logo

Genes within 1Mb (chr6:136453863:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0353 0.0888 0.162 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 6.63e-01 0.0172 0.0395 0.162 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0296 0.105 0.162 B L1
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0954 0.111 0.162 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 1.60e-01 0.117 0.0827 0.162 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 1.51e-01 -0.112 0.0777 0.162 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0326 0.108 0.162 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0308 0.0596 0.162 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00153 0.0451 0.162 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 8.85e-01 0.014 0.0961 0.162 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00262 0.0972 0.162 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0296 0.046 0.162 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 6.13e-01 0.0469 0.0927 0.162 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 6.24e-01 0.0333 0.0677 0.162 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0241 0.0458 0.162 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 6.77e-01 0.0471 0.113 0.162 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 6.77e-01 -0.042 0.101 0.162 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0562 0.0601 0.162 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0325 0.0825 0.155 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 9.61e-01 0.00368 0.0742 0.155 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 8.73e-01 0.0185 0.116 0.155 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -96956 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0332 0.0954 0.155 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 8.43e-01 0.0143 0.0724 0.155 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 4.55e-02 0.211 0.105 0.155 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0154 0.0915 0.155 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 1.77e-01 -0.134 0.0988 0.155 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -330182 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0708 0.119 0.155 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 5.85e-01 0.0375 0.0685 0.162 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 7.61e-01 0.0179 0.0586 0.162 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 4.04e-01 0.0962 0.115 0.162 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -96956 sc-eQTL 4.85e-01 0.0711 0.102 0.162 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 2.61e-01 -0.108 0.0958 0.162 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 2.31e-01 0.0992 0.0825 0.162 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 3.89e-01 0.0586 0.0678 0.162 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -330182 sc-eQTL 9.42e-01 0.00596 0.0822 0.162 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 2.84e-01 0.0805 0.075 0.163 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 6.16e-02 0.0744 0.0396 0.163 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 4.56e-02 0.231 0.115 0.163 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 1.29e-01 0.16 0.105 0.163 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 5.63e-01 0.0519 0.0896 0.163 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0275 0.0712 0.162 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0339 0.0597 0.162 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0667 0.116 0.162 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 4.89e-01 0.0787 0.113 0.162 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 203528 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0511 0.0671 0.162 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 9.79e-01 0.0023 0.0856 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 8.69e-01 0.0193 0.117 0.163 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0984 0.0947 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 1.51e-01 0.165 0.114 0.163 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0693 0.126 0.163 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 3.03e-01 0.119 0.115 0.163 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 3.13e-01 0.13 0.129 0.163 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 2.56e-01 -0.107 0.0938 0.163 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 3.01e-02 0.232 0.106 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 4.73e-01 0.0439 0.0612 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 4.76e-01 0.0804 0.112 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 3.49e-01 -0.112 0.119 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 6.95e-01 -0.041 0.105 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0752 0.0972 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 5.57e-01 0.0647 0.11 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 6.89e-01 0.0469 0.117 0.159 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0489 0.0693 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 1.85e-01 -0.156 0.118 0.159 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 5.74e-01 0.067 0.119 0.159 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 6.31e-01 0.0519 0.108 0.159 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 1.07e-01 -0.168 0.104 0.159 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 9.03e-01 0.0122 0.0999 0.159 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 1.53e-01 -0.127 0.0883 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 7.29e-01 0.0176 0.0507 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0655 0.117 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0825 0.114 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 2.11e-01 0.123 0.098 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0204 0.0834 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0784 0.115 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0502 0.109 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 1.33e-01 0.0949 0.0629 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0986 0.119 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 4.79e-01 -0.084 0.118 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 2.17e-01 0.135 0.109 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 2.10e-01 -0.116 0.0921 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 1.81e-01 -0.15 0.112 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 7.52e-01 0.0321 0.101 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00149 0.09 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 7.56e-01 -0.035 0.112 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 2.03e-01 0.139 0.108 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 5.99e-01 0.0559 0.106 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 7.37e-01 0.0307 0.0915 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 8.22e-01 0.0128 0.0569 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0059 0.0457 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0466 0.107 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 9.75e-01 0.00319 0.101 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 1.28e-01 -0.0694 0.0454 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 9.29e-01 0.00908 0.101 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0381 0.0787 