0577 0.129 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 1.92e-01 0.107 0.0818 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 2.02e-01 0.134 0.105 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 2.45e-01 -0.15 0.129 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0432 0.0978 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 5.09e-04 0.252 0.0713 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 8.27e-02 0.174 0.1 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 3.55e-01 0.102 0.11 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 6.31e-01 0.0748 0.155 0.148 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 9.46e-01 0.00887 0.131 0.148 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0402 0.16 0.148 PB L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 7.49e-01 -0.032 0.0997 0.148 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0407 0.121 0.148 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0552 0.138 0.148 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0784 0.145 0.148 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 1.75e-01 -0.139 0.102 0.137 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 1.00e-01 -0.176 0.107 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 1.41e-01 0.183 0.124 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0691 0.0991 0.137 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0113 0.0626 0.137 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 8.74e-01 0.0192 0.121 0.137 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 1.19e-01 -0.189 0.121 0.137 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 6.86e-01 0.0475 0.117 0.139 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0817 0.0851 0.139 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 2.68e-01 0.137 0.124 0.139 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 6.40e-02 -0.248 0.133 0.139 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.43e-02 0.182 0.0736 0.139 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 6.69e-01 0.0346 0.0809 0.139 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 3.90e-01 0.098 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 5.68e-01 0.0609 0.106 0.134 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00655 0.0938 0.134 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 2.66e-01 -0.153 0.137 0.134 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 2.11e-01 -0.131 0.105 0.134 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 4.54e-01 -0.081 0.108 0.134 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00434 0.137 0.134 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 862070 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0956 0.141 0.134 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 2.49e-01 0.0821 0.0711 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0755 0.0701 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 9.97e-01 0.000466 0.128 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 2.28e-01 0.0926 0.0765 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 9.15e-01 0.0085 0.0798 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 7.49e-01 0.0262 0.082 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 862070 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0924 0.102 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0359 0.0831 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 7.11e-01 0.0287 0.0774 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 8.27e-02 0.231 0.132 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 5.81e-01 0.0409 0.0738 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 8.97e-01 0.013 0.1 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 7.30e-01 0.0366 0.106 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 862070 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0785 0.103 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 8.21e-01 0.0276 0.122 0.139 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 2.26e-01 -0.176 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0762 0.154 0.139 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 7.84e-01 0.037 0.135 0.139 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 1.09e-01 0.12 0.0744 0.139 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 8.04e-01 0.0395 0.159 0.139 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 7.51e-01 0.0433 0.136 0.139 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 1.71e-02 -0.209 0.0868 0.14 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 8.15e-02 -0.153 0.0871 0.14 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 1.34e-01 -0.178 0.118 0.14 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 5.17e-02 0.147 0.0753 0.14 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 3.54e-03 0.357 0.121 0.14 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 4.96e-01 0.0772 0.113 0.14 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 862070 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0597 0.131 0.14 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 3.56e-01 0.0999 0.108 0.136 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 8.95e-01 0.01 0.0759 0.136 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 4.57e-01 0.0998 0.134 0.136 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0178 0.0959 0.136 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 8.87e-01 0.0178 0.125 0.136 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0976 0.12 0.136 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 862070 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0489 0.126 0.136 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 1.20e-01 0.185 0.118 0.144 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00661 0.109 0.144 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0583 0.131 0.144 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 9.29e-01 0.00991 0.111 0.144 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 2.95e-02 0.318 0.145 0.144 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 6.27e-01 0.0547 0.112 0.144 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 862070 sc-eQTL 2.64e-01 -0.151 0.135 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0669 0.103 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00937 0.0834 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0443 0.118 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 4.37e-01 0.0856 0.11 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 8.58e-01 0.013 0.0726 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0558 0.096 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 3.00e-01 0.127 0.122 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 4.75e-01 0.0752 0.105 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0149 0.0781 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 4.00e-01 0.108 0.128 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0504 0.115 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 8.69e-02 0.103 0.0598 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 8.32e-01 0.0187 0.0883 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 2.85e-01 -0.115 0.107 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 3.31e-01 0.0702 0.072 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0993 0.0672 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 3.86e-01 0.113 0.129 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 2.27e-01 0.0806 0.0665 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 9.39e-01 0.006 0.0783 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 5.54e-01 0.0474 0.08 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 862070 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0969 0.0929 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0373 0.0854 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0145 0.0652 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0461 0.129 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 4.91e-01 0.055 0.0798 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 4.08e-02 0.209 0.101 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 8.10e-01 0.0257 0.107 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 862070 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0924 0.121 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 426666 sc-eQTL 1.17e-01 0.126 0.0797 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -757416 sc-eQTL 8.30e-01 0.0213 0.0994 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 823551 sc-eQTL 8.79e-02 -0.23 0.134 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -461304 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0622 0.0838 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -221099 sc-eQTL 7.09e-04 0.244 0.0711 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 853638 sc-eQTL 7.04e-01 0.0376 0.0987 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -222118 sc-eQTL 1.40e-01 0.151 0.102 0.138 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N -461304 8.25e-07 6.07e-07 8.51e-08 4.43e-07 1.05e-07 2.01e-07 5.13e-07 9.78e-08 3.66e-07 2.28e-07 7.15e-07 2.8e-07 7.93e-07 1.41e-07 2.57e-07 1.61e-07 3.69e-07 3.82e-07 1.55e-07 1.15e-07 1.92e-07 3.49e-07 3.04e-07 1.23e-07 8.33e-07 2.29e-07 2.22e-07 2.54e-07 3e-07 5.82e-07 2.83e-07 5.35e-08 5.55e-08 1.36e-07 2.58e-07 1.48e-07 1.07e-07 6.56e-08 6.41e-08 2.15e-08 4.73e-08 5.87e-07 4.65e-08 5.61e-09 1.08e-07 1.25e-08 9.73e-08 2.48e-08 5.93e-08