logo

Genes within 1Mb (chr6:137629699:C:CATTGG):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 1.14e-01 0.238 0.15 0.051 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0789 0.118 0.051 B L1
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 2.06e-01 -0.226 0.178 0.051 B L1
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 2.44e-01 0.138 0.118 0.051 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0697 0.0953 0.051 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0778 0.133 0.051 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 6.52e-01 0.0677 0.15 0.051 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 9.14e-01 -0.011 0.101 0.051 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 4.21e-01 0.0934 0.116 0.051 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 2.13e-01 0.203 0.162 0.051 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 4.49e-01 0.0829 0.109 0.051 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 9.84e-01 0.00205 0.102 0.051 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0183 0.0781 0.051 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 6.15e-01 0.065 0.129 0.051 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 2.96e-01 -0.119 0.114 0.051 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 5.42e-01 0.0745 0.122 0.051 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 1.28e-01 -0.289 0.189 0.051 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 3.30e-01 0.121 0.124 0.051 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 5.12e-01 0.063 0.0959 0.051 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0301 0.101 0.051 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 3.05e-01 0.145 0.141 0.051 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 9.58e-01 0.0074 0.14 0.054 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 4.20e-01 0.107 0.132 0.054 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 4.01e-02 -0.403 0.195 0.054 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00377 0.149 0.054 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 8.21e-02 0.269 0.154 0.054 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0313 0.152 0.054 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 845654 sc-eQTL 1.69e-01 -0.278 0.201 0.054 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 2.36e-01 0.138 0.116 0.051 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 4.42e-01 0.0726 0.0942 0.051 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 1.37e-01 0.29 0.195 0.051 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0782 0.0984 0.051 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 1.10e-01 0.184 0.114 0.051 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 2.39e-01 -0.144 0.122 0.051 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 845654 sc-eQTL 4.60e-01 -0.103 0.139 0.051 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0192 0.128 0.052 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0127 0.146 0.052 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 2.46e-01 -0.229 0.197 0.052 NK L1
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 4.71e-01 0.0897 0.124 0.052 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 4.99e-01 0.0719 0.106 0.052 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0224 0.152 0.052 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0563 0.151 0.052 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0362 0.121 0.051 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 7.37e-01 -0.043 0.128 0.051 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 5.17e-01 -0.128 0.197 0.051 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 1.01e-01 0.259 0.157 0.051 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 4.25e-01 0.06 0.0751 0.051 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 5.54e-01 -0.086 0.145 0.051 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 4.56e-01 -0.111 0.149 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 3.27e-01 -0.191 0.195 0.056 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 8.74e-01 0.0304 0.191 0.056 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 4.81e-01 -0.135 0.192 0.056 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0165 0.0993 0.056 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 2.13e-01 0.24 0.192 0.056 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0962 0.216 0.056 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 4.29e-01 -0.133 0.168 0.056 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 1.38e-01 0.263 0.177 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 9.99e-01 0.000181 0.133 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 3.43e-01 -0.177 0.186 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 6.68e-01 0.0728 0.17 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 1.99e-01 -0.171 0.133 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0212 0.161 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 4.72e-01 -0.136 0.189 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 6.66e-01 0.083 0.192 0.052 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 3.41e-01 -0.14 0.146 0.052 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 9.09e-01 0.0222 0.194 0.052 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 2.28e-01 0.22 0.182 0.052 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 2.48e-02 -0.281 0.124 0.052 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0208 0.172 0.052 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00867 0.187 0.052 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 1.69e-01 0.208 0.151 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0706 0.129 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 5.58e-01 -0.117 0.2 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 4.00e-01 0.147 0.175 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0358 0.102 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 9.06e-01 0.0168 0.143 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 6.89e-01 0.0637 0.159 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 7.30e-02 0.332 0.184 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0955 0.123 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 3.93e-01 -0.174 0.203 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 3.94e-01 0.126 0.148 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 6.91e-01 0.0589 0.148 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 3.52e-01 -0.147 0.157 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 1.54e-01 0.272 0.19 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 6.27e-01 0.0822 0.169 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 2.54e-01 -0.178 0.156 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 5.98e-01 -0.099 0.187 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 3.21e-01 