logo

Genes within 1Mb (chr6:138127906:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 2.21e-01 -0.102 0.0832 0.207 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0268 0.0812 0.207 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0012 0.0637 0.207 B L1
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0044 0.0636 0.207 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 8.75e-01 0.00808 0.0513 0.207 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 2.22e-01 0.0875 0.0715 0.207 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 7.62e-01 0.0128 0.0421 0.207 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 2.58e-02 0.179 0.0797 0.207 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 8.58e-01 0.0168 0.0933 0.207 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0731 0.0543 0.207 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00492 0.0626 0.207 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 5.48e-02 -0.113 0.0585 0.207 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0742 0.0551 0.207 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 6.24e-01 0.03 0.0611 0.207 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 3.00e-02 -0.0969 0.0443 0.207 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0427 0.0696 0.207 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 7.09e-01 0.0379 0.101 0.207 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 3.16e-01 0.0622 0.0619 0.207 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0309 0.0663 0.207 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 7.52e-02 -0.12 0.0671 0.207 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0452 0.0521 0.207 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 7.03e-02 0.123 0.0677 0.207 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 9.52e-01 0.00233 0.0389 0.207 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 4.34e-01 -0.06 0.0765 0.207 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 6.43e-02 -0.187 0.1 0.207 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0108 0.0751 0.207 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 4.98e-01 0.0483 0.0711 0.207 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 2.43e-01 0.0936 0.08 0.207 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -564665 sc-eQTL 8.38e-02 -0.16 0.0921 0.207 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 2.87e-01 0.0874 0.0819 0.207 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 6.54e-01 0.036 0.0804 0.207 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -564642 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0092 0.097 0.207 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0403 0.0818 0.207 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 7.40e-01 0.0247 0.0743 0.207 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0927 0.063 0.207 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 8.06e-02 0.0896 0.051 0.207 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0527 0.0536 0.207 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -564665 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0534 0.097 0.207 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 5.39e-01 0.035 0.0568 0.207 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0513 0.0739 0.207 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -564642 sc-eQTL 3.76e-01 0.0894 0.101 0.207 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 6.59e-01 0.0294 0.0666 0.207 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 8.24e-01 0.0201 0.09 0.208 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00127 0.0692 0.208 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 6.33e-01 0.0379 0.0793 0.208 NK L1
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 5.01e-01 0.0454 0.0672 0.208 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 6.73e-02 -0.105 0.0572 0.208 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00779 0.0741 0.208 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 8.11e-01 -0.013 0.0541 0.208 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0778 0.0815 0.208 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0104 0.106 0.207 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 1.37e-01 -0.0961 0.0644 0.207 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0345 0.0686 0.207 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 7.68e-01 0.025 0.0847 0.207 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0144 0.0403 0.207 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 7.88e-01 0.0223 0.0827 0.207 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0534 0.0541 0.207 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00375 0.0799 0.207 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 4.39e-01 0.093 0.12 0.214 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 2.88e-01 -0.114 0.107 0.214 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0618 0.105 0.214 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0514 0.0545 0.214 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 1.21e-01 0.164 0.105 0.214 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 3.14e-01 0.121 0.119 0.214 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 6.06e-01 -0.056 0.108 0.214 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 9.39e-01 0.00712 0.0926 0.214 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 5.07e-01 0.0694 0.104 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 1.57e-02 0.232 0.0952 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0468 0.0722 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0463 0.092 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 5.75e-01 0.0406 0.0722 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 8.05e-01 0.0241 0.0975 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 4.39e-01 0.0643 0.0829 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 6.14e-03 0.279 0.101 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 3.40e-01 -0.101 0.106 0.209 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 5.69e-01 0.0597 0.105 0.209 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 3.16e-01 -0.08 0.0796 0.209 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 2.14e-01 0.124 0.0991 0.209 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 7.96e-01 0.0177 0.0685 0.209 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00875 0.0994 0.209 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 1.60e-01 -0.11 0.0783 0.209 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 7.76e-01 -0.029 0.102 0.209 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0123 0.0992 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0819 0.0818 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0206 0.0697 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 9.27e-01 0.00867 0.0946 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 5.59e-02 0.105 0.0544 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00788 0.0801 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00104 0.056 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 8.88e-03 0.223 0.0846 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 9.27e-02 -0.161 0.0956 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0909 0.099 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 7.55e-01 0.0206 0.0658 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0122 0.0791 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 5.35e-01 -0.049 0.0789 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 1.99e-01 0.111 0.0861 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 6.67e-01 0.0274 0.0636 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 9.92e-01 0.00109 0.102 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0672 0.104 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0699 0.097 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 4.93e-01 0.0615 0.0895 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0424 0.109 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0109 0.0637 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0268 0.102 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 1.99e-01 0.119 0.0922 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 3.99e-01 0.0836 0.0989 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0302 0.0973 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0296 0.0514 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 9.31e-01 0.00526 0.0607 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0652 0.0801 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0728 0.056 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 7.58e-01 0.0207 0.0671 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 2.87e-02 -0.0984 0.0447 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0235 0.0729 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 4.66e-01 0.0693 0.0949 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0997 0.0712 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0046 0.0707 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 2.52e-02 -0.198 0.0877 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0784 0.0512 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0729 0.0719 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 2.35e-02 -0.125 0.0548 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0328 0.0722 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 4.48e-01 0.0817 0.107 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0815 0.0813 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 4.87e-01 0.051 0.0732 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0235 0.0852 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 7.00e-01 0.0209 0.0541 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 8.70e-01 0.0149 0.0912 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 5.23e-03 -0.18 0.0638 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 2.73e-01 -0.095 0.0865 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000839 0.11 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 2.74e-01 0.0808 0.0736 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 9.32e-01 0.0067 0.0783 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 3.06e-02 -0.21 0.0966 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0914 0.0618 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 2.07e-02 0.197 0.0844 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 3.64e-01 0.0628 0.069 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0598 0.0873 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 2.56e-01 0.12 0.105 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 5.02e-02 -0.144 0.0729 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 8.31e-01 0.0144 0.0674 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0102 0.0811 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0232 0.0575 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 5.35e-01 0.0507 0.0816 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0314 0.0428 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0162 0.0851 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 6.51e-01 0.0534 0.118 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0447 0.0971 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 2.06e-01 -0.105 0.0824 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0923 0.109 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0235 0.0526 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 1.10e-01 0.143 0.0889 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 2.74e-03 -0.264 0.0871 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 5.22e-01 0.0618 0.0963 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0165 0.11 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 8.61e-01 0.0167 0.0951 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0589 0.0998 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0911 0.114 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 8.85e-01 0.0102 0.0702 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 9.08e-01 0.0124 0.107 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 8.26e-01 0.0182 0.0825 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 2.23e-01 -0.127 0.104 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0659 0.115 0.208 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 8.37e-02 -0.129 0.074 0.208 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0451 0.0797 0.208 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00404 0.105 0.208 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 4.61e-01 0.037 0.0501 0.208 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0129 0.0941 0.208 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0522 0.0691 0.208 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0529 0.0927 0.208 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 2.66e-01 0.12 0.108 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0333 0.0842 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 4.14e-01 0.0751 0.0918 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 4.29e-01 0.0778 0.0982 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0655 0.0625 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00679 0.0913 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00332 0.0841 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00167 0.1 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 9.97e-01 0.000307 0.0967 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00291 0.0636 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 7.92e-01 0.0226 0.0859 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 9.54e-01 0.00443 0.077 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0835 0.0596 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 1.44e-01 -0.115 0.0785 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 8.86e-01 0.00766 0.0534 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 4.49e-01 -0.068 0.0896 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0917 0.112 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0617 0.0824 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0236 0.0956 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 7.55e-01 0.0266 0.085 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 4.63e-01 -0.048 0.0653 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 2.10e-01 0.13 0.103 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 7.74e-01 0.0245 0.0852 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0432 0.105 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 4.57e-01 0.0748 0.1 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 8.62e-01 0.0118 0.0677 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 3.18e-01 0.0865 0.0864 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 5.85e-01 0.0441 0.0806 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0263 0.0605 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00699 0.0894 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 2.61e-02 -0.127 0.0569 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 8.96e-01 -0.012 0.0912 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 3.54e-01 -0.116 0.125 0.215 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 8.03e-01 0.0331 0.132 0.215 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 4.80e-01 0.0788 0.111 0.215 PB L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 2.41e-03 -0.253 0.0814 0.215 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 9.56e-01 0.00575 0.103 0.215 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 2.09e-01 0.152 0.12 0.215 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 1.10e-01 0.135 0.0839 0.215 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 2.73e-01 0.135 0.123 0.215 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 3.84e-01 -0.096 0.11 0.209 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 1.83e-01 -0.112 0.0837 0.209 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 9.08e-01 0.0102 0.0879 0.209 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 2.82e-01 0.0874 0.081 0.209 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0154 0.0512 0.209 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 9.61e-01 0.00494 0.102 0.209 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0393 0.0659 0.209 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 5.69e-01 0.0566 0.0993 0.209 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0929 0.104 0.207 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 9.64e-01 0.00439 0.0978 0.207 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 8.88e-01 0.01 0.0709 0.207 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 2.51e-01 -0.128 0.111 0.207 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0238 0.0621 0.207 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 6.44e-01 0.0413 0.0892 0.207 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0761 0.0759 0.207 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000957 0.0948 0.207 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 1.22e-02 -0.256 0.101 0.215 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0587 0.0837 0.215 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 5.03e-01 0.0494 0.0737 0.215 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 6.87e-01 0.0333 0.0826 0.215 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -564665 sc-eQTL 3.99e-02 -0.196 0.0946 0.215 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 2.85e-01 0.118 0.11 0.215 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 9.34e-01 0.00751 0.0902 0.215 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -564642 sc-eQTL 5.02e-01 -0.071 0.105 0.215 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0185 0.108 0.215 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 8.07e-01 0.0197 0.0806 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0579 0.0586 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 5.51e-02 0.111 0.0574 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0407 0.0632 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -564665 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00698 0.097 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0411 0.0866 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 8.48e-01 -0.014 0.0728 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -564642 sc-eQTL 2.24e-01 0.124 0.101 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 3.08e-01 0.0688 0.0674 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 2.09e-01 -0.117 0.0925 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0647 0.0681 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 8.96e-01 0.00834 0.0636 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0967 0.0603 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -564665 sc-eQTL 2.97e-01 -0.104 0.0992 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 5.24e-02 0.182 0.0933 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 8.35e-01 -0.017 0.0818 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -564642 sc-eQTL 6.43e-01 0.0506 0.109 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0354 0.087 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0151 0.128 0.215 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 8.88e-02 -0.173 0.101 0.215 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 5.48e-02 0.233 0.12 0.215 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 1.05e-01 -0.183 0.112 0.215 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 8.32e-01 0.0133 0.0629 0.215 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 4.31e-02 0.253 0.124 0.215 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 7.60e-01 0.029 0.0944 0.215 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0259 0.114 0.215 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 8.22e-01 0.0243 0.108 0.213 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0603 0.0727 0.213 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 8.29e-03 0.19 0.0714 0.213 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 3.31e-01 0.0611 0.0627 0.213 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -564665 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0214 0.0979 0.213 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 9.10e-01 0.0114 0.101 0.213 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 8.77e-01 0.0143 0.0923 0.213 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -564642 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0335 0.11 0.213 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 2.83e-01 -0.101 0.0934 0.213 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0182 0.103 0.208 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 2.48e-01 -0.101 0.0872 0.208 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 1.23e-02 0.153 0.0604 0.208 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 9.87e-01 0.00126 0.0775 0.208 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -564665 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0569 0.0987 0.208 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 1.54e-01 -0.106 0.0741 0.208 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 9.33e-01 0.00758 0.0897 0.208 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -564642 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0779 0.11 0.208 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 5.92e-01 -0.052 0.0968 0.208 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 8.32e-01 0.0243 0.114 0.212 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0638 0.0969 0.212 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 3.83e-01 0.0776 0.0887 0.212 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 7.75e-02 0.158 0.0891 0.212 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -564665 sc-eQTL 2.88e-01 -0.094 0.0882 0.212 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 2.18e-01 0.11 0.0893 0.212 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 6.61e-01 -0.043 0.0979 0.212 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -564642 sc-eQTL 2.08e-02 0.204 0.0874 0.212 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0384 0.0913 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 6.82e-01 0.0409 0.0997 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 9.94e-02 0.14 0.0846 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0543 0.069 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 4.03e-01 0.0762 0.0909 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0115 0.0601 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 4.18e-01 0.0746 0.0919 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0667 0.0636 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 1.61e-02 0.243 0.1 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 2.42e-01 -0.108 0.092 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 2.43e-01 -0.101 0.086 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00339 0.064 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 8.94e-01 0.0126 0.094 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 2.58e-01 0.0558 0.0492 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 3.97e-01 0.0623 0.0735 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 7.73e-01 0.0149 0.0516 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 4.97e-02 0.172 0.0872 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0319 0.0743 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0715 0.059 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 1.74e-01 0.0753 0.0552 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0478 0.0547 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -564665 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0385 0.0975 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 4.10e-01 0.0661 0.0801 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0306 0.0713 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -564642 sc-eQTL 4.62e-01 0.0771 0.105 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 5.45e-01 0.0398 0.0656 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0193 0.102 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 9.22e-02 -0.121 0.0712 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 6.40e-03 0.148 0.0538 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 7.28e-01 0.0233 0.067 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -564665 sc-eQTL 3.04e-01 -0.1 0.0971 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00547 0.0606 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 8.04e-01 0.022 0.0887 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -564642 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00961 0.108 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 2.35e-01 -0.107 0.0895 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -645603 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0255 0.0936 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 908457 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0099 0.0654 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -275625 sc-eQTL 8.83e-01 0.012 0.0812 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 20487 sc-eQTL 5.48e-01 0.0412 0.0684 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 260692 sc-eQTL 8.68e-02 -0.102 0.0592 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -860355 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00898 0.078 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -900839 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0197 0.0503 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 259673 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0731 0.0833 0.209 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N 20487 1.59e-05 1.9e-05 3.05e-06 1.02e-05 2.79e-06 7.28e-06 2.25e-05 2.96e-06 1.63e-05 7.65e-06 2.04e-05 7.68e-06 2.89e-05 6.86e-06 5.14e-06 9.76e-06 8.8e-06 1.37e-05 4.31e-06 4.19e-06 8.02e-06 1.62e-05 1.71e-05 4.96e-06 2.66e-05 5.31e-06 7.92e-06 7.29e-06 1.75e-05 1.6e-05 1.16e-05 1.14e-06 1.51e-06 4.49e-06 6.68e-06 3.76e-06 1.79e-06 2.64e-06 3.25e-06 2.1e-06 1.11e-06 2.24e-05 2.56e-06 1.97e-07 1.27e-06 2.52e-06 2.47e-06 9.11e-07 8.3e-07