logo

Genes within 1Mb (chr6:136629827:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 8.24e-01 0.0287 0.129 0.079 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 8.79e-01 0.00871 0.0574 0.079 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 4.66e-02 -0.302 0.151 0.079 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 8.80e-01 0.0182 0.121 0.079 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 7.70e-01 0.0332 0.113 0.079 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0603 0.156 0.079 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 6.49e-01 0.0386 0.0845 0.079 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 2.57e-01 0.0724 0.0638 0.079 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 6.74e-01 0.0573 0.136 0.079 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0448 0.0652 0.079 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00486 0.131 0.079 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 3.25e-01 0.101 0.103 0.079 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0107 0.0697 0.079 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 4.28e-01 0.136 0.171 0.079 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0369 0.0915 0.079 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 4.93e-01 0.0835 0.122 0.081 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 1.45e-01 -0.159 0.109 0.081 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 8.37e-01 0.0354 0.172 0.081 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 79008 sc-eQTL 2.10e-01 0.177 0.141 0.081 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 1.05e-01 -0.253 0.155 0.081 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 7.15e-01 0.0495 0.135 0.081 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 3.99e-01 -0.124 0.146 0.081 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -154218 sc-eQTL 7.11e-01 0.0655 0.176 0.081 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 8.34e-01 0.0205 0.0978 0.079 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 9.34e-01 0.00697 0.0836 0.079 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 3.99e-01 -0.139 0.164 0.079 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 79008 sc-eQTL 5.88e-01 0.0787 0.145 0.079 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 7.06e-01 0.0446 0.118 0.079 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0113 0.0968 0.079 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -154218 sc-eQTL 1.48e-01 -0.169 0.117 0.079 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 4.18e-01 0.0878 0.108 0.079 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0476 0.0575 0.079 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 8.60e-02 -0.287 0.166 0.079 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0229 0.129 0.079 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 5.54e-01 0.0608 0.103 0.079 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0254 0.0861 0.079 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0728 0.167 0.079 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 379492 sc-eQTL 6.52e-01 0.0436 0.0967 0.079 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 9.76e-02 0.204 0.123 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 3.70e-02 -0.373 0.178 0.071 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 3.42e-01 0.139 0.146 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 5.14e-01 -0.116 0.177 0.071 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 4.69e-01 -0.129 0.178 0.071 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 1.11e-01 -0.317 0.197 0.071 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00712 0.145 0.071 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0404 0.151 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0937 0.0854 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 1.56e-02 -0.379 0.155 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 1.71e-01 -0.2 0.146 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 1.76e-01 0.184 0.136 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0883 0.154 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 2.97e-02 -0.355 0.162 0.08 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 6.16e-01 0.0489 0.0973 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 9.71e-01 0.006 0.166 0.08 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 5.76e-01 0.0848 0.151 0.08 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 3.02e-01 0.151 0.146 0.08 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00235 0.14 0.08 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 7.59e-01 0.0395 0.129 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 6.72e-01 0.0313 0.0737 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 7.87e-01 0.0461 0.17 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 3.12e-01 -0.145 0.143 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00578 0.121 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 9.20e-02 -0.283 0.167 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 3.93e-01 -0.138 0.161 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 8.22e-01 -0.021 0.0934 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 2.01e-01 -0.225 0.176 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 3.93e-01 0.138 0.162 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0994 0.136 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 5.91e-01 0.0891 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 8.44e-01 -0.03 0.152 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 2.30e-01 0.162 0.134 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 1.66e-01 0.233 0.168 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 7.57e-01 0.0493 0.159 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0601 0.137 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 3.73e-01 0.0716 0.0802 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 1.56e-01 0.0914 0.0642 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 9.03e-01 0.0184 0.152 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0176 0.0645 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0526 0.143 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 1.98e-01 -0.145 0.112 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 3.15e-01 0.0714 0.0709 