logo

Genes within 1Mb (chr6:136319477:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 4.43e-01 0.107 0.14 0.064 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 7.44e-01 0.0204 0.0623 0.064 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 2.37e-01 -0.196 0.165 0.064 B L1
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 1.35e-01 -0.261 0.174 0.064 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 4.56e-01 0.0977 0.131 0.064 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 2.80e-01 -0.133 0.123 0.064 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 4.97e-01 0.116 0.17 0.064 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0934 0.0953 0.064 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 8.81e-01 0.0108 0.0722 0.064 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 9.57e-01 0.00828 0.154 0.064 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 1.19e-01 -0.242 0.155 0.064 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 7.80e-03 -0.195 0.0725 0.064 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 7.88e-02 0.26 0.147 0.064 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0157 0.108 0.064 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0706 0.0732 0.064 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0279 0.181 0.064 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 5.15e-01 -0.105 0.161 0.064 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 2.64e-01 -0.108 0.0962 0.064 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 3.40e-01 -0.135 0.142 0.059 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 6.18e-01 0.0637 0.128 0.059 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 6.95e-01 0.0785 0.2 0.059 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -231342 sc-eQTL 1.23e-01 0.253 0.163 0.059 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 6.83e-01 0.0509 0.124 0.059 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 3.18e-01 0.182 0.182 0.059 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0902 0.157 0.059 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 1.58e-01 -0.241 0.17 0.059 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -464568 sc-eQTL 9.00e-01 -0.026 0.205 0.059 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0611 0.106 0.064 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 9.76e-01 0.00275 0.0907 0.064 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 2.11e-01 0.223 0.178 0.064 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -231342 sc-eQTL 6.03e-01 0.0819 0.157 0.064 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 4.20e-01 -0.12 0.148 0.064 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 2.78e-01 -0.139 0.128 0.064 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 5.27e-01 0.0665 0.105 0.064 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -464568 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0715 0.127 0.064 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 5.20e-01 0.0779 0.121 0.064 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0136 0.0642 0.064 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 1.74e-01 0.253 0.186 0.064 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 7.95e-01 0.0444 0.17 0.064 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 1.78e-01 -0.194 0.144 0.064 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0237 0.111 0.064 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 5.55e-01 0.0551 0.0933 0.064 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 7.72e-02 -0.32 0.18 0.064 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 6.85e-01 0.0722 0.177 0.064 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 69142 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0958 0.105 0.064 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 4.49e-01 -0.101 0.134 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 3.15e-01 -0.179 0.178 0.069 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 1.72e-01 -0.198 0.144 0.069 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 8.16e-01 0.0409 0.176 0.069 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 4.96e-01 0.131 0.192 0.069 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 4.26e-01 -0.141 0.176 0.069 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 5.67e-01 0.113 0.197 0.069 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0611 0.144 0.069 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 1.18e-01 0.28 0.178 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 7.71e-01 0.0297 0.102 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 6.17e-01 0.094 0.188 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 4.20e-02 -0.403 0.197 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0192 0.174 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0912 0.162 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 3.54e-01 0.17 0.183 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 7.34e-01 -0.066 0.194 0.06 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0326 0.115 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 2.46e-01 -0.227 0.196 0.06 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0189 0.198 0.06 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0551 0.179 0.06 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 2.19e-01 -0.213 0.173 0.06 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 5.71e-01 -0.094 0.166 0.06 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 5.51e-01 0.0834 0.14 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 2.67e-01 0.0886 0.0797 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 7.40e-02 -0.329 0.183 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 1.60e-01 -0.252 0.179 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 6.11e-01 0.0789 0.155 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00101 0.132 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0285 0.182 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0885 0.172 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 5.88e-01 0.0541 0.0998 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 1.55e-01 -0.268 0.187 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 2.93e-01 -0.197 0.187 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 6.47e-01 0.0793 0.173 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 3.98e-01 -0.123 0.146 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 2.23e-01 0.216 0.176 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 4.27e-02 -0.328 0.161 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 4.85e-01 -0.101 0.144 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 4.14e-01 0.148 0.18 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 8.21e-01 0.0395 0.175 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 4.81e-01 -0.12 0.17 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0233 0.147 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 8.17e-01 -0.021 0.0906 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 8.21e-01 0.0165 0.0727 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 7.00e-01 0.0661 0.171 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 2.03e-01 -0.204 0.159 