logo

Genes within 1Mb (chr6:137565886:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0564 0.0883 0.173 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 2.32e-01 0.0829 0.0691 0.173 B L1
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 1.60e-01 -0.147 0.104 0.173 B L1
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 1.23e-01 -0.107 0.0689 0.173 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0735 0.0556 0.173 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 4.46e-03 0.219 0.0763 0.173 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 8.02e-01 0.022 0.0878 0.173 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0297 0.0596 0.173 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 5.08e-01 0.0452 0.0683 0.173 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 4.91e-01 0.0661 0.0959 0.173 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 8.85e-01 0.0093 0.0645 0.173 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 9.22e-01 0.00594 0.0604 0.173 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0297 0.046 0.173 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0226 0.076 0.173 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000343 0.0686 0.173 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 6.48e-01 0.0336 0.0734 0.173 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 2.23e-01 0.139 0.114 0.173 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 6.95e-01 0.0294 0.0748 0.173 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0229 0.0577 0.173 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 9.84e-01 0.00124 0.061 0.173 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000897 0.0848 0.173 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00219 0.0818 0.18 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 9.03e-01 0.0095 0.0775 0.18 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 2.33e-01 0.137 0.115 0.18 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 5.36e-02 -0.168 0.0866 0.18 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0545 0.0907 0.18 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 2.05e-01 -0.113 0.0888 0.18 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 781841 sc-eQTL 8.94e-02 -0.201 0.118 0.18 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 9.31e-01 0.00603 0.0696 0.173 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 5.15e-01 0.0368 0.0565 0.173 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 4.69e-01 0.085 0.117 0.173 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0818 0.0588 0.173 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0163 0.0689 0.173 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00113 0.0732 0.173 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 781841 sc-eQTL 5.53e-01 0.0495 0.0834 0.173 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0106 0.0768 0.174 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 8.89e-01 0.0122 0.088 0.174 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 1.39e-01 0.175 0.118 0.174 NK L1
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00749 0.0747 0.174 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 1.91e-01 0.0836 0.0637 0.174 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 8.43e-01 0.0182 0.0916 0.174 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 1.12e-02 0.228 0.0893 0.174 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 5.48e-01 0.0431 0.0716 0.173 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 7.67e-01 0.0226 0.076 0.173 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 8.11e-01 -0.028 0.117 0.173 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0528 0.0937 0.173 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 6.18e-01 0.0223 0.0446 0.173 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 1.70e-01 0.118 0.0858 0.173 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 1.48e-01 0.128 0.0881 0.173 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 1.73e-01 0.161 0.117 0.179 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 8.36e-01 0.024 0.116 0.179 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00908 0.116 0.179 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 8.42e-01 0.012 0.0601 0.179 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 3.59e-01 -0.107 0.116 0.179 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 8.87e-01 0.0185 0.13 0.179 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00766 0.102 0.179 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 5.64e-01 0.0611 0.106 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 8.73e-01 0.0127 0.0792 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 8.14e-01 0.026 0.111 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 5.65e-03 -0.277 0.099 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0166 0.0791 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 7.81e-01 0.0266 0.0956 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 1.28e-01 0.171 0.112 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 8.64e-03 -0.299 0.113 0.175 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0341 0.0873 0.175 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 6.79e-01 0.0478 0.116 0.175 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0805 0.109 0.175 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0565 0.0748 0.175 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 1.69e-01 0.141 0.102 0.175 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0422 0.111 0.175 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 8.43e-01 0.0178 0.0896 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 4.55e-01 0.0571 0.0762 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0843 0.118 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 1.28e-01 0.157 0.103 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0929 0.0596 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 1.04e-01 0.137 0.0838 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0365 0.0939 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 8.08e-01 0.0274 0.113 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 4.16e-02 0.152 0.074 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 2.79e-01 -0.133 0.123 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0704 0.0896 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0868 0.0895 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 6.24e-01 0.0469 0.0954 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 2.29e-01 0.139 0.116 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0582 0.107 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 3.33e-01 0.0953 0.0982 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 2.00e-01 0.152 0.118 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0698 0.12 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 9.93e-01 0.00059 0.07 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0398 0.112 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 9.12e-01 -0.012 0.109 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 6.67e-02 -0.104 0.0563 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 2.88e-01 0.0711 0.0668 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 9.02e-01 0.0132 0.107 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0734 0.0883 