logo

Genes within 1Mb (chr6:136493962:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0462 0.0896 0.165 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 7.46e-01 0.0129 0.0399 0.165 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 9.46e-01 0.00716 0.106 0.165 B L1
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 2.99e-01 0.116 0.112 0.165 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 9.89e-01 0.00118 0.0839 0.165 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 4.99e-01 0.0533 0.0787 0.165 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 1.26e-01 -0.166 0.108 0.165 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 8.00e-02 0.104 0.059 0.165 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 4.87e-01 0.0313 0.0449 0.165 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 2.16e-01 -0.118 0.0954 0.165 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 7.36e-01 0.0327 0.0969 0.165 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 1.28e-01 -0.0698 0.0456 0.165 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 4.43e-01 -0.071 0.0923 0.165 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 8.17e-02 0.119 0.0683 0.165 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 5.66e-01 0.0267 0.0465 0.165 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 7.38e-02 0.205 0.114 0.165 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 3.78e-01 0.0902 0.102 0.165 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0153 0.0612 0.165 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 1.82e-01 0.111 0.0827 0.171 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00851 0.0747 0.171 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0902 0.117 0.171 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -56857 sc-eQTL 5.39e-01 0.059 0.096 0.171 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0242 0.0729 0.171 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00922 0.107 0.171 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 7.17e-01 0.0334 0.0921 0.171 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0212 0.0999 0.171 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -290083 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0158 0.12 0.171 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 7.21e-01 0.0249 0.0696 0.165 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 9.15e-01 0.00639 0.0595 0.165 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 9.82e-03 -0.301 0.115 0.165 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -56857 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0764 0.103 0.165 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00558 0.0976 0.165 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 3.12e-01 0.085 0.0839 0.165 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 5.46e-01 0.0417 0.0689 0.165 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -290083 sc-eQTL 5.61e-01 0.0486 0.0834 0.165 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 2.64e-01 0.0853 0.0761 0.165 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 9.30e-01 0.00359 0.0405 0.165 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0236 0.118 0.165 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 6.35e-01 0.051 0.107 0.165 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00769 0.0911 0.165 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 3.81e-01 0.0624 0.0711 0.165 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 8.71e-01 -0.00974 0.0597 0.165 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00702 0.116 0.165 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 5.66e-01 0.0652 0.113 0.165 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 243627 sc-eQTL 5.63e-01 0.0388 0.0671 0.165 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0395 0.0855 0.165 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 7.77e-01 0.0339 0.12 0.151 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 7.03e-01 0.0371 0.0971 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 8.49e-01 0.0225 0.118 0.151 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0153 0.129 0.151 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 4.88e-01 0.0822 0.118 0.151 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0249 0.132 0.151 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0273 0.0963 0.151 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 6.03e-01 0.0549 0.105 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 2.03e-01 0.0762 0.0598 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 9.25e-02 -0.185 0.11 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 2.70e-01 0.129 0.117 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 2.80e-01 -0.111 0.102 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 2.25e-01 0.116 0.095 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00654 0.108 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 2.38e-01 -0.134 0.114 0.166 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0602 0.0675 0.166 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 1.06e-03 0.372 0.112 0.166 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 1.92e-02 0.27 0.114 0.166 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 9.93e-01 0.000972 0.105 0.166 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 1.13e-01 0.161 0.101 0.166 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0229 0.0973 0.166 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 8.57e-01 0.0164 0.0907 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 8.02e-01 0.013 0.0518 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 6.66e-01 0.0517 0.12 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 4.06e-01 0.0971 0.117 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0482 0.101 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 7.51e-01 0.0272 0.0853 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 4.91e-02 -0.232 0.117 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0685 0.111 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 6.90e-01 0.0258 0.0645 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 9.29e-01 0.0109 0.122 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 2.82e-01 0.13 0.121 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 5.82e-01 0.0617 0.112 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0788 0.0942 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0943 0.114 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 6.09e-01 0.0537 0.105 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00565 0.0931 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0453 0.116 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 8.83e-01 0.0167 0.113 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0571 0.11 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0486 0.0946 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 9.63e-02 0.0936 0.056 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 9.18e-01 0.00466 0.0453 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0581 0.106 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 6.71e-01 0.0424 0.0996 