Genes within 1Mb (chr6:137630713:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 6.27e-01 0.0505 0.104 0.128 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 5.31e-01 0.051 0.0813 0.128 B L1
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.27e-01 -0.12 0.123 0.128 B L1
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0101 0.0813 0.128 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 9.36e-01 0.00531 0.0655 0.128 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 7.15e-01 0.0334 0.0912 0.128 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 7.02e-02 0.186 0.102 0.128 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 8.21e-01 0.0161 0.0709 0.128 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 6.52e-01 0.0367 0.0813 0.128 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0158 0.114 0.128 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 4.85e-01 0.0535 0.0766 0.128 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0729 0.0717 0.128 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0249 0.0547 0.128 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0498 0.0904 0.128 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 6.81e-01 0.0328 0.0796 0.128 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 6.40e-01 0.0399 0.0852 0.128 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.24e-01 -0.131 0.133 0.128 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 4.97e-01 0.059 0.0868 0.128 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 8.42e-01 0.0134 0.067 0.128 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0575 0.0707 0.128 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 2.62e-01 0.11 0.0982 0.128 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0385 0.106 0.117 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 2.71e-01 -0.111 0.1 0.117 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.99e-02 -0.306 0.148 0.117 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 5.26e-01 0.0722 0.114 0.117 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0108 0.118 0.117 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 9.23e-02 0.194 0.115 0.117 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 846668 sc-eQTL 2.63e-01 0.172 0.153 0.117 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 7.68e-01 0.0241 0.0817 0.128 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 4.14e-01 0.0542 0.0662 0.128 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 5.85e-01 0.0751 0.137 0.128 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 2.11e-01 0.0867 0.0691 0.128 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0937 0.0807 0.128 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0155 0.0859 0.128 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 846668 sc-eQTL 6.72e-03 0.264 0.0963 0.128 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 8.97e-01 0.0115 0.0889 0.129 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0567 0.102 0.129 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 9.05e-02 -0.232 0.136 0.129 NK L1
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0422 0.0864 0.129 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 9.32e-02 -0.124 0.0735 0.129 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 2.03e-02 -0.245 0.105 0.129 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 8.54e-01 0.0193 0.105 0.129 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 5.09e-01 -0.055 0.0831 0.128 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 6.67e-01 -0.038 0.0882 0.128 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.25e-01 -0.134 0.135 0.128 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0198 0.109 0.128 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0613 0.0516 0.128 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0299 0.1 0.128 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 5.43e-01 0.0626 0.103 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0384 0.134 0.13 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 9.40e-01 0.00984 0.131 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.97e-01 -0.111 0.131 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 6.60e-01 0.0299 0.068 0.13 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 5.76e-02 -0.25 0.131 0.13 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 8.15e-01 0.0346 0.148 0.13 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 4.12e-01 0.0946 0.115 0.13 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 4.13e-01 0.0996 0.121 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 8.11e-01 0.0218 0.0912 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 2.18e-01 -0.157 0.127 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0685 0.116 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00739 0.0911 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0428 0.11 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 8.71e-01 -0.021 0.129 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 1.81e-02 0.314 0.132 0.129 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0508 0.102 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 9.55e-01 0.00754 0.135 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 7.32e-01 0.0435 0.127 0.129 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 6.83e-01 0.0356 0.0872 0.129 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 1.38e-03 -0.377 0.116 0.129 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 8.42e-02 0.224 0.129 0.129 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 5.57e-01 0.0617 0.105 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 2.95e-01 0.0936 0.0891 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 2.32e-01 -0.166 0.138 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 7.86e-01 0.033 0.121 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00425 0.0703 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00778 0.0987 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 4.66e-01 0.0802 0.11 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0879 0.129 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0252 0.0859 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 8.64e-01 0.0242 0.142 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0168 0.103 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0625 0.103 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 2.32e-01 0.131 0.109 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 1.50e-01 0.192 0.133 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 4.79e-01 0.0853 0.12 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 2.69e-01 0.123 0.111 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 4.35e-01 -0.104 0.133 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 8.56e-01 0.0246 0.135 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 4.33e-02 -0.159 0.0781 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 5.93e-01 0.0673 0.126 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0761 0.123 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 7.23e-01 -0.024 0.0676 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 6.39e-01 