Genes within 1Mb (chr6:136334068:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0203 0.0807 0.214 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0276 0.0359 0.214 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 7.28e-01 0.0333 0.0955 0.214 B L1
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 4.52e-01 0.076 0.101 0.214 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0539 0.0754 0.214 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 1.23e-01 0.109 0.0706 0.214 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 1.61e-01 -0.137 0.0975 0.214 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 1.15e-02 0.133 0.0522 0.214 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 6.31e-01 0.0193 0.0401 0.214 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 9.91e-02 -0.14 0.0847 0.214 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0457 0.0863 0.214 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0425 0.0408 0.214 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0398 0.0823 0.214 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 1.51e-02 0.147 0.06 0.214 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 4.57e-01 0.0306 0.0411 0.214 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 1.33e-01 0.152 0.101 0.214 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 8.13e-01 0.0214 0.0904 0.214 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0831 0.0538 0.214 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 3.82e-01 0.0641 0.0731 0.221 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 9.79e-01 0.00176 0.0659 0.221 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 8.53e-01 0.0191 0.103 0.221 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -216751 sc-eQTL 9.99e-01 6.67e-05 0.0848 0.221 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 7.59e-02 -0.114 0.0638 0.221 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 7.49e-01 0.0301 0.094 0.221 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0122 0.0812 0.221 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0311 0.0881 0.221 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -449977 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00163 0.106 0.221 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0143 0.0616 0.214 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0299 0.0526 0.214 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 5.87e-02 -0.195 0.103 0.214 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -216751 sc-eQTL 2.69e-01 -0.101 0.0911 0.214 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 4.78e-01 0.0612 0.0862 0.214 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 4.04e-01 0.062 0.0742 0.214 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 3.18e-01 0.0609 0.0608 0.214 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -449977 sc-eQTL 3.47e-01 0.0694 0.0737 0.214 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 1.84e-01 0.0894 0.0671 0.215 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0173 0.0357 0.215 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 1.65e-01 -0.144 0.103 0.215 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 9.32e-01 0.00808 0.0948 0.215 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0568 0.0802 0.215 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 4.17e-01 0.0511 0.0628 0.214 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00619 0.0527 0.214 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 9.98e-01 0.000221 0.103 0.214 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 8.55e-01 0.0183 0.1 0.214 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 83733 sc-eQTL 9.48e-01 0.0039 0.0593 0.214 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0638 0.0755 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0594 0.106 0.202 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 4.27e-01 0.0682 0.0858 0.202 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 9.50e-01 0.0065 0.104 0.202 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0395 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 9.00e-01 0.0132 0.105 0.202 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0988 0.117 0.202 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00541 0.0852 0.202 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 3.92e-01 0.0802 0.0936 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 2.45e-01 0.0621 0.0532 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 1.77e-01 -0.132 0.0977 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 6.10e-01 0.053 0.104 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0857 0.091 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 9.72e-02 0.14 0.0843 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0327 0.096 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 7.52e-01 -0.032 0.101 0.216 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 9.80e-01 0.00149 0.0599 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 1.52e-02 0.246 0.1 0.216 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 4.30e-02 0.207 0.102 0.216 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0244 0.0931 0.216 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 1.57e-02 0.216 0.0888 0.216 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0519 0.0861 0.216 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 7.28e-01 0.0282 0.081 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0313 0.0462 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 6.79e-01 0.0443 0.107 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 6.85e-01 0.0424 0.104 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0434 0.0897 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 3.43e-01 0.0722 0.076 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 8.59e-02 -0.181 0.105 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 1.90e-01 -0.13 0.0989 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 6.34e-01 0.0274 0.0575 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 5.28e-01 0.0686 0.109 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 6.12e-01 0.0549 0.108 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0077 0.0999 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 5.93e-01 0.045 0.0841 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0897 0.102 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 2.46e-01 0.109 0.0933 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0207 0.083 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 8.35e-01 0.0217 0.104 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 4.64e-01 0.0737 0.1 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 1.81e-01 -0.131 0.0975 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0934 0.0842 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 2.14e-02 0.115 0.0497 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 7.23e-01 0.0143 0.0404 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 1.39e-01 -0.14 0.0945 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 6.45e-01 -0.041 0.0888 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 8.62e-01 -0.00703 0.0404 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 8.16e-01 