Genes within 1Mb (chr6:136653485:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000656 0.0762 0.265 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0142 0.0339 0.265 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 6.94e-01 0.0355 0.0901 0.265 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 1.84e-01 0.0946 0.071 0.265 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 8.82e-01 0.00997 0.067 0.265 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 6.78e-01 0.0385 0.0925 0.265 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0172 0.0505 0.265 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 8.82e-01 0.00568 0.0382 0.265 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 3.63e-01 0.0741 0.0812 0.265 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0393 0.0389 0.265 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 4.19e-01 0.0636 0.0785 0.265 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0387 0.0572 0.265 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 3.80e-01 0.034 0.0387 0.265 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 7.46e-01 0.031 0.0954 0.265 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0657 0.0507 0.265 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 4.31e-01 0.0548 0.0695 0.257 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0438 0.0625 0.257 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 7.96e-01 0.0253 0.098 0.257 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 102666 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0847 0.0803 0.257 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 1.02e-01 0.146 0.0887 0.257 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 6.88e-01 0.031 0.0771 0.257 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 3.95e-01 0.0713 0.0836 0.257 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -130560 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0815 0.101 0.257 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 4.10e-01 0.0487 0.0589 0.265 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0445 0.0503 0.265 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 8.08e-01 0.0241 0.0993 0.265 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 102666 sc-eQTL 4.00e-01 0.0737 0.0874 0.265 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 1.46e-01 0.103 0.0709 0.265 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 5.31e-01 0.0366 0.0583 0.265 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -130560 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0185 0.0707 0.265 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 7.54e-01 0.0205 0.0653 0.266 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 2.76e-04 0.124 0.0336 0.266 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 4.79e-01 0.0713 0.101 0.266 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 2.38e-01 0.0919 0.0776 0.266 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 3.55e-01 0.0563 0.0607 0.265 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0077 0.051 0.265 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 8.45e-01 0.0194 0.0991 0.265 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 403150 sc-eQTL 7.76e-01 0.0163 0.0573 0.265 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 7.17e-01 0.0265 0.073 0.265 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 7.54e-01 0.0308 0.098 0.258 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 5.73e-01 0.0448 0.0795 0.258 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 2.18e-02 0.22 0.0949 0.258 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 6.97e-02 0.175 0.0961 0.258 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 3.00e-01 0.112 0.108 0.258 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0572 0.0788 0.258 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 6.99e-01 0.0341 0.0882 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 7.39e-01 0.0167 0.0502 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 1.79e-01 -0.124 0.0919 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0484 0.0857 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 3.52e-01 0.0743 0.0796 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 2.91e-02 0.196 0.0893 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 6.64e-01 0.0424 0.0973 0.265 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0184 0.0578 0.265 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0512 0.0982 0.265 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 3.53e-01 0.0835 0.0897 0.265 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0988 0.0867 0.265 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 1.05e-01 0.135 0.0826 0.265 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 9.88e-01 0.00112 0.0762 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 1.49e-01 -0.0627 0.0433 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 6.60e-01 0.0443 0.1 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 5.12e-01 0.0554 0.0844 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 9.08e-01 0.00831 0.0716 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0121 0.0992 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0739 0.0926 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0167 0.0537 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 4.59e-01 0.0752 0.101 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 1.69e-01 0.128 0.0929 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0659 0.0785 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 2.39e-01 -0.112 0.095 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0186 0.0882 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 4.61e-01 0.0578 0.0781 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 6.27e-01 0.0476 0.0977 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 7.09e-01 0.0345 0.0922 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 7.32e-01 0.0273 0.0796 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0106 0.0476 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0134 0.0382 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 7.29e-01 0.0312 0.0899 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 1.13e-01 -0.0605 