0.0375 0.0798 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.66e-01 0.116 0.127 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 1.12e-01 0.167 0.105 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0669 0.0738 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0544 0.0542 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0692 0.0957 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 4.44e-01 0.0707 0.0922 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0214 0.0913 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0894 0.135 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 4.45e-01 0.0875 0.114 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0378 0.0665 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 7.83e-01 0.0209 0.0757 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 3.32e-01 0.0904 0.093 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 2.26e-01 0.127 0.105 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 1.24e-01 0.145 0.0941 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 2.91e-01 -0.143 0.135 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0463 0.11 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0433 0.0698 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 8.31e-02 0.187 0.107 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 4.86e-01 0.0781 0.112 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0123 0.0943 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0249 0.1 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0393 0.13 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 5.54e-01 0.0739 0.125 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0909 0.0791 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 2.62e-01 -0.126 0.112 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 6.47e-01 0.0512 0.112 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 1.87e-01 0.124 0.0939 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 3.26e-01 0.0849 0.0863 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0839 0.137 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 8.63e-01 0.018 0.104 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 9.44e-01 0.00515 0.0738 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0604 0.0873 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 1.14e-01 0.172 0.108 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 4.55e-01 0.0922 0.123 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0885 0.105 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0166 0.142 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 2.42e-01 -0.162 0.138 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0639 0.0667 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 2.44e-01 0.139 0.119 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 1.23e-01 0.188 0.122 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 1.17e-01 0.183 0.117 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 8.41e-01 0.0247 0.123 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0594 0.135 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 7.48e-01 0.0451 0.14 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0786 0.0863 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 9.50e-01 0.00834 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0695 0.128 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0472 0.0956 0.128 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0648 0.102 0.128 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 1.39e-01 -0.191 0.129 0.128 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 6.76e-01 0.0566 0.135 0.128 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0841 0.0641 0.128 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 9.06e-01 0.0132 0.112 0.128 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 8.68e-01 0.0199 0.119 0.128 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0768 0.106 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0959 0.116 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.97e-01 -0.118 0.138 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 6.32e-01 0.0596 0.124 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0465 0.0792 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 2.82e-01 -0.13 0.12 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 3.33e-01 0.122 0.126 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 5.42e-01 0.0503 0.0824 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0585 0.111 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.92e-01 -0.122 0.142 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0278 0.0998 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 1.34e-01 -0.116 0.0772 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0981 0.112 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 5.83e-01 0.0639 0.116 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 7.85e-01 0.0292 0.107 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 7.29e-01 -0.043 0.124 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.40e-01 -0.129 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0337 0.11 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0596 0.0846 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 6.79e-02 -0.245 0.133 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 3.45e-01 0.129 0.136 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0245 0.0878 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0798 0.112 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0439 0.138 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 7.59e-01 0.032 0.105 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 1.49e-01 -0.113 0.078 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 9.76e-02 -0.178 0.107 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 3.37e-01 -0.113 0.118 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 2.04e-02 -0.392 0.167 0.137 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 3.49e-02 0.301 0.141 0.137 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 4.97e-01 -0.119 0.175 0.137 PB L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 2.66e-02 0.241 0.107 0.137 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 2.57e-01 -0.15 0.132 0.137 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0597 0.151 0.137 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 3.55e-01 -0.147 0.159 0.137 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 1.53e-01 -0.155 0.108 0.13 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0857 0.114 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 8.32e-01 0.0281 0.132 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 2.46e-01 -0.122 0.105 0.13 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 1.47e-01 -0.0963 0.0661 0.13 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0206 0.129 0.13 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 3.98e-01 0.109 0.129 0.13 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 9.99e-01 0.000135 0.127 0.128 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 6.75e-01 0.0387 0.0921 0.128 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0328 