logo

Genes within 1Mb (chr6:136290973:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 7.26e-01 0.0363 0.103 0.126 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 7.17e-01 0.0167 0.046 0.126 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 3.96e-01 -0.104 0.122 0.126 B L1
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0891 0.129 0.126 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 3.28e-01 0.0946 0.0965 0.126 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 9.41e-01 0.00676 0.0909 0.126 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 2.77e-01 -0.137 0.125 0.126 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 6.16e-01 0.0346 0.0689 0.126 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0379 0.0521 0.126 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 2.61e-01 -0.125 0.111 0.126 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0656 0.112 0.126 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 4.17e-03 -0.151 0.0522 0.126 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 1.42e-01 0.157 0.107 0.126 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 1.62e-01 0.11 0.0783 0.126 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 8.58e-01 -0.00951 0.0532 0.126 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 4.77e-01 0.0934 0.131 0.126 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 4.14e-01 0.0956 0.117 0.126 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0816 0.0698 0.126 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 8.06e-01 0.0242 0.0983 0.122 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 9.29e-01 0.00788 0.0885 0.122 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0425 0.138 0.122 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -259846 sc-eQTL 5.01e-02 0.222 0.113 0.122 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 8.73e-01 0.0138 0.0863 0.122 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 1.03e-01 0.205 0.125 0.122 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0736 0.109 0.122 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 3.85e-01 -0.103 0.118 0.122 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -493072 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0553 0.142 0.122 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0754 0.0778 0.126 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0729 0.0665 0.126 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 4.15e-01 -0.107 0.131 0.126 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -259846 sc-eQTL 7.30e-01 0.04 0.116 0.126 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0608 0.109 0.126 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0428 0.0941 0.126 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 2.88e-01 0.0819 0.077 0.126 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -493072 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0699 0.0934 0.126 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 4.21e-01 0.0701 0.087 0.127 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 6.35e-01 -0.022 0.0462 0.127 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 8.36e-01 0.0278 0.134 0.127 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 4.44e-01 0.094 0.122 0.127 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0874 0.104 0.127 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0202 0.0815 0.126 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 9.25e-01 0.00642 0.0684 0.126 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 2.44e-01 -0.155 0.133 0.126 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 2.31e-01 0.156 0.13 0.126 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 40638 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0253 0.0769 0.126 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 2.72e-01 -0.108 0.0977 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0116 0.134 0.125 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0199 0.109 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0908 0.132 0.125 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 6.93e-01 0.0572 0.144 0.125 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0497 0.133 0.125 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 4.77e-01 0.106 0.148 0.125 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0256 0.108 0.125 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 3.45e-01 0.118 0.125 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 3.15e-01 0.0714 0.0709 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 6.87e-01 0.0528 0.131 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 4.06e-01 -0.115 0.138 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0317 0.122 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 6.59e-01 0.05 0.113 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 4.32e-01 -0.101 0.128 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 9.17e-01 0.0141 0.135 0.123 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 9.29e-01 0.00717 0.0804 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 2.95e-01 0.143 0.136 0.123 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 7.25e-01 0.0484 0.138 0.123 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 7.83e-01 0.0344 0.125 0.123 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 8.52e-01 0.0226 0.121 0.123 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0599 0.116 0.123 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 7.20e-01 0.0372 0.104 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 5.89e-01 0.032 0.0592 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 6.16e-03 -0.372 0.134 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 4.17e-01 -0.108 0.133 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 1.54e-01 0.164 0.114 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 2.78e-01 0.106 0.0973 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 1.53e-01 -0.193 0.134 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 2.30e-01 -0.155 0.128 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 1.62e-01 0.104 0.0744 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000852 0.141 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0542 0.14 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0653 0.13 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 3.51e-01 -0.102 0.109 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0123 0.132 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 1.59e-01 -0.169 0.119 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0536 0.106 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0613 0.133 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 1.45e-01 0.187 0.128 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0845 0.125 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0587 0.108 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 2.85e-01 0.0698 0.0651 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0677 0.0522 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 9.99e-01 0.000189 0.123 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0627 0.115 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 4.46e-03 -0.148 0.0514 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 1.69e-01 0.16 0.116 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0379 0.0912 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0156 0.0576 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0765 0.134 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0484 0.12 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 1.01e-01 -0.122 0.0744 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 6.53e-01 0.0586 0.13 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0446 0.103 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0727 0.0731 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 3.37e-01 -0.128 0.133 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0686 0.125 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 5.95e-02 -0.199 0.105 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 3.39e-01 0.119 0.124 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0135 0.0936 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0307 0.0624 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 5.04e-01 -0.086 0.129 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 8.69e-01 0.0206 0.125 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0323 0.111 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 4.04e-01 0.078 0.0932 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0981 0.0648 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 7.44e-01 0.0443 0.135 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 5.18e-01 0.0792 0.122 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0448 0.0865 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 4.40e-01 0.0942 0.122 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000346 0.0915 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 2.87e-01 0.149 0.14 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 6.73e-01 0.057 0.135 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 9.15e-01 0.0126 0.118 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 6.18e-01 0.0585 0.117 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 2.92e-01 -0.116 0.11 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 1.44e-01 0.197 0.134 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 5.42e-02 0.262 0.135 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 4.48e-02 -0.267 0.132 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 2.24e-01 -0.116 0.0953 0.123 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0204 0.0794 0.123 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 6.58e-02 -0.238 0.129 0.123 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 3.16e-01 0.138 0.137 0.123 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 40638 sc-eQTL 2.37e-01 0.127 0.107 0.123 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 3.05e-01 -0.115 0.112 0.123 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 5.92e-01 0.0551 0.103 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 1.20e-01 -0.118 0.0753 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 9.57e-01 0.00729 0.134 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0909 0.125 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 9.61e-01 0.00576 0.116 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 6.50e-01 0.0367 0.0806 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 3.62e-01 0.0481 0.0526 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 6.08e-01 0.0714 0.139 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 2.99e-01 0.141 0.136 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0397 0.109 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 1.68e-01 0.145 0.105 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0971 0.0889 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 1.64e-01 -0.186 0.133 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 7.12e-01 0.0517 0.14 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 1.16e-01 -0.208 0.132 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 5.76e-01 0.0475 0.085 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0491 0.0634 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 3.49e-01 0.125 0.133 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 2.82e-01 0.138 0.128 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0682 0.104 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 5.95e-01 0.0943 0.177 0.122 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0529 0.153 0.122 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 4.62e-01 -0.134 0.182 0.122 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 3.41e-02 -0.406 0.189 0.122 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 2.10e-01 0.163 0.129 0.122 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 9.93e-01 0.00137 0.157 0.122 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0599 0.131 0.122 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 4.21e-01 0.0853 0.106 0.126 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 2.75e-02 -0.241 0.109 0.126 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 5.14e-01 0.0841 0.129 0.126 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 3.98e-01 -0.115 0.136 0.126 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 40638 sc-eQTL 5.17e-02 -0.174 0.0888 0.126 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 3.42e-02 -0.264 0.124 0.126 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 2.77e-01 -0.134 0.123 0.126 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 1.02e-01 0.13 0.0791 0.126 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 1.14e-01 -0.205 0.129 0.126 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 3.04e-01 -0.13 0.126 0.126 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 7.19e-01 0.0306 0.0849 0.126 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 3.70e-02 0.248 0.118 0.126 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 2.57e-01 0.124 0.109 0.12 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0414 0.11 0.12 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00736 0.142 0.12 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -259846 sc-eQTL 9.53e-02 0.21 0.125 0.12 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 4.45e-01 0.0982 0.128 0.12 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 1.39e-01 0.186 0.125 0.12 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0168 0.111 0.12 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0941 0.114 0.12 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -493072 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0461 0.145 0.12 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0306 0.073 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0656 0.0782 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00463 0.131 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -259846 sc-eQTL 3.89e-01 0.0974 0.113 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0792 0.114 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 8.57e-01 0.02 0.111 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 2.32e-01 0.0977 0.0814 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -493072 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0426 0.105 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 1.74e-01 -0.115 0.0842 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 6.08e-01 0.0445 0.0868 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0928 0.136 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -259846 sc-eQTL 9.28e-01 0.0114 0.126 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 5.40e-01 0.0763 0.124 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 3.24e-01 -0.114 0.116 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 6.31e-01 0.0492 0.102 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -493072 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0845 0.105 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0815 0.122 0.136 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0925 0.108 0.136 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0191 0.155 0.136 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0231 0.148 0.136 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 40638 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0195 0.119 0.136 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 2.46e-01 -0.185 0.159 0.136 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0609 0.0907 0.129 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 2.64e-01 -0.134 0.12 0.129 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 7.93e-03 -0.322 0.12 0.129 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -259846 sc-eQTL 9.07e-02 0.203 0.12 0.129 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0583 0.13 0.129 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 8.67e-01 0.0199 0.119 0.129 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 2.54e-01 -0.145 0.127 0.129 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -493072 sc-eQTL 1.46e-02 -0.327 0.133 0.129 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 1.44e-01 -0.154 0.105 0.133 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0236 0.0819 0.133 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 2.66e-01 -0.145 0.13 0.133 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -259846 sc-eQTL 2.44e-01 0.134 0.115 0.133 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 3.38e-01 -0.121 0.126 0.133 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 6.11e-01 0.0558 0.11 0.133 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 6.49e-01 0.0553 0.121 0.133 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -493072 sc-eQTL 1.40e-01 0.182 0.122 0.133 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0383 0.122 0.133 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 9.29e-01 0.00814 0.0916 0.133 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 7.41e-01 0.0446 0.134 0.133 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -259846 sc-eQTL 5.62e-01 0.0544 0.0938 0.133 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 7.42e-01 0.0337 0.102 0.133 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 1.45e-01 0.186 0.127 0.133 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 3.37e-01 -0.144 0.15 0.133 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 5.46e-01 0.0747 0.123 0.133 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -493072 sc-eQTL 6.24e-01 0.068 0.138 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 4.24e-01 0.0858 0.107 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 8.12e-01 0.0143 0.0602 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 7.28e-01 0.0429 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 3.73e-01 -0.117 0.131 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0141 0.111 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 3.94e-01 0.0853 0.0999 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 2.98e-01 -0.132 0.127 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0365 0.11 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 4.19e-01 0.0408 0.0503 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 3.77e-02 -0.277 0.132 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 3.78e-01 -0.119 0.135 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 4.69e-01 0.0807 0.111 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00543 0.0921 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 410031 sc-eQTL 2.93e-01 -0.143 0.135 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0619 0.0734 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0411 0.0684 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0236 0.132 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -259846 sc-eQTL 7.61e-01 0.0359 0.118 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 7.52e-01 -0.035 0.111 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0526 0.0965 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 2.77e-01 0.0866 0.0795 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -493072 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0752 0.0947 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 1.44e-01 -0.127 0.0864 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0933 0.0782 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 3.44e-02 -0.276 0.13 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -259846 sc-eQTL 1.53e-01 0.181 0.126 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0875 0.12 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 439272 sc-eQTL 4.83e-01 0.0761 0.108 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0417 0.104 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -493072 sc-eQTL 8.41e-01 0.0248 0.123 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -928476 sc-eQTL 7.00e-01 0.0317 0.0823 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 1122 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00418 0.0478 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -531591 sc-eQTL 6.11e-01 0.0708 0.139 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 793208 sc-eQTL 1.44e-01 0.185 0.126 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -501504 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0656 0.101 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146410 MTFR2 40649 eQTL 2.18e-07 0.174 0.0334 0.0 0.0 0.116
ENSG00000182747 SLC35D3 -631328 eQTL 0.00597 -0.131 0.0476 0.0 0.0 0.116

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146410 MTFR2 40649 1.2e-05 1.24e-05 1.68e-06 4.11e-06 1.82e-06 4.2e-06 1.23e-05 1.26e-06 7.68e-06 4.04e-06 1.19e-05 4.92e-06 1.79e-05 3.95e-06 2.94e-06 5.06e-06 3.75e-06 3.89e-06 2.58e-06 2.59e-06 3.64e-06 8.97e-06 9.7e-06 2.78e-06 1.21e-05 2.21e-06 3.58e-06 2.3e-06 1.13e-05 7.86e-06 4.6e-06 5.76e-07 7.68e-07 2.2e-06 2.8e-06 1.11e-06 1.07e-06 4.58e-07 8.53e-07 1.04e-06 2.08e-07 1.71e-05 1.49e-06 1.75e-07 6.74e-07 1.72e-06 1.05e-06 6.8e-07 5.77e-07
ENSG00000182747 SLC35D3 -631328 2.56e-07 1.16e-07 3.41e-08 1.66e-07 1.03e-07 9.14e-08 1.31e-07 5.29e-08 1.33e-07 3.99e-08 1.55e-07 7.4e-08 1.2e-07 6.1e-08 4.77e-08 7.4e-08 5.2e-08 1.02e-07 4.91e-08 2.88e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.32e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.04e-07 1.08e-07 9.43e-08 3.19e-08 2.75e-08 8.21e-08 1.06e-07 4.23e-08 5.09e-08 8e-08 8.44e-08 3.87e-08 3.31e-08 1.42e-07 4.33e-08 0.0 1.15e-07 1.83e-08 1.5e-07 4.96e-09 4.72e-08