0.038 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0255 0.0848 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00714 0.0678 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 2.01e-01 0.0547 0.0426 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 2.62e-01 0.112 0.0992 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00826 0.0556 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 2.32e-01 0.115 0.0962 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0725 0.0762 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 8.27e-02 -0.0937 0.0537 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0478 0.0985 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 5.95e-01 0.0416 0.0783 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 8.79e-01 0.014 0.0918 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 4.42e-01 0.0529 0.0687 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 4.64e-02 0.0911 0.0455 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 7.71e-01 0.0276 0.0946 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0952 0.0815 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 7.30e-01 0.0238 0.069 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0135 0.0482 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 2.98e-01 0.104 0.0998 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0968 0.0636 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0471 0.089 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 6.89e-02 0.121 0.0663 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 7.33e-02 -0.183 0.101 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 5.35e-01 0.0535 0.0861 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0844 0.0852 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 7.92e-01 0.0212 0.0806 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0935 0.098 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 8.03e-01 0.0243 0.0974 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 8.68e-01 0.0115 0.0692 0.264 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00653 0.0575 0.264 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 4.33e-01 0.0736 0.0937 0.264 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 403150 sc-eQTL 9.00e-01 0.00976 0.0776 0.264 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 4.64e-01 0.0594 0.081 0.264 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 7.46e-01 0.025 0.0771 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 2.50e-02 0.127 0.0562 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 6.06e-01 0.0518 0.1 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0498 0.0872 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0214 0.0608 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 1.45e-03 0.125 0.0388 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 1.40e-01 0.154 0.104 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 1.77e-01 0.111 0.0821 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 9.53e-01 0.00466 0.0785 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 1.00e-01 0.109 0.066 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0711 0.0996 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 7.62e-01 0.03 0.0989 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0194 0.063 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 7.83e-02 0.0826 0.0467 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0437 0.0989 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 3.16e-01 0.0775 0.0771 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0234 0.115 0.281 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 2.85e-01 0.106 0.099 0.281 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 6.60e-01 0.0522 0.118 0.281 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0277 0.0846 0.281 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 6.32e-02 -0.189 0.101 0.281 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 1.71e-01 -0.117 0.0848 0.281 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 1.99e-01 -0.102 0.0789 0.263 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 5.76e-01 0.046 0.0821 0.263 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 9.36e-01 0.00779 0.0962 0.263 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 403150 sc-eQTL 7.44e-01 0.0219 0.0669 0.263 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 4.60e-01 -0.069 0.0933 0.263 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 1.19e-01 0.143 0.0913 0.265 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0306 0.0592 0.265 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 2.22e-01 0.118 0.0966 0.265 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0232 0.0632 0.265 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 7.75e-01 0.0255 0.0888 0.265 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 6.09e-01 0.0398 0.0776 0.261 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0163 0.0783 0.261 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 8.30e-01 0.0216 0.1 0.261 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 102666 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0182 0.0895 0.261 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 5.32e-02 0.172 0.0883 0.261 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 8.92e-01 0.0107 0.0788 0.261 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 7.24e-01 0.0285 0.0809 0.261 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -130560 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0667 0.102 0.261 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 3.08e-01 0.0558 0.0546 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 8.30e-01 0.0126 0.0587 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 9.98e-01 0.000223 0.0985 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 102666 sc-eQTL 3.56e-01 0.0783 0.0847 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00801 0.0834 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 8.36e-01 0.0127 0.0613 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -130560 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00362 0.0788 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 6.60e-01 -0.028 0.0637 