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 3.86e-01 0.0431 0.0496 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 6.04e-02 0.216 0.115 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0354 0.104 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 5.59e-01 0.0378 0.0646 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 9.28e-01 0.0102 0.112 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0551 0.089 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0453 0.0631 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0418 0.115 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0414 0.107 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00354 0.0914 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 8.44e-02 0.184 0.106 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 1.01e-01 0.132 0.0803 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 6.06e-01 0.0278 0.0538 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 6.83e-01 0.0454 0.111 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0695 0.108 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 8.27e-01 0.021 0.096 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 1.68e-01 -0.111 0.0803 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 8.64e-01 0.00968 0.0563 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0127 0.117 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00242 0.106 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0138 0.0747 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 3.28e-01 0.103 0.105 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 2.46e-01 0.092 0.079 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 2.15e-01 -0.15 0.121 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0148 0.117 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 5.15e-01 0.0665 0.102 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 7.06e-01 0.0387 0.103 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 5.70e-01 0.0551 0.0968 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 2.54e-01 0.135 0.118 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 2.94e-01 0.125 0.119 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 3.14e-01 -0.118 0.117 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000247 0.0811 0.162 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0663 0.0672 0.162 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 2.17e-01 -0.136 0.11 0.162 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0906 0.117 0.162 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 203528 sc-eQTL 5.26e-01 0.0577 0.0908 0.162 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 4.70e-01 0.0686 0.0949 0.162 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 6.50e-01 0.0413 0.091 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 8.15e-01 0.0158 0.0671 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 4.46e-01 0.0905 0.118 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 2.49e-01 0.127 0.11 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0664 0.103 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 2.87e-01 0.0738 0.0692 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 1.71e-02 0.107 0.0447 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 6.11e-02 0.223 0.118 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 9.50e-02 0.195 0.116 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 3.07e-01 0.0959 0.0938 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 3.59e-01 0.0834 0.0907 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 5.06e-01 0.0512 0.0769 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 7.77e-01 0.0327 0.115 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 2.23e-02 0.274 0.119 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 8.17e-01 0.0265 0.114 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 4.95e-01 0.0501 0.0734 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 6.49e-02 0.101 0.0544 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 5.56e-01 0.0679 0.115 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 8.52e-01 0.0206 0.111 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000959 0.0901 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 5.98e-01 0.0749 0.142 0.178 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 2.03e-01 0.155 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 5.55e-01 0.0861 0.145 0.178 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 1.11e-01 -0.245 0.153 0.178 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 5.81e-01 0.0575 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 5.35e-01 -0.078 0.125 0.178 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 3.38e-01 0.101 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0279 0.0921 0.157 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 5.94e-01 0.051 0.0955 0.157 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 2.14e-01 0.139 0.112 0.157 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 3.60e-01 -0.108 0.118 0.157 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 203528 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0435 0.0778 0.157 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0847 0.109 0.157 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00597 0.108 0.162 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 7.08e-01 0.0261 0.0695 0.162 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 2.71e-01 0.125 0.113 0.162 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0345 0.111 0.162 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0157 0.0741 0.162 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 6.24e-01 0.0511 0.104 0.162 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0288 0.0913 0.161 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 4.66e-01 0.0671 0.0919 0.161 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0468 0.118 0.161 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -96956 sc-eQTL 6.83e-01 -0.043 0.105 0.161 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 1.02e-01 0.175 0.106 0.161 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 9.72e-02 0.173 0.104 0.161 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 8.14e-01 0.0218 0.0926 0.161 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0437 0.095 0.161 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -330182 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0784 0.12 0.161 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 5.04e-01 0.0427 0.0637 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 2.13e-01 0.085 0.0681 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 7.87e-01 0.031 0.115 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -96956 sc-eQTL 7.82e-01 0.0274 0.0988 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0907 0.0993 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 1.36e-01 0.144 0.0965 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 8.34e-02 0.123 0.0708 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -330182 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00132 0.0917 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00981 0.0735 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0391 0.0754 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 4.96e-01 0.0802 0.118 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -96956 sc-eQTL 