logo

Genes within 1Mb (chr6:136288138:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 6.44e-01 0.0343 0.0742 0.267 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 6.66e-01 0.0143 0.033 0.267 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 9.69e-01 0.00344 0.0878 0.267 B L1
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0572 0.0928 0.267 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 1.13e-01 0.11 0.069 0.267 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00487 0.0653 0.267 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0366 0.0901 0.267 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0541 0.0495 0.267 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0101 0.0376 0.267 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 6.60e-01 0.0352 0.08 0.267 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0398 0.0809 0.267 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 3.03e-02 -0.0827 0.0379 0.267 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 7.71e-02 0.136 0.0767 0.267 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0148 0.0562 0.267 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 7.93e-01 0.00999 0.038 0.267 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 6.44e-01 0.0434 0.0937 0.267 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0857 0.0834 0.267 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0549 0.0499 0.267 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0309 0.0698 0.264 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0819 0.0625 0.264 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 9.98e-01 0.000259 0.0983 0.264 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -262681 sc-eQTL 1.72e-01 0.11 0.0804 0.264 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 8.27e-01 0.0134 0.0613 0.264 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 5.28e-01 0.0566 0.0895 0.264 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 6.72e-01 0.0329 0.0774 0.264 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 7.39e-01 0.028 0.084 0.264 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -495907 sc-eQTL 2.84e-01 -0.108 0.101 0.264 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0045 0.0571 0.267 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 3.48e-02 -0.103 0.0483 0.267 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 5.91e-01 0.0517 0.0959 0.267 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -262681 sc-eQTL 8.39e-02 0.146 0.0841 0.267 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 6.81e-01 0.0329 0.0799 0.267 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0663 0.0687 0.267 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 4.39e-01 0.0437 0.0564 0.267 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -495907 sc-eQTL 6.96e-01 0.0267 0.0684 0.267 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 2.62e-01 -0.071 0.0631 0.268 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 3.73e-01 0.03 0.0335 0.268 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0603 0.0976 0.268 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 8.63e-01 0.0154 0.0891 0.268 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 3.89e-02 -0.155 0.0747 0.268 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0124 0.0589 0.267 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0337 0.0494 0.267 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 8.39e-02 -0.166 0.0954 0.267 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 9.33e-01 0.0079 0.0939 0.267 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 37803 sc-eQTL 5.07e-01 0.0368 0.0555 0.267 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0406 0.0708 0.267 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 3.98e-01 0.0826 0.0976 0.263 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 4.15e-01 0.0648 0.0792 0.263 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 8.68e-01 -0.016 0.0962 0.263 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 2.22e-01 0.128 0.105 0.263 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 2.90e-01 0.102 0.0965 0.263 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0433 0.108 0.263 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 7.16e-01 0.0287 0.0787 0.263 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 1.33e-01 -0.135 0.0896 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 8.33e-01 0.0108 0.0512 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 6.56e-01 -0.042 0.0942 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 8.31e-01 0.0213 0.0999 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0318 0.0876 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 1.23e-01 0.126 0.081 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0842 0.092 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0384 0.0975 0.261 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 6.80e-01 0.0239 0.0579 0.261 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 2.98e-01 0.103 0.0982 0.261 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0534 0.0991 0.261 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 1.31e-01 0.136 0.0896 0.261 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0594 0.087 0.261 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 1.38e-01 0.123 0.0829 0.261 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 2.45e-01 0.0886 0.076 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 7.48e-01 0.014 0.0436 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 1.38e-01 -0.149 0.1 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 1.69e-01 -0.135 0.0977 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 2.40e-01 0.0994 0.0843 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 7.13e-01 0.0264 0.0717 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 2.53e-01 -0.113 0.099 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 7.85e-02 -0.166 0.0938 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0537 0.0546 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00424 0.103 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0216 0.103 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 6.03e-01 0.0494 0.095 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0713 0.0799 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 3.92e-01 0.0832 0.0969 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 9.23e-02 -0.145 0.0856 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0807 0.0763 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 6.53e-01 0.0431 0.0955 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 5.81e-01 0.0511 0.0925 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 2.46e-01 -0.105 0.0899 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0508 0.0777 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0232 0.0473 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0216 0.038 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 8.34e-01 0.0187 0.0893 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0306 