logo

Genes within 1Mb (chr6:137796485:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 4.59e-01 -0.104 0.14 0.073 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0695 0.136 0.073 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0389 0.107 0.073 B L1
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 1.07e-01 0.26 0.16 0.073 B L1
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0664 0.107 0.073 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.55e-02 0.207 0.0849 0.073 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0722 0.135 0.073 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 8.28e-01 0.0337 0.155 0.073 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0463 0.0907 0.073 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 1.05e-01 -0.168 0.103 0.073 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 6.03e-01 0.076 0.146 0.073 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 6.57e-03 -0.265 0.0964 0.073 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.19e-01 0.143 0.0914 0.073 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 2.85e-01 -0.124 0.115 0.073 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 5.02e-01 -0.115 0.171 0.073 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 8.22e-01 0.0236 0.105 0.073 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 6.20e-02 -0.209 0.111 0.073 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0566 0.175 0.073 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 5.58e-01 -0.067 0.114 0.073 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.45e-01 0.128 0.0877 0.073 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 1.23e-01 -0.199 0.129 0.073 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 7.56e-01 -0.052 0.167 0.077 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 4.29e-01 0.0982 0.124 0.077 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 1.49e-01 -0.169 0.117 0.077 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0166 0.175 0.077 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 3.76e-01 0.117 0.132 0.077 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -896086 sc-eQTL 5.09e-01 0.101 0.153 0.077 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -896063 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0601 0.16 0.077 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0802 0.135 0.077 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 3.79e-01 0.109 0.124 0.073 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 1.50e-01 0.152 0.105 0.073 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0435 0.0856 0.073 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 2.03e-01 0.226 0.177 0.073 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 2.71e-01 0.0986 0.0892 0.073 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -896086 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0115 0.162 0.073 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -896063 sc-eQTL 3.59e-02 -0.351 0.166 0.073 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 3.43e-01 0.105 0.111 0.073 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0789 0.152 0.073 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 1.93e-01 0.152 0.117 0.073 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 9.07e-01 0.0156 0.134 0.073 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 5.40e-01 -0.111 0.18 0.073 NK L1
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 6.14e-01 0.0575 0.114 0.073 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 5.92e-03 0.266 0.0957 0.073 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 4.14e-01 0.113 0.138 0.073 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 1.82e-01 -0.235 0.175 0.073 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 4.85e-01 0.075 0.107 0.073 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 8.07e-02 -0.198 0.113 0.073 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 7.24e-01 0.0619 0.175 0.073 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 5.78e-01 0.0781 0.14 0.073 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 9.42e-03 0.172 0.0657 0.073 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 5.15e-01 0.0863 0.132 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 7.28e-03 -0.541 0.199 0.071 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 4.55e-01 -0.136 0.182 0.071 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 4.06e-01 0.148 0.178 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 2.16e-01 -0.221 0.178 0.071 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0724 0.0925 0.071 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 3.91e-01 0.154 0.179 0.071 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 4.75e-01 0.112 0.157 0.071 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 6.89e-02 -0.313 0.171 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 1.12e-01 -0.252 0.158 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0582 0.119 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 5.58e-01 0.0978 0.167 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0495 0.152 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.73e-01 0.162 0.119 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 3.76e-01 0.15 0.169 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0935 0.174 0.073 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 5.53e-01 -0.102 0.172 0.073 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0732 0.131 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00304 0.174 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 4.24e-01 0.131 0.163 0.073 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 6.21e-02 0.209 0.112 0.073 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 4.27e-02 0.338 0.166 0.073 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0909 0.166 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0322 0.138 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 2.70e-01 -0.129 0.117 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 3.09e-01 0.185 0.181 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 5.30e-01 0.0998 0.159 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.60e-03 0.288 0.0899 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0634 0.144 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 1.68e-01 0.226 0.164 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0965 0.169 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 8.66e-01 0.019 0.112 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0424 0.185 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 4.05e-01 -0.112 0.135 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 2.47e-02 0.302 0.133 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 4.23e-01 -0.14 0.174 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 1.99e-01 0.217 0.169 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0671 0.159 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 3.44e-01 -0.139 0.146 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 2.84e-01 -0.189 0.175 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 3.05e-01 -0.183 0.178 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 4.31e-02 0.21 0.103 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 5.27e-01 -0.103 0.162 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 4.97e-01 0.11 0.162 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0617 0.0858 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 1.77e-02 -0.239 0.1 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 3.87e-01 0.14 0.162 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 8.61e-02 -0.229 0.133 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.42e-01 0.138 0.0935 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 3.65e-01 -0.11 0.121 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0322 0.16 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 6.15e-01 0.0605 0.12 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0147 0.119 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 6.52e-01 0.0797 0.176 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 3.31e-01 -0.145 0.149 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 8.47e-02 0.149 0.086 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 5.97e-02 -0.228 0.12 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0077 0.18 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0171 0.137 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 3.84e-02 -0.254 0.122 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 1.44e-01 0.257 0.175 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 4.25e-01 -0.114 0.143 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.16e-02 0.228 0.0894 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 2.10e-01 -0.182 0.145 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0553 0.183 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 4.25e-02 0.249 0.122 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0851 0.131 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 4.11e-01 0.139 0.169 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 7.45e-01 0.0532 0.163 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.19e-01 0.162 0.103 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 7.69e-01 0.043 0.146 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0558 0.176 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0884 0.123 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 1.92e-01 -0.147 0.112 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 3.05e-01 -0.183 0.177 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 7.93e-01 0.0355 0.135 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.48e-01 0.139 0.0955 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 1.56e-01 -0.201 0.141 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0917 0.192 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 1.28e-01 -0.241 0.158 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 4.75e-01 0.0968 0.135 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 3.60e-01 -0.167 0.182 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0646 0.179 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.12e-01 0.137 0.0856 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 1.58e-01 -0.222 0.157 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 7.41e-01 0.061 0.184 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 3.12e-01 -0.161 0.159 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 1.06e-01 -0.271 0.167 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 1.87e-01 0.242 0.183 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 7.42e-01 -0.063 0.191 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 6.71e-02 0.215 0.117 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 4.83e-01 -0.123 0.175 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0618 0.189 0.074 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 5.89e-01 0.0662 0.122 0.074 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 2.59e-02 -0.291 0.129 0.074 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 6.66e-01 0.0719 0.166 0.074 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 4.45e-01 -0.132 0.173 0.074 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.92e-02 0.192 0.0814 0.074 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 3.33e-01 0.148 0.152 0.074 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0477 0.175 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 1.72e-01 0.187 0.136 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 5.13e-01 0.0977 0.149 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 4.86e-01 -0.124 0.178 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0259 0.16 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.35e-01 0.152 0.101 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 8.61e-01 0.0285 0.162 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 3.66e-01 0.149 0.164 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 4.82e-02 0.213 0.107 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0158 0.146 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0869 0.186 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0229 0.131 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 5.44e-02 0.196 0.101 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 4.75e-01 0.109 0.153 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 1.20e-01 -0.29 0.186 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 2.63e-02 0.303 0.136 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 9.00e-01 -0.02 0.159 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 9.69e-01 0.00676 0.174 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 5.24e-01 0.0902 0.141 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.80e-02 0.256 0.107 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00593 0.175 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 4.25e-01 -0.133 0.167 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 9.46e-02 0.188 0.112 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 4.73e-01 0.103 0.144 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 6.20e-01 0.0878 0.177 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 2.60e-01 0.151 0.134 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 9.43e-04 0.328 0.0979 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 5.70e-01 0.086 0.151 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 8.93e-01 0.0285 0.212 0.078 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 5.67e-01 -0.129 0.224 0.078 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0216 0.189 0.078 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0273 0.23 0.078 PB L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00223 0.144 0.078 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 7.02e-01 0.067 0.174 0.078 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 8.98e-01 -0.027 0.21 0.078 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 9.25e-02 -0.312 0.184 0.072 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0452 0.142 0.072 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 2.70e-02 -0.326 0.146 0.072 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 5.22e-01 0.11 0.172 0.072 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 3.72e-01 -0.122 0.137 0.072 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 8.72e-01 0.0139 0.0863 0.072 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 1.19e-01 -0.261 0.167 0.072 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 2.06e-01 -0.219 0.173 0.073 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 3.96e-01 -0.138 0.163 0.073 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0893 0.118 0.073 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 3.60e-01 -0.158 0.172 0.073 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 8.58e-02 -0.32 0.185 0.073 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.75e-03 0.321 0.101 0.073 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 1.41e-01 0.233 0.157 0.073 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 5.65e-01 0.0989 0.172 0.076 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 1.65e-01 0.194 0.139 0.076 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0281 0.123 0.076 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0265 0.181 0.076 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 7.70e-01 0.0404 0.138 0.076 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -896086 sc-eQTL 2.28e-01 0.192 0.159 0.076 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -896063 sc-eQTL 6.97e-01 0.0687 0.176 0.076 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0647 0.18 0.076 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 