logo

Genes within 1Mb (chr6:137615761:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 9.47e-01 0.00726 0.109 0.122 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0393 0.0857 0.122 B L1
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 2.04e-01 0.164 0.129 0.122 B L1
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 6.96e-01 0.0335 0.0856 0.122 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 2.77e-02 0.151 0.0682 0.122 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 5.84e-01 0.0526 0.0961 0.122 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 1.04e-01 -0.176 0.108 0.122 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 2.65e-01 0.0805 0.072 0.122 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 2.12e-02 -0.19 0.0818 0.122 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0432 0.116 0.122 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 6.90e-02 -0.142 0.0775 0.122 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 4.18e-01 0.0593 0.073 0.122 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 4.34e-01 0.0436 0.0556 0.122 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0411 0.092 0.122 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 3.58e-01 0.076 0.0825 0.122 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 9.79e-02 -0.146 0.0879 0.122 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 1.18e-01 0.215 0.137 0.122 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 9.36e-01 0.0073 0.0901 0.122 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 4.24e-01 0.0557 0.0695 0.122 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 6.29e-02 0.136 0.0729 0.122 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 9.78e-02 -0.169 0.102 0.122 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 3.02e-01 0.104 0.1 0.122 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 3.47e-02 -0.2 0.094 0.122 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0922 0.141 0.122 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 6.06e-01 0.0554 0.107 0.122 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 7.86e-01 0.0303 0.111 0.122 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 5.73e-01 0.0617 0.109 0.122 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 831716 sc-eQTL 3.01e-01 -0.15 0.145 0.122 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 9.05e-01 0.00986 0.0824 0.122 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0816 0.0666 0.122 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 5.93e-01 0.0741 0.139 0.122 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 8.85e-03 0.182 0.0687 0.122 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 2.79e-01 0.0882 0.0813 0.122 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 1.05e-01 0.14 0.086 0.122 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 831716 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0366 0.0987 0.122 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 4.44e-01 0.0707 0.0921 0.12 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 2.06e-01 -0.134 0.105 0.12 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 4.19e-01 0.115 0.142 0.12 NK L1
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0197 0.0897 0.12 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 4.87e-02 0.151 0.0761 0.12 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 1.70e-01 0.151 0.109 0.12 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0196 0.109 0.12 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 7.43e-01 0.028 0.0851 0.122 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 3.33e-02 -0.191 0.0893 0.122 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 8.84e-01 0.0204 0.139 0.122 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00397 0.111 0.122 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 1.19e-02 0.132 0.0522 0.122 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 3.11e-01 0.104 0.102 0.122 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 1.26e-01 0.161 0.105 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0856 0.142 0.125 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 1.85e-01 0.185 0.139 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 3.22e-02 -0.299 0.138 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0446 0.0725 0.125 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 2.32e-01 0.168 0.14 0.125 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 8.23e-02 0.273 0.156 0.125 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0913 0.123 0.125 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 8.48e-01 -0.024 0.125 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00218 0.094 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 5.73e-01 0.074 0.131 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 8.71e-01 0.0195 0.12 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 1.01e-01 0.154 0.0932 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0317 0.113 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 6.35e-01 0.0632 0.133 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 5.24e-01 0.0875 0.137 0.123 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0561 0.104 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0561 0.138 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 5.20e-01 0.0839 0.13 0.123 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 2.06e-02 0.207 0.0885 0.123 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 2.35e-01 0.145 0.122 0.123 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 3.95e-01 0.114 0.133 0.123 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00636 0.108 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0742 0.0917 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 8.40e-01 0.0287 0.142 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 4.50e-01 -0.094 0.124 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 1.38e-01 0.107 0.0718 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0105 0.101 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0508 0.113 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 6.64e-01 0.0578 0.133 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0432 0.0882 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 1.50e-01 0.209 0.145 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 6.80e-01 0.0438 0.106 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 2.58e-01 0.12 0.106 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 3.80e-01 0.099 0.113 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 2.22e-02 -0.312 0.135 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 8.29e-01 0.0268 0.124 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 3.28e-01 -0.112 0.114 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 3.88e-02 -0.283 0.136 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 4.43e-01 -0.107 0.139 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 1.28e-01 0.124 0.0809 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 3.42e-01 0.123 0.13 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0781 0.127 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 3.97e-01 0.0585 0.0689 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 1.30e-02 -0.201 0.0803 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 8.01e-01 0.033 0.13 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 2.29e-01 -0.129 0.107 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 