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 2.43e-02 -0.163 0.0719 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 2.88e-02 0.351 0.16 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0589 0.125 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 6.66e-01 0.0342 0.079 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 8.95e-01 0.0242 0.184 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 2.84e-01 -0.176 0.164 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 1.40e-01 -0.151 0.102 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0812 0.178 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 1.22e-01 -0.219 0.141 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 5.92e-01 -0.054 0.101 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0951 0.183 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 5.23e-02 -0.331 0.17 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 7.77e-02 -0.256 0.144 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 1.77e-01 0.23 0.17 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 4.29e-01 -0.101 0.128 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0971 0.0851 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0533 0.176 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 2.58e-01 -0.193 0.17 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0558 0.152 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0775 0.128 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 2.26e-01 -0.108 0.0888 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 3.90e-01 -0.159 0.185 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0406 0.167 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0874 0.118 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 3.48e-01 0.159 0.169 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 9.36e-01 0.0103 0.127 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 4.91e-01 0.134 0.195 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 8.12e-01 0.0446 0.188 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 7.52e-01 -0.052 0.164 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0553 0.161 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0881 0.152 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 1.51e-01 0.266 0.184 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 2.33e-01 0.224 0.187 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 5.39e-02 -0.353 0.182 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 4.37e-01 -0.103 0.132 0.063 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 7.24e-01 0.0387 0.109 0.063 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 8.57e-02 -0.306 0.177 0.063 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00854 0.19 0.063 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 69142 sc-eQTL 4.95e-01 0.101 0.148 0.063 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 4.35e-01 -0.121 0.154 0.063 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0366 0.141 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 2.29e-01 -0.125 0.103 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00751 0.183 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 5.01e-01 -0.115 0.171 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 4.35e-01 -0.125 0.159 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 5.02e-01 0.0755 0.112 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 2.41e-01 0.0861 0.0732 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 1.69e-01 0.266 0.193 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 4.45e-01 0.145 0.189 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 4.08e-01 -0.126 0.152 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 4.25e-01 0.112 0.14 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0369 0.119 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0627 0.178 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 6.63e-01 0.081 0.186 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 1.68e-01 -0.243 0.176 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 6.37e-01 0.0554 0.117 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 8.73e-01 -0.014 0.0876 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 2.13e-01 0.23 0.184 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0421 0.177 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 3.89e-01 -0.124 0.144 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 3.39e-01 0.202 0.211 0.07 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0766 0.182 0.07 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0615 0.217 0.07 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 1.85e-03 -0.704 0.221 0.07 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 1.99e-02 0.358 0.152 0.07 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 7.37e-01 0.0631 0.187 0.07 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0232 0.157 0.07 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0584 0.143 0.063 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 1.66e-02 -0.353 0.146 0.063 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 4.56e-01 0.13 0.173 0.063 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 1.38e-01 -0.272 0.183 0.063 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 69142 sc-eQTL 6.67e-01 -0.052 0.121 0.063 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 2.35e-01 -0.2 0.168 0.063 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 2.18e-01 -0.209 0.169 0.064 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 2.05e-01 0.139 0.109 0.064 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0561 0.18 0.064 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 1.55e-01 -0.248 0.174 0.064 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0616 0.117 0.064 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 3.59e-01 0.151 0.164 0.064 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00801 0.158 0.059 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 3.70e-01 0.143 0.159 0.059 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0464 0.204 0.059 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -231342 sc-eQTL 5.27e-01 0.115 0.182 0.059 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 6.02e-01 0.0969 0.185 0.059 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 6.19e-01 0.0902 0.181 0.059 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 7.26e-01 0.0562 0.16 0.059 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 2.19e-01 -0.202 0.164 0.059 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -464568 sc-eQTL 2.63e-01 -0.234 0.208 0.059 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0316 0.0988 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 7.99e-01 0.027 0.106 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 6.88e-02 0.322 0.176 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -231342 sc-eQTL 1.54e-01 0.218 0.152 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 6.22e-01 -0.076 0.154 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 8.20e-01 0.0343 0.15 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 6.70e-02 0.202 0.11 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -464568 