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 6.73e-01 0.0277 0.0655 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 4.12e-01 -0.084 0.102 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 102666 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0475 0.0953 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 2.01e-01 0.112 0.0871 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 1.44e-01 0.112 0.0766 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -130560 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0338 0.0793 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 6.21e-01 0.0441 0.0891 0.279 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0565 0.0784 0.279 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 2.33e-01 0.135 0.112 0.279 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 403150 sc-eQTL 6.78e-01 0.036 0.0865 0.279 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0105 0.116 0.279 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 2.74e-01 0.0735 0.0671 0.264 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 2.02e-01 -0.113 0.0885 0.264 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 1.66e-02 0.216 0.0894 0.264 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 102666 sc-eQTL 2.15e-01 0.111 0.0889 0.264 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 5.87e-02 0.166 0.0874 0.264 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 1.73e-01 -0.129 0.0941 0.264 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -130560 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0695 0.0997 0.264 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0563 0.0785 0.265 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0876 0.0607 0.265 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 1.47e-01 0.141 0.0968 0.265 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 102666 sc-eQTL 3.17e-03 0.251 0.0841 0.265 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 2.07e-03 0.249 0.0797 0.265 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0502 0.0903 0.265 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -130560 sc-eQTL 8.29e-01 0.0199 0.0917 0.265 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 1.23e-01 -0.145 0.0938 0.257 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0649 0.0707 0.257 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0468 0.104 0.257 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 102666 sc-eQTL 5.94e-01 0.0388 0.0726 0.257 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0417 0.0986 0.257 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 9.72e-01 0.00406 0.116 0.257 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 6.96e-01 0.0375 0.0955 0.257 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -130560 sc-eQTL 6.21e-01 0.0531 0.107 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 5.08e-01 0.0523 0.0788 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 4.27e-01 0.0352 0.0442 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0502 0.0907 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 5.02e-01 0.0549 0.0815 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 4.00e-01 0.062 0.0736 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 4.13e-03 0.267 0.0919 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0184 0.0797 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0524 0.0364 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 3.60e-01 0.0888 0.0968 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 2.84e-01 0.0867 0.0807 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0438 0.0668 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 772543 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0725 0.0984 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 6.30e-01 0.0267 0.0553 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 7.38e-01 0.0172 0.0515 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0642 0.0992 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 102666 sc-eQTL 8.34e-01 0.0186 0.0888 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 8.73e-01 0.0116 0.0727 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 5.20e-01 0.0386 0.0599 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -130560 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0238 0.0714 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00503 0.0653 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 2.66e-02 -0.13 0.0583 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 3.90e-03 0.282 0.0966 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 102666 sc-eQTL 1.33e-02 0.234 0.0939 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 801784 sc-eQTL 4.15e-04 0.284 0.0791 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 1.88e-01 -0.103 0.0779 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -130560 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0185 0.0928 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -565964 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0149 0.062 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 363634 sc-eQTL 1.14e-03 0.116 0.0351 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -169079 sc-eQTL 3.93e-01 0.0895 0.104 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -138992 sc-eQTL 9.45e-02 0.127 0.0759 0.267 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000016402 IL20RA -391695 pQTL 0.0227 0.0781 0.0342 0.00197 0.0 0.258
ENSG00000112357 PEX7 -169079 eQTL 0.0303 0.0638 0.0294 0.0 0.0 0.257
ENSG00000135525 MAP7 102666 eQTL 0.0402 -0.0543 0.0264 0.0 0.0 0.257
ENSG00000146410 MTFR2 403161 eQTL 0.0009 -0.0817 0.0245 0.0 0.0 0.257
ENSG00000182747 SLC35D3 -268816 eQTL 0.00164 -0.11 0.0347 0.0 0.0 0.257


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146410 MTFR2 403161 1.97e-06 2.6e-06 5.96e-07 1.86e-06 4.89e-07 7.26e-07 2.29e-06 8.73e-07 2.35e-06 1.17e-06 3.34e-06 1.71e-06 3.69e-06 1.36e-06 9.62e-07 1.49e-06 1.14e-06 2.32e-06 1.47e-06 1.28e-06 1.26e-06 3.12e-06 2.14e-06 1.08e-06 3.8e-06 1.08e-06 1.47e-06 1.81e-06 2.45e-06 1.86e-06 2.02e-06 4.71e-07 5.8e-07 1.27e-06 1.65e-06 9.21e-07 8.21e-07 4.53e-07 1.35e-06 3.46e-07 3.05e-07 2.88e-06 5.88e-07 1.44e-07 3.04e-07 3.31e-07 8.19e-07 2.07e-07 3.26e-07