logo

Genes within 1Mb (chr6:136480896:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 2.99e-01 0.118 0.114 0.111 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 8.73e-01 -0.00813 0.0507 0.111 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 1.78e-01 0.181 0.134 0.111 B L1
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00886 0.142 0.111 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 2.20e-01 0.131 0.106 0.111 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0851 0.1 0.111 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 2.01e-01 0.177 0.138 0.111 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0548 0.0763 0.111 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0338 0.0578 0.111 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 6.74e-02 0.224 0.122 0.111 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0785 0.124 0.111 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 6.74e-01 0.0248 0.0589 0.111 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 1.26e-01 0.182 0.118 0.111 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 9.61e-01 0.00419 0.0861 0.111 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0116 0.0583 0.111 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 3.53e-02 0.301 0.142 0.111 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 1.56e-01 -0.181 0.128 0.111 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 8.98e-01 0.00982 0.0766 0.111 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 7.99e-01 -0.027 0.106 0.11 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 4.83e-02 -0.188 0.0946 0.11 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 5.30e-01 0.0941 0.149 0.11 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -69923 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0292 0.123 0.11 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 8.76e-01 0.0145 0.0932 0.11 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 8.74e-01 0.0217 0.136 0.11 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 4.81e-01 0.0831 0.118 0.11 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 2.98e-01 0.133 0.127 0.11 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -303149 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00984 0.154 0.11 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 1.98e-01 0.113 0.0875 0.111 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 1.74e-01 -0.102 0.0748 0.111 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 4.76e-02 0.292 0.146 0.111 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -69923 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0826 0.13 0.111 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0579 0.123 0.111 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 9.38e-01 0.00822 0.106 0.111 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 1.11e-01 -0.139 0.0865 0.111 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -303149 sc-eQTL 6.35e-01 0.05 0.105 0.111 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 6.12e-02 -0.182 0.0965 0.112 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 7.28e-01 -0.018 0.0516 0.112 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 2.62e-01 -0.168 0.15 0.112 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 1.13e-01 -0.216 0.136 0.112 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 2.16e-01 -0.143 0.116 0.112 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 7.18e-01 0.0326 0.0901 0.111 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0577 0.0755 0.111 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0179 0.147 0.111 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 3.11e-01 -0.146 0.143 0.111 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 230561 sc-eQTL 1.66e-01 0.118 0.0845 0.111 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 6.26e-01 0.0529 0.108 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 1.50e-01 0.211 0.146 0.112 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 8.19e-02 0.207 0.118 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0158 0.144 0.112 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 1.91e-01 0.207 0.157 0.112 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 3.36e-01 0.14 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 7.82e-01 0.045 0.162 0.112 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 3.93e-01 0.101 0.118 0.112 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 1.10e-01 -0.215 0.134 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 8.19e-01 0.0176 0.0769 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 9.90e-01 0.00171 0.141 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 6.58e-01 0.0665 0.15 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 9.24e-01 0.0126 0.131 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 5.90e-01 0.0659 0.122 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 9.35e-01 0.0112 0.138 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 1.51e-01 -0.215 0.149 0.108 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 2.94e-01 0.0934 0.0888 0.108 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 4.66e-01 -0.11 0.151 0.108 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0678 0.152 0.108 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 2.54e-02 0.308 0.137 0.108 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 2.15e-01 -0.166 0.133 0.108 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 3.74e-01 0.114 0.128 0.108 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 8.85e-03 0.303 0.115 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 7.54e-01 0.0209 0.0667 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 6.22e-01 0.0761 0.154 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 2.22e-01 -0.183 0.15 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 3.39e-01 0.124 0.129 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00139 0.11 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 1.92e-01 0.198 0.151 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0891 0.144 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 3.40e-02 -0.176 0.0827 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 5.63e-01 0.0912 0.158 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 5.47e-01 0.0945 0.157 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 2.46e-01 0.168 0.145 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 8.90e-01 -0.017 0.122 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 1.42e-01 0.217 0.147 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0788 0.128 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 3.12e-01 -0.115 0.113 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0112 0.142 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 4.14e-01 -0.113 0.137 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 4.17e-01 -0.109 0.134 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 2.88e-01 -0.123 0.115 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0914 0.0723 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0257 