Genes within 1Mb (chr6:136416227:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 5.47e-01 0.0738 0.122 0.09 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0286 0.0544 0.09 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0437 0.145 0.09 B L1
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 4.82e-01 -0.108 0.153 0.09 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 9.82e-01 0.00255 0.114 0.09 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 8.80e-01 0.0163 0.108 0.09 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0658 0.148 0.09 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 1.38e-01 0.12 0.0804 0.09 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 6.74e-01 0.0257 0.0611 0.09 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0492 0.13 0.09 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 4.37e-01 -0.102 0.132 0.09 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0551 0.0622 0.09 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 4.12e-01 -0.103 0.125 0.09 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 3.49e-01 0.0873 0.0931 0.09 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0262 0.0631 0.09 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 2.97e-01 0.162 0.155 0.09 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 3.82e-01 -0.121 0.139 0.09 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0807 0.0828 0.09 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 3.10e-01 0.113 0.111 0.095 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 2.48e-01 -0.115 0.0995 0.095 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 8.13e-01 -0.037 0.156 0.095 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -134592 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0181 0.128 0.095 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0857 0.0972 0.095 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0704 0.142 0.095 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 7.89e-01 0.0329 0.123 0.095 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0922 0.133 0.095 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -367818 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00756 0.161 0.095 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 8.84e-01 0.014 0.0956 0.09 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 7.11e-01 0.0303 0.0817 0.09 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 1.40e-01 -0.237 0.16 0.09 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -134592 sc-eQTL 4.33e-01 0.111 0.142 0.09 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0753 0.134 0.09 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 7.97e-01 0.0297 0.115 0.09 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 8.31e-01 0.0202 0.0946 0.09 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -367818 sc-eQTL 3.42e-01 0.109 0.114 0.09 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 8.32e-02 0.179 0.103 0.09 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 8.32e-01 0.0117 0.0549 0.09 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 9.99e-01 0.00029 0.16 0.09 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 9.77e-01 0.00417 0.146 0.09 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0518 0.123 0.09 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 2.23e-03 0.295 0.0952 0.09 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0262 0.0816 0.09 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 4.57e-01 -0.118 0.158 0.09 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 2.69e-01 -0.171 0.155 0.09 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 165892 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000153 0.0917 0.09 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0223 0.117 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 5.43e-01 -0.101 0.166 0.082 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 5.90e-01 0.0727 0.135 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 2.31e-01 0.195 0.162 0.082 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0783 0.179 0.082 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0137 0.164 0.082 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0198 0.183 0.082 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00959 0.134 0.082 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 7.68e-01 0.0429 0.145 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00509 0.0825 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 5.74e-03 -0.416 0.149 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0529 0.161 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 5.42e-01 -0.086 0.141 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 9.28e-01 0.0118 0.131 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 2.84e-01 0.159 0.148 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 1.90e-01 -0.205 0.156 0.091 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 1.47e-01 -0.135 0.0924 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 1.74e-01 0.215 0.157 0.091 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 5.32e-01 0.0996 0.159 0.091 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 9.62e-01 0.00682 0.144 0.091 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 1.58e-01 0.197 0.139 0.091 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 2.09e-01 -0.168 0.133 0.091 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 3.67e-01 0.112 0.124 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 5.16e-01 0.0459 0.0707 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 1.71e-01 0.223 0.163 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0943 0.159 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 2.17e-01 -0.169 0.137 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00848 0.116 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 7.39e-02 -0.288 0.16 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 9.08e-01 0.0178 0.153 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0972 0.0886 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 7.30e-01 -0.058 0.168 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 6.57e-01 0.0741 0.167 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 1.98e-01 0.199 0.154 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0781 0.13 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0212 0.158 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 3.36e-01 0.135 0.14 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 1.62e-01 -0.174 0.124 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 7.90e-01 0.0415 0.155 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 1.63e-01 -0.21 0.15 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 4.45e-01 -0.112 0.146 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 2.72e-01 -0.139 0.126 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 8.22e-02 0.133 0.0761 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 2.97e-01 0.0642 0.0614 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 4.88e-01 -0.1 0.145 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0628 0.135 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 4.52e-01 