0.189 0.19 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 6.81e-01 0.0456 0.111 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 7.62e-01 0.0537 0.177 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 3.58e-01 0.159 0.172 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 4.89e-01 0.0663 0.0957 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 8.24e-01 0.0252 0.113 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 3.22e-01 0.179 0.181 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 9.60e-03 0.384 0.147 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 9.86e-01 0.00184 0.105 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 7.70e-01 0.0225 0.0769 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 8.05e-01 0.0335 0.136 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 4.50e-01 -0.101 0.133 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 1.22e-01 0.204 0.131 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 2.93e-01 0.206 0.196 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 9.12e-01 0.0182 0.166 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 8.36e-01 0.02 0.0962 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0853 0.109 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 4.64e-01 0.0987 0.135 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 3.53e-01 0.14 0.15 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 1.94e-01 0.176 0.135 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 2.61e-01 -0.219 0.194 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 6.46e-02 0.29 0.156 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 8.58e-01 -0.018 0.1 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 2.30e-01 -0.186 0.154 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 5.56e-01 0.0944 0.16 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 3.70e-01 0.124 0.138 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 3.34e-01 0.141 0.146 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 5.74e-01 -0.107 0.19 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 8.23e-01 0.0409 0.183 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 3.23e-01 0.115 0.116 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 7.72e-01 0.0476 0.164 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 2.65e-01 0.182 0.163 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 8.54e-01 0.0249 0.135 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 5.16e-01 0.0803 0.123 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 7.32e-02 -0.349 0.194 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 4.38e-01 -0.115 0.148 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0442 0.105 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0235 0.125 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 4.58e-01 0.116 0.156 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0325 0.175 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 3.88e-01 0.128 0.148 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 4.79e-01 -0.142 0.2 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 5.12e-01 -0.129 0.196 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 8.67e-01 0.0158 0.0947 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 5.14e-01 -0.11 0.169 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 6.98e-01 0.0673 0.173 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 8.37e-01 -0.029 0.141 0.052 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0711 0.15 0.052 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 6.01e-01 -0.1 0.191 0.052 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 2.44e-02 0.446 0.197 0.052 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0396 0.0946 0.052 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 8.94e-01 0.0219 0.165 0.052 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 3.88e-01 -0.151 0.175 0.052 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00363 0.164 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 3.64e-01 0.162 0.178 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 8.10e-01 0.0512 0.213 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 1.50e-01 0.275 0.19 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 4.56e-01 0.0908 0.122 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 2.16e-01 -0.229 0.185 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 8.54e-02 -0.333 0.193 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 8.70e-01 0.0194 0.119 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 8.41e-01 0.0323 0.16 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 2.67e-01 -0.227 0.204 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 8.64e-01 0.0246 0.144 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 3.59e-01 0.103 0.112 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 2.40e-01 -0.189 0.16 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0998 0.167 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 5.89e-01 0.0841 0.155 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 8.49e-01 0.0343 0.18 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 6.96e-01 0.0772 0.197 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0396 0.16 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0253 0.123 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 3.57e-01 -0.18 0.195 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 3.39e-01 0.19 0.198 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 8.66e-01 0.0213 0.126 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 7.72e-01 0.0465 0.161 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 2.80e-01 -0.213 0.197 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 6.96e-01 0.0586 0.15 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 6.19e-01 0.0558 0.112 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 3.03e-01 0.159 0.154 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 9.48e-01 -0.011 0.169 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 1.24e-01 -0.238 0.154 0.052 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0544 0.162 0.052 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 9.12e-01 0.021 0.189 0.052 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 6.00e-01 0.0788 0.15 0.052 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 5.73e-01 0.0534 0.0945 0.052 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0194 0.183 0.052 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 6.13e-01 -0.093 0.183 0.052 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0217 0.181 0.051 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0577 0.132 0.051 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 4.28e-02 0.387 0.19 0.051 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 5.67e-01 -0.119 0.207 0.051 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 