logo

Genes within 1Mb (chr6:137643816:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 6.01e-01 0.0526 0.1 0.139 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0211 0.0788 0.139 B L1
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 3.40e-01 0.113 0.119 0.139 B L1
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00644 0.0787 0.139 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.60e-01 0.089 0.0631 0.139 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0427 0.0883 0.139 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 1.99e-01 -0.128 0.0993 0.139 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 2.95e-01 0.069 0.0657 0.139 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0525 0.0754 0.139 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 8.04e-01 0.0264 0.106 0.139 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 7.68e-01 -0.021 0.0712 0.139 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 2.16e-01 0.0825 0.0665 0.139 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 6.09e-01 0.026 0.0508 0.139 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0125 0.084 0.139 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 9.91e-01 0.000814 0.075 0.139 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00854 0.0803 0.139 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 5.00e-01 0.0844 0.125 0.139 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 2.32e-01 0.0978 0.0815 0.139 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 6.02e-02 0.118 0.0626 0.139 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 3.01e-01 0.069 0.0665 0.139 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 8.55e-01 0.017 0.0927 0.139 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 5.91e-01 0.0497 0.0923 0.142 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0721 0.0874 0.142 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 9.33e-02 -0.218 0.129 0.142 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0991 0.0985 0.142 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 8.39e-01 0.0208 0.102 0.142 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 5.23e-01 0.0644 0.101 0.142 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 859771 sc-eQTL 2.41e-01 -0.157 0.133 0.142 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 4.90e-01 0.053 0.0766 0.139 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 1.82e-01 -0.083 0.062 0.139 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 4.50e-01 0.0976 0.129 0.139 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.31e-01 0.0982 0.0647 0.139 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 4.60e-01 0.0562 0.0759 0.139 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 7.62e-01 0.0244 0.0806 0.139 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 859771 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0876 0.0918 0.139 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 4.14e-01 0.0687 0.084 0.139 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0018 0.0963 0.139 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 8.33e-02 -0.224 0.129 0.139 NK L1
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0145 0.0818 0.139 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.62e-03 0.218 0.0684 0.139 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 5.43e-01 0.0611 0.1 0.139 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 2.23e-01 0.121 0.0989 0.139 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 4.27e-01 0.0635 0.0797 0.139 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 1.07e-01 -0.136 0.0841 0.139 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0419 0.13 0.139 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 1.61e-01 0.146 0.104 0.139 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 6.51e-02 0.0914 0.0493 0.139 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 2.56e-01 -0.109 0.0956 0.139 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 8.54e-01 0.0182 0.0986 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0782 0.13 0.145 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 3.64e-02 0.265 0.126 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 1.37e-01 -0.189 0.127 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0734 0.0658 0.145 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 3.49e-01 0.12 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 4.57e-01 -0.107 0.143 0.145 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 5.28e-01 0.0708 0.112 0.145 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0928 0.116 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 5.31e-01 0.0544 0.0868 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 9.07e-01 0.0142 0.121 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0376 0.111 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0214 0.0868 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 7.94e-01 0.0275 0.105 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 9.88e-01 0.00178 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0124 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0817 0.0962 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 3.52e-01 -0.119 0.127 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 4.55e-01 0.0899 0.12 0.14 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 4.68e-01 0.0601 0.0826 0.14 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0352 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 8.05e-02 0.215 0.122 0.14 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 5.05e-01 0.0665 0.0997 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0342 0.0849 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 5.14e-01 0.086 0.132 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0701 0.115 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.44e-01 0.0976 0.0665 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0433 0.0938 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 4.74e-01 -0.075 0.105 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 2.07e-01 0.152 0.12 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 3.65e-01 0.0724 0.0798 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 5.75e-01 0.074 0.132 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0322 0.0961 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 7.05e-01 0.0364 0.096 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 8.57e-01 0.0185 0.102 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 2.10e-01 -0.156 0.124 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 3.25e-01 0.113 0.115 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 2.37e-01 -0.126 0.106 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 4.86e-02 -0.251 0.126 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 6.16e-01 -0.065 0.129 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.25e-02 0.187 0.0743 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 4.92e-01 0.0829 0.12 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0627 0.117 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 3.13e-01 0.0629 0.0623 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0964 0.0733 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 2.48e-01 0.136 0.117 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00463 0.0972 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 2.45e-01 0.0793 0.068 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 8.84e-01 0.00733 0.0501 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0175 0.0883 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 2.11e-01 0.109 0.087 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 9.81e-01 0.00211 0.0864 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0359 0.128 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 4.59e-01 0.0803 0.108 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.69e-01 0.0864 0.0626 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 5.84e-01 0.0393 0.0716 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0474 0.0881 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 4.65e-01 0.0723 0.0988 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0915 0.0887 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 3.33e-01 -0.124 0.127 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 5.26e-01 0.0656 0.103 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.59e-02 0.157 0.0648 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 2.18e-01 0.125 0.101 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 6.96e-01 0.0411 0.105 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 2.85e-01 0.0963 0.0898 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 4.45e-01 0.0729 0.0953 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 1.64e-01 0.172 0.123 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 1.16e-01 0.187 0.118 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.19e-02 0.189 0.0746 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 2.70e-01 0.118 0.107 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 4.59e-02 0.212 0.106 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 8.14e-01 -0.021 0.0892 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0231 0.0818 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 2.33e-01 -0.154 0.129 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 1.07e-01 -0.158 0.0977 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.08e-01 0.112 0.0694 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 6.77e-01 0.0345 0.0827 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0374 0.103 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 2.44e-01 -0.136 0.117 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 2.63e-02 0.22 0.0984 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0173 0.134 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0196 0.132 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 4.69e-02 0.126 0.0628 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 4.42e-01 0.0871 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 2.63e-01 -0.13 0.116 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 2.61e-01 -0.128 0.113 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 3.97e-01 -0.101 0.119 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 6.29e-01 0.0632 0.131 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 1.53e-01 0.194 0.135 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 6.57e-02 0.154 0.083 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 5.30e-01 0.0814 0.129 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 2.87e-01 0.132 0.124 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 8.63e-01 0.0157 0.0903 0.141 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0917 0.0964 0.141 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 7.72e-01 0.0355 0.122 0.141 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 1.50e-01 0.183 0.127 0.141 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 3.42e-02 0.128 0.0601 0.141 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0243 0.106 0.141 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 6.39e-01 0.0529 0.112 0.141 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 5.32e-01 0.0627 0.1 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 9.17e-01 0.0114 0.109 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0547 0.13 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 2.80e-01 0.126 0.117 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.86e-01 0.0986 0.0743 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 5.81e-01 0.0626 0.113 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 2.22e-01 0.145 0.118 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 1.59e-01 0.11 0.0776 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0415 0.105 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 2.97e-02 -0.291 0.133 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0371 0.0944 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.37e-02 0.18 0.0724 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0965 0.106 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 5.75e-01 0.0618 0.11 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 1.82e-01 0.134 0.1 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0946 0.117 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 9.42e-01 0.00938 0.128 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0892 0.104 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.02e-01 0.13 0.0794 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 8.16e-01 0.0296 0.127 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 6.54e-01 0.0577 0.129 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 1.92e-01 0.107 0.0818 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 2.02e-01 0.134 0.105 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 2.45e-01 -0.15 0.129 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0432 0.0978 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 5.09e-04 0.252 0.0713 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 8.27e-02 0.174 0.1 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 3.55e-01 0.102 0.11 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 6.31e-01 0.0748 0.155 0.148 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 9.46e-01 0.00887 0.131 0.148 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0402 0.16 0.148 PB L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 7.49e-01 -0.032 0.0997 0.148 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0407 0.121 0.148 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0552 0.138 0.148 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0784 0.145 0.148 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 1.75e-01 -0.139 0.102 0.137 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 1.00e-01 -0.176 0.107 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 1.41e-01 0.183 0.124 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0691 0.0991 0.137 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0113 0.0626 0.137 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 8.74e-01 0.0192 0.121 0.137 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 1.19e-01 -0.189 0.121 0.137 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 6.86e-01 0.0475 0.117 0.139 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0817 0.0851 0.139 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 2.68e-01 0.137 0.124 0.139 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 6.40e-02 -0.248 0.133 0.139 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.43e-02 0.182 0.0736 0.139 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 6.69e-01 0.0346 0.0809 0.139 