0.0463 0.0615 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0949 0.136 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 4.16e-01 0.0872 0.107 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 8.05e-01 0.0168 0.0677 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 2.96e-01 -0.164 0.157 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0994 0.141 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0852 0.0879 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 7.54e-01 0.048 0.153 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 5.73e-01 0.069 0.122 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0816 0.0865 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 6.44e-01 0.073 0.158 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 4.87e-01 -0.103 0.147 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0753 0.125 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0583 0.147 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 6.89e-01 0.0451 0.113 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 4.55e-01 0.0561 0.075 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 6.03e-01 0.0807 0.155 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 9.62e-01 0.00722 0.15 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 8.82e-01 0.0198 0.134 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 5.27e-01 0.0691 0.109 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0917 0.0759 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 2.60e-01 0.178 0.158 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 1.24e-01 -0.22 0.142 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 6.53e-02 -0.186 0.1 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 7.83e-01 0.0393 0.143 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 8.90e-01 0.0149 0.107 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0139 0.164 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 6.96e-01 0.0617 0.158 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 2.72e-01 -0.152 0.138 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 3.39e-01 0.137 0.143 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00108 0.135 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 1.07e-01 0.265 0.164 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 2.73e-01 -0.183 0.166 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00131 0.163 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 3.66e-02 0.235 0.112 0.089 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 5.95e-01 0.05 0.0938 0.089 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 7.28e-01 0.0534 0.153 0.089 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 4.56e-01 -0.121 0.163 0.089 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 165892 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0632 0.127 0.089 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 3.12e-01 -0.134 0.132 0.089 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 5.69e-01 0.0707 0.124 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0825 0.0914 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 5.77e-02 0.306 0.16 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 9.00e-01 0.0191 0.151 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 9.69e-01 0.00554 0.141 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 6.77e-02 0.173 0.0943 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 8.19e-01 0.0142 0.0621 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0761 0.164 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 3.95e-01 -0.137 0.16 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0911 0.129 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 1.92e-01 0.163 0.125 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0689 0.106 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 1.92e-01 0.207 0.158 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 3.69e-01 -0.15 0.166 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 6.44e-01 -0.073 0.158 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 4.20e-02 0.203 0.0992 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 6.47e-01 0.0343 0.0748 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 8.25e-02 -0.273 0.156 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 3.32e-01 0.146 0.15 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 9.65e-01 0.00547 0.123 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 8.36e-01 0.0404 0.195 0.093 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 3.30e-01 -0.164 0.167 0.093 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 7.12e-01 0.0741 0.2 0.093 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 3.27e-01 0.208 0.211 0.093 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0334 0.143 0.093 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 6.94e-01 -0.068 0.172 0.093 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 7.20e-02 -0.259 0.142 0.093 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 1.17e-01 0.196 0.124 0.089 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 9.43e-02 -0.217 0.129 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0925 0.152 0.089 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 6.60e-01 0.0708 0.161 0.089 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 165892 sc-eQTL 6.72e-01 0.0448 0.106 0.089 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 1.70e-01 0.202 0.147 0.089 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 4.83e-01 0.102 0.145 0.09 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 9.50e-01 0.00585 0.0938 0.09 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 3.24e-01 0.151 0.153 0.09 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00629 0.149 0.09 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 8.10e-02 -0.174 0.0993 0.09 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0495 0.141 0.09 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 2.58e-01 0.14 0.123 0.093 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0539 0.125 0.093 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 9.87e-01 0.00251 0.16 0.093 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -134592 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0699 0.142 0.093 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 6.41e-02 -0.268 0.144 0.093 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0773 0.142 0.093 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 2.33e-01 0.15 0.125 0.093 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 1.22e-01 -0.199 0.128 0.093 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -367818 sc-eQTL 7.89e-01 0.0437 0.163 0.093 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 9.90e-01 0.00113 0.0889 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 3.25e-01 0.0938 0.0951 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0153 0.16 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -134592 sc-eQTL 4.22e-01 -0.111 0.138 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0112 0.139 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 8.75e-01 0.0214 0.135 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 