Genes within 1Mb (chr6:136243257:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 2.65e-01 -0.131 0.117 0.085 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0052 0.0522 0.085 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 6.63e-02 -0.254 0.138 0.085 B L1
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 4.25e-01 -0.117 0.147 0.085 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0206 0.11 0.085 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 2.74e-01 0.113 0.103 0.085 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 1.51e-01 -0.204 0.142 0.085 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 8.38e-01 0.016 0.0782 0.085 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0747 0.059 0.085 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 2.97e-01 -0.131 0.126 0.085 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 3.83e-01 -0.111 0.127 0.085 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 2.85e-02 -0.132 0.0597 0.085 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 4.32e-01 0.0957 0.121 0.085 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00968 0.0899 0.085 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 6.95e-01 0.0239 0.0608 0.085 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 5.33e-01 0.0936 0.15 0.085 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0681 0.134 0.085 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 6.68e-02 -0.146 0.0793 0.085 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 2.85e-01 0.114 0.106 0.09 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 5.57e-02 -0.183 0.0951 0.09 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 1.41e-01 0.221 0.149 0.09 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -307562 sc-eQTL 5.53e-01 0.0733 0.123 0.09 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 1.04e-01 -0.152 0.093 0.09 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0851 0.137 0.09 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0464 0.118 0.09 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 7.68e-01 0.0378 0.128 0.09 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -540788 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0472 0.154 0.09 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 7.54e-02 -0.16 0.0897 0.085 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0423 0.0773 0.085 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 2.17e-01 -0.188 0.152 0.085 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -307562 sc-eQTL 5.25e-01 0.0854 0.134 0.085 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 2.25e-01 -0.154 0.126 0.085 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 5.76e-01 0.0612 0.109 0.085 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 3.38e-01 0.0858 0.0893 0.085 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -540788 sc-eQTL 6.79e-02 0.197 0.108 0.085 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0852 0.1 0.086 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 7.15e-01 0.0195 0.0533 0.086 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 3.48e-01 -0.145 0.154 0.086 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 2.13e-01 -0.176 0.141 0.086 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0804 0.12 0.086 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 8.64e-01 0.0162 0.0941 0.085 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 3.22e-01 0.0781 0.0787 0.085 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 9.66e-01 0.0065 0.153 0.085 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 4.44e-01 -0.115 0.15 0.085 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 -7078 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0309 0.0886 0.085 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 2.33e-01 -0.135 0.113 0.085 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0947 0.149 0.089 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 9.73e-01 0.00408 0.121 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0771 0.147 0.089 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0415 0.161 0.089 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 1.21e-01 0.228 0.147 0.089 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0885 0.165 0.089 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 1.55e-01 0.17 0.119 0.089 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0849 0.138 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 7.05e-01 0.0297 0.0783 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 3.39e-01 -0.138 0.144 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 8.90e-01 0.0211 0.153 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 3.91e-01 -0.115 0.134 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 7.14e-02 0.224 0.124 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 2.58e-01 -0.159 0.14 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 9.10e-01 0.0169 0.149 0.086 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 7.64e-01 0.0265 0.0884 0.086 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 2.05e-01 0.19 0.15 0.086 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 3.42e-01 -0.144 0.151 0.086 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 7.68e-01 0.0405 0.137 0.086 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 6.38e-01 0.0627 0.133 0.086 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 2.73e-01 -0.139 0.127 0.086 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 2.95e-01 -0.124 0.118 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0568 0.0675 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 1.86e-01 -0.206 0.155 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 3.05e-01 -0.156 0.152 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0105 0.131 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 6.74e-01 0.0469 0.111 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0165 0.154 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0255 0.145 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 7.21e-01 0.0301 0.0843 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 4.60e-01 -0.118 0.159 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0906 0.158 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0563 0.146 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 7.83e-01 0.0339 0.123 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 2.70e-01 -0.165 0.149 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 5.69e-01 -0.077 0.135 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 4.39e-01 -0.093 0.12 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0376 0.15 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 2.09e-01 -0.182 0.145 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0739 0.141 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0858 0.122 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0126 0.0744 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 8.46e-02 -0.103 0.0593 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 9.89e-01 0.00194 0.141 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0946 0.131 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 5.68e-02 -0.113 0.0593 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 5.67e-01 0.076 0.132 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 