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0617 0.165 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0495 0.0924 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 2.32e-01 0.192 0.16 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0157 0.128 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0823 0.0908 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 4.67e-01 -0.121 0.165 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 3.20e-01 -0.131 0.131 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 6.73e-01 0.0653 0.154 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0728 0.121 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0468 0.0807 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 2.70e-01 0.184 0.166 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 3.54e-01 -0.133 0.144 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 1.93e-01 0.15 0.115 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0386 0.0804 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 4.54e-01 -0.125 0.167 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 1.18e-01 -0.167 0.106 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 1.60e-01 -0.221 0.157 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 6.05e-01 0.0612 0.118 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 9.00e-01 0.0229 0.181 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 3.58e-01 -0.14 0.152 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00877 0.152 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 7.25e-02 -0.257 0.142 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 1.18e-01 0.273 0.174 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0951 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0176 0.123 0.076 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00684 0.102 0.076 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 4.14e-01 0.137 0.167 0.076 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 379492 sc-eQTL 4.63e-01 -0.101 0.138 0.076 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00293 0.144 0.076 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 3.12e-01 0.13 0.129 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00537 0.0951 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 4.88e-01 0.117 0.168 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 9.18e-01 0.015 0.146 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 3.78e-01 0.0878 0.0993 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0946 0.0647 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 3.28e-01 -0.168 0.171 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00515 0.135 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 7.95e-01 0.033 0.127 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0158 0.107 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 5.34e-01 0.1 0.161 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 1.02e-01 -0.261 0.159 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 1.31e-01 0.158 0.105 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0355 0.0785 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 6.82e-02 -0.3 0.164 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 4.79e-01 0.0915 0.129 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 7.32e-01 0.0705 0.206 0.07 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 3.13e-01 -0.179 0.177 0.07 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 2.96e-01 0.221 0.21 0.07 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0604 0.151 0.07 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 5.73e-01 0.103 0.182 0.07 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 4.91e-01 -0.105 0.152 0.07 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 4.85e-01 0.0915 0.131 0.078 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 1.59e-01 -0.191 0.135 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 8.45e-02 -0.274 0.158 0.078 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 379492 sc-eQTL 2.90e-01 0.117 0.11 0.078 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 3.18e-01 0.155 0.154 0.078 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 9.41e-01 0.0115 0.153 0.079 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 6.32e-01 0.0475 0.0991 0.079 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 1.56e-01 0.23 0.161 0.079 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 2.90e-01 -0.112 0.105 0.079 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00622 0.149 0.079 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 2.86e-01 0.147 0.137 0.076 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0765 0.139 0.076 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 3.58e-01 0.164 0.178 0.076 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 79008 sc-eQTL 4.01e-01 0.133 0.159 0.076 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 1.09e-01 -0.253 0.157 0.076 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 4.53e-01 0.105 0.14 0.076 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 3.41e-01 -0.137 0.143 0.076 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -154218 sc-eQTL 4.21e-01 0.147 0.182 0.076 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 8.95e-01 0.012 0.0907 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 6.58e-01 0.0431 0.0973 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 5.86e-01 -0.089 0.163 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 79008 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0636 0.141 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0181 0.138 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 1.32e-01 -0.153 0.101 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -154218 sc-eQTL 2.81e-01 -0.141 0.13 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 8.38e-01 0.0215 0.105 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0531 0.108 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 6.34e-01 0.0802 0.169 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 79008 sc-eQTL 6.35e-01 0.0746 0.157 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 2.69e-01 0.159 0.144 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 2.63e-01 0.142 0.127 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -154218 sc-eQTL 2.50e-01 -0.151 0.13 