logo

Genes within 1Mb (chr6:136483167:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 2.20e-01 -0.154 0.125 0.071 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0207 0.0559 0.071 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 8.63e-01 0.0256 0.149 0.071 B L1
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 6.58e-02 0.288 0.156 0.071 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 5.06e-01 0.0781 0.117 0.071 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 2.37e-01 0.13 0.11 0.071 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 1.81e-02 -0.359 0.151 0.071 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 5.39e-01 0.0522 0.0849 0.071 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 9.39e-01 0.00489 0.0643 0.071 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 9.07e-02 -0.231 0.136 0.071 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 2.16e-01 0.171 0.138 0.071 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 9.80e-02 -0.108 0.0652 0.071 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 9.17e-01 0.0137 0.132 0.071 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 1.41e-01 0.144 0.0972 0.071 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 1.98e-01 0.0849 0.0659 0.071 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 1.28e-01 0.248 0.162 0.071 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 6.38e-02 0.269 0.144 0.071 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00247 0.0869 0.071 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 4.22e-01 0.093 0.116 0.072 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0123 0.104 0.072 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 1.92e-01 -0.213 0.163 0.072 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -67652 sc-eQTL 5.38e-01 0.0826 0.134 0.072 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0134 0.102 0.072 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 2.53e-01 0.17 0.148 0.072 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 4.37e-01 -0.1 0.128 0.072 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 4.59e-01 0.103 0.139 0.072 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -300878 sc-eQTL 5.93e-01 0.0898 0.168 0.072 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0219 0.0962 0.071 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0903 0.0821 0.071 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 8.55e-02 -0.278 0.161 0.071 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -67652 sc-eQTL 3.18e-02 -0.305 0.141 0.071 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 2.67e-01 0.15 0.135 0.071 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 3.44e-01 0.11 0.116 0.071 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 4.35e-01 0.0744 0.0952 0.071 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -300878 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0453 0.115 0.071 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0488 0.106 0.071 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 9.87e-01 -0.000942 0.0564 0.071 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0329 0.164 0.071 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 5.40e-01 0.0917 0.149 0.071 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0601 0.126 0.071 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 7.05e-02 -0.181 0.0994 0.071 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00728 0.084 0.071 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 9.17e-01 0.017 0.163 0.071 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 1.66e-01 0.221 0.159 0.071 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 232832 sc-eQTL 8.40e-01 0.0191 0.0944 0.071 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0385 0.12 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 4.72e-01 0.136 0.189 0.061 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 4.54e-01 0.115 0.153 0.061 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 4.35e-01 -0.145 0.186 0.061 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 5.64e-01 -0.118 0.203 0.061 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 5.75e-01 0.105 0.187 0.061 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 7.36e-01 0.0707 0.209 0.061 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 4.53e-01 -0.114 0.152 0.061 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 1.00e+00 -1.63e-05 0.147 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 5.68e-02 0.158 0.0827 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 8.45e-01 0.03 0.153 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 1.10e-01 0.259 0.162 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 4.68e-01 -0.103 0.142 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 7.22e-02 0.238 0.132 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0641 0.15 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0488 0.16 0.071 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0203 0.095 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 1.05e-02 0.411 0.159 0.071 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 5.85e-02 0.307 0.161 0.071 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 6.89e-01 0.0593 0.148 0.071 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 9.41e-02 0.239 0.142 0.071 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 4.21e-01 0.11 0.136 0.071 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 3.00e-01 -0.13 0.125 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0841 0.0716 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 3.38e-01 -0.159 0.165 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 1.30e-01 0.244 0.161 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 2.00e-01 0.178 0.139 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 4.31e-01 0.0931 0.118 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 1.01e-01 -0.268 0.163 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 2.59e-01 -0.174 0.154 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 6.21e-01 0.0442 0.0894 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 8.26e-01 0.0372 0.169 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 2.64e-01 0.187 0.167 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 8.81e-01 0.0232 0.155 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 8.61e-01 -0.023 0.131 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 3.28e-02 -0.337 0.157 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0519 0.155 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 8.82e-01 0.0204 0.137 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 7.77e-01 0.0486 0.172 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 2.68e-02 0.366 0.164 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0259 0.162 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 4.55e-01 -0.104 0.139 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 4.58e-01 0.0599 0.0806 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 2.80e-01 -0.07 0.0646 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 5.11e-01 -0.1 0.152 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 3.26e-01 0.14 0.142 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 