9.35e-01 0.00839 0.103 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00863 0.0653 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 1.63e-02 -0.363 0.15 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 9.75e-01 0.00435 0.136 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 2.11e-02 -0.195 0.0839 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 4.52e-01 0.111 0.147 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0361 0.117 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0473 0.0831 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 9.09e-01 0.0174 0.151 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 2.02e-01 -0.181 0.141 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 9.27e-01 0.0111 0.12 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0552 0.141 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 2.69e-01 -0.121 0.109 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 4.83e-01 0.0511 0.0728 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0324 0.15 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0468 0.146 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 2.12e-02 -0.298 0.128 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0632 0.105 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0169 0.0733 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 3.98e-01 0.129 0.152 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0215 0.138 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0301 0.0973 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 7.52e-01 0.043 0.136 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 9.61e-01 -0.005 0.102 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 6.91e-01 0.0622 0.156 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 3.17e-01 -0.15 0.15 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 1.10e-01 -0.21 0.131 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 8.50e-01 0.0253 0.134 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 2.12e-01 -0.158 0.126 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0823 0.154 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 9.75e-01 0.00486 0.156 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0289 0.153 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 2.76e-01 -0.117 0.107 0.087 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00049 0.089 0.087 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 6.37e-01 0.0687 0.145 0.087 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0751 0.154 0.087 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 -7078 sc-eQTL 6.66e-01 0.0519 0.12 0.087 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0886 0.125 0.087 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 5.16e-01 -0.077 0.118 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 1.46e-01 0.127 0.087 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 3.74e-01 0.137 0.154 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0502 0.144 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 2.13e-01 -0.167 0.134 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0802 0.092 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0666 0.06 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 4.81e-01 -0.112 0.159 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 4.23e-01 -0.125 0.155 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00164 0.125 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0438 0.122 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 9.58e-01 0.00543 0.103 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 9.01e-01 0.0192 0.154 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 8.19e-02 -0.28 0.16 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 3.60e-01 0.14 0.153 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 1.47e-01 -0.142 0.0975 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 5.43e-01 0.0445 0.0731 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 3.47e-01 -0.145 0.154 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 2.58e-01 -0.167 0.147 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 2.72e-01 -0.132 0.12 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 8.66e-01 0.0332 0.196 0.081 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 9.69e-01 0.00661 0.169 0.081 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 5.59e-01 -0.118 0.201 0.081 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 2.41e-01 -0.25 0.212 0.081 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 4.16e-02 0.291 0.141 0.081 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 2.10e-01 -0.217 0.172 0.081 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 1.60e-01 -0.204 0.144 0.081 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 3.75e-01 0.107 0.121 0.087 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 7.45e-01 0.0408 0.125 0.087 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 2.25e-01 -0.178 0.146 0.087 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0914 0.155 0.087 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 -7078 sc-eQTL 8.15e-02 -0.177 0.101 0.087 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0217 0.143 0.087 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 6.79e-01 0.0582 0.14 0.085 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0526 0.0905 0.085 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0703 0.148 0.085 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0216 0.144 0.085 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 1.11e-01 -0.154 0.096 0.085 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 1.13e-01 0.215 0.135 0.085 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 7.16e-02 0.209 0.115 0.09 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 1.21e-01 -0.182 0.117 0.09 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 1.27e-01 0.23 0.15 0.09 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -307562 sc-eQTL 5.99e-01 0.0707 0.134 0.09 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 3.32e-02 -0.29 0.135 0.09 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0739 0.134 0.09 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 1.59e-01 -0.166 0.117 0.09 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 1.39e-01 -0.179 0.121 0.09 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -540788 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0207 0.154 0.09 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 2.21e-01 -0.104 0.0844 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0141 0.0909 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 2.16e-01 -0.188 0.152 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -307562 sc-eQTL 8.23e-02 0.228 0.13 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 9.20e-02 -0.222 0.131 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0169 0.129 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0141 0.0948 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -540788 sc-eQTL 3.28e-01 0.119 0.122 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 1.91e-01 -0.129 0.0983 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0315 0.101 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 1.14e-01 -0.25 0.157 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -307562 