3.66e-01 0.0683 0.0753 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0442 0.0553 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0474 0.0977 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 1.02e-01 0.155 0.0944 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 2.12e-01 -0.117 0.0936 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 7.10e-01 0.0519 0.139 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 1.88e-01 -0.155 0.117 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 2.77e-01 0.0744 0.0683 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 2.10e-01 0.0976 0.0777 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 1.86e-01 -0.127 0.0955 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 4.23e-01 -0.086 0.107 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 1.39e-02 -0.236 0.0951 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0655 0.138 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0331 0.112 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 2.44e-03 0.214 0.0697 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 5.33e-02 0.212 0.109 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 2.92e-01 -0.12 0.114 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 4.04e-01 0.0808 0.0967 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0999 0.102 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 5.08e-03 0.37 0.131 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 7.67e-01 0.038 0.128 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 2.94e-01 0.0855 0.0813 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 2.16e-01 0.142 0.115 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 5.10e-01 0.0755 0.114 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0832 0.0958 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0729 0.0878 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 9.92e-01 0.00136 0.139 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0906 0.105 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 3.63e-01 0.0682 0.0749 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 2.58e-01 0.101 0.0886 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 1.17e-01 -0.174 0.11 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 4.16e-02 -0.268 0.131 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 4.81e-01 0.0794 0.112 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0671 0.152 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0161 0.149 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 3.19e-01 0.0715 0.0715 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 1.13e-01 0.203 0.127 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 9.79e-02 -0.217 0.13 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0026 0.125 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 1.04e-01 -0.212 0.13 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 7.87e-01 0.0389 0.144 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 5.21e-01 0.0959 0.149 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 1.70e-01 0.126 0.0915 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 4.65e-01 0.104 0.142 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 8.23e-01 0.0306 0.136 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 8.32e-01 0.0206 0.0971 0.121 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0613 0.104 0.121 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 2.73e-01 0.144 0.131 0.121 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 6.22e-01 0.0678 0.137 0.121 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 3.74e-04 0.229 0.0634 0.121 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 6.18e-01 0.0569 0.114 0.121 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 7.45e-02 0.215 0.12 0.121 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 4.81e-01 0.0762 0.108 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 1.15e-01 -0.185 0.117 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00937 0.141 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0317 0.126 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 5.03e-01 0.0539 0.0803 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 4.55e-01 0.0913 0.122 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 4.07e-01 0.106 0.128 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 4.35e-01 0.0669 0.0855 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 1.57e-01 -0.164 0.115 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 7.48e-01 0.0475 0.148 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 9.66e-01 0.00436 0.104 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 1.62e-01 0.113 0.0803 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 5.48e-01 0.0697 0.116 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 8.21e-01 0.0273 0.121 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 2.47e-01 0.125 0.107 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0271 0.125 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0287 0.137 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 9.97e-01 0.00042 0.111 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 1.22e-01 0.132 0.0848 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 2.75e-01 0.148 0.135 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0447 0.137 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 3.66e-01 0.0813 0.0897 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 9.03e-01 -0.014 0.115 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 2.34e-01 0.168 0.141 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0567 0.107 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 6.58e-03 0.216 0.0788 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 3.27e-01 0.108 0.11 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 8.84e-01 0.0176 0.121 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 6.47e-01 0.0772 0.168 0.137 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0677 0.141 0.137 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 3.59e-01 -0.158 0.172 0.137 PB L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0886 0.108 0.137 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0125 0.131 0.137 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 5.01e-01 -0.1 0.149 0.137 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 6.41e-01 0.0734 0.157 0.137 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0352 0.111 0.117 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 6.42e-02 -0.215 0.115 0.117 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 4.65e-01 0.0989 0.135 0.117 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0233 0.107 0.117 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 7.52e-01 0.0215 0.0678 0.117 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 3.43e-01 0.124 0.131 0.117 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 2.50e-01 -0.151 0.131 0.117 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00956 0.126 0.122 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 2.04e-01 -0.116 0.0914 0.122 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 9.58e-01 0.00703 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 4.88e-02 -0.284 0.143 0.122 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 9.39e-02 0.134 0.0798 0.122 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 3.33e-01 0.0843 0.0869 0.122 