logo

Genes within 1Mb (chr6:136461295:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0676 0.125 0.085 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 8.80e-01 0.00841 0.0557 0.085 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 4.18e-01 -0.12 0.148 0.085 B L1
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0731 0.157 0.085 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 4.47e-01 -0.089 0.117 0.085 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0844 0.11 0.085 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 8.94e-01 0.0202 0.152 0.085 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 9.14e-02 0.141 0.083 0.085 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 8.95e-01 0.00833 0.0632 0.085 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 5.57e-01 -0.079 0.134 0.085 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0682 0.136 0.085 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0584 0.0643 0.085 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0987 0.13 0.085 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 1.44e-01 0.14 0.0958 0.085 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0715 0.0649 0.085 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 2.06e-01 0.203 0.16 0.085 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0125 0.143 0.085 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0923 0.0854 0.085 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 2.13e-02 0.262 0.113 0.09 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0572 0.103 0.09 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0404 0.161 0.09 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -89524 sc-eQTL 6.14e-01 0.0669 0.132 0.09 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0309 0.101 0.09 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 2.07e-01 -0.185 0.146 0.09 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 9.45e-01 0.00882 0.127 0.09 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 3.37e-01 -0.132 0.137 0.09 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -322750 sc-eQTL 7.85e-01 0.0454 0.166 0.09 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 4.91e-01 0.0676 0.098 0.085 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 1.33e-01 0.126 0.0834 0.085 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 3.31e-01 -0.161 0.165 0.085 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -89524 sc-eQTL 6.24e-01 0.0714 0.146 0.085 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 2.72e-01 -0.151 0.137 0.085 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 8.51e-01 0.0223 0.118 0.085 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0189 0.0971 0.085 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -322750 sc-eQTL 3.04e-01 0.121 0.117 0.085 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 2.49e-02 0.24 0.106 0.086 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 8.93e-01 0.00766 0.057 0.086 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0319 0.166 0.086 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 7.90e-01 0.0403 0.151 0.086 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 6.51e-01 -0.058 0.128 0.086 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 1.97e-02 0.232 0.0987 0.085 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0334 0.0838 0.085 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 9.81e-01 0.00393 0.163 0.085 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0804 0.159 0.085 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 210960 sc-eQTL 8.39e-01 0.0192 0.0942 0.085 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0706 0.12 0.085 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 3.90e-01 -0.148 0.172 0.079 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0741 0.14 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 4.01e-01 0.143 0.169 0.079 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0403 0.186 0.079 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 5.70e-01 0.0971 0.171 0.079 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0819 0.191 0.079 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 4.22e-01 0.112 0.139 0.079 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 8.15e-01 0.0348 0.149 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0124 0.0847 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 1.10e-02 -0.394 0.153 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00576 0.165 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 4.11e-01 -0.119 0.145 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0453 0.135 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 8.61e-01 0.0267 0.152 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 9.21e-02 -0.272 0.161 0.086 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0485 0.0961 0.086 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 1.90e-01 0.214 0.163 0.086 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 4.28e-01 0.131 0.164 0.086 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 8.30e-01 0.0322 0.149 0.086 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 5.67e-01 0.0828 0.144 0.086 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 2.94e-01 -0.145 0.138 0.086 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 7.56e-01 0.0398 0.128 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 3.36e-01 0.0701 0.0727 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 2.49e-01 0.194 0.168 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0839 0.164 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 6.89e-02 -0.257 0.14 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 4.04e-01 -0.1 0.12 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 3.02e-01 -0.172 0.166 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0742 0.158 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0636 0.0914 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 5.18e-01 -0.112 0.173 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 6.21e-01 0.0849 0.172 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 6.18e-01 0.0794 0.159 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 5.02e-01 -0.09 0.134 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 8.11e-01 0.0389 0.162 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 1.34e-01 0.217 0.144 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 3.83e-01 -0.112 0.128 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0856 0.161 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 1.64e-01 -0.216 0.155 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 2.55e-01 -0.173 0.151 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0348 0.131 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 2.19e-01 0.0971 0.0787 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 8.46e-01 0.0124 0.0634 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0908 0.149 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0349 0.14 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 8.43e-01 0.0126 0.0634 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0892 0.141 