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0283 0.148 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 4.40e-01 0.112 0.145 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 5.53e-01 0.0802 0.135 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 1.16e-02 0.299 0.117 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -540788 sc-eQTL 5.18e-01 0.0795 0.123 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0668 0.131 0.1 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 1.32e-01 -0.173 0.114 0.1 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 7.84e-01 0.0455 0.166 0.1 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 1.00e+00 -6.93e-05 0.158 0.1 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 -7078 sc-eQTL 9.57e-01 0.00689 0.127 0.1 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 3.04e-01 -0.175 0.17 0.1 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0434 0.103 0.089 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 8.54e-01 -0.025 0.135 0.089 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00015 0.138 0.089 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -307562 sc-eQTL 2.36e-01 -0.161 0.136 0.089 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 4.88e-01 -0.102 0.147 0.089 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 4.37e-01 0.105 0.134 0.089 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0505 0.144 0.089 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -540788 sc-eQTL 9.52e-02 0.253 0.151 0.089 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 2.48e-02 -0.268 0.119 0.09 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0474 0.0933 0.09 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 3.51e-01 0.139 0.149 0.09 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -307562 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0149 0.131 0.09 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 4.61e-01 -0.106 0.144 0.09 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 5.18e-01 0.0809 0.125 0.09 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 2.93e-01 -0.145 0.138 0.09 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -540788 sc-eQTL 2.51e-01 0.161 0.14 0.09 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 8.16e-01 0.0308 0.132 0.105 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 8.83e-02 -0.169 0.0984 0.105 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 3.91e-01 0.125 0.145 0.105 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -307562 sc-eQTL 4.90e-01 0.0704 0.102 0.105 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0799 0.111 0.105 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0125 0.138 0.105 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 8.19e-01 0.0373 0.163 0.105 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 1.37e-01 0.199 0.133 0.105 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -540788 sc-eQTL 6.75e-01 0.0631 0.15 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0412 0.122 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 7.06e-01 0.0259 0.0686 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 7.99e-01 0.0359 0.141 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0845 0.149 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0583 0.126 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 1.13e-01 0.181 0.114 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 2.12e-01 -0.181 0.145 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 3.15e-01 -0.125 0.124 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 6.75e-01 -0.024 0.0573 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 1.13e-01 -0.24 0.151 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 4.39e-01 -0.119 0.153 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0468 0.127 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 6.09e-01 0.0536 0.105 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 362315 sc-eQTL 4.47e-01 -0.117 0.154 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 1.41e-01 -0.126 0.0851 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0189 0.0796 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 7.13e-02 -0.276 0.152 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -307562 sc-eQTL 2.43e-01 0.16 0.137 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 3.37e-01 -0.124 0.128 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 8.16e-01 0.0261 0.112 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 2.42e-01 0.108 0.0924 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -540788 sc-eQTL 3.09e-01 0.112 0.11 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 5.96e-02 -0.187 0.0988 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0464 0.09 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 4.16e-01 0.122 0.15 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -307562 sc-eQTL 2.56e-01 -0.165 0.145 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 2.43e-01 -0.161 0.137 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 391556 sc-eQTL 4.41e-01 0.0959 0.124 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 3.40e-01 -0.114 0.119 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -540788 sc-eQTL 4.22e-02 0.287 0.14 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -976192 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0879 0.0943 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0293 0.0548 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -579307 sc-eQTL 4.10e-01 -0.131 0.159 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 745492 sc-eQTL 2.20e-01 -0.178 0.145 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -549220 sc-eQTL 5.71e-01 -0.066 0.116 0.086 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000029363 BCLAF1 -46594 eQTL 0.0334 0.0328 0.0154 0.0 0.0 0.0873
ENSG00000182747 SLC35D3 -679044 eQTL 0.00431 -0.156 0.0545 0.0 0.0 0.0873


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 \N -307562 1.24e-06 1.01e-06 3.45e-07 6.38e-07 3.48e-07 4.76e-07 1.38e-06 3.68e-07 1.28e-06 4.52e-07 1.48e-06 6.57e-07 1.95e-06 2.76e-07 5.5e-07 7.95e-07 8.37e-07 5.76e-07 8.21e-07 6.34e-07 6.17e-07 1.28e-06 8.96e-07 6.47e-07 1.96e-06 4.28e-07 7.73e-07 7.08e-07 1.24e-06 1.29e-06 5.88e-07 2.06e-07 2.42e-07 5.82e-07 4.36e-07 4.67e-07 5.1e-07 2.24e-07 3.74e-07 3.23e-07 2.67e-07 1.62e-06 6.17e-08 4.22e-08 2.98e-07 1.11e-07 2.21e-07 3.7e-08 1.56e-07
ENSG00000182747 SLC35D3 -679044 3.21e-07 1.67e-07 6.72e-08 2.24e-07 1.07e-07 8.85e-08 2.5e-07 6.75e-08 1.85e-07 1.11e-07 1.86e-07 1.59e-07 2.38e-07 8.44e-08 6.93e-08 9.48e-08 5.73e-08 2.15e-07 8.68e-08 8.52e-08 1.33e-07 1.89e-07 1.73e-07 3.67e-08 2.37e-07 1.65e-07 1.25e-07 1.44e-07 1.36e-07 1.8e-07 1.26e-07 6.04e-08 4.76e-08 9.5e-08 4.78e-08 3.94e-08 5.76e-08 6.11e-08 4.75e-08 8.09e-08 4.51e-08 1.55e-07 3.59e-08 1.08e-08 7.89e-08 1.05e-08 9.1e-08 0.0 4.74e-08
ENSG00000197442 \N -549220 5.37e-07 3.12e-07 8.9e-08 2.62e-07 9.82e-08 1.57e-07 4.05e-07 9.78e-08 2.6e-07 1.89e-07 3.66e-07 2.8e-07 4.27e-07 9.48e-08 1.45e-07 1.53e-07 1.62e-07 2.96e-07 1.77e-07 1.24e-07 1.76e-07 2.63e-07 2.63e-07 1.13e-07 4.11e-07 2.29e-07 1.85e-07 1.97e-07 2.31e-07 3.71e-07 1.93e-07 6.13e-08 5.77e-08 1.24e-07 1.54e-07 6.85e-08 1e-07 7.86e-08 4.11e-08 5.25e-08 7.16e-08 2.9e-07 1.7e-08 1.71e-08 1.29e-07 1.91e-08 7.89e-08 1.15e-08 4.71e-08