8.18e-01 0.0253 0.11 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00856 0.108 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 8.08e-01 0.0245 0.101 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0259 0.0887 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -330182 sc-eQTL 5.88e-01 0.0496 0.0914 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 8.33e-01 0.0234 0.111 0.161 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0704 0.0978 0.161 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00224 0.141 0.161 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 1.54e-01 -0.191 0.134 0.161 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 203528 sc-eQTL 3.54e-01 -0.1 0.108 0.161 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 4.10e-01 -0.119 0.144 0.161 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 9.39e-01 -0.006 0.0786 0.16 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 6.57e-01 0.0461 0.104 0.16 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 6.06e-01 0.0547 0.106 0.16 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -96956 sc-eQTL 4.20e-01 0.0841 0.104 0.16 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 7.03e-01 0.0431 0.113 0.16 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0398 0.103 0.16 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 2.64e-01 -0.123 0.11 0.16 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -330182 sc-eQTL 1.25e-01 -0.179 0.116 0.16 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0925 0.0921 0.161 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 6.33e-01 0.0342 0.0717 0.161 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 4.99e-01 0.0773 0.114 0.161 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -96956 sc-eQTL 3.01e-01 0.104 0.101 0.161 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00695 0.111 0.161 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 9.86e-02 0.158 0.0952 0.161 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 8.65e-01 0.018 0.106 0.161 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -330182 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0571 0.108 0.161 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0872 0.107 0.155 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 8.82e-01 0.012 0.0805 0.155 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00713 0.118 0.155 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -96956 sc-eQTL 3.05e-01 0.0847 0.0823 0.155 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0251 0.0899 0.155 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 5.90e-01 0.0606 0.112 0.155 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 8.45e-01 0.0259 0.132 0.155 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 1.94e-01 -0.141 0.108 0.155 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -330182 sc-eQTL 7.09e-01 0.0455 0.122 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 1.45e-01 0.137 0.0938 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0195 0.0529 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0891 0.108 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 2.94e-01 -0.121 0.115 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00378 0.0974 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0916 0.0878 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 8.37e-01 0.023 0.112 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 1.32e-01 -0.141 0.0932 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 3.44e-01 0.0408 0.043 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0908 0.114 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 4.35e-01 -0.09 0.115 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 1.68e-01 0.131 0.0948 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 1.61e-01 -0.11 0.0783 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 572921 sc-eQTL 1.93e-01 -0.151 0.115 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 5.28e-01 0.0404 0.0639 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 6.78e-01 0.0247 0.0595 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 4.35e-01 0.0897 0.115 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -96956 sc-eQTL 5.20e-01 0.0661 0.103 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0966 0.096 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 3.32e-01 0.0815 0.0839 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 2.57e-01 0.0785 0.0691 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -330182 sc-eQTL 6.66e-01 0.0357 0.0825 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0152 0.0763 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 8.17e-01 0.0159 0.069 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 2.01e-01 0.147 0.115 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -96956 sc-eQTL 1.48e-01 0.161 0.111 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 6.85e-01 0.0428 0.105 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 602162 sc-eQTL 1.61e-01 0.134 0.0948 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0405 0.0914 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -330182 sc-eQTL 4.34e-01 -0.085 0.108 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -765586 sc-eQTL 2.30e-01 0.085 0.0707 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 164012 sc-eQTL 2.73e-02 0.0905 0.0407 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -368701 sc-eQTL 5.11e-02 0.233 0.119 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 956098 sc-eQTL 1.47e-01 0.158 0.108 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 sc-eQTL 2.75e-01 0.0954 0.0871 0.164 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112357 PEX7 -368701 eQTL 0.0282 0.0756 0.0344 0.0 0.0 0.174
ENSG00000146410 MTFR2 203539 eQTL 0.000331 0.103 0.0287 0.0 0.0 0.174
ENSG00000182747 SLC35D3 -468438 eQTL 7.45e-06 -0.182 0.0404 0.0 0.0 0.174
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 eQTL 0.000711 0.0544 0.016 0.00217 0.00116 0.174

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 \N -96956 5.87e-06 6.47e-06 9.56e-07 3.67e-06 1.84e-06 1.92e-06 8.99e-06 1.44e-06 5.24e-06 3.4e-06 8.58e-06 3e-06 1.11e-05 2.82e-06 1.37e-06 4.59e-06 3.19e-06 3.81e-06 2.19e-06 2.44e-06 3.32e-06 7.56e-06 5.31e-06 2.42e-06 9.55e-06 2.46e-06 3.44e-06 2.27e-06 6.94e-06 7.69e-06 3.74e-06 5.5e-07 9.22e-07 2.77e-06 2.42e-06 2.07e-06 1.41e-06 1.09e-06 1.38e-06 1.04e-06 1.04e-06 8.1e-06 8.79e-07 1.47e-07 6.97e-07 9.43e-07 9.45e-07 6.09e-07 5.88e-07
ENSG00000182747 SLC35D3 -468438 1.13e-06 6.78e-07 1.6e-07 4.27e-07 9.61e-08 2.67e-07 6.23e-07 2.26e-07 7.56e-07 3.22e-07 1.07e-06 5.22e-07 1.05e-06 1.59e-07 3.27e-07 3.68e-07 5.41e-07 4.4e-07 2.79e-07 1.78e-07 2.5e-07 5.34e-07 4.4e-07 2.65e-07 1.22e-06 2.52e-07 4.27e-07 3.78e-07 5.7e-07 7.36e-07 4.08e-07 6.31e-08 4.83e-08 2.1e-07 3.5e-07 1.54e-07 1.23e-07 1.11e-07 7.63e-08 1.56e-08 1.03e-07 7.53e-07 4.65e-08 2.02e-08 1.61e-07 1.5e-08 1.1e-07 1.26e-08 6.46e-08
ENSG00000197442 MAP3K5 -338614 1.24e-06 9.33e-07 3.28e-07 7.35e-07 3.46e-07 4.76e-07 1.52e-06 3.85e-07 1.49e-06 4.65e-07 1.79e-06 6.45e-07 2.19e-06 3e-07 5.35e-07 9.13e-07 8.19e-07 7.19e-07 7.73e-07 6.82e-07 6.13e-07 1.56e-06 9.01e-07 6.4e-07 2.23e-06 5.38e-07 8.36e-07 7.03e-07 1.43e-06 1.27e-06 6.68e-07 1.57e-07 2.08e-07 6.95e-07 5.32e-07 4.53e-07 5.1e-07 1.69e-07 3.6e-07 2.93e-07 2.57e-07 1.46e-06 5e-08 4.12e-08 1.54e-07 1.26e-07 2.3e-07 7.81e-08 1.13e-07