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 1.36e-01 0.164 0.11 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00911 0.0697 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 1.56e-01 -0.23 0.161 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 5.63e-01 -0.084 0.145 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 1.54e-01 -0.129 0.0902 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 9.59e-01 0.00805 0.157 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 8.93e-01 0.017 0.126 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 2.05e-01 -0.113 0.0888 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 3.85e-01 -0.141 0.162 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 4.17e-01 -0.123 0.151 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00885 0.129 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0576 0.151 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 2.85e-01 0.124 0.116 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0186 0.0774 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 7.36e-01 0.054 0.16 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 8.53e-01 0.0286 0.155 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0851 0.138 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 3.81e-01 0.0984 0.112 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0674 0.0782 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 2.26e-01 0.197 0.162 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 3.84e-01 -0.128 0.147 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 1.12e-01 -0.165 0.103 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 7.50e-01 0.0469 0.147 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0601 0.11 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 7.92e-01 0.0445 0.168 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 5.53e-01 0.0964 0.162 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 2.02e-01 -0.181 0.141 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 1.37e-01 0.219 0.147 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 4.68e-01 -0.101 0.139 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 5.32e-02 0.328 0.168 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 2.14e-01 -0.214 0.171 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0393 0.169 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 1.41e-01 0.171 0.116 0.084 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 7.80e-01 0.027 0.0965 0.084 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 4.81e-01 0.111 0.157 0.084 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 3.07e-01 -0.171 0.167 0.084 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 210960 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0418 0.13 0.084 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 1.04e-01 -0.221 0.135 0.084 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 7.67e-01 0.0376 0.127 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0567 0.0934 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 2.73e-01 0.181 0.165 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 3.22e-01 0.153 0.154 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 9.42e-01 0.0104 0.143 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 5.83e-02 0.187 0.098 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00494 0.0646 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0711 0.17 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 4.54e-01 -0.125 0.167 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0991 0.134 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 1.69e-02 0.303 0.126 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0111 0.108 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 2.27e-01 0.195 0.161 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 4.08e-01 -0.14 0.169 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0585 0.161 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 1.70e-02 0.245 0.102 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 9.21e-01 0.00765 0.077 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 7.07e-02 -0.292 0.161 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 8.33e-01 0.0327 0.155 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 9.96e-01 0.000568 0.127 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0921 0.21 0.081 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 3.79e-01 -0.16 0.181 0.081 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0988 0.215 0.081 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 5.91e-01 0.123 0.228 0.081 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 6.35e-01 0.0732 0.154 0.081 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0834 0.186 0.081 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 1.12e-01 -0.246 0.154 0.081 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 3.92e-01 0.111 0.13 0.083 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0799 0.134 0.083 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 4.60e-01 -0.117 0.157 0.083 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 5.46e-01 0.101 0.167 0.083 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 210960 sc-eQTL 6.89e-01 0.0439 0.11 0.083 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 1.70e-01 0.21 0.152 0.083 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 4.58e-01 0.112 0.151 0.085 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00756 0.0974 0.085 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 1.17e-01 0.249 0.158 0.085 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0501 0.155 0.085 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0931 0.104 0.085 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 4.80e-01 -0.103 0.146 0.085 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 4.18e-02 0.262 0.128 0.088 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000843 0.13 0.088 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 7.32e-01 0.0574 0.167 0.088 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -89524 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0457 0.149 0.088 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0778 0.152 0.088 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 1.30e-01 -0.224 0.147 0.088 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 5.74e-01 0.0738 0.131 0.088 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 2.98e-01 -0.14 0.134 0.088 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -322750 sc-eQTL 4.67e-01 0.124 0.17 0.088 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 6.11e-01 0.0463 0.0909 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 8.10e-02 0.17 0.0969 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 6.91e-01 0.0651 0.164 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -89524 sc-eQTL 4.16e-01 -0.115 0.141 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0952 0.142 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0334 0.138 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 1.10e-01 -0.162 0.101 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -322750 sc-eQTL 