3.47e-02 -0.136 0.0641 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 9.12e-01 0.0158 0.144 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 9.45e-01 0.00768 0.112 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 7.78e-01 0.0199 0.0704 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 3.56e-01 -0.151 0.163 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 3.16e-01 0.147 0.146 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 1.82e-01 -0.122 0.0911 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 6.79e-01 0.0659 0.159 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 5.95e-01 0.0682 0.128 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 4.17e-01 0.0738 0.0907 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 2.23e-01 -0.201 0.165 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 6.75e-02 0.282 0.153 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 1.95e-01 -0.17 0.131 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 5.79e-01 0.0855 0.154 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 6.49e-01 0.055 0.121 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 6.25e-01 0.0394 0.0806 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0643 0.166 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 4.62e-01 0.119 0.161 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 4.59e-01 0.106 0.143 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 2.40e-01 0.134 0.114 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0669 0.0795 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 7.37e-02 0.295 0.164 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 2.65e-01 0.167 0.149 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 5.11e-01 0.0696 0.106 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 9.37e-01 0.0121 0.153 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 9.97e-01 0.000419 0.115 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 6.99e-01 0.0678 0.175 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 2.09e-01 0.212 0.168 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 9.96e-01 0.000831 0.148 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0596 0.143 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 2.90e-01 -0.143 0.135 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 7.30e-01 0.057 0.165 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 7.54e-01 0.0522 0.167 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 1.51e-01 -0.234 0.162 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 1.87e-03 -0.358 0.114 0.069 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0445 0.0966 0.069 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 3.69e-01 -0.142 0.157 0.069 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 1.18e-01 0.261 0.167 0.069 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 232832 sc-eQTL 5.19e-01 0.0841 0.13 0.069 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 7.25e-01 -0.048 0.136 0.069 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0452 0.127 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0388 0.094 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 9.35e-01 0.0135 0.166 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0247 0.155 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 8.82e-01 0.0215 0.144 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0938 0.0976 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 8.12e-01 0.0152 0.0639 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00534 0.169 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 8.14e-01 0.0388 0.165 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0179 0.133 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0734 0.129 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 7.08e-01 0.041 0.109 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 2.07e-01 -0.206 0.163 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00228 0.171 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 7.87e-01 -0.044 0.162 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0572 0.104 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0436 0.0775 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 4.34e-01 0.128 0.163 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 2.05e-01 0.198 0.156 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0943 0.127 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 3.42e-01 -0.225 0.236 0.056 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 5.00e-01 0.138 0.204 0.056 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 8.59e-01 0.0434 0.243 0.056 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 2.56e-01 0.293 0.257 0.056 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 2.61e-01 -0.195 0.173 0.056 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 4.06e-01 0.175 0.209 0.056 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 4.77e-02 -0.346 0.173 0.056 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 3.43e-01 0.122 0.128 0.072 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 7.82e-01 0.037 0.133 0.072 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0693 0.156 0.072 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 3.59e-01 0.152 0.165 0.072 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 232832 sc-eQTL 1.99e-02 -0.252 0.107 0.072 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 5.93e-02 -0.285 0.15 0.072 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 3.77e-01 -0.133 0.15 0.071 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 5.77e-01 0.0541 0.0968 0.071 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 4.01e-01 -0.133 0.158 0.071 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 3.27e-01 0.151 0.154 0.071 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 3.39e-01 0.0988 0.103 0.071 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 3.26e-01 0.143 0.145 0.071 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 2.25e-01 0.161 0.132 0.071 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 9.32e-02 -0.223 0.132 0.071 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 3.90e-01 -0.147 0.171 0.071 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -67652 sc-eQTL 5.76e-01 0.0855 0.152 0.071 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0218 0.156 0.071 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 7.87e-02 0.267 0.151 0.071 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0979 0.134 0.071 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 5.50e-01 0.0824 0.138 0.071 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -300878 sc-eQTL 5.13e-01 0.114 0.175 0.071 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 7.73e-01 -0.026 0.0898 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 2.97e-01 -0.1 0.0961 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 1.02e-01 -0.264 0.161 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -67652 sc-eQTL 4.74e-02 -0.275 0.138 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 3.39e-01 0.134 0.14 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 7.14e-01 0.0502 0.137 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 9.38e-01 0.0078 0.101 