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 9.18e-01 0.0161 0.157 0.085 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000101 0.138 0.085 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 9.85e-01 0.00363 0.199 0.085 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 379492 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00961 0.152 0.085 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 5.60e-01 0.119 0.204 0.085 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00113 0.11 0.082 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 4.90e-01 -0.101 0.145 0.082 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 5.53e-01 0.0882 0.148 0.082 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 79008 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0928 0.146 0.082 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0985 0.144 0.082 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 1.67e-01 0.214 0.154 0.082 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -154218 sc-eQTL 5.27e-02 -0.316 0.162 0.082 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 1.71e-01 -0.193 0.141 0.079 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 7.13e-01 0.0404 0.11 0.079 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 2.98e-01 -0.182 0.175 0.079 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 79008 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0894 0.154 0.079 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 3.79e-01 -0.129 0.147 0.079 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 9.35e-01 0.0133 0.163 0.079 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -154218 sc-eQTL 1.48e-01 0.238 0.164 0.079 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 8.43e-01 0.031 0.157 0.079 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 7.64e-02 -0.208 0.116 0.079 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 5.90e-01 0.0932 0.172 0.079 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 79008 sc-eQTL 6.48e-01 0.0551 0.12 0.079 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0715 0.164 0.079 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 6.79e-01 0.0799 0.193 0.079 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 8.21e-01 0.0358 0.158 0.079 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -154218 sc-eQTL 4.05e-01 -0.148 0.177 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 1.54e-01 -0.193 0.135 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0218 0.0759 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 1.57e-01 -0.22 0.155 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 3.15e-01 -0.14 0.139 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 1.89e-01 0.166 0.126 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00223 0.161 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 1.00e+00 -3.55e-06 0.136 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 6.05e-01 0.0324 0.0626 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 2.41e-01 -0.194 0.165 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0418 0.139 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0689 0.114 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 748885 sc-eQTL 3.37e-01 -0.162 0.168 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 8.09e-01 0.0222 0.0917 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 6.38e-01 0.0402 0.0853 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 9.91e-01 0.00182 0.165 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 79008 sc-eQTL 7.90e-01 0.0392 0.147 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 3.69e-01 0.108 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0396 0.0994 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -154218 sc-eQTL 1.06e-01 -0.191 0.118 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 1.15e-01 -0.17 0.108 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 8.82e-01 0.0145 0.098 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 2.08e-01 -0.206 0.163 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 79008 sc-eQTL 8.43e-01 0.0314 0.158 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 778126 sc-eQTL 1.95e-01 -0.175 0.135 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 5.78e-01 0.0724 0.13 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -154218 sc-eQTL 4.87e-01 -0.107 0.154 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -589622 sc-eQTL 4.14e-01 0.0836 0.102 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 339976 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0451 0.0592 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -192737 sc-eQTL 5.63e-02 -0.328 0.171 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -162650 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0202 0.126 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000182747 SLC35D3 -292474 eQTL 0.011 0.144 0.0565 0.0 0.0 0.079

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000029363 \N 339976 1.31e-06 8.97e-07 1.85e-07 3.04e-07 9.93e-08 3.08e-07 7.32e-07 2.71e-07 8.46e-07 2.72e-07 1.09e-06 5.69e-07 1.3e-06 2.12e-07 3.86e-07 4.47e-07 6.67e-07 4.95e-07 3.26e-07 2.76e-07 2.62e-07 5.66e-07 5.66e-07 3.29e-07 1.42e-06 2.4e-07 5.05e-07 3.88e-07 6.91e-07 8.5e-07 4.47e-07 3.34e-08 1.08e-07 2.19e-07 3.22e-07 2.94e-07 2.36e-07 1.41e-07 1.01e-07 8.43e-09 1.15e-07 8.45e-07 6.23e-08 1.21e-08 1.91e-07 4.38e-08 1.68e-07 8.74e-08 5.39e-08
ENSG00000182747 SLC35D3 -292474 1.34e-06 9.31e-07 2.91e-07 6.42e-07 2.1e-07 4.46e-07 1.18e-06 3.52e-07 1.2e-06 3.83e-07 1.41e-06 6.03e-07 1.82e-06 2.54e-07 4.38e-07 7.41e-07 8.26e-07 5.63e-07 4.95e-07 5.33e-07 4.19e-07 1.17e-06 8.26e-07 5.6e-07 1.92e-06 3.63e-07 6.85e-07 5.78e-07 1.04e-06 1.11e-06 5.66e-07 7.24e-08 2.27e-07 4.91e-07 4.25e-07 4.66e-07 4.68e-07 1.55e-07 2.21e-07 6.46e-08 2.32e-07 1.43e-06 5.81e-08 2.67e-08 1.87e-07 8.9e-08 2.3e-07 7.69e-08 9.51e-08
ENSG00000197442 \N -162650 3e-06 3.18e-06 4.85e-07 2.04e-06 6.13e-07 7.11e-07 2.28e-06 8.7e-07 2.24e-06 1.19e-06 2.65e-06 1.68e-06 4.01e-06 1.42e-06 9.33e-07 1.86e-06 1.46e-06 2.22e-06 1.29e-06 1.35e-06 1.43e-06 3.15e-06 2.74e-06 1.24e-06 3.96e-06 1.06e-06 1.52e-06 1.79e-06 2.66e-06 2.28e-06 2.08e-06 3.98e-07 6.13e-07 1.24e-06 1.43e-06 9.1e-07 8.38e-07 4.21e-07 1.17e-06 3.79e-07 1.51e-07 3.37e-06 6.16e-07 1.89e-07 3.06e-07 3.65e-07 8.28e-07 2.49e-07 1.58e-07