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0234 0.142 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0395 0.114 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0218 0.117 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 4.97e-01 0.125 0.183 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -231342 sc-eQTL 5.21e-01 -0.11 0.171 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00197 0.168 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 1.15e-01 -0.247 0.156 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0574 0.138 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -464568 sc-eQTL 4.59e-01 -0.105 0.142 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 4.21e-01 -0.148 0.183 0.061 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 3.57e-01 -0.149 0.161 0.061 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0581 0.233 0.061 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 2.18e-01 -0.274 0.221 0.061 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 69142 sc-eQTL 4.18e-01 -0.144 0.178 0.061 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 5.61e-02 -0.455 0.236 0.061 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 3.72e-01 -0.108 0.121 0.064 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 7.91e-01 0.0426 0.16 0.064 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 8.36e-02 -0.282 0.162 0.064 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -231342 sc-eQTL 1.27e-01 0.245 0.16 0.064 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0912 0.174 0.064 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 7.85e-01 0.0434 0.159 0.064 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 4.09e-01 -0.141 0.17 0.064 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -464568 sc-eQTL 2.00e-01 -0.231 0.179 0.064 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 1.63e-01 -0.201 0.143 0.068 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 3.55e-01 0.103 0.112 0.068 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0608 0.179 0.068 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -231342 sc-eQTL 3.09e-01 0.161 0.157 0.068 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 4.27e-01 -0.137 0.173 0.068 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 4.31e-01 -0.118 0.15 0.068 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0589 0.166 0.068 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -464568 sc-eQTL 2.31e-01 0.201 0.168 0.068 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 1.89e-01 -0.229 0.173 0.065 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0053 0.131 0.065 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 2.58e-01 0.217 0.191 0.065 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -231342 sc-eQTL 3.95e-02 0.274 0.132 0.065 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00592 0.146 0.065 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 4.00e-01 0.153 0.182 0.065 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 6.31e-01 -0.103 0.214 0.065 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 4.92e-01 -0.121 0.176 0.065 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -464568 sc-eQTL 7.25e-01 0.0697 0.198 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 8.13e-01 0.0358 0.151 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 4.66e-01 -0.062 0.0848 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 3.79e-01 -0.153 0.174 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 5.22e-02 -0.358 0.183 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0353 0.156 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0448 0.141 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0249 0.18 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 9.78e-01 0.00408 0.147 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 3.19e-01 0.0673 0.0674 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 3.57e-02 -0.375 0.177 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 1.26e-01 -0.276 0.18 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 6.15e-01 0.0753 0.149 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 3.23e-01 -0.122 0.123 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 438535 sc-eQTL 5.32e-01 0.114 0.182 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0289 0.0996 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00713 0.0927 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 1.01e-01 0.293 0.178 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -231342 sc-eQTL 7.21e-01 0.0571 0.16 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 4.88e-01 -0.104 0.15 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 2.52e-01 -0.15 0.13 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 3.56e-01 0.0997 0.108 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -464568 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0599 0.128 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 2.65e-01 -0.13 0.117 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 6.19e-01 0.0525 0.106 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 2.85e-01 -0.189 0.176 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -231342 sc-eQTL 1.20e-01 0.264 0.17 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 4.51e-01 -0.122 0.161 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 467776 sc-eQTL 8.78e-01 0.0225 0.146 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 2.89e-01 -0.149 0.14 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -464568 sc-eQTL 6.29e-01 0.0804 0.166 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 sc-eQTL 5.79e-01 0.0637 0.114 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 29626 sc-eQTL 9.14e-01 0.00722 0.0665 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -503087 sc-eQTL 1.19e-01 0.301 0.192 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 821712 sc-eQTL 6.64e-01 0.0765 0.176 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -473000 sc-eQTL 4.29e-01 -0.112 0.141 0.065 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -899972 eQTL 0.396 0.0218 0.0256 0.0014 0.0 0.0731
ENSG00000146410 MTFR2 69153 eQTL 4.32e-11 0.273 0.0409 0.00138 0.00161 0.0731
ENSG00000182747 SLC35D3 -602824 eQTL 0.00383 -0.171 0.0589 0.0 0.0 0.0731

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 \N -231342 1.28e-06 1.25e-06 3.12e-07 1.16e-06 3.57e-07 5.09e-07 1.63e-06 3.62e-07 1.45e-06 6.29e-07 2.03e-06 8.67e-07 2.55e-06 2.95e-07 5.01e-07 9.19e-07 9.15e-07 7e-07 8.59e-07 6.36e-07 8.11e-07 1.82e-06 8.89e-07 6.31e-07 2.41e-06 4.83e-07 9.36e-07 9.25e-07 1.38e-06 1.16e-06 7.64e-07 1.58e-07 2.33e-07 6.74e-07 5.21e-07 4.49e-07 6.81e-07 2.38e-07 3.35e-07 1.17e-07 1.98e-07 2.12e-06 1.39e-07 5.72e-08 1.72e-07 1.38e-07 2.15e-07 5.35e-08 1.09e-07
ENSG00000146410 MTFR2 69153 6.95e-06 9.04e-06 6.41e-07 3.67e-06 1.5e-06 1.53e-06 8.05e-06 1.2e-06 4.64e-06 3.41e-06 8.9e-06 3.3e-06 1.07e-05 3.13e-06 1.45e-06 4.51e-06 3.02e-06 3.84e-06 1.66e-06 1.51e-06 2.86e-06 7.45e-06 4.97e-06 1.76e-06 1.03e-05 2.14e-06 3.4e-06 2.1e-06 6.07e-06 7.53e-06 3.64e-06 4.2e-07 6.85e-07 1.93e-06 2.1e-06 1.13e-06 1.08e-06 5.44e-07 8.58e-07 5e-07 2.79e-07 9.44e-06 8.05e-07 1.8e-07 3.43e-07 1.05e-06 1.03e-06 5.2e-07 4.23e-07