1.80e-01 -0.133 0.0991 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -367818 sc-eQTL 5.47e-01 0.0772 0.128 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00108 0.103 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0201 0.106 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 4.32e-02 -0.333 0.163 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -134592 sc-eQTL 1.55e-01 0.219 0.153 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0776 0.151 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 3.90e-01 0.121 0.141 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 4.01e-01 0.104 0.124 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -367818 sc-eQTL 6.56e-01 0.0571 0.128 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 1.42e-02 0.352 0.142 0.1 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 5.48e-01 0.0766 0.127 0.1 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 8.80e-02 -0.312 0.182 0.1 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0536 0.175 0.1 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 165892 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0799 0.14 0.1 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0835 0.188 0.1 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 8.93e-01 0.0145 0.107 0.093 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0155 0.142 0.093 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 6.19e-01 0.072 0.145 0.093 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -134592 sc-eQTL 4.54e-01 -0.107 0.142 0.093 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 6.95e-01 0.0605 0.154 0.093 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0226 0.141 0.093 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 5.70e-02 0.286 0.149 0.093 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -367818 sc-eQTL 4.67e-01 -0.116 0.159 0.093 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 3.54e-01 -0.119 0.128 0.093 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 2.70e-01 -0.11 0.0991 0.093 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 9.47e-01 0.0105 0.159 0.093 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -134592 sc-eQTL 7.39e-01 0.0467 0.14 0.093 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 4.32e-01 -0.121 0.153 0.093 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 4.80e-01 0.0939 0.133 0.093 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 6.64e-01 0.064 0.147 0.093 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -367818 sc-eQTL 3.57e-01 0.138 0.149 0.093 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 3.59e-01 0.126 0.138 0.105 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 2.83e-02 -0.226 0.102 0.105 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 7.84e-01 0.0417 0.152 0.105 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -134592 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0247 0.106 0.105 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 7.39e-01 0.0385 0.115 0.105 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 7.72e-01 0.0418 0.144 0.105 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 3.84e-01 -0.148 0.169 0.105 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0509 0.139 0.105 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -367818 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0806 0.156 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0736 0.13 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0429 0.0727 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0296 0.149 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0196 0.158 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0852 0.134 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 4.49e-01 0.0916 0.121 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 4.74e-01 0.11 0.154 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 4.58e-01 0.0972 0.131 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 9.31e-01 0.00519 0.0601 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 4.17e-01 0.129 0.159 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0688 0.161 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 7.07e-01 -0.05 0.133 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0273 0.11 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 535285 sc-eQTL 2.00e-01 -0.207 0.161 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 9.34e-01 0.00738 0.0896 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 3.20e-01 0.0829 0.0832 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 2.96e-01 -0.168 0.16 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -134592 sc-eQTL 5.91e-01 0.0775 0.144 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0374 0.135 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 6.48e-01 0.0538 0.118 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0466 0.0971 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -367818 sc-eQTL 3.88e-01 0.0998 0.115 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0635 0.105 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0592 0.0949 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0044 0.159 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -134592 sc-eQTL 6.71e-01 0.0651 0.153 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0268 0.145 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 564526 sc-eQTL 8.93e-01 0.0176 0.131 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 1.95e-01 0.163 0.126 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -367818 sc-eQTL 9.87e-01 0.00242 0.15 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -803222 sc-eQTL 7.39e-02 0.174 0.0967 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 126376 sc-eQTL 8.19e-01 0.013 0.0565 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -406337 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0634 0.164 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 918462 sc-eQTL 9.82e-01 0.00342 0.15 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -376250 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0536 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135525 MAP7 -134592 eQTL 0.000163 -0.167 0.0441 0.0 0.0 0.0697


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 MAP7 -134592 4.51e-06 4.65e-06 7.79e-07 2.42e-06 1.14e-06 1.35e-06 3.59e-06 9.55e-07 4.26e-06 2.01e-06 4.65e-06 3.37e-06 7.43e-06 2.16e-06 1.43e-06 2.68e-06 2.04e-06 2.75e-06 1.36e-06 9.88e-07 2.55e-06 4.35e-06 3.47e-06 1.55e-06 5.16e-06 1.43e-06 2.41e-06 1.65e-06 4.32e-06 3.75e-06 2.54e-06 6.26e-07 6.92e-07 1.92e-06 2.03e-06 1.02e-06 9.59e-07 4.75e-07 1.05e-06 3.42e-07 3.61e-07 5.43e-06 4.35e-07 1.6e-07 3.75e-07 4.99e-07 7.44e-07 2.26e-07 3.35e-07
ENSG00000182747 \N -506074 7.74e-07 3.77e-07 7.72e-08 3.19e-07 1.05e-07 1.57e-07 4.25e-07 9.78e-08 3.03e-07 1.89e-07 4.64e-07 3.11e-07 5.81e-07 1.07e-07 1.32e-07 1.75e-07 1.62e-07 3.39e-07 1.13e-07 8.41e-08 1.65e-07 2.7e-07 2.77e-07 1.04e-07 5.53e-07 2.33e-07 1.85e-07 2.13e-07 2.57e-07 2.75e-07 2.31e-07 6.68e-08 5.64e-08 1.15e-07 2.58e-07 5.2e-08 8.87e-08 6.1e-08 5.89e-08 5.64e-08 4.27e-08 3.66e-07 2.94e-08 1.14e-08 8.45e-08 1.32e-08 1.04e-07 0.0 4.68e-08