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0406 0.0452 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0712 0.1 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 1.95e-01 0.102 0.0786 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 4.38e-01 0.0386 0.0497 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 5.44e-02 -0.222 0.115 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 9.70e-01 0.00389 0.104 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 9.04e-02 -0.109 0.0643 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 7.49e-01 0.036 0.112 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 5.23e-01 0.0581 0.0908 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00503 0.0645 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 3.74e-01 -0.104 0.117 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 2.83e-01 0.118 0.109 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0546 0.0932 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0252 0.109 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 4.35e-01 0.0656 0.084 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 6.08e-01 0.0288 0.056 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 7.72e-01 0.0336 0.116 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 7.12e-01 0.0414 0.112 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 5.38e-01 0.0615 0.0998 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 1.82e-01 0.107 0.0799 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0619 0.0559 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 4.88e-02 0.228 0.115 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 9.09e-01 0.012 0.105 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0152 0.0744 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 6.37e-01 0.0502 0.106 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 8.65e-01 0.0136 0.0798 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 6.66e-01 0.0527 0.122 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 5.11e-01 0.0773 0.118 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0341 0.103 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 6.51e-01 0.0475 0.105 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 6.79e-01 -0.041 0.0989 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 1.64e-01 0.168 0.12 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0899 0.122 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0583 0.12 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0576 0.0825 0.162 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 8.42e-01 0.0137 0.0686 0.162 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0286 0.112 0.162 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 4.53e-01 0.0894 0.119 0.162 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 243627 sc-eQTL 7.23e-01 0.0329 0.0926 0.162 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 2.17e-01 -0.119 0.0965 0.162 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00142 0.0914 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0398 0.0674 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 3.33e-01 0.115 0.119 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 6.66e-01 0.048 0.111 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 4.03e-01 0.0865 0.103 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 5.96e-01 0.0373 0.0702 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 7.68e-01 0.0136 0.0459 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0457 0.121 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0232 0.119 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0338 0.0952 0.166 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 1.73e-01 0.126 0.0923 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 8.59e-01 -0.014 0.0785 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0223 0.118 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0874 0.123 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0809 0.117 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 2.52e-01 0.0847 0.0736 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0315 0.0551 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0867 0.116 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 2.73e-01 0.122 0.111 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 8.11e-01 0.0217 0.0906 0.166 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 4.89e-01 -0.104 0.15 0.156 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 9.81e-01 0.00311 0.13 0.156 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00623 0.155 0.156 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 1.97e-01 0.212 0.163 0.156 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0588 0.11 0.156 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 9.57e-01 0.00721 0.133 0.156 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 5.83e-03 -0.303 0.108 0.156 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 2.29e-01 0.111 0.0919 0.163 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 3.91e-01 -0.082 0.0955 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0816 0.112 0.163 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 2.25e-01 0.144 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 243627 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0545 0.0778 0.163 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 8.02e-01 0.0274 0.109 0.163 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 9.00e-01 0.0134 0.107 0.165 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 3.47e-01 0.0649 0.0688 0.165 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 6.49e-01 0.0513 0.113 0.165 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 8.22e-01 0.0246 0.11 0.165 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0465 0.0735 0.165 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 9.35e-01 0.00844 0.103 0.165 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 3.61e-02 0.196 0.0928 0.166 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0582 0.0946 0.166 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0496 0.122 0.166 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -56857 sc-eQTL 7.99e-01 0.0276 0.108 0.166 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0705 0.11 0.166 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 7.51e-01 0.0343 0.108 0.166 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 8.72e-01 0.0154 0.0953 0.166 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0319 0.0978 0.166 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -290083 sc-eQTL 5.42e-01 0.0758 0.124 0.166 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 8.15e-01 0.0152 0.0649 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 6.09e-01 0.0357 0.0696 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 1.07e-01 -0.188 0.116 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -56857 sc-eQTL 8.14e-02 -0.175 0.0998 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 8.80e-01 0.0153 0.101 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 9.56e-01 0.00544 0.0988 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0816 0.0724 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -290083 