0.134 0.128 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 2.77e-01 0.158 0.145 0.128 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 3.04e-01 -0.083 0.0805 0.128 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 7.88e-02 -0.153 0.0869 0.128 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0155 0.123 0.128 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0681 0.118 0.117 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0575 0.104 0.117 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 5.49e-03 -0.421 0.15 0.117 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0227 0.117 0.117 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 3.32e-01 0.117 0.12 0.117 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 2.45e-01 0.177 0.151 0.117 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 846668 sc-eQTL 2.77e-01 0.17 0.156 0.117 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0395 0.0771 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 2.97e-01 0.0792 0.0758 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 2.61e-01 0.156 0.138 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 5.60e-01 0.0485 0.083 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 8.37e-01 0.0178 0.0863 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0695 0.0886 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 846668 sc-eQTL 6.66e-02 0.203 0.11 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 2.41e-01 -0.105 0.0892 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 9.15e-01 0.00887 0.0833 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 8.03e-01 0.0359 0.144 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 9.42e-01 0.00582 0.0795 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 4.05e-02 -0.221 0.107 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0117 0.114 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 846668 sc-eQTL 1.12e-01 0.177 0.111 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 4.19e-01 0.104 0.128 0.13 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0786 0.153 0.13 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 5.30e-01 0.102 0.162 0.13 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 1.64e-01 -0.197 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 1.50e-02 -0.19 0.0773 0.13 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 2.63e-01 -0.187 0.166 0.13 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 7.19e-01 0.0515 0.143 0.13 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 9.70e-01 0.00379 0.0998 0.124 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 6.32e-01 0.0476 0.0994 0.124 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.53e-01 0.125 0.134 0.124 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 4.13e-01 0.0706 0.086 0.124 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0493 0.14 0.124 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 5.10e-01 0.0847 0.128 0.124 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 846668 sc-eQTL 3.12e-01 0.15 0.148 0.124 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 6.18e-01 0.0575 0.115 0.12 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0531 0.0806 0.12 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 6.88e-01 0.0573 0.143 0.12 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0147 0.102 0.12 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 1.69e-01 -0.182 0.132 0.12 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 9.92e-01 0.00134 0.127 0.12 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 846668 sc-eQTL 3.79e-01 0.118 0.134 0.12 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00386 0.137 0.116 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0834 0.125 0.116 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 9.71e-01 0.0055 0.15 0.116 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 7.63e-01 0.0382 0.127 0.116 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 4.78e-01 -0.12 0.168 0.116 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 4.32e-02 0.259 0.127 0.116 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 846668 sc-eQTL 4.07e-01 0.129 0.155 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 2.15e-01 0.134 0.108 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 8.08e-01 0.0214 0.088 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.04e-01 -0.128 0.125 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 9.94e-01 0.000832 0.116 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 4.74e-01 0.0549 0.0765 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 1.99e-01 -0.13 0.101 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 5.44e-01 0.0787 0.129 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 8.43e-01 0.0219 0.11 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 4.52e-01 0.0617 0.0818 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00531 0.134 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 6.37e-01 0.0569 0.12 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 8.17e-01 0.0146 0.0632 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 5.62e-01 0.0538 0.0926 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 3.57e-01 0.104 0.112 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0414 0.0775 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 2.78e-01 0.0787 0.0724 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 6.32e-01 0.0667 0.139 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 2.12e-01 0.0894 0.0714 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0795 0.0839 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0517 0.0859 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 846668 sc-eQTL 4.13e-02 0.203 0.099 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 2.34e-01 0.111 0.0929 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00341 0.0711 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 3.06e-01 0.144 0.14 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00119 0.0871 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0859 0.112 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00416 0.117 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 846668 sc-eQTL 1.64e-01 0.184 0.132 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 sc-eQTL 7.89e-01 0.0228 0.0851 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -772818 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0666 0.105 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 808149 sc-eQTL 2.41e-01 -0.168 0.143 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -476706 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0248 0.089 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -236501 sc-eQTL 7.23e-02 -0.139 0.0769 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 838236 sc-eQTL 9.79e-02 -0.173 0.104 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -237520 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0106 0.109 0.129 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 411264 pQTL 0.0143 0.057 0.0232 0.0 0.0 0.126


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina