logo

Genes within 1Mb (chr6:138129769:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0982 0.083 0.212 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 7.03e-01 -0.031 0.081 0.212 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000158 0.0635 0.212 B L1
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0272 0.0634 0.212 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 9.12e-01 0.00568 0.0511 0.212 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 2.23e-01 0.0871 0.0713 0.212 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 8.63e-01 0.00726 0.042 0.212 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 2.93e-02 0.174 0.0795 0.212 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 8.87e-01 0.0132 0.093 0.212 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0822 0.0541 0.212 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 9.18e-01 0.00646 0.0624 0.212 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 6.67e-02 -0.108 0.0584 0.212 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0624 0.055 0.212 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 6.70e-01 0.026 0.0609 0.212 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 1.42e-02 -0.109 0.0441 0.212 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 6.14e-01 -0.035 0.0694 0.212 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 6.17e-01 0.0507 0.101 0.212 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 3.76e-01 0.0549 0.0619 0.212 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0162 0.0664 0.212 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 9.56e-02 -0.112 0.0672 0.212 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0418 0.0521 0.212 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 5.37e-02 0.131 0.0676 0.212 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 8.44e-01 -0.00763 0.0388 0.212 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0622 0.0765 0.212 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 5.88e-02 -0.191 0.1 0.212 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00503 0.0751 0.212 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 5.36e-01 0.0441 0.0711 0.212 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 2.36e-01 0.0951 0.0799 0.212 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -562802 sc-eQTL 7.79e-02 -0.163 0.092 0.212 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 2.28e-01 0.0989 0.0817 0.212 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 7.30e-01 0.0278 0.0803 0.212 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -562779 sc-eQTL 8.21e-01 0.0219 0.0969 0.212 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0377 0.0817 0.212 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 5.05e-01 0.0495 0.0741 0.212 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 1.03e-01 -0.103 0.0628 0.212 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 7.88e-02 0.09 0.0509 0.212 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0552 0.0535 0.212 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -562802 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0461 0.0969 0.212 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 5.43e-01 0.0346 0.0567 0.212 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 4.49e-01 -0.056 0.0738 0.212 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -562779 sc-eQTL 3.18e-01 0.101 0.101 0.212 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 7.83e-01 0.0184 0.0665 0.212 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 8.04e-01 0.0223 0.09 0.212 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00795 0.0692 0.212 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 6.19e-01 0.0395 0.0792 0.212 NK L1
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 5.44e-01 0.0408 0.0672 0.212 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 8.85e-02 -0.0979 0.0572 0.212 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0114 0.0741 0.212 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0204 0.054 0.212 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0898 0.0814 0.212 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00266 0.106 0.212 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0888 0.0643 0.212 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0348 0.0684 0.212 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 6.56e-01 0.0377 0.0844 0.212 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0148 0.0402 0.212 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 8.85e-01 0.0119 0.0825 0.212 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0553 0.0539 0.212 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 8.64e-01 0.0137 0.0797 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 6.46e-01 0.0549 0.119 0.219 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0926 0.107 0.219 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0511 0.105 0.219 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0608 0.0542 0.219 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 1.89e-01 0.139 0.105 0.219 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 2.57e-01 0.135 0.119 0.219 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0817 0.108 0.219 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 8.72e-01 0.0149 0.0921 0.219 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 4.57e-01 0.0774 0.104 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 1.90e-02 0.224 0.0949 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0405 0.072 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 4.59e-01 -0.068 0.0916 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.14e-01 0.0264 0.072 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 8.04e-01 0.0241 0.0972 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 5.84e-01 0.0454 0.0827 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 1.27e-02 0.253 0.101 0.212 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 3.59e-01 -0.097 0.106 0.213 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 5.28e-01 0.0659 0.104 0.213 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0819 0.0793 0.213 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 2.77e-01 0.108 0.0989 0.213 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.92e-01 0.018 0.0682 0.213 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 7.70e-01 -0.029 0.0991 0.213 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 1.41e-01 -0.115 0.078 0.213 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 6.23e-01 -0.05 0.101 0.213 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0176 0.099 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0865 0.0815 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0288 0.0695 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0144 0.0943 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 5.98e-02 0.103 0.0543 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00327 0.0798 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00667 0.0558 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 6.01e-03 0.234 0.0842 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 1.16e-01 -0.151 0.0954 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0957 0.0987 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 6.32e-01 0.0315 0.0656 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00696 0.0789 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0609 0.0787 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 2.56e-01 0.098 0.086 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 8.88e-01 0.00898 0.0635 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 9.84e-01 0.00202 0.102 0.212 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0482 0.104 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0696 0.0969 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 4.08e-01 0.074 0.0893 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 6.94e-01 -0.043 0.109 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0247 0.0636 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0181 0.102 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 3.29e-01 0.0904 0.0923 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 4.51e-01 0.0746 0.0988 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0505 0.0971 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0415 0.0513 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 8.30e-01 0.013 0.0606 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0654 0.0799 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0615 0.056 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 7.10e-01 0.0249 0.0669 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 1.51e-02 -0.109 0.0444 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0171 0.0727 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 4.21e-01 0.0763 0.0947 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0992 0.071 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 9.55e-01 0.00395 0.0706 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 3.16e-02 -0.189 0.0876 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 2.06e-01 -0.065 0.0512 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0826 0.0717 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 1.34e-02 -0.136 0.0545 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0263 0.072 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 4.68e-01 0.0778 0.107 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0863 0.081 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 4.60e-01 0.054 0.0729 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0184 0.0849 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 5.30e-01 0.0339 0.0539 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 8.98e-01 0.0116 0.0909 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 4.88e-03 -0.181 0.0636 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0923 0.0862 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 9.49e-01 0.00707 0.109 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 3.37e-01 0.0707 0.0735 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 7.87e-01 0.0212 0.0781 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 4.30e-02 -0.197 0.0965 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0869 0.0617 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 1.17e-02 0.214 0.084 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 5.47e-01 0.0416 0.0689 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0589 0.0871 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 2.39e-01 0.124 0.105 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 3.93e-02 -0.151 0.0727 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 7.51e-01 0.0214 0.0673 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00322 0.0809 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0215 0.0574 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 5.65e-01 0.047 0.0814 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0387 0.0427 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0108 0.0849 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 4.99e-01 0.0794 0.117 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0245 0.0969 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0926 0.0822 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0806 0.109 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0174 0.0525 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 6.25e-02 0.166 0.0885 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 2.39e-03 -0.267 0.0868 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 8.54e-01 0.0177 0.0961 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 9.14e-01 0.0119 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 8.21e-01 0.0215 0.0946 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0401 0.0993 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 3.75e-01 -0.1 0.113 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 8.35e-01 0.0146 0.0698 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 8.63e-01 0.0184 0.106 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 9.84e-01 0.00169 0.082 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 2.86e-01 -0.11 0.103 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0642 0.114 0.212 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 7.93e-02 -0.13 0.0738 0.212 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0465 0.0794 0.212 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 9.02e-01 0.0129 0.105 0.212 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 4.38e-01 0.0388 0.0499 0.212 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0287 0.0937 0.212 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 4.42e-01 -0.053 0.0688 0.212 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0412 0.0924 0.212 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 2.38e-01 0.127 0.107 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0566 0.0838 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 3.11e-01 0.0928 0.0913 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 4.16e-01 0.0797 0.0978 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0655 0.0623 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00894 0.0909 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00408 0.0837 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 9.99e-01 8.36e-05 0.0995 0.211 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0266 0.0967 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000392 0.0636 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 8.13e-01 0.0204 0.0859 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00658 0.077 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0753 0.0596 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 1.80e-01 -0.106 0.0786 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 9.26e-01 0.00494 0.0534 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0671 0.0896 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0601 0.112 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0691 0.0821 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0124 0.0953 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 9.31e-01 0.00734 0.0847 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0376 0.0651 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 3.70e-01 0.0926 0.103 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 8.62e-01 0.0147 0.0849 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0447 0.105 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 4.05e-01 0.0835 0.1 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 9.69e-01 0.00261 0.0676 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 3.72e-01 0.0771 0.0862 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 6.38e-01 0.0379 0.0805 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.66e-01 -0.018 0.0603 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00973 0.0892 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 1.71e-02 -0.136 0.0567 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 6.28e-01 -0.044 0.0909 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0961 0.125 0.219 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 8.32e-01 0.0281 0.132 0.219 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 4.63e-01 0.0818 0.111 0.219 PB L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 6.29e-03 -0.228 0.0819 0.219 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 8.77e-01 0.016 0.103 0.219 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 1.87e-01 0.16 0.12 0.219 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 1.39e-01 0.125 0.0839 0.219 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 2.44e-01 0.144 0.123 0.219 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0879 0.11 0.213 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 1.69e-01 -0.115 0.0836 0.213 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 9.40e-01 0.00662 0.0878 0.213 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 2.00e-01 0.104 0.0808 0.213 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0194 0.0511 0.213 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0114 0.102 0.213 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0432 0.0658 0.213 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 7.17e-01 0.0361 0.0993 0.213 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0629 0.104 0.212 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0173 0.0976 0.212 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 7.44e-01 0.0232 0.0708 0.212 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 3.37e-01 -0.107 0.111 0.212 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0202 0.0621 0.212 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 7.65e-01 0.0267 0.0892 0.212 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0802 0.0758 0.212 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00742 0.0947 0.212 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 9.74e-03 -0.263 0.101 0.22 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 4.72e-01 -0.06 0.0833 0.22 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 4.67e-01 0.0534 0.0733 0.22 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.56e-01 0.0256 0.0822 0.22 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -562802 sc-eQTL 3.14e-02 -0.204 0.0941 0.22 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 2.28e-01 0.132 0.109 0.22 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 9.89e-01 0.00122 0.0898 0.22 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -562779 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0371 0.105 0.22 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00176 0.107 0.22 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 5.89e-01 0.0435 0.0804 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0652 0.0585 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 4.39e-02 0.116 0.0572 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0467 0.063 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -562802 sc-eQTL 9.95e-01 0.000588 0.0968 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0313 0.0864 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0218 0.0727 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -562779 sc-eQTL 1.61e-01 0.142 0.101 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 3.55e-01 0.0623 0.0673 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0914 0.0924 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0698 0.0679 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 8.16e-01 0.0148 0.0634 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.36e-02 -0.108 0.06 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -562802 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0969 0.099 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 6.15e-02 0.175 0.0931 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0181 0.0816 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -562779 sc-eQTL 6.01e-01 0.0569 0.109 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0535 0.0868 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0161 0.127 0.221 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 8.23e-02 -0.176 0.1 0.221 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 5.43e-02 0.231 0.119 0.221 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 9.52e-02 -0.187 0.111 0.221 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.01e-01 0.024 0.0624 0.221 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 4.73e-02 0.246 0.123 0.221 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 6.87e-01 0.0379 0.0937 0.221 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00122 0.113 0.221 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 7.28e-01 0.0376 0.108 0.218 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0607 0.0724 0.218 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 8.28e-03 0.19 0.0711 0.218 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 3.61e-01 0.0572 0.0625 0.218 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -562802 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0168 0.0975 0.218 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 7.83e-01 0.0277 0.101 0.218 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 7.95e-01 0.0239 0.0919 0.218 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -562779 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0345 0.109 0.218 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 2.75e-01 -0.102 0.093 0.218 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0217 0.103 0.213 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 1.65e-01 -0.122 0.0873 0.213 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 1.38e-02 0.15 0.0605 0.213 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 8.47e-01 -0.015 0.0776 0.213 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -562802 sc-eQTL 5.38e-01 -0.061 0.0989 0.213 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 1.14e-01 -0.118 0.0741 0.213 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00834 0.0899 0.213 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -562779 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0769 0.11 0.213 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 5.10e-01 -0.064 0.097 0.213 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 7.93e-01 0.03 0.114 0.218 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0521 0.0966 0.218 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 3.52e-01 0.0825 0.0884 0.218 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.96e-02 0.157 0.0888 0.218 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -562802 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0775 0.088 0.218 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 2.16e-01 0.111 0.0889 0.218 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0587 0.0976 0.218 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -562779 sc-eQTL 2.92e-02 0.192 0.0873 0.218 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0471 0.0909 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 6.30e-01 0.048 0.0993 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 9.36e-02 0.142 0.0843 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0523 0.0687 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 5.33e-01 0.0565 0.0906 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0192 0.0599 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 4.84e-01 0.0642 0.0916 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0788 0.0633 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 3.82e-02 0.209 0.1 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 2.33e-01 -0.11 0.0917 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 2.29e-01 -0.103 0.0857 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00688 0.0638 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00706 0.0937 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 2.56e-01 0.0559 0.0491 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 3.91e-01 0.0629 0.0732 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 9.40e-01 0.00387 0.0514 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 4.17e-02 0.178 0.0868 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00674 0.0742 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0776 0.0589 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 1.65e-01 0.0768 0.0551 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0515 0.0546 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -562802 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0318 0.0973 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 3.98e-01 0.0677 0.0799 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0363 0.0712 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -562779 sc-eQTL 3.59e-01 0.0959 0.104 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 6.76e-01 0.0274 0.0655 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00972 0.102 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 6.90e-02 -0.13 0.071 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 7.39e-03 0.145 0.0537 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 8.56e-01 0.0122 0.0668 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -562802 sc-eQTL 3.02e-01 -0.1 0.0968 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00472 0.0604 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 8.33e-01 0.0187 0.0884 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -562779 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0122 0.107 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 2.27e-01 -0.108 0.0893 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -643740 sc-eQTL 7.89e-01 -0.025 0.0935 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 910320 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0127 0.0653 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -273762 sc-eQTL 9.08e-01 0.00942 0.0811 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 22350 sc-eQTL 7.28e-01 0.0238 0.0684 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 262555 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0934 0.0592 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -858492 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00992 0.0779 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -898976 sc-eQTL 6.05e-01 -0.026 0.0502 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 261536 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0892 0.0831 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N 22350 3.75e-05 3.3e-05 6.4e-06 1.58e-05 5.94e-06 1.45e-05 4.59e-05 4.65e-06 3.18e-05 1.57e-05 3.9e-05 1.79e-05 4.85e-05 1.43e-05 7.12e-06 1.98e-05 1.83e-05 2.59e-05 7.94e-06 6.77e-06 1.59e-05 3.41e-05 3.29e-05 9.15e-06 4.49e-05 8.26e-06 1.46e-05 1.3e-05 3.26e-05 2.57e-05 2.07e-05 1.64e-06 2.62e-06 7.1e-06 1.19e-05 5.85e-06 3.16e-06 3.11e-06 4.8e-06 3.36e-06 1.76e-06 3.84e-05 3.68e-06 3.62e-07 2.59e-06 3.93e-06 4.14e-06 1.6e-06 1.52e-06