0.0208 0.0895 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 5.23e-01 0.045 0.0703 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 4.13e-01 0.0364 0.0444 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0706 0.103 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0544 0.0926 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0603 0.0576 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 6.52e-01 0.0453 0.1 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 5.87e-02 0.152 0.0798 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 8.84e-01 0.00831 0.0571 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 5.14e-01 0.068 0.104 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 6.41e-01 0.0453 0.0971 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0645 0.0825 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 4.95e-01 0.0661 0.0967 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 2.17e-01 0.0906 0.0731 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 2.08e-01 0.0616 0.0487 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0311 0.101 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 2.50e-01 0.113 0.0976 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0532 0.0871 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 6.67e-02 0.13 0.0706 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0684 0.0495 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 3.77e-02 0.214 0.102 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0798 0.0932 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0545 0.0659 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 5.81e-01 0.0516 0.0933 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 8.05e-01 0.0173 0.0701 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 6.21e-01 0.053 0.107 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 3.42e-01 0.0983 0.103 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 1.71e-01 -0.124 0.0899 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 4.73e-01 0.0672 0.0935 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0515 0.0883 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 9.84e-02 0.178 0.107 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 2.60e-01 -0.123 0.109 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 6.18e-02 -0.199 0.106 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0404 0.0729 0.212 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 9.65e-01 0.00264 0.0606 0.212 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0178 0.099 0.212 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 4.44e-01 0.0805 0.105 0.212 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 83733 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00245 0.0818 0.212 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 7.90e-02 -0.15 0.0849 0.212 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 5.23e-01 0.0518 0.0809 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0601 0.0596 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 6.33e-02 0.195 0.105 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0565 0.0984 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 4.60e-01 0.0678 0.0916 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 3.23e-01 0.0614 0.062 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00488 0.0406 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 2.66e-02 -0.236 0.106 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0732 0.105 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0794 0.084 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 2.93e-01 0.0873 0.0828 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0648 0.0701 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 6.12e-01 0.0535 0.105 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0202 0.11 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0608 0.104 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 1.09e-01 0.105 0.065 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 6.82e-01 -0.02 0.0488 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0649 0.103 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 1.71e-01 0.135 0.098 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0491 0.0802 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0198 0.136 0.189 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 9.02e-01 0.0145 0.118 0.189 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 4.90e-01 0.0966 0.14 0.189 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 5.89e-02 0.279 0.146 0.189 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 3.10e-01 -0.102 0.0995 0.189 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 4.58e-01 0.0895 0.12 0.189 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 1.96e-01 -0.13 0.1 0.189 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 9.45e-02 0.137 0.0814 0.215 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0695 0.0849 0.215 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0217 0.0996 0.215 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00606 0.105 0.215 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 83733 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0836 0.069 0.215 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0869 0.0965 0.215 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 7.34e-01 0.0321 0.0943 0.214 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 8.90e-01 0.00847 0.0609 0.214 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0149 0.0997 0.214 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0219 0.0969 0.214 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0525 0.0649 0.214 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00972 0.0913 0.214 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 1.50e-01 0.118 0.0815 0.217 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 8.88e-01 0.0117 0.0826 0.217 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0611 0.106 0.217 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -216751 sc-eQTL 9.28e-01 0.00859 0.0944 0.217 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 6.13e-02 -0.18 0.0954 0.217 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 4.76e-01 0.0671 0.094 0.217 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 8.88e-01 0.0117 0.0831 0.217 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 5.58e-01 -0.05 0.0853 0.217 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -449977 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0517 0.108 0.217 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0148 0.0573 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00562 0.0614 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0873 0.103 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -216751 sc-eQTL 1.88e-02 -0.208 0.0876 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 3.65e-01 0.0811 0.0893 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 8.47e-01 0.0168 0.0872 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0629 0.064 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -449977 sc-eQTL 3.78e-01 0.0728 0.0823 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0582 0.0665 