0.0582 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 2.27e-01 0.165 0.137 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0772 0.128 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 6.79e-01 0.0241 0.0582 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 2.25e-01 0.157 0.129 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0358 0.1 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0557 0.0631 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 3.20e-02 0.314 0.145 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0168 0.132 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 6.16e-01 0.0413 0.0821 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 8.39e-01 0.029 0.143 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 3.32e-01 0.111 0.114 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0289 0.0813 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0666 0.148 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 3.21e-01 -0.137 0.138 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0108 0.118 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 4.35e-01 -0.108 0.138 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 7.72e-01 0.0297 0.102 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 2.99e-02 -0.148 0.0675 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 3.35e-02 0.298 0.139 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 3.42e-01 -0.13 0.136 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 6.70e-02 -0.222 0.121 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 8.71e-02 0.176 0.103 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0109 0.0721 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 4.39e-01 0.116 0.149 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 9.72e-01 0.00473 0.135 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 6.68e-02 0.175 0.0949 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 2.27e-01 -0.171 0.141 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 8.00e-01 0.027 0.106 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0654 0.163 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 1.53e-01 -0.224 0.156 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 3.28e-01 0.134 0.137 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0267 0.131 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0419 0.123 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 2.75e-01 -0.164 0.15 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0885 0.152 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 3.86e-01 0.129 0.149 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 7.27e-01 0.0362 0.104 0.113 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 8.97e-01 0.0112 0.0862 0.113 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 7.90e-01 0.0376 0.141 0.113 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 8.04e-01 0.0371 0.149 0.113 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 230561 sc-eQTL 4.26e-01 0.0926 0.116 0.113 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 4.29e-01 0.0961 0.121 0.113 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0647 0.116 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 4.30e-01 0.0674 0.0853 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 2.92e-01 -0.159 0.151 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0821 0.141 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 6.58e-01 -0.058 0.131 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 1.35e-01 -0.136 0.0904 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000595 0.0594 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 9.19e-01 -0.016 0.157 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 6.18e-02 -0.286 0.152 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0743 0.123 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0191 0.113 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 4.08e-02 -0.195 0.0946 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 2.59e-01 -0.162 0.143 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 2.35e-01 -0.178 0.149 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0563 0.142 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0595 0.0956 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0485 0.0713 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 7.33e-01 0.0512 0.15 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 2.26e-01 -0.174 0.143 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 2.42e-01 -0.137 0.117 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 2.92e-01 -0.18 0.17 0.119 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 1.00e-02 -0.374 0.143 0.119 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 4.25e-01 0.14 0.175 0.119 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0631 0.186 0.119 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 9.42e-01 0.00919 0.125 0.119 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 5.21e-01 -0.097 0.151 0.119 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 7.29e-01 0.0439 0.126 0.119 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 4.06e-01 0.0954 0.114 0.113 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0202 0.119 0.113 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 2.54e-02 -0.31 0.138 0.113 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 1.08e-01 -0.237 0.146 0.113 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 230561 sc-eQTL 7.74e-02 0.171 0.0961 0.113 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 1.52e-01 -0.194 0.135 0.113 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 8.40e-01 0.0284 0.141 0.111 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 9.62e-01 0.00437 0.0909 0.111 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0759 0.149 0.111 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00214 0.145 0.111 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 6.79e-01 0.0402 0.0969 0.111 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 3.92e-01 0.117 0.136 0.111 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 9.13e-01 0.013 0.119 0.112 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 1.58e-01 -0.168 0.119 0.112 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 2.13e-01 0.191 0.153 0.112 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -69923 sc-eQTL 6.35e-01 0.0649 0.137 0.112 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 6.33e-01 0.0667 0.139 0.112 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 5.16e-01 0.0885 0.136 0.112 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0468 0.12 0.112 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 1.06e-02 0.313 0.121 0.112 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -303149 sc-eQTL 7.36e-01 0.0528 0.157 0.112 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 1.85e-01 0.109 0.0822 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0711 0.0884 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 1.70e-01 0.203 0.148 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -69923 