logo

Genes within 1Mb (chr6:136240069:T:TAAAC):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0167 0.146 0.058 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00676 0.0648 0.058 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 1.02e-01 -0.281 0.171 0.058 B L1
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 7.09e-01 -0.068 0.182 0.058 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0267 0.136 0.058 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 3.52e-02 0.268 0.127 0.058 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 1.87e-01 -0.233 0.176 0.058 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 4.17e-01 0.0784 0.0965 0.058 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0115 0.0731 0.058 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0914 0.156 0.058 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 4.99e-01 -0.107 0.157 0.058 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 7.23e-04 -0.249 0.0726 0.058 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0453 0.15 0.058 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 1.08e-01 0.179 0.111 0.058 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 1.02e-01 0.123 0.0749 0.058 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 3.05e-01 0.19 0.185 0.058 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 3.18e-01 -0.166 0.165 0.058 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 9.48e-03 -0.255 0.0975 0.058 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 6.35e-02 0.244 0.131 0.061 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0786 0.118 0.061 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 8.21e-01 0.0421 0.186 0.061 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 -310750 sc-eQTL 4.88e-01 0.106 0.152 0.061 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 1.07e-01 -0.186 0.115 0.061 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0346 0.169 0.061 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0377 0.146 0.061 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 6.91e-02 0.287 0.157 0.061 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -543976 sc-eQTL 7.77e-01 0.0542 0.191 0.061 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0616 0.111 0.058 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0468 0.0949 0.058 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 9.27e-02 -0.314 0.186 0.058 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 -310750 sc-eQTL 4.56e-01 0.123 0.165 0.058 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 1.83e-01 -0.207 0.155 0.058 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 3.61e-01 0.122 0.134 0.058 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 5.99e-01 0.0579 0.11 0.058 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 -543976 sc-eQTL 2.13e-01 0.166 0.133 0.058 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 3.64e-01 0.114 0.126 0.058 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 5.50e-01 0.04 0.0668 0.058 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00819 0.194 0.058 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 5.67e-01 -0.102 0.177 0.058 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 3.58e-01 -0.138 0.15 0.058 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 2.91e-01 0.123 0.116 0.058 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 1.08e-01 0.157 0.097 0.058 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0684 0.19 0.058 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 9.85e-01 0.00349 0.186 0.058 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 -10266 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0426 0.11 0.058 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 5.11e-02 -0.272 0.139 0.058 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 9.24e-01 0.018 0.189 0.059 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 9.91e-02 0.252 0.152 0.059 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 3.87e-01 -0.161 0.186 0.059 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 1.70e-01 -0.279 0.202 0.059 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 2.72e-01 0.205 0.186 0.059 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0871 0.209 0.059 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 7.30e-01 0.0525 0.152 0.059 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 3.05e-01 0.176 0.171 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 2.03e-01 0.124 0.0971 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 8.39e-02 -0.309 0.178 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 9.93e-01 0.00168 0.19 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0134 0.167 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 3.82e-02 0.32 0.153 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 9.23e-01 0.017 0.175 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 1.94e-01 0.239 0.183 0.058 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 2.40e-01 0.129 0.109 0.058 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 3.89e-02 0.383 0.184 0.058 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 3.92e-01 -0.161 0.187 0.058 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 3.59e-01 -0.156 0.17 0.058 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 5.03e-01 0.11 0.164 0.058 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 1.85e-01 -0.208 0.157 0.058 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0492 0.146 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0228 0.0836 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 6.41e-02 -0.356 0.191 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0238 0.188 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0468 0.162 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 4.50e-01 0.104 0.137 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0737 0.191 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0237 0.181 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 8.90e-01 0.0145 0.105 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0144 0.198 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0176 0.197 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 7.01e-01 0.0699 0.182 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 3.31e-01 0.149 0.153 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 4.76e-01 -0.133 0.186 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0298 0.167 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 7.47e-01 -0.048 0.148 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0182 0.186 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 3.33e-01 -0.174 0.179 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 4.37e-01 -0.136 0.175 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 3.73e-01 0.135 0.151 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 5.96e-01 0.0488 0.0918 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0481 0.0737 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 8.35e-01 0.0361 0.174 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 3.03e-01 -0.167 0.162 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 6.16e-02 -0.138 0.0732 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0345 0.164 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 4.36e-01 0.0993 0.127 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 7.91e-01 0.0214 