0.0836 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 2.68e-02 -0.0838 0.0376 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 1.87e-01 0.111 0.0839 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0857 0.0653 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0101 0.0414 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 2.95e-01 0.101 0.0961 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 2.79e-01 0.0935 0.0861 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0702 0.0536 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 6.48e-01 0.0428 0.0934 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0583 0.0741 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 6.90e-02 -0.0954 0.0522 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0184 0.0957 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0851 0.0893 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 2.56e-02 -0.169 0.0752 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 8.42e-01 0.0178 0.0892 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00905 0.0679 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0368 0.0452 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 4.23e-01 -0.075 0.0933 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 2.29e-01 -0.109 0.0903 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0757 0.0805 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 2.89e-01 0.0713 0.067 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0311 0.0468 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 5.06e-01 0.0647 0.0972 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 7.95e-01 0.0229 0.088 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 7.48e-01 -0.02 0.0622 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0723 0.0895 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 7.40e-01 0.0223 0.0673 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 9.91e-01 0.00116 0.103 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 1.29e-01 -0.15 0.0986 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 4.28e-01 0.0689 0.0866 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 8.43e-01 0.0168 0.0849 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0735 0.08 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 7.88e-01 0.0264 0.0977 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 3.48e-01 0.0929 0.0987 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 2.91e-01 -0.102 0.0966 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0293 0.0691 0.264 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0347 0.0574 0.264 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0878 0.0936 0.264 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0754 0.0995 0.264 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 37803 sc-eQTL 4.94e-02 0.152 0.0768 0.264 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 8.24e-01 -0.018 0.081 0.264 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00383 0.0757 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 6.69e-01 0.0239 0.0558 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 2.20e-01 -0.121 0.0983 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0489 0.092 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0609 0.0856 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 6.41e-02 -0.108 0.0578 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 4.13e-02 0.0773 0.0377 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 3.18e-01 0.1 0.1 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 5.09e-01 0.065 0.0982 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0839 0.0787 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 5.74e-01 0.0425 0.0754 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 4.29e-02 -0.129 0.0633 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 1.28e-02 -0.237 0.0944 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 2.81e-01 -0.108 0.0999 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 7.83e-03 -0.251 0.0934 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0505 0.0626 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0264 0.0468 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 5.05e-01 0.0658 0.0984 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 6.70e-01 0.0403 0.0944 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0905 0.0767 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 3.20e-01 -0.124 0.125 0.27 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0822 0.108 0.27 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 8.48e-01 0.0246 0.129 0.27 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 2.41e-02 -0.305 0.133 0.27 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 4.16e-01 0.0748 0.0916 0.27 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 9.16e-01 0.0117 0.111 0.27 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 2.33e-01 -0.11 0.0922 0.27 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 3.62e-01 0.0692 0.0757 0.27 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 1.76e-01 -0.106 0.0783 0.27 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 1.18e-01 -0.144 0.0916 0.27 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0705 0.0973 0.27 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 37803 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0588 0.0639 0.27 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 2.94e-02 -0.194 0.0884 0.27 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0651 0.0895 0.267 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 2.22e-01 0.0707 0.0577 0.267 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0714 0.0946 0.267 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00544 0.0921 0.267 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 5.89e-01 0.0334 0.0617 0.267 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 6.20e-01 0.0431 0.0868 0.267 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 8.93e-01 0.0104 0.0771 0.261 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0633 0.0775 0.261 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 6.71e-01 0.0424 0.0996 0.261 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -262681 sc-eQTL 8.01e-02 0.155 0.0881 0.261 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 9.13e-01 0.00987 0.0906 0.261 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 5.76e-01 0.0495 0.0884 0.261 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0116 0.0782 0.261 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 4.07e-01 0.0666 0.0801 0.261 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -495907 sc-eQTL 5.56e-01 -0.06 0.102 0.261 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 8.56e-01 -0.00971 0.0535 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0563 0.0573 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 3.43e-01 0.0913 0.0961 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -262681 sc-eQTL 1.54e-02 0.2 0.0818 