sc-eQTL 8.91e-01 0.0175 0.128 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 3.11e-01 -0.131 0.129 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 2.41e-01 -0.147 0.125 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 1.44e-01 -0.135 0.0919 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -303149 sc-eQTL 1.15e-01 0.187 0.118 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 1.77e-01 0.127 0.0941 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 2.22e-01 -0.118 0.0967 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0869 0.152 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -69923 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0897 0.141 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 8.50e-01 0.0263 0.139 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0528 0.13 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 9.25e-01 0.0107 0.114 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -303149 sc-eQTL 9.87e-01 0.00186 0.118 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0917 0.143 0.103 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 4.21e-02 -0.255 0.124 0.103 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 1.60e-02 0.434 0.178 0.103 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 5.40e-01 0.106 0.173 0.103 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 230561 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00576 0.139 0.103 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00607 0.187 0.103 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00235 0.102 0.111 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 8.03e-02 -0.235 0.133 0.111 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 2.40e-01 0.161 0.137 0.111 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -69923 sc-eQTL 4.78e-01 0.0958 0.135 0.111 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 3.29e-01 0.143 0.146 0.111 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 5.27e-01 0.0844 0.133 0.111 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0837 0.143 0.111 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -303149 sc-eQTL 6.61e-01 0.0663 0.151 0.111 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 6.39e-01 0.0563 0.12 0.109 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 7.28e-01 0.0323 0.093 0.109 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 1.23e-01 0.229 0.147 0.109 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -69923 sc-eQTL 2.13e-01 -0.163 0.13 0.109 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 5.06e-01 0.0956 0.143 0.109 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 5.31e-01 0.078 0.124 0.109 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 5.68e-02 -0.261 0.136 0.109 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -303149 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0491 0.14 0.109 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 2.37e-01 -0.185 0.156 0.096 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 2.94e-01 -0.123 0.117 0.096 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 8.03e-01 0.0432 0.173 0.096 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -69923 sc-eQTL 4.46e-02 -0.241 0.119 0.096 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 1.04e-01 -0.213 0.13 0.096 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 3.25e-01 -0.161 0.163 0.096 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 2.46e-01 0.224 0.192 0.096 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 4.63e-01 0.117 0.158 0.096 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -303149 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0224 0.178 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0869 0.118 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 1.97e-01 0.0853 0.0659 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00778 0.136 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0522 0.144 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 3.22e-01 0.121 0.122 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0363 0.11 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 7.70e-01 -0.041 0.14 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 2.89e-02 0.267 0.121 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 3.95e-01 -0.048 0.0563 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 5.20e-01 0.0961 0.149 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0994 0.151 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 1.56e-01 0.177 0.124 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 9.60e-01 0.00512 0.103 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 599954 sc-eQTL 4.99e-02 0.297 0.15 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 2.10e-01 0.104 0.0823 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0774 0.0767 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 4.78e-01 0.105 0.148 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -69923 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0587 0.133 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0826 0.124 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0899 0.108 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 1.14e-01 -0.142 0.0891 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -303149 sc-eQTL 4.87e-01 0.0742 0.106 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 5.43e-01 0.0593 0.0973 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 5.32e-01 -0.055 0.0879 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 1.61e-01 0.206 0.146 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -69923 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0183 0.142 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0345 0.135 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 629195 sc-eQTL 2.53e-01 0.139 0.121 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 2.88e-01 -0.124 0.116 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -303149 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0242 0.138 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -738553 sc-eQTL 1.13e-01 -0.146 0.0916 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 191045 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0366 0.0534 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -341668 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0806 0.155 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 983131 sc-eQTL 5.55e-02 -0.27 0.14 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -311581 sc-eQTL 2.47e-01 -0.131 0.113 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 \N -69923 9.93e-06 1.18e-05 1.3e-06 6.11e-06 2.36e-06 4.19e-06 1.03e-05 1.92e-06 9.65e-06 4.97e-06 1.24e-05 5.31e-06 1.46e-05 3.53e-06 2.59e-06 6.34e-06 4.26e-06 7.77e-06 2.64e-06 2.78e-06 5.18e-06 9.86e-06 7.38e-06 2.82e-06 1.39e-05 3.68e-06 4.82e-06 4.08e-06 9.22e-06 7.86e-06 5.38e-06 1.01e-06 1.14e-06 2.89e-06 4.54e-06 2.07e-06 1.65e-06 1.85e-06 1.63e-06 1.02e-06 8.13e-07 1.41e-05 1.45e-06 1.9e-07 6.87e-07 1.48e-06 1.4e-06 6.87e-07 4.77e-07