3.89e-01 0.116 0.134 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 2.02e-01 0.125 0.0977 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 6.87e-01 -0.039 0.0967 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 3.96e-01 0.15 0.176 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 3.05e-01 0.108 0.105 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -896086 sc-eQTL 4.24e-01 0.13 0.162 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -896063 sc-eQTL 4.22e-02 -0.343 0.168 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 5.52e-02 0.216 0.112 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0758 0.155 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 1.54e-01 0.162 0.113 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0308 0.106 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 2.06e-01 0.231 0.182 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 8.15e-01 0.0237 0.101 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -896086 sc-eQTL 3.24e-01 -0.164 0.166 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -896063 sc-eQTL 4.51e-01 -0.137 0.182 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 4.10e-01 -0.12 0.145 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 2.07e-01 -0.258 0.203 0.076 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 2.19e-01 0.201 0.163 0.076 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 3.55e-01 -0.18 0.194 0.076 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 1.63e-01 -0.288 0.206 0.076 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 5.75e-01 0.102 0.181 0.076 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 9.50e-02 0.167 0.0996 0.076 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0911 0.182 0.076 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 1.74e-01 -0.245 0.179 0.071 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 3.72e-01 -0.108 0.121 0.071 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 3.98e-01 -0.102 0.121 0.071 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 1.75e-02 -0.387 0.161 0.071 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 3.03e-03 0.308 0.103 0.071 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -896086 sc-eQTL 4.57e-01 -0.121 0.163 0.071 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -896063 sc-eQTL 5.20e-02 -0.354 0.181 0.071 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 8.26e-02 0.271 0.155 0.071 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 1.46e-01 0.245 0.167 0.072 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 4.12e-01 0.118 0.143 0.072 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 1.89e-01 -0.132 0.1 0.072 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 1.00e-01 0.291 0.176 0.072 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 3.89e-01 0.109 0.127 0.072 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -896086 sc-eQTL 2.66e-01 0.18 0.161 0.072 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -896063 sc-eQTL 2.23e-01 -0.219 0.179 0.072 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 2.27e-01 -0.192 0.158 0.072 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 2.39e-01 -0.214 0.181 0.082 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 8.25e-01 0.0342 0.154 0.082 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 2.78e-01 -0.154 0.141 0.082 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 3.73e-01 0.151 0.169 0.082 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.21e-02 0.356 0.14 0.082 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -896086 sc-eQTL 1.53e-01 -0.201 0.14 0.082 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -896063 sc-eQTL 2.16e-01 -0.175 0.141 0.082 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0583 0.145 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 5.12e-02 -0.321 0.164 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 2.30e-01 -0.169 0.141 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 3.70e-01 -0.103 0.114 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 9.65e-01 0.00704 0.162 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 9.44e-01 0.0106 0.151 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 1.05e-01 0.161 0.099 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 1.78e-01 0.227 0.168 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0234 0.155 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 4.41e-01 -0.112 0.145 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0695 0.107 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 4.17e-01 0.143 0.176 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 7.76e-01 0.0449 0.158 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 3.69e-03 0.239 0.0813 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 4.04e-01 -0.123 0.147 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 5.57e-01 0.0731 0.124 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 1.22e-01 0.153 0.0984 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0678 0.0925 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 2.87e-01 0.189 0.177 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 5.83e-01 0.0503 0.0914 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -896086 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00797 0.163 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -896063 sc-eQTL 1.19e-01 -0.272 0.174 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 2.68e-01 0.121 0.109 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0136 0.169 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 6.27e-01 0.0574 0.118 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0575 0.09 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 7.20e-01 0.0638 0.178 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 3.65e-02 0.23 0.109 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -896086 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0266 0.16 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -896063 sc-eQTL 1.19e-01 -0.276 0.176 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 1.67e-01 0.204 0.147 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -977024 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0464 0.158 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 577036 sc-eQTL 1.15e-01 0.174 0.11 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 sc-eQTL 9.90e-01 0.00168 0.137 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 973921 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0826 0.186 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -310934 sc-eQTL 6.68e-01 0.0497 0.116 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -70729 sc-eQTL 6.82e-03 0.271 0.099 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -71748 sc-eQTL 3.35e-01 0.136 0.141 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 eQTL 0.00584 -0.124 0.045 0.0 0.0 0.0447

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -607046 3.1e-07 1.27e-07 3.69e-08 2.05e-07 8.83e-08 8.33e-08 1.67e-07 5.4e-08 1.44e-07 4.94e-08 1.62e-07 8.36e-08 1.52e-07 7.37e-08 6.25e-08 7.3e-08 4.09e-08 1.27e-07 5.97e-08 4e-08 1.21e-07 1.27e-07 1.44e-07 3.23e-08 1.55e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.57e-08 1.2e-07 1.07e-07 9.64e-08 3.87e-08 3.3e-08 8.34e-08 7.02e-08 3.6e-08 5.37e-08 9.61e-08 6.55e-08 4.02e-08 4.39e-08 1.46e-07 3.35e-08 1.52e-08 3.84e-08 1.99e-08 1.21e-07 3.83e-09 4.88e-08
ENSG00000112357 \N 973921 2.67e-07 1.01e-07 3.31e-08 1.79e-07 9.91e-08 9.71e-08 1.41e-07 5.35e-08 1.37e-07 4.24e-08 1.63e-07 8.02e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.55e-08 8.01e-08 4.63e-08 1.1e-07 5.19e-08 3.89e-08 1.04e-07 1.3e-07 1.3e-07 4.53e-08 1.31e-07 1.13e-07 1.1e-07 8.71e-08 1.02e-07 1.09e-07 9.75e-08 3.8e-08 2.74e-08 8.25e-08 9.24e-08 3.9e-08 4.79e-08 9.35e-08 8.3e-08 3.07e-08 3.91e-08 1.36e-07 4.33e-08 1.82e-08 7.26e-08 1.72e-08 1.25e-07 4.26e-09 4.91e-08