0.0805 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 2.34e-01 -0.223 0.187 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 4.58e-01 0.125 0.168 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 4.51e-04 -0.362 0.102 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0871 0.182 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 8.21e-01 0.0328 0.145 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0161 0.103 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0152 0.187 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 8.05e-01 0.0433 0.175 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 3.22e-01 -0.147 0.148 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 6.61e-01 0.0766 0.174 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 4.86e-01 0.0942 0.135 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 4.73e-01 0.0647 0.0899 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 4.41e-01 -0.143 0.185 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 5.25e-01 -0.114 0.18 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 2.02e-02 -0.371 0.158 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 2.32e-01 0.155 0.129 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 9.15e-01 0.00964 0.0906 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 3.74e-02 0.39 0.186 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 2.82e-01 -0.183 0.17 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 3.53e-01 -0.112 0.12 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 7.94e-02 0.295 0.167 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 3.87e-01 0.109 0.126 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 2.21e-01 0.236 0.192 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0356 0.186 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 3.81e-01 -0.143 0.163 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 4.69e-01 0.121 0.167 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 2.78e-01 -0.171 0.157 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 7.51e-01 0.0611 0.193 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 5.44e-01 -0.118 0.195 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 4.56e-01 -0.143 0.191 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0551 0.132 0.058 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 1.90e-01 0.144 0.109 0.058 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 5.11e-01 -0.118 0.179 0.058 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 5.37e-01 0.118 0.19 0.058 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 -10266 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0358 0.148 0.058 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 6.25e-02 -0.288 0.154 0.058 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 7.86e-01 0.0406 0.149 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 7.77e-01 0.0312 0.11 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 1.84e-01 0.258 0.193 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 8.57e-01 0.0328 0.181 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 2.10e-01 -0.212 0.168 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 7.07e-01 0.0438 0.116 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0298 0.0759 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 6.78e-01 0.0833 0.2 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 4.86e-01 -0.137 0.196 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 3.23e-01 -0.156 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 1.36e-01 0.229 0.153 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 6.93e-01 0.0514 0.13 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 6.55e-01 0.0873 0.195 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 1.79e-02 -0.48 0.201 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 6.85e-01 0.0787 0.193 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 6.13e-01 0.0619 0.122 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 4.31e-01 0.0719 0.0912 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 1.98e-01 -0.247 0.191 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 9.28e-01 0.0165 0.184 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 5.49e-01 -0.09 0.15 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 3.10e-01 -0.22 0.216 0.059 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 5.45e-01 -0.113 0.187 0.059 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 2.07e-01 -0.281 0.221 0.059 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0112 0.236 0.059 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00356 0.159 0.059 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 5.83e-01 -0.106 0.192 0.059 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 2.68e-02 -0.353 0.157 0.059 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 4.18e-02 0.305 0.149 0.059 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 7.59e-01 0.0479 0.156 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 4.48e-01 -0.139 0.182 0.059 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 3.50e-01 -0.181 0.193 0.059 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 -10266 sc-eQTL 9.97e-02 -0.209 0.126 0.059 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 8.75e-01 0.028 0.177 0.059 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 2.20e-01 0.213 0.173 0.058 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0648 0.112 0.058 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0422 0.184 0.058 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 8.25e-01 0.0397 0.179 0.058 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 1.00e-01 -0.197 0.119 0.058 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 2.97e-01 0.176 0.168 0.058 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 9.50e-03 0.377 0.144 0.061 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0948 0.147 0.061 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 3.52e-01 0.176 0.189 0.061 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -310750 sc-eQTL 6.32e-01 0.081 0.169 0.061 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 2.40e-01 -0.202 0.172 0.061 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 7.00e-01 0.0648 0.168 0.061 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 2.29e-01 -0.179 0.148 0.061 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 8.80e-01 0.0232 0.153 0.061 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -543976 sc-eQTL 4.58e-01 0.144 0.193 0.061 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0494 0.104 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0139 0.111 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 5.33e-01 -0.116 0.186 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 -310750 sc-eQTL 4.65e-01 0.117 0.16 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 8.19e-02 -0.281 0.161 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 4.21e-01 0.127 0.158 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 8.43e-01 -0.023 0.116 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -543976 sc-eQTL 4.16e-01 0.121 0.149 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0106 0.121 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0936 0.124 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 5.41e-02 -0.372 0.192 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 -310750 