5.23e-01 0.0737 0.115 0.051 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0613 0.125 0.051 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 1.59e-01 0.247 0.175 0.051 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 8.69e-01 0.0268 0.162 0.051 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0501 0.143 0.051 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 5.81e-02 -0.396 0.208 0.051 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 1.66e-01 -0.221 0.159 0.051 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 2.63e-01 0.184 0.164 0.051 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00278 0.208 0.051 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 845654 sc-eQTL 1.60e-01 -0.301 0.213 0.051 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 2.69e-02 0.239 0.107 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 7.65e-01 0.0319 0.107 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 1.58e-01 0.275 0.194 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0544 0.117 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 7.88e-02 0.213 0.121 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 2.52e-01 -0.143 0.124 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 845654 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0832 0.156 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 7.22e-01 0.0448 0.126 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00625 0.117 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 2.98e-01 0.21 0.201 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 4.93e-01 0.0768 0.112 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 5.40e-01 0.0932 0.152 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 8.93e-01 0.0215 0.161 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 845654 sc-eQTL 2.18e-01 -0.193 0.156 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 8.50e-01 0.0254 0.134 0.053 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 5.28e-01 0.0848 0.134 0.053 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 9.28e-01 0.0164 0.181 0.053 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0416 0.116 0.053 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 3.32e-02 0.401 0.187 0.053 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 5.39e-01 -0.106 0.173 0.053 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 845654 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0919 0.199 0.053 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 5.03e-01 0.13 0.193 0.051 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 7.29e-01 0.0616 0.178 0.051 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 4.38e-01 -0.166 0.213 0.051 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 2.80e-01 -0.194 0.179 0.051 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 8.40e-01 0.0481 0.238 0.051 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 2.22e-01 -0.223 0.181 0.051 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 845654 sc-eQTL 4.21e-01 0.177 0.219 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 3.06e-01 0.16 0.156 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0745 0.127 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 2.19e-01 -0.221 0.18 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 7.04e-02 0.302 0.166 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 7.20e-02 -0.198 0.11 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 6.72e-01 -0.062 0.146 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 5.22e-01 -0.12 0.187 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 7.15e-02 0.288 0.159 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0844 0.119 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 2.64e-01 -0.218 0.195 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 3.30e-01 0.17 0.174 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 9.86e-01 0.00165 0.0918 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0223 0.135 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 2.40e-01 0.192 0.163 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 1.37e-01 0.163 0.109 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 8.37e-01 0.0211 0.103 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 1.16e-01 0.309 0.196 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0542 0.101 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 1.35e-01 0.178 0.118 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 3.22e-01 -0.12 0.121 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 845654 sc-eQTL 2.72e-01 -0.155 0.141 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 7.85e-01 0.0358 0.131 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 9.17e-02 0.168 0.0991 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 9.76e-01 0.00583 0.197 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0684 0.122 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 2.62e-01 0.175 0.156 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 3.26e-01 -0.161 0.163 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 845654 sc-eQTL 8.21e-01 0.0421 0.186 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 410250 sc-eQTL 6.63e-01 0.0531 0.122 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -773832 sc-eQTL 9.61e-01 0.00741 0.151 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 807135 sc-eQTL 2.72e-01 -0.225 0.205 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -477720 sc-eQTL 5.50e-01 0.0761 0.127 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -237515 sc-eQTL 4.91e-01 0.0764 0.111 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 837222 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0415 0.15 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -238534 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0139 0.155 0.052 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -773832 2.66e-07 1.06e-07 3.65e-08 1.68e-07 1.02e-07 9.36e-08 1.44e-07 5.29e-08 1.42e-07 4.23e-08 1.63e-07 7.49e-08 1.26e-07 6.07e-08 4.77e-08 8.01e-08 5.1e-08 1.1e-07 5.2e-08 2.85e-08 1.05e-07 1.33e-07 1.29e-07 5.01e-08 1.32e-07 1.09e-07 1.1e-07 8.45e-08 9.88e-08 1.1e-07 9.75e-08 3.59e-08 2.75e-08 8e-08 9.88e-08 4.19e-08 4.7e-08 8.28e-08 8.3e-08 3.34e-08 3.18e-08 1.36e-07 3.91e-08 4.13e-08 1.09e-07 1.8e-08 1.45e-07 4.96e-09 4.61e-08
ENSG00000112378 \N -477720 3.14e-07 1.36e-07 6.57e-08 1.82e-07 9.01e-08 9.05e-08 3.42e-07 5.21e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.63e-07 7.88e-08 2.13e-07 7.13e-08 6e-08 7.23e-08 4.12e-08 1.64e-07 6.75e-08 4.2e-08 1.33e-07 1.25e-07 1.44e-07 4.05e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.18e-07 9.36e-08 1.32e-07 2.1e-07 9.7e-08 3.94e-08 3.09e-08 8.82e-08 9.07e-08 3.76e-08 5.26e-08 9.35e-08 7.47e-08 3.82e-08 3.07e-08 1.59e-07 3.13e-08 7.23e-09 5.87e-08 1.83e-08 1.22e-07 4.33e-09 4.81e-08