sc-eQTL 9.25e-01 0.00881 0.0934 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0186 0.0753 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 4.74e-01 0.0554 0.0772 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 9.83e-03 -0.31 0.119 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -56857 sc-eQTL 7.77e-01 0.0319 0.113 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0263 0.111 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 4.04e-02 0.211 0.102 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 1.54e-01 0.129 0.0905 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -290083 sc-eQTL 5.31e-01 0.0588 0.0936 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 1.30e-01 0.164 0.108 0.191 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0117 0.0954 0.191 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 4.28e-01 -0.109 0.137 0.191 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 6.07e-01 0.0675 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 243627 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0128 0.105 0.191 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0178 0.141 0.191 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 7.00e-01 0.0302 0.0782 0.171 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 2.18e-01 -0.127 0.103 0.171 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0543 0.105 0.171 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -56857 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0547 0.104 0.171 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 9.12e-01 0.0124 0.112 0.171 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 8.38e-01 -0.021 0.103 0.171 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 5.98e-01 0.0581 0.11 0.171 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -290083 sc-eQTL 2.49e-01 -0.134 0.116 0.171 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 3.82e-01 -0.082 0.0935 0.17 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0846 0.0725 0.17 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0655 0.116 0.17 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -56857 sc-eQTL 5.67e-01 0.0587 0.102 0.17 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0517 0.112 0.17 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 1.01e-01 0.159 0.0966 0.17 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 4.25e-01 0.0859 0.108 0.17 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -290083 sc-eQTL 1.47e-01 0.158 0.109 0.17 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 1.48e-01 0.15 0.103 0.184 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0416 0.078 0.184 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0378 0.115 0.184 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -56857 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0615 0.0799 0.184 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 3.36e-01 0.0838 0.0869 0.184 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 3.65e-01 0.0985 0.108 0.184 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 3.06e-01 -0.131 0.128 0.184 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00079 0.105 0.184 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -290083 sc-eQTL 7.78e-01 0.0334 0.118 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00776 0.0936 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 7.88e-01 0.0141 0.0526 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 1.88e-01 0.142 0.107 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 1.10e-01 0.183 0.114 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0743 0.0967 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 8.95e-02 0.148 0.0868 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 8.97e-01 0.0144 0.111 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0357 0.0958 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 6.57e-01 0.0196 0.044 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 6.72e-01 0.0494 0.117 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 3.76e-01 0.104 0.118 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00825 0.0974 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 8.28e-01 0.0175 0.0804 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 613020 sc-eQTL 4.18e-02 -0.24 0.117 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 8.42e-01 0.0131 0.0656 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 3.16e-01 0.0612 0.0609 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 2.92e-02 -0.255 0.116 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -56857 sc-eQTL 3.13e-01 -0.106 0.105 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 8.51e-01 0.0186 0.0986 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 2.91e-01 0.091 0.0859 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 9.18e-01 0.00731 0.0711 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -290083 sc-eQTL 5.88e-01 0.0458 0.0845 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0338 0.0764 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 1.09e-01 -0.11 0.0687 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0717 0.115 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -56857 sc-eQTL 4.69e-01 0.0807 0.111 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0224 0.106 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 642261 sc-eQTL 4.43e-01 0.0732 0.0953 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 3.92e-01 0.0784 0.0915 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -290083 sc-eQTL 9.57e-01 0.00591 0.109 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -725487 sc-eQTL 4.37e-01 0.056 0.072 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 204111 sc-eQTL 8.54e-01 0.00771 0.0419 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -328602 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0289 0.122 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 996197 sc-eQTL 3.31e-01 0.108 0.111 0.166 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -298515 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0273 0.0888 0.166 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135525 MAP7 -56857 eQTL 1.53e-07 -0.175 0.0331 0.0158 0.0155 0.136

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 MAP7 -56857 9e-06 1.13e-05 1.21e-06 6.69e-06 2.36e-06 4.2e-06 1.16e-05 1.93e-06 9.59e-06 4.81e-06 1.2e-05 5.31e-06 1.8e-05 3.66e-06 2.66e-06 6.29e-06 4.55e-06 6.71e-06 2.65e-06 2.85e-06 4.63e-06 8.59e-06 7.76e-06 3.36e-06 1.39e-05 3.35e-06 4.65e-06 3.77e-06 1.02e-05 8.32e-06 6.24e-06 9.46e-07 1.33e-06 3.14e-06 4.55e-06 2.22e-06 1.72e-06 1.94e-06 2.19e-06 9.85e-07 1.03e-06 1.3e-05 1.43e-06 1.54e-07 7.56e-07 1.61e-06 8.96e-07 7.11e-07 6.14e-07
ENSG00000197442 \N -298515 1.27e-06 1.01e-06 2.15e-07 1.15e-06 1.18e-07 4.39e-07 1.34e-06 2.98e-07 1.14e-06 3.82e-07 1.35e-06 6.19e-07 1.98e-06 2.78e-07 4.28e-07 5.49e-07 7.43e-07 5.67e-07 3.95e-07 6.44e-07 2.38e-07 8.11e-07 7.78e-07 5.84e-07 1.94e-06 2.7e-07 6.38e-07 5.44e-07 9.73e-07 1.09e-06 5.72e-07 5.02e-08 1.36e-07 5.67e-07 4.66e-07 3.05e-07 4.21e-07 1.54e-07 3.25e-07 3.12e-07 2.67e-07 1.53e-06 7.66e-08 1.21e-08 1.73e-07 7.43e-08 1.54e-07 3.84e-08 5.86e-08