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 4.17e-01 0.0995 0.122 0.122 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 4.87e-01 0.0798 0.115 0.117 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 1.73e-01 -0.138 0.101 0.117 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0463 0.149 0.117 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 9.83e-01 0.00242 0.113 0.117 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0492 0.116 0.117 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0148 0.147 0.117 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 831716 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0225 0.152 0.117 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 6.78e-01 0.0318 0.0767 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 1.73e-01 -0.103 0.0753 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 8.52e-01 0.0257 0.138 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 5.56e-03 0.227 0.0811 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 2.92e-01 0.0904 0.0857 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 1.22e-01 0.136 0.0877 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 831716 sc-eQTL 9.11e-01 0.0124 0.11 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0783 0.0891 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0985 0.0829 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 3.60e-01 0.131 0.143 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 8.00e-02 0.139 0.0788 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0223 0.108 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 1.50e-01 0.164 0.113 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 831716 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0629 0.111 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0505 0.129 0.124 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 1.26e-02 -0.381 0.151 0.124 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 6.52e-01 -0.074 0.164 0.124 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 7.54e-01 0.045 0.143 0.124 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 1.81e-01 0.106 0.0791 0.124 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00407 0.168 0.124 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0446 0.144 0.124 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 4.77e-02 -0.186 0.0935 0.12 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 3.90e-01 -0.081 0.0939 0.12 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 4.19e-02 -0.258 0.126 0.12 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 3.69e-02 0.169 0.0806 0.12 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 6.31e-03 0.359 0.13 0.12 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 2.58e-01 0.137 0.121 0.12 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 831716 sc-eQTL 8.48e-01 0.0269 0.14 0.12 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 5.70e-01 0.064 0.112 0.12 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 5.17e-01 -0.051 0.0787 0.12 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 1.78e-01 0.187 0.139 0.12 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 3.43e-01 0.0943 0.0993 0.12 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0692 0.129 0.12 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 2.62e-01 -0.14 0.124 0.12 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 831716 sc-eQTL 3.37e-01 -0.126 0.131 0.12 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 2.03e-01 0.16 0.125 0.13 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 1.95e-01 -0.149 0.115 0.13 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0321 0.138 0.13 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 1.33e-01 0.175 0.116 0.13 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 2.66e-01 0.172 0.154 0.13 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 3.61e-01 0.108 0.118 0.13 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 831716 sc-eQTL 9.08e-02 -0.241 0.141 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 9.27e-01 0.0103 0.112 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0236 0.091 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0264 0.129 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 9.29e-01 0.0106 0.12 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 6.72e-02 0.144 0.0785 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 4.28e-01 0.083 0.105 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 7.08e-01 0.0501 0.134 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00901 0.114 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0605 0.0846 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 4.20e-01 0.112 0.139 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0217 0.124 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 4.11e-02 0.133 0.0647 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 5.19e-01 0.0618 0.0957 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 2.06e-01 -0.147 0.116 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 9.79e-01 0.00205 0.0777 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 1.43e-01 -0.106 0.0724 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 5.00e-01 0.0941 0.139 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 1.49e-02 0.174 0.0709 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 4.28e-01 0.0668 0.0841 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 7.05e-02 0.155 0.0855 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 831716 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0711 0.1 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0904 0.0919 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0771 0.0701 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0652 0.139 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 5.92e-02 0.162 0.0854 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 4.03e-01 0.0923 0.11 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 4.00e-01 0.0971 0.115 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 831716 sc-eQTL 3.90e-01 -0.113 0.131 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 sc-eQTL 3.59e-01 0.0801 0.0871 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -787770 sc-eQTL 2.00e-01 -0.139 0.108 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 793197 sc-eQTL 3.83e-01 0.128 0.147 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -491658 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0337 0.0913 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -251453 sc-eQTL 4.15e-02 0.162 0.0788 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 823284 sc-eQTL 2.52e-01 0.123 0.107 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -252472 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00593 0.111 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 396312 eQTL 0.0484 0.0461 0.0233 0.0 0.0 0.0893

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -787770 2.69e-07 1.3e-07 4.47e-08 1.82e-07 9.24e-08 9.76e-08 1.49e-07 5.2e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.6e-07 8.59e-08 1.41e-07 6.56e-08 6.04e-08 7.37e-08 3.94e-08 1.18e-07 5.75e-08 4.16e-08 1.08e-07 1.23e-07 1.34e-07 3.42e-08 1.4e-07 1.16e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.08e-07 1.07e-07 9.91e-08 3.26e-08 3.66e-08 8.44e-08 7.66e-08 3.2e-08 4.99e-08 9.26e-08 6.55e-08 3.76e-08 4.36e-08 1.36e-07 5.08e-08 1.11e-08 3.42e-08 1.99e-08 1.21e-07 1.88e-09 5.02e-08