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0148 0.0836 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0536 0.0814 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 2.92e-01 0.0631 0.0598 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -495907 sc-eQTL 4.21e-01 0.062 0.0769 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 6.20e-01 0.0308 0.0621 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0671 0.0636 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0828 0.0995 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -262681 sc-eQTL 8.56e-01 0.0169 0.0929 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 5.33e-01 0.057 0.0912 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 1.19e-01 -0.133 0.0846 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 6.41e-01 0.035 0.075 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -495907 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0755 0.0772 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0654 0.0915 0.261 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 6.84e-02 -0.146 0.0797 0.261 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.116 0.261 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 8.36e-01 -0.023 0.111 0.261 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 37803 sc-eQTL 5.29e-01 0.0561 0.0888 0.261 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 4.82e-01 -0.084 0.119 0.261 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0724 0.0663 0.273 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 1.16e-02 -0.22 0.0864 0.273 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0527 0.0895 0.273 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -262681 sc-eQTL 3.79e-01 0.0776 0.088 0.273 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 5.38e-01 0.0588 0.0954 0.273 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 2.57e-01 0.0987 0.0868 0.273 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0738 0.0933 0.273 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -495907 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0733 0.0985 0.273 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 8.94e-02 -0.133 0.0777 0.269 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00186 0.0608 0.269 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0128 0.0969 0.269 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -262681 sc-eQTL 2.29e-01 0.103 0.0853 0.269 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 3.32e-01 0.091 0.0936 0.269 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 7.12e-01 0.03 0.0812 0.269 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 5.34e-01 -0.056 0.0899 0.269 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -495907 sc-eQTL 1.31e-01 0.138 0.0908 0.269 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0578 0.0935 0.266 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 2.43e-01 -0.082 0.0699 0.266 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 8.63e-01 0.0178 0.103 0.266 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -262681 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0177 0.0719 0.266 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0478 0.0782 0.266 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 5.09e-01 0.0646 0.0976 0.266 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 6.40e-01 -0.054 0.115 0.266 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 2.66e-01 0.105 0.0943 0.266 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -495907 sc-eQTL 7.70e-01 0.0311 0.106 0.266 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0529 0.0779 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 5.12e-01 0.0287 0.0437 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 8.44e-01 0.0176 0.0896 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0497 0.0952 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 5.92e-01 0.0432 0.0805 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 3.96e-01 0.0618 0.0727 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 6.51e-01 -0.042 0.0926 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 7.02e-01 0.0307 0.0801 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 8.04e-01 -0.00915 0.0368 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 1.37e-01 -0.145 0.097 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 2.54e-01 -0.112 0.0982 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 1.58e-01 0.115 0.081 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 6.56e-01 -0.03 0.0672 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 407196 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0494 0.0991 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 9.05e-01 0.00642 0.0539 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0681 0.05 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 6.49e-01 0.0442 0.0967 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -262681 sc-eQTL 9.00e-02 0.146 0.0859 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 9.71e-01 0.00297 0.0811 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0975 0.0705 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 4.69e-01 0.0423 0.0584 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -495907 sc-eQTL 7.87e-01 0.0188 0.0695 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 8.82e-02 -0.109 0.0634 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 9.00e-02 -0.0977 0.0573 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00353 0.0964 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -262681 sc-eQTL 3.52e-01 0.0868 0.093 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 4.18e-01 0.0715 0.0882 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 436437 sc-eQTL 2.09e-01 0.1 0.0794 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0668 0.0764 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -495907 sc-eQTL 1.76e-01 0.123 0.0904 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -931311 sc-eQTL 8.60e-02 -0.103 0.0595 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -1713 sc-eQTL 5.38e-01 0.0215 0.0348 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -534426 sc-eQTL 6.35e-01 0.0481 0.101 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 790373 sc-eQTL 5.68e-01 0.0526 0.092 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 sc-eQTL 7.68e-02 -0.13 0.0732 0.269 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146410 MTFR2 37814 eQTL 0.00648 0.0677 0.0248 0.0 0.0 0.263
ENSG00000197442 MAP3K5 -504339 eQTL 0.0293 -0.0302 0.0138 0.0 0.0 0.263

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146410 MTFR2 37814 2.66e-05 2.95e-05 3.68e-06 1.34e-05 5.58e-06 1.19e-05 3.43e-05 4.35e-06 2.6e-05 1.19e-05 3.22e-05 1.56e-05 3.96e-05 1.16e-05 5.8e-06 1.39e-05 1.35e-05 2.17e-05 6.6e-06 5.38e-06 1.07e-05 2.55e-05 2.61e-05 7.06e-06 4.05e-05 6.12e-06 1.05e-05 9.99e-06 2.5e-05 2.1e-05 1.68e-05 1.6e-06 1.92e-06 5.37e-06 1.01e-05 4.49e-06 2.42e-06 2.97e-06 3.46e-06 3.04e-06 1.64e-06 3.32e-05 2.98e-06 4.37e-07 2.16e-06 2.98e-06 3.59e-06 1.5e-06 1.19e-06