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00716 0.0685 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 1.80e-02 -0.252 0.106 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -216751 sc-eQTL 6.38e-01 0.0469 0.0996 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 3.87e-01 0.0847 0.0978 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 1.38e-01 0.135 0.0909 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 6.53e-02 0.148 0.0799 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -449977 sc-eQTL 5.03e-01 0.0556 0.0829 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 2.81e-01 0.101 0.0934 0.261 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 9.17e-01 0.00863 0.0826 0.261 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0759 0.119 0.261 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 2.06e-01 0.143 0.113 0.261 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 83733 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00758 0.091 0.261 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0764 0.122 0.261 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 1.62e-01 0.0967 0.0689 0.222 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0814 0.0913 0.222 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 9.61e-01 0.00461 0.0934 0.222 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -216751 sc-eQTL 1.94e-01 -0.119 0.0915 0.222 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0501 0.0994 0.222 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0565 0.0907 0.222 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 6.19e-01 0.0484 0.0973 0.222 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -449977 sc-eQTL 3.07e-01 -0.105 0.103 0.222 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0645 0.0834 0.217 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 8.38e-02 -0.112 0.0644 0.217 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 2.04e-01 -0.131 0.103 0.217 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -216751 sc-eQTL 8.48e-01 0.0175 0.0914 0.217 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0726 0.1 0.217 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 1.15e-01 0.137 0.0862 0.217 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 4.40e-02 0.193 0.0951 0.217 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -449977 sc-eQTL 6.28e-01 0.0472 0.0974 0.217 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 1.03e-01 0.153 0.0933 0.237 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0549 0.0704 0.237 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 8.62e-01 -0.018 0.104 0.237 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -216751 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0754 0.0721 0.237 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0278 0.0787 0.237 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 1.75e-01 0.133 0.0977 0.237 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 3.78e-01 -0.102 0.115 0.237 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0244 0.0952 0.237 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -449977 sc-eQTL 5.71e-01 0.0605 0.107 0.237 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 6.13e-01 0.0424 0.0837 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 7.61e-01 0.0143 0.047 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 2.77e-01 0.105 0.0961 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 1.88e-01 0.135 0.102 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0978 0.0863 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 3.61e-02 0.163 0.0774 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0451 0.0995 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0332 0.0854 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0164 0.0392 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 4.85e-01 0.0727 0.104 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 6.44e-01 0.0486 0.105 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0307 0.0868 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 2.20e-01 0.0879 0.0714 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 453126 sc-eQTL 5.46e-02 -0.203 0.105 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0296 0.058 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 8.92e-01 0.00732 0.054 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 1.33e-01 -0.156 0.104 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -216751 sc-eQTL 2.38e-01 -0.11 0.0929 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 1.96e-01 0.113 0.0869 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 2.66e-01 0.0848 0.076 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 6.44e-01 0.0291 0.0629 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -449977 sc-eQTL 3.07e-01 0.0765 0.0747 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00315 0.0674 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0956 0.0605 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 2.85e-01 -0.109 0.101 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -216751 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0637 0.0982 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0275 0.0931 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 482367 sc-eQTL 7.83e-01 0.0232 0.0841 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 1.82e-01 0.108 0.0804 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -449977 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0613 0.0957 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -885381 sc-eQTL 2.66e-01 0.0709 0.0636 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 44217 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00468 0.037 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -488496 sc-eQTL 8.85e-02 -0.183 0.107 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 836303 sc-eQTL 5.60e-01 0.0571 0.0979 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0934 0.0782 0.216 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135525 MAP7 -216751 eQTL 4.86e-08 -0.167 0.0303 0.0359 0.0458 0.171
ENSG00000146410 MTFR2 83744 eQTL 0.0105 -0.0733 0.0286 0.0 0.0 0.171
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 eQTL 0.00591 -0.044 0.0159 0.0 0.0 0.171


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 MAP7 -216751 4.36e-06 5.32e-06 8.52e-07 2.46e-06 1.27e-06 1.21e-06 4.13e-06 9.12e-07 4.18e-06 1.69e-06 4.24e-06 3.11e-06 7.77e-06 2.45e-06 1.31e-06 3.69e-06 2e-06 2.87e-06 1.41e-06 9.54e-07 1.67e-06 4.9e-06 4.58e-06 1.8e-06 7.71e-06 1.24e-06 2.27e-06 1.51e-06 4.26e-06 3.32e-06 2.25e-06 5.76e-07 5.69e-07 1.42e-06 2.08e-06 8.94e-07 9.41e-07 4.3e-07 1.04e-06 3.45e-07 1.67e-07 7.12e-06 4.18e-07 1.61e-07 3.61e-07 5.86e-07 7.88e-07 2.26e-07 1.57e-07
ENSG00000197442 MAP3K5 -458409 1.29e-06 9.39e-07 3.06e-07 3.16e-07 2.05e-07 3.36e-07 7.99e-07 2.07e-07 8.46e-07 2.72e-07 1.07e-06 5.5e-07 1.46e-06 2.4e-07 4.19e-07 5.75e-07 6.29e-07 5.02e-07 6.68e-07 2.15e-07 2.38e-07 1.17e-06 7.39e-07 2.24e-07 1.94e-06 2.4e-07 4.91e-07 4.96e-07 8.47e-07 8.47e-07 4.54e-07 6.13e-08 5.42e-08 1.69e-07 3.22e-07 1.55e-07 2.34e-07 1.03e-07 1.33e-07 1.86e-08 9.84e-08 1.62e-06 4.59e-08 1.66e-07 1.61e-07 5.38e-08 8.84e-08 7.28e-08 5.96e-08