6.77e-01 0.0547 0.131 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 4.65e-01 0.0769 0.105 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 5.79e-01 0.06 0.108 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 1.76e-01 -0.228 0.168 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -89524 sc-eQTL 2.29e-01 0.189 0.157 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 3.88e-01 -0.134 0.155 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 3.54e-01 0.134 0.144 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 4.79e-01 0.09 0.127 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -322750 sc-eQTL 5.33e-01 0.0818 0.131 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 1.03e-02 0.379 0.146 0.094 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0235 0.131 0.094 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0689 0.189 0.094 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0468 0.18 0.094 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 210960 sc-eQTL 7.88e-01 -0.039 0.145 0.094 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 3.14e-01 -0.195 0.193 0.094 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0475 0.11 0.089 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 4.24e-01 0.116 0.145 0.089 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 6.40e-01 0.0692 0.148 0.089 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -89524 sc-eQTL 1.83e-01 -0.193 0.145 0.089 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 8.67e-01 0.0263 0.158 0.089 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 9.07e-01 0.0169 0.144 0.089 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 1.20e-01 0.239 0.153 0.089 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -322750 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0434 0.163 0.089 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0475 0.132 0.088 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0217 0.103 0.088 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00215 0.164 0.088 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -89524 sc-eQTL 6.27e-01 0.0702 0.144 0.088 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 6.01e-01 -0.083 0.158 0.088 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00903 0.137 0.088 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0449 0.152 0.088 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -322750 sc-eQTL 1.69e-01 0.212 0.153 0.088 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 3.33e-02 0.303 0.141 0.096 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 9.07e-02 -0.181 0.106 0.096 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0237 0.158 0.096 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -89524 sc-eQTL 5.90e-01 0.0593 0.11 0.096 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 8.75e-01 0.0189 0.12 0.096 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 6.37e-01 0.0706 0.149 0.096 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 3.75e-01 -0.156 0.176 0.096 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 4.26e-01 -0.115 0.145 0.096 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -322750 sc-eQTL 3.60e-01 -0.149 0.162 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 4.41e-01 -0.102 0.132 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00946 0.0742 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0363 0.152 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 8.69e-01 0.0266 0.162 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0697 0.137 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0217 0.123 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 6.61e-01 0.069 0.157 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00604 0.135 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 4.92e-01 0.0428 0.0621 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 5.90e-01 0.0888 0.164 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0354 0.166 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 1.70e-01 -0.189 0.137 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0992 0.113 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 580353 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0923 0.167 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 4.36e-01 0.0716 0.0917 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 4.69e-02 0.169 0.0846 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0357 0.165 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -89524 sc-eQTL 7.79e-01 0.0414 0.147 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 3.84e-01 -0.12 0.138 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 7.59e-01 0.037 0.121 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0663 0.0994 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -322750 sc-eQTL 3.75e-01 0.105 0.118 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0561 0.108 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 5.80e-01 0.0539 0.0971 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 8.58e-01 -0.029 0.162 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -89524 sc-eQTL 8.93e-01 0.0211 0.157 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0474 0.149 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 609594 sc-eQTL 9.84e-01 0.00271 0.134 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 7.80e-01 0.0361 0.129 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -322750 sc-eQTL 5.34e-01 0.0952 0.153 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -758154 sc-eQTL 2.92e-02 0.22 0.1 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 171444 sc-eQTL 9.71e-01 0.00212 0.0588 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -361269 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0836 0.171 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 963530 sc-eQTL 8.86e-01 0.0224 0.156 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -331182 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0464 0.125 0.086 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135525 MAP7 -89524 eQTL 0.00159 -0.144 0.0453 0.0 0.0 0.0677
ENSG00000182747 SLC35D3 -461006 eQTL 0.0373 0.125 0.0599 0.0 0.0 0.0677

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 MAP7 -89524 1.1e-05 1.25e-05 3.46e-06 9.42e-06 2.36e-06 5e-06 1.95e-05 2.16e-06 1.27e-05 6.24e-06 1.66e-05 6.83e-06 2.17e-05 5.16e-06 4.39e-06 9.37e-06 6.29e-06 1.21e-05 3.77e-06 4.14e-06 7.27e-06 1.35e-05 1.33e-05 5.15e-06 2.11e-05 4.73e-06 7.15e-06 6.92e-06 1.42e-05 9.42e-06 7.58e-06 1.24e-06 1.46e-06 4.01e-06 6.02e-06 4.06e-06 1.91e-06 2.2e-06 2.83e-06 2.38e-06 1.63e-06 2e-05 2.67e-06 2.5e-07 1.35e-06 2.75e-06 2.18e-06 1.02e-06 1.01e-06
ENSG00000182747 SLC35D3 -461006 3.77e-07 2.67e-07 1.63e-07 3.61e-07 1.02e-07 1.5e-07 4.09e-07 7.56e-08 2.53e-07 2.26e-07 3.92e-07 3.27e-07 8.6e-07 1.01e-07 1.48e-07 1.61e-07 8.74e-08 3.73e-07 2.25e-07 1.51e-07 1.92e-07 3.87e-07 3.02e-07 1.44e-07 3.98e-07 2.07e-07 1.39e-07 2.19e-07 2.4e-07 2.75e-07 1.78e-07 1.87e-07 5.3e-08 2.35e-07 1.97e-07 2.58e-07 3.12e-07 7.66e-08 8.43e-08 4.12e-08 1.22e-07 4.04e-07 5.51e-08 1.93e-08 6.59e-08 3.54e-08 1.3e-07 7.74e-08 1.09e-07