sc-eQTL 7.28e-01 0.0629 0.181 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 7.43e-01 0.0583 0.178 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 5.54e-01 0.098 0.165 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 2.90e-01 0.154 0.145 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -543976 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0406 0.15 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 5.46e-01 0.107 0.177 0.064 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 4.34e-01 -0.122 0.156 0.064 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 4.30e-01 0.177 0.224 0.064 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 9.68e-01 0.00866 0.214 0.064 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 -10266 sc-eQTL 3.72e-01 0.153 0.172 0.064 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 4.05e-01 -0.192 0.23 0.064 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 2.93e-01 0.132 0.125 0.06 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0267 0.166 0.06 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 2.20e-01 -0.208 0.169 0.06 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -310750 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0748 0.167 0.06 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0612 0.181 0.06 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 3.01e-01 0.17 0.164 0.06 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 6.50e-01 0.0802 0.177 0.06 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -543976 sc-eQTL 9.22e-02 0.314 0.185 0.06 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 1.34e-01 -0.221 0.147 0.061 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0493 0.114 0.061 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0318 0.183 0.061 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 -310750 sc-eQTL 3.12e-01 0.163 0.161 0.061 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 5.28e-01 -0.112 0.177 0.061 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 5.33e-01 0.0956 0.153 0.061 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0152 0.17 0.061 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -543976 sc-eQTL 1.30e-01 0.26 0.171 0.061 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 9.61e-01 0.00788 0.162 0.071 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 2.62e-01 -0.136 0.121 0.071 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0228 0.178 0.071 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 -310750 sc-eQTL 7.14e-01 0.0456 0.124 0.071 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 1.39e-01 -0.2 0.134 0.071 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 4.30e-01 0.133 0.168 0.071 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 9.39e-01 0.0152 0.199 0.071 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 2.68e-01 0.181 0.163 0.071 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 -543976 sc-eQTL 3.85e-01 0.159 0.183 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 1.77e-01 0.204 0.151 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 8.26e-02 0.147 0.0843 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 8.37e-01 0.0358 0.174 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 4.27e-01 -0.147 0.184 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 9.68e-01 0.00634 0.156 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 4.59e-02 0.281 0.14 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0933 0.18 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0543 0.154 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00628 0.0709 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 9.28e-02 -0.315 0.187 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 9.74e-01 0.00617 0.19 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 9.78e-01 0.00436 0.157 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 1.69e-01 0.178 0.129 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 359127 sc-eQTL 3.35e-01 -0.184 0.19 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 7.24e-01 -0.037 0.105 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0336 0.0975 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 1.24e-01 -0.289 0.187 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -310750 sc-eQTL 5.07e-01 0.112 0.168 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 2.63e-01 -0.176 0.157 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 4.39e-01 0.107 0.137 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 7.02e-01 0.0435 0.114 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -543976 sc-eQTL 5.96e-01 0.0717 0.135 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0716 0.123 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0585 0.111 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 5.04e-01 -0.124 0.185 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 -310750 sc-eQTL 9.54e-01 0.0103 0.179 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 2.25e-01 -0.206 0.169 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 388368 sc-eQTL 4.56e-01 0.114 0.153 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 6.91e-01 0.0585 0.147 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 -543976 sc-eQTL 7.34e-02 0.311 0.173 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -979380 sc-eQTL 7.67e-01 0.0355 0.12 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 -49782 sc-eQTL 8.77e-01 0.0108 0.0694 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -582495 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0437 0.202 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 742304 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0836 0.184 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 -552408 sc-eQTL 3.92e-01 -0.126 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112357 PEX7 -582495 eQTL 0.0313 -0.116 0.0537 0.0 0.0 0.0589
ENSG00000135525 MAP7 -310750 eQTL 0.000656 -0.164 0.0481 0.0 0.0 0.0589

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135525 MAP7 -310750 3.61e-06 9.95e-06 1.04e-06 1.97e-06 4.58e-07 7.87e-07 2.29e-06 8.7e-07 1.83e-06 9.75e-07 2.52e-06 3.72e-06 4.84e-06 2.33e-06 9.23e-07 2.42e-06 1.55e-06 2.14e-06 1.46e-06 4.61e-07 1.98e-06 4.63e-06 3.44e-06 9.71e-07 4.79e-06 1.27e-06 1.48e-06 1.51e-06 2.99e-06 1.86e-06 1.96e-06 2.54e-07 3.25e-07 8.95e-07 1.63e-06 9.66e-07 9.3e-07 3.86e-07 5.07e-07 2.15e-07 2.56e-07 3.71e-06 1.57e-06 1.93e-07 2.83e-07 3.96e-07 8.69e-07 2.24e-07 2.46e-07
ENSG00000182747 \N -682232 1.38e-06 4.68e-06 6.72e-07 1.28e-06 2.58e-07 6.22e-07 1.55e-06 3.37e-07 1.24e-06 4.36e-07 1.52e-06 2.48e-06 2.5e-06 1.42e-06 5.34e-07 9.98e-07 8.3e-07 7.21e-07 5.56e-07 3.34e-07 7.86e-07 2e-06 1.11e-06 6.37e-07 2.39e-06 7.6e-07 9.41e-07 9.6e-07 1.55e-06 1.25e-06 8.13e-07 4.75e-08 5.95e-08 5.82e-07 5.42e-07 4.52e-07 7.5e-07 1.92e-07 1.34e-07 4.12e-08 1.02e-07 1.47e-06 8.75e-07 1.95e-07 1.41e-07 2.28e-07 2.24e-07 1.38e-07 1.08e-07
ENSG00000197442 \N -552408 1.55e-06 5.1e-06 8.72e-07 1.25e-06 3.36e-07 6.09e-07 1.41e-06 3.97e-07 1.45e-06 6.19e-07 1.95e-06 3.54e-06 2.61e-06 1.37e-06 4.61e-07 1.1e-06 9.18e-07 1.08e-06 6.7e-07 5.19e-07 6.53e-07 2.91e-06 1.5e-06 5.38e-07 2.62e-06 1.05e-06 1.04e-06 1.1e-06 1.66e-06 1.21e-06 7.39e-07 3.87e-08 1.7e-07 6.9e-07 6.8e-07 4.89e-07 8.07e-07 2.87e-07 2.94e-07 2.29e-07 1.99e-07 1.61e-06 1.28e-06 1.93e-07 1.95e-07 3.22e-07 2.59e-07 2.23e-07 1.83e-07