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 7.82e-01 0.0172 0.062 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00233 0.0456 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00832 0.0803 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 2.89e-01 0.0844 0.0794 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 8.93e-01 0.0106 0.0788 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0044 0.117 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 7.13e-01 0.0364 0.0988 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0438 0.0573 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0975 0.065 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0126 0.0804 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 7.90e-01 0.0242 0.0905 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0397 0.0814 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0794 0.117 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0258 0.0947 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 1.48e-01 -0.087 0.0598 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 1.23e-01 -0.143 0.0924 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0573 0.0963 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 9.60e-01 0.00427 0.0846 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 6.38e-01 0.0422 0.0896 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0551 0.116 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 3.59e-01 0.103 0.112 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0188 0.0711 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0447 0.1 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 6.97e-01 -0.039 0.1 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 1.85e-01 -0.109 0.0816 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 6.18e-01 0.0375 0.0751 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 6.75e-02 0.217 0.118 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 5.79e-01 0.0501 0.0902 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 7.90e-01 0.0171 0.0641 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 4.54e-01 0.0569 0.0759 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 1.94e-01 -0.123 0.0944 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 1.06e-01 0.173 0.106 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 8.24e-01 0.0202 0.0911 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 5.51e-01 0.0734 0.123 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 3.86e-01 0.104 0.12 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00313 0.058 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 1.14e-01 -0.163 0.103 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0794 0.106 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 4.94e-01 0.0703 0.103 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 3.45e-01 0.102 0.108 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0294 0.118 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 6.26e-01 -0.06 0.123 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 2.35e-01 -0.09 0.0755 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 8.33e-01 0.0247 0.117 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 2.01e-01 0.144 0.112 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00363 0.0848 0.173 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00481 0.0906 0.173 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0714 0.115 0.173 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 2.32e-01 -0.143 0.119 0.173 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0236 0.057 0.173 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 4.83e-01 0.0697 0.0992 0.173 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 5.89e-02 0.199 0.105 0.173 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000829 0.0897 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00104 0.0979 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 1.16e-01 0.184 0.116 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 2.32e-02 -0.237 0.103 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 9.66e-01 0.00282 0.0668 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 7.39e-01 0.0339 0.102 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 8.41e-01 0.0213 0.107 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0108 0.0704 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 7.82e-01 0.0264 0.0951 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 5.22e-01 0.0776 0.121 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0451 0.0852 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 1.88e-01 0.0872 0.066 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 7.41e-01 0.0316 0.0954 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 1.98e-02 0.23 0.098 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 5.07e-01 0.0604 0.0909 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 6.95e-01 0.0414 0.105 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 2.51e-01 0.133 0.115 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 9.10e-01 0.0106 0.0938 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 3.24e-01 0.0712 0.072 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 5.99e-01 0.0603 0.115 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 7.04e-01 0.0441 0.116 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 6.68e-01 0.0319 0.0744 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 6.46e-01 0.0437 0.095 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 2.75e-01 0.128 0.116 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 9.56e-01 0.0049 0.0886 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 4.16e-01 0.054 0.0663 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 7.96e-01 0.0236 0.0912 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 1.48e-01 0.145 0.0996 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0666 0.154 0.159 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 8.55e-01 0.0237 0.13 0.159 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 5.09e-01 -0.105 0.158 0.159 PB L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 3.94e-01 0.0842 0.0985 0.159 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 4.37e-01 0.0932 0.12 0.159 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 5.35e-02 0.262 0.134 0.159 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 6.72e-01 0.0611 0.144 0.159 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 1.39e-01 0.137 0.0919 0.174 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 9.85e-01 0.0018 0.0966 0.174 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0659 0.112 0.174 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 8.61e-01 0.0157 0.0893 0.174 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0242 0.0563 0.174 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0851 0.109 0.174 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0775 0.109 0.174 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 9.92e-01 0.00112 0.108 0.173 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 8.97e-01 0.0101 0.0781 0.173 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 2.93e-02 0.247 0.112 0.173 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 2.91e-01 0.13 0.123 0.173 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 