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 3.90e-01 0.098 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 5.68e-01 0.0609 0.106 0.134 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00655 0.0938 0.134 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 2.66e-01 -0.153 0.137 0.134 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 2.11e-01 -0.131 0.105 0.134 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 4.54e-01 -0.081 0.108 0.134 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00434 0.137 0.134 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859771 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0956 0.141 0.134 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 2.49e-01 0.0821 0.0711 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0755 0.0701 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 9.97e-01 0.000466 0.128 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 2.28e-01 0.0926 0.0765 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 9.15e-01 0.0085 0.0798 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 7.49e-01 0.0262 0.082 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859771 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0924 0.102 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0359 0.0831 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 7.11e-01 0.0287 0.0774 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 8.27e-02 0.231 0.132 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 5.81e-01 0.0409 0.0738 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 8.97e-01 0.013 0.1 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 7.30e-01 0.0366 0.106 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859771 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0785 0.103 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 8.21e-01 0.0276 0.122 0.139 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 2.26e-01 -0.176 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0762 0.154 0.139 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 7.84e-01 0.037 0.135 0.139 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 1.09e-01 0.12 0.0744 0.139 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 8.04e-01 0.0395 0.159 0.139 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 7.51e-01 0.0433 0.136 0.139 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 1.71e-02 -0.209 0.0868 0.14 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 8.15e-02 -0.153 0.0871 0.14 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 1.34e-01 -0.178 0.118 0.14 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 5.17e-02 0.147 0.0753 0.14 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 3.54e-03 0.357 0.121 0.14 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 4.96e-01 0.0772 0.113 0.14 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859771 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0597 0.131 0.14 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 3.56e-01 0.0999 0.108 0.136 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 8.95e-01 0.01 0.0759 0.136 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 4.57e-01 0.0998 0.134 0.136 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0178 0.0959 0.136 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 8.87e-01 0.0178 0.125 0.136 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0976 0.12 0.136 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859771 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0489 0.126 0.136 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 1.20e-01 0.185 0.118 0.144 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00661 0.109 0.144 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0583 0.131 0.144 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 9.29e-01 0.00991 0.111 0.144 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 2.95e-02 0.318 0.145 0.144 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 6.27e-01 0.0547 0.112 0.144 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859771 sc-eQTL 2.64e-01 -0.151 0.135 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0669 0.103 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00937 0.0834 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0443 0.118 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 4.37e-01 0.0856 0.11 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 8.58e-01 0.013 0.0726 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0558 0.096 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 3.00e-01 0.127 0.122 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 4.75e-01 0.0752 0.105 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0149 0.0781 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 4.00e-01 0.108 0.128 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0504 0.115 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 8.69e-02 0.103 0.0598 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 8.32e-01 0.0187 0.0883 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 2.85e-01 -0.115 0.107 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 3.31e-01 0.0702 0.072 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0993 0.0672 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 3.86e-01 0.113 0.129 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 2.27e-01 0.0806 0.0665 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 9.39e-01 0.006 0.0783 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 5.54e-01 0.0474 0.08 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 859771 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0969 0.0929 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0373 0.0854 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0145 0.0652 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0461 0.129 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 4.91e-01 0.055 0.0798 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 4.08e-02 0.209 0.101 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 8.10e-01 0.0257 0.107 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 859771 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0924 0.121 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 424367 sc-eQTL 1.17e-01 0.126 0.0797 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -759715 sc-eQTL 8.30e-01 0.0213 0.0994 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 821252 sc-eQTL 8.79e-02 -0.23 0.134 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -463603 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0622 0.0838 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223398 sc-eQTL 7.09e-04 0.244 0.0711 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 851339 sc-eQTL 7.04e-01 0.0376 0.0987 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224417 sc-eQTL 1.40e-01 0.151 0.102 0.138 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N -463603 3.27e-07 1.92e-07 8.9e-08 2.27e-07 1.02e-07 1.28e-07 3.11e-07 5.66e-08 1.94e-07 9.72e-08 2.04e-07 1.59e-07 3.77e-07 8.55e-08 1.07e-07 8.71e-08 8.64e-08 1.91e-07 7.27e-08 5.33e-08 1.18e-07 1.47e-07 1.75e-07 3.58e-08 2.48e-07 1.51e-07 1.22e-07 1.12e-07 1.36e-07 2.75e-07 1.21e-07 3.59e-08 3.74e-08 9.72e-08 1.07e-07 5.7e-08 6.14e-08 8.57e-08 6.5e-08 3.99e-08 5.13e-08 1.62e-07 2.8e-08 5.87e-09 3.32e-08 6.83e-09 9.96e-08 3.09e-09 4.85e-08