Genes within 1Mb (chr6:136298478:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 5.77e-01 0.0639 0.114 0.094 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 5.92e-01 0.0273 0.0509 0.094 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 3.00e-01 -0.14 0.135 0.094 B L1
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 3.55e-01 -0.132 0.143 0.094 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 5.50e-01 0.0641 0.107 0.094 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0469 0.101 0.094 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0709 0.139 0.094 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 6.47e-01 0.0356 0.0777 0.094 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0155 0.0588 0.094 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 2.04e-01 -0.159 0.125 0.094 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 3.45e-01 -0.12 0.126 0.094 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 7.38e-02 -0.107 0.0595 0.094 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 2.16e-01 0.149 0.12 0.094 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 1.57e-01 0.124 0.0871 0.094 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0812 0.059 0.094 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 9.44e-01 0.0103 0.146 0.094 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 7.52e-01 0.0413 0.13 0.094 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0637 0.0777 0.094 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0351 0.11 0.09 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 8.94e-01 0.0132 0.0988 0.09 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 6.10e-01 -0.079 0.154 0.09 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -252341 sc-eQTL 3.44e-01 0.12 0.127 0.09 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 3.97e-01 0.0817 0.0962 0.09 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 2.20e-01 0.173 0.14 0.09 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0648 0.122 0.09 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 3.68e-01 -0.119 0.132 0.09 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -485567 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0981 0.159 0.09 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 6.96e-01 -0.034 0.0869 0.094 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0543 0.0743 0.094 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 9.77e-01 0.0043 0.146 0.094 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -252341 sc-eQTL 7.23e-01 0.0458 0.129 0.094 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 5.89e-01 -0.066 0.122 0.094 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 2.30e-01 -0.126 0.105 0.094 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 4.74e-01 0.0616 0.086 0.094 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -485567 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0992 0.104 0.094 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 7.93e-02 0.17 0.0967 0.094 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0178 0.0517 0.094 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 7.79e-01 0.0423 0.15 0.094 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 4.15e-01 0.112 0.137 0.094 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0846 0.116 0.094 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 4.88e-01 0.0626 0.0901 0.094 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00207 0.0757 0.094 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.147 0.094 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 5.02e-01 0.0965 0.144 0.094 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 48143 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0562 0.085 0.094 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0681 0.108 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 3.27e-01 -0.143 0.146 0.097 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 3.98e-01 -0.1 0.118 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0901 0.144 0.097 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 5.23e-01 0.101 0.157 0.097 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 3.24e-01 -0.143 0.144 0.097 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 5.70e-01 0.092 0.161 0.097 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 9.51e-01 0.00727 0.118 0.097 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 1.53e-01 0.2 0.14 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 6.38e-01 0.0376 0.0798 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 5.07e-01 0.0975 0.147 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 1.29e-01 -0.236 0.155 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 5.78e-01 -0.076 0.136 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0755 0.127 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0934 0.143 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 8.32e-01 0.0324 0.153 0.091 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 7.00e-01 -0.035 0.0909 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 7.57e-01 0.0479 0.155 0.091 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 8.67e-01 -0.026 0.156 0.091 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 7.32e-01 0.0484 0.141 0.091 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0173 0.137 0.091 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0724 0.131 0.091 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 6.88e-01 0.046 0.114 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 3.04e-01 0.0671 0.0652 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 1.57e-02 -0.363 0.149 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 2.53e-01 -0.168 0.147 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 1.94e-01 0.165 0.126 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 2.24e-01 0.131 0.107 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 1.17e-01 -0.233 0.148 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 1.96e-01 -0.183 0.141 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 2.02e-01 0.104 0.0817 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0556 0.155 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0405 0.154 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0685 0.142 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 1.75e-01 -0.162 0.119 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 5.49e-01 0.0873 0.145 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0863 0.131 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0575 0.116 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000413 0.146 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 4.47e-01 0.107 0.141 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0777 0.137 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0973 0.118 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 3.34e-01 0.0708 0.0731 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0394 0.0588 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0888 0.138 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 3.89e-01 -0.112 0.129 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 1.01e-01 -0.0963 0.0585 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 2.85e-01 0.139 0.13 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0364 0.102 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 7.38e-01 0.0216 0.0645 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0243 0.15 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 3.89e-01 -0.116 0.134 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0625 0.0838 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 8.87e-01 0.0207 0.146 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0241 0.115 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0916 0.0816 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 4.55e-01 -0.111 0.149 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 2.24e-01 -0.169 0.139 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 8.99e-02 -0.2 0.118 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 2.76e-01 0.151 0.138 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 8.24e-01 0.0229 0.103 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0731 0.0687 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 3.99e-01 -0.12 0.142 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0227 0.138 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 9.24e-01 0.0118 0.123 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 7.77e-01 0.0296 0.104 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 1.41e-01 -0.107 0.0723 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 6.10e-01 -0.077 0.151 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 9.04e-01 0.0166 0.137 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0885 0.0963 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 5.87e-01 0.074 0.136 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0339 0.102 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 9.90e-01 0.00194 0.156 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 3.34e-01 0.145 0.15 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 8.71e-01 0.0214 0.131 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 2.09e-01 0.164 0.131 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 3.48e-01 -0.116 0.123 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 8.81e-03 0.392 0.148 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 4.67e-02 0.302 0.151 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 5.56e-02 -0.285 0.148 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 8.91e-01 0.0148 0.107 0.091 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0101 0.0892 0.091 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 7.94e-02 -0.255 0.144 0.091 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 8.67e-01 0.0259 0.155 0.091 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 48143 sc-eQTL 1.64e-01 0.167 0.12 0.091 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0582 0.126 0.091 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 3.67e-01 0.103 0.114 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 6.99e-02 -0.152 0.0832 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0134 0.148 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0762 0.138 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 6.53e-01 0.0579 0.129 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 7.06e-02 0.162 0.0894 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 2.09e-01 0.0739 0.0586 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 7.41e-01 0.0512 0.155 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 3.36e-01 0.146 0.152 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0528 0.122 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 1.89e-01 0.15 0.114 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 1.14e-01 -0.152 0.096 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0558 0.145 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 4.37e-01 0.118 0.151 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 9.62e-02 -0.239 0.143 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 1.76e-01 0.128 0.094 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0281 0.0704 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 6.27e-01 0.0721 0.148 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 3.73e-01 0.127 0.142 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0394 0.116 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 4.89e-01 0.135 0.195 0.093 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 9.38e-01 0.0132 0.168 0.093 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 4.56e-01 -0.149 0.2 0.093 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 9.70e-03 -0.542 0.206 0.093 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 5.39e-02 0.274 0.141 0.093 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 5.97e-01 0.0914 0.172 0.093 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 7.42e-01 0.0477 0.144 0.093 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 4.12e-01 0.0959 0.117 0.093 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 1.55e-02 -0.291 0.119 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 5.18e-01 0.0919 0.142 0.093 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 2.44e-01 -0.175 0.15 0.093 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 48143 sc-eQTL 8.08e-02 -0.172 0.0979 0.093 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 4.64e-02 -0.274 0.137 0.093 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 2.05e-01 -0.173 0.136 0.094 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 2.76e-02 0.193 0.0872 0.094 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 1.72e-01 -0.197 0.144 0.094 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 2.29e-01 -0.169 0.14 0.094 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 6.29e-01 0.0455 0.0941 0.094 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 3.92e-02 0.272 0.131 0.094 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0268 0.122 0.09 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 7.33e-01 0.0419 0.123 0.09 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0873 0.157 0.09 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -252341 sc-eQTL 6.41e-01 0.0655 0.14 0.09 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 2.86e-01 0.152 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 3.91e-01 0.12 0.139 0.09 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 8.60e-01 0.0218 0.123 0.09 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 4.22e-01 -0.102 0.126 0.09 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -485567 sc-eQTL 2.82e-01 -0.173 0.16 0.09 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 9.28e-01 0.00738 0.0812 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0393 0.087 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 1.17e-01 0.228 0.145 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -252341 sc-eQTL 2.67e-01 0.14 0.125 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0796 0.127 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0287 0.124 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 1.50e-01 0.131 0.0905 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -485567 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0418 0.117 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0785 0.0932 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 6.46e-01 0.044 0.0958 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0667 0.15 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -252341 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00335 0.14 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 5.40e-01 0.0842 0.137 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 1.70e-01 -0.176 0.127 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0208 0.113 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -485567 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0852 0.116 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00777 0.137 0.097 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 7.63e-01 0.0363 0.12 0.097 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 7.86e-01 0.0471 0.173 0.097 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00827 0.165 0.097 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 48143 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0651 0.132 0.097 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 1.78e-01 -0.239 0.177 0.097 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 2.73e-01 -0.111 0.101 0.096 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 7.84e-01 0.0368 0.134 0.096 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 4.71e-02 -0.271 0.136 0.096 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -252341 sc-eQTL 1.43e-01 0.197 0.134 0.096 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00366 0.146 0.096 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 8.61e-01 0.0234 0.133 0.096 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0737 0.143 0.096 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -485567 sc-eQTL 1.03e-02 -0.384 0.148 0.096 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0826 0.117 0.1 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0417 0.0908 0.1 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 2.35e-01 -0.172 0.144 0.1 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -252341 sc-eQTL 2.02e-01 0.163 0.127 0.1 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0441 0.14 0.1 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 9.15e-01 -0.013 0.121 0.1 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0676 0.134 0.1 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -485567 sc-eQTL 5.34e-01 0.0849 0.136 0.1 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 9.82e-01 0.00307 0.135 0.099 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0103 0.102 0.099 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00497 0.149 0.099 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -252341 sc-eQTL 3.34e-01 0.101 0.104 0.099 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 4.16e-01 0.0923 0.113 0.099 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 3.30e-01 0.138 0.141 0.099 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 2.35e-01 -0.198 0.166 0.099 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 7.24e-01 0.0485 0.137 0.099 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -485567 sc-eQTL 8.08e-01 0.0374 0.154 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 3.73e-01 0.107 0.12 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0228 0.0674 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0312 0.138 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 1.35e-01 -0.219 0.146 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 5.41e-01 -0.076 0.124 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0212 0.112 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 3.58e-01 -0.131 0.142 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0376 0.121 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 2.27e-01 0.0671 0.0554 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 5.58e-02 -0.281 0.146 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 2.80e-01 -0.16 0.148 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 6.67e-01 0.0529 0.123 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0256 0.101 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 417536 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0892 0.149 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0256 0.0818 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0314 0.0762 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 3.72e-01 0.131 0.147 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -252341 sc-eQTL 7.14e-01 0.0483 0.131 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0504 0.123 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 2.04e-01 -0.137 0.107 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 3.69e-01 0.0797 0.0886 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -485567 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0613 0.106 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 2.67e-01 -0.107 0.096 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0316 0.0869 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 4.76e-02 -0.287 0.144 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -252341 sc-eQTL 1.58e-01 0.198 0.14 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00692 0.133 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 446777 sc-eQTL 6.45e-01 0.0554 0.12 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 3.17e-01 -0.115 0.115 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -485567 sc-eQTL 5.11e-01 -0.09 0.137 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -920971 sc-eQTL 1.21e-01 0.142 0.0913 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 8627 sc-eQTL 8.66e-01 0.00903 0.0533 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -524086 sc-eQTL 6.90e-01 0.0619 0.155 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 800713 sc-eQTL 2.49e-01 0.162 0.141 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -493999 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0481 0.113 0.095 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112357 PEX7 -524086 eQTL 0.0167 0.108 0.0451 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000146410 MTFR2 48154 eQTL 1.33e-09 0.228 0.0372 0.0 0.0 0.0903


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146410 MTFR2 48154 8.31e-06 9.99e-06 1.33e-06 6.11e-06 2.44e-06 4.21e-06 1.12e-05 2.14e-06 9.72e-06 5.42e-06 1.28e-05 5.78e-06 1.58e-05 3.69e-06 2.91e-06 6.41e-06 4.66e-06 7.38e-06 2.7e-06 2.84e-06 5.14e-06 9.57e-06 8.49e-06 3.23e-06 1.58e-05 3.85e-06 4.86e-06 4.49e-06 1.12e-05 9.19e-06 5.65e-06 9.5e-07 1.19e-06 3.43e-06 4.78e-06 2.59e-06 1.82e-06 1.96e-06 2.16e-06 1e-06 9.49e-07 1.27e-05 1.34e-06 2.36e-07 6.99e-07 1.7e-06 1.75e-06 7.04e-07 4.77e-07