9.51e-01 0.00425 0.0684 0.173 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 6.77e-01 0.0309 0.0741 0.173 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0995 0.104 0.173 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 6.19e-01 0.0452 0.0907 0.18 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 7.08e-01 0.03 0.0799 0.18 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 6.69e-01 0.0502 0.117 0.18 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 2.05e-01 -0.113 0.0891 0.18 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0622 0.092 0.18 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 4.01e-01 -0.098 0.116 0.18 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 781841 sc-eQTL 2.34e-02 -0.27 0.118 0.18 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 9.72e-01 0.00227 0.0642 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 9.29e-01 0.00562 0.0633 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00795 0.116 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0277 0.0691 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 9.69e-01 0.00277 0.0719 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 5.94e-01 0.0394 0.0738 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 781841 sc-eQTL 8.60e-02 0.158 0.0918 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 7.79e-01 0.021 0.0748 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 3.60e-01 0.0637 0.0695 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 2.66e-01 0.133 0.12 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0579 0.0664 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 3.87e-01 0.0781 0.0902 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 8.42e-01 0.019 0.0954 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 781841 sc-eQTL 2.18e-01 -0.115 0.0928 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 3.31e-01 -0.108 0.111 0.182 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 3.71e-01 0.119 0.132 0.182 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 2.31e-01 0.169 0.14 0.182 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 1.14e-01 -0.194 0.122 0.182 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 6.58e-02 0.125 0.0676 0.182 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 3.56e-01 -0.134 0.144 0.182 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 7.42e-01 0.0409 0.124 0.182 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0498 0.0797 0.173 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0281 0.0796 0.173 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0172 0.108 0.173 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0359 0.0689 0.173 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 8.01e-02 -0.196 0.111 0.173 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00138 0.103 0.173 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 781841 sc-eQTL 2.35e-01 -0.14 0.118 0.173 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0474 0.0931 0.176 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 8.85e-01 0.00944 0.0653 0.176 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0325 0.115 0.176 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0467 0.0824 0.176 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 6.35e-01 0.0509 0.107 0.176 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0157 0.103 0.176 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 781841 sc-eQTL 4.34e-02 0.219 0.108 0.176 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 1.06e-01 -0.175 0.108 0.175 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 5.48e-01 0.0601 0.0997 0.175 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 1.94e-01 0.156 0.119 0.175 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0156 0.101 0.175 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0896 0.134 0.175 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 1.94e-01 -0.133 0.102 0.175 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 781841 sc-eQTL 2.99e-01 -0.128 0.123 0.175 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0161 0.0939 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 9.10e-01 0.0086 0.0762 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0333 0.108 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 5.90e-02 -0.189 0.0995 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0317 0.0662 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 2.51e-01 0.101 0.0874 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 4.40e-01 0.0866 0.112 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 9.19e-01 0.00964 0.0946 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 1.12e-01 0.111 0.0697 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 1.17e-01 -0.18 0.114 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 3.75e-01 0.0915 0.103 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 6.05e-02 -0.101 0.0537 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 4.36e-02 0.16 0.0786 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 9.07e-01 0.0113 0.0964 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00532 0.0651 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 5.02e-01 0.041 0.0609 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 4.96e-01 0.0796 0.117 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0456 0.0602 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 6.69e-01 0.0302 0.0706 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 7.07e-01 0.0271 0.0722 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 781841 sc-eQTL 5.09e-01 0.0555 0.0839 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0851 0.0765 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 6.22e-01 0.0289 0.0585 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0223 0.116 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 5.68e-01 -0.041 0.0716 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 1.53e-01 -0.131 0.0915 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 6.27e-01 0.0468 0.096 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 781841 sc-eQTL 1.38e-01 0.162 0.109 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 346437 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0145 0.0723 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -837645 sc-eQTL 7.05e-01 0.034 0.0897 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 743322 sc-eQTL 1.90e-01 0.16 0.121 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -541533 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00154 0.0757 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -301328 sc-eQTL 1.67e-01 0.091 0.0656 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 773409 sc-eQTL 8.14e-01 0.0209 0.089 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -302347 sc-eQTL 7.92e-03 0.243 0.0906 0.175 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000220412 \N -141315 3.24e-06 2.68e-06 2.46e-07 1.69e-06 4.56e-07 8.2e-07 1.9e-06 4.44e-07 1.7e-06 7.73e-07 2.1e-06 1.31e-06 3.49e-06 1.22e-06 5.5e-07 1.19e-06 1.07e-06 1.97e-06 6.56e-07 9.31e-07 7.02e-07 2.44e-06 2.16e-06 1.02e-06 3.42e-06 1.22e-06 1.22e-06 1.34e-06 2.02e-06 1.81e-06 1.29e-06 2.74e-07 4.53e-07 1.12e-06 9.55e-07 6.58e-07 7.56e-07 3.84e-07 7.85e-07 1.68e-07 1.51e-07 2.94e-06 4.11e-07 1.74e-07 3.39e-07 3.17e-07 4.97e-07 2.63e-07 2.24e-07