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -300878 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0575 0.129 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 4.94e-01 -0.071 0.104 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 5.75e-01 0.0598 0.107 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 9.13e-02 -0.281 0.165 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -67652 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0936 0.155 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 6.11e-01 0.0778 0.153 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 2.69e-01 0.157 0.142 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 2.16e-01 0.155 0.125 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -300878 sc-eQTL 9.71e-01 0.00466 0.129 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0967 0.144 0.091 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0372 0.127 0.091 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 7.37e-01 0.0613 0.182 0.091 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 1.61e-01 0.244 0.173 0.091 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 232832 sc-eQTL 3.65e-01 0.127 0.139 0.091 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 8.37e-01 0.0387 0.187 0.091 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 4.77e-01 0.0773 0.108 0.073 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 2.22e-01 -0.175 0.143 0.073 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 1.02e-01 -0.239 0.145 0.073 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -67652 sc-eQTL 4.83e-01 -0.101 0.144 0.073 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0815 0.156 0.073 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 4.63e-01 -0.105 0.142 0.073 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 1.31e-01 -0.23 0.152 0.073 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -300878 sc-eQTL 3.11e-01 -0.163 0.161 0.073 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0322 0.129 0.075 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 2.87e-01 -0.107 0.1 0.075 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 4.03e-01 -0.134 0.16 0.075 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -67652 sc-eQTL 6.94e-01 0.0558 0.141 0.075 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0123 0.155 0.075 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 8.31e-02 0.232 0.133 0.075 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 4.31e-01 0.117 0.148 0.075 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -300878 sc-eQTL 4.90e-01 0.104 0.151 0.075 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 4.62e-01 0.108 0.146 0.082 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 2.68e-01 0.122 0.109 0.082 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 2.95e-01 -0.169 0.16 0.082 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -67652 sc-eQTL 1.61e-01 -0.157 0.112 0.082 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 4.07e-01 0.102 0.122 0.082 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 2.58e-01 0.173 0.152 0.082 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 2.46e-01 -0.209 0.179 0.082 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 4.32e-01 0.116 0.148 0.082 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -300878 sc-eQTL 1.84e-01 0.22 0.165 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 7.23e-01 0.0463 0.13 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 5.52e-01 0.0436 0.0731 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 9.62e-02 0.249 0.149 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 6.29e-02 0.295 0.158 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0521 0.135 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 2.07e-02 0.28 0.12 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0404 0.155 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 1.36e-01 -0.198 0.132 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 3.76e-01 -0.054 0.0609 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0826 0.162 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 1.40e-01 0.24 0.162 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 2.14e-01 0.168 0.134 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 5.30e-01 0.0701 0.111 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 602225 sc-eQTL 5.30e-03 -0.454 0.161 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0376 0.0906 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0469 0.0843 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 9.36e-02 -0.272 0.162 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -67652 sc-eQTL 6.17e-02 -0.271 0.144 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 2.19e-01 0.167 0.136 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 3.95e-01 0.101 0.119 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 3.91e-01 0.0842 0.0981 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -300878 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0387 0.117 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 8.26e-01 0.0234 0.106 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 8.79e-02 -0.164 0.0955 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 3.71e-01 -0.144 0.16 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -67652 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0629 0.155 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 9.19e-01 -0.015 0.147 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 631466 sc-eQTL 4.81e-01 0.0936 0.133 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0215 0.127 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -300878 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0319 0.151 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -736282 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0912 0.1 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 193316 sc-eQTL 8.60e-01 0.0103 0.0582 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -339397 sc-eQTL 9.61e-01 0.0082 0.169 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 985402 sc-eQTL 2.27e-01 0.186 0.154 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -309310 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0799 0.123 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 \N -67652 5.63e-06 9.44e-06 1.34e-06 5.06e-06 1.66e-06 3.41e-06 9.62e-06 1.69e-06 7.82e-06 4.47e-06 1.04e-05 4.6e-06 1.36e-05 3.95e-06 1.57e-06 5.82e-06 3.74e-06 5.37e-06 2.58e-06 2.65e-06 3.46e-06 7.81e-06 5.84e-06 2.82e-06 1.25e-05 2.32e-06 4.35e-06 3.1e-06 7.59e-06 7.81e-06 4.61e-06 9.54e-07 9.52e-07 2.93e-06 4.46e-06 2.28e-06 1.35e-06 1.14e-06 1.72e-06 1.01e-06 8.36e-07 1.08e-05 8.46e-07 1.59e-07 5.92e-07 1.25e-06 9.61e-07 7.23e-07 4.34e-07
ENSG00000182747 \N -439134 3.92e-07 3.11e-07 1.14e-07 3.62e-07 1.11e-07 1.32e-07 3.42e-07 7.52e-08 2.53e-07 1.65e-07 3.47e-07 2.04e-07 7.02e-07 1.1e-07 1.01e-07 1.46e-07 8.53e-08 2.9e-07 1.7e-07 9.01e-08 1.35e-07 2.48e-07 2.48e-07 1.23e-07 4.88e-07 1.71e-07 1.74e-07 1.7e-07 1.87e-07 4.27e-07 1.88e-07 5.88e-08 5.48e-08 1.52e-07 3.04e-07 9.51e-08 1.13e-07 6.32e-08 6.63e-08 2.22e-08 4.27e-08 4.55e-07 2.16e-08 5.8e-09 5.32e-08 1.42e-08 9.19e-08 1.11e-08 5.76e-08