logo

Genes within 1Mb (chr6:138126973:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0791 0.0834 0.209 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0142 0.0813 0.209 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00851 0.0637 0.209 B L1
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 9.42e-01 0.00463 0.0636 0.209 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 7.50e-01 0.0164 0.0513 0.209 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 1.52e-01 0.103 0.0714 0.209 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 6.81e-01 0.0173 0.0422 0.209 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 2.73e-02 0.177 0.0798 0.209 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 8.61e-01 0.0164 0.0935 0.209 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0797 0.0544 0.209 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 8.48e-01 -0.012 0.0627 0.209 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 5.08e-02 -0.115 0.0586 0.209 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0706 0.0552 0.209 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 5.80e-01 0.0339 0.0612 0.209 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 3.83e-02 -0.0928 0.0445 0.209 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0409 0.0697 0.209 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 6.57e-01 0.045 0.101 0.209 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 3.29e-01 0.0605 0.0619 0.209 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0412 0.0663 0.209 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 6.76e-02 -0.123 0.0671 0.209 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0416 0.0521 0.209 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 4.86e-02 0.134 0.0676 0.209 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 8.63e-01 0.00674 0.0389 0.209 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0567 0.0766 0.209 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 6.42e-02 -0.187 0.1 0.209 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00164 0.0751 0.209 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 5.55e-01 0.042 0.0711 0.209 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 2.74e-01 0.0877 0.08 0.209 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -565598 sc-eQTL 7.72e-02 -0.164 0.0921 0.209 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 2.49e-01 0.0946 0.0818 0.209 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 6.93e-01 0.0318 0.0804 0.209 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -565575 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0154 0.097 0.209 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 6.08e-01 -0.042 0.0817 0.209 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 7.51e-01 0.0237 0.0744 0.209 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 9.30e-02 -0.106 0.063 0.209 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 1.16e-01 0.0807 0.0512 0.209 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0606 0.0537 0.209 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -565598 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0576 0.0972 0.209 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 5.62e-01 0.033 0.0569 0.209 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0525 0.074 0.209 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -565575 sc-eQTL 4.31e-01 0.0796 0.101 0.209 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 6.83e-01 0.0272 0.0667 0.209 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 8.05e-01 0.0222 0.0902 0.21 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 9.90e-01 0.00091 0.0693 0.21 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 7.09e-01 0.0297 0.0794 0.21 NK L1
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 4.87e-01 0.0469 0.0674 0.21 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 7.08e-02 -0.104 0.0573 0.21 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00963 0.0742 0.21 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00965 0.0542 0.21 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0709 0.0817 0.21 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0041 0.107 0.209 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0905 0.0646 0.209 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0463 0.0687 0.209 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 6.82e-01 0.0348 0.0848 0.209 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0154 0.0404 0.209 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 8.53e-01 0.0154 0.0829 0.209 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0547 0.0542 0.209 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 9.27e-01 0.00738 0.0801 0.209 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 5.31e-01 0.0751 0.12 0.217 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 3.10e-01 -0.109 0.107 0.217 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0517 0.105 0.217 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0516 0.0544 0.217 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 8.39e-02 0.182 0.105 0.217 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 2.69e-01 0.132 0.119 0.217 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0685 0.108 0.217 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 9.73e-01 0.00316 0.0925 0.217 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 3.95e-01 0.0888 0.104 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 1.46e-02 0.234 0.0951 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0505 0.0722 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0584 0.0919 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 5.25e-01 0.0459 0.0721 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 8.30e-01 0.021 0.0975 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 4.18e-01 0.0673 0.0828 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 3.88e-03 0.293 0.1 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0758 0.106 0.211 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 5.42e-01 0.0639 0.104 0.211 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0893 0.0795 0.211 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 2.43e-01 0.116 0.0991 0.211 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 8.61e-01 0.012 0.0684 0.211 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 9.11e-01 0.0111 0.0993 0.211 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 9.13e-02 -0.132 0.078 0.211 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0342 0.102 0.211 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 9.60e-01 0.00497 0.0992 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0678 0.0818 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0295 0.0697 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 8.12e-01 0.0225 0.0945 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 3.78e-02 0.113 0.0543 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 9.44e-01 0.00564 0.08 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 8.60e-01 0.00986 0.056 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 1.06e-02 0.218 0.0846 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 1.12e-01 -0.152 0.0956 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0947 0.0989 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 8.12e-01 0.0157 0.0657 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0149 0.079 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0347 0.0789 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 1.55e-01 0.123 0.086 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 6.56e-01 0.0283 0.0635 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00807 0.102 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0492 0.104 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 4.53e-01 -0.073 0.097 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 5.14e-01 0.0585 0.0895 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0508 0.109 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0106 0.0637 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00391 0.102 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 1.47e-01 0.134 0.0921 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 4.04e-01 0.0828 0.0989 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0328 0.0974 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0329 0.0515 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0036 0.0608 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 4.55e-01 -0.06 0.0802 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0689 0.0561 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 7.23e-01 0.0239 0.0672 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 4.34e-02 -0.091 0.0448 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0203 0.0729 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 4.49e-01 0.0722 0.0953 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 1.39e-01 -0.106 0.0714 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0132 0.071 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 2.19e-02 -0.203 0.0879 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 1.47e-01 -0.0749 0.0514 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0687 0.0722 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 1.89e-02 -0.13 0.0549 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0402 0.0724 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 3.91e-01 0.0923 0.107 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0919 0.0813 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 5.80e-01 0.0406 0.0733 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0318 0.0852 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 7.26e-01 0.019 0.0541 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 9.33e-01 0.00765 0.0912 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 3.50e-03 -0.188 0.0638 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0882 0.0866 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 8.51e-01 0.0206 0.11 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 1.92e-01 0.0963 0.0736 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00107 0.0783 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 3.46e-02 -0.206 0.0967 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0888 0.0619 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 9.26e-03 0.221 0.0841 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 3.37e-01 0.0664 0.069 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0665 0.0873 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 2.52e-01 0.121 0.105 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 4.81e-02 -0.145 0.073 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 9.42e-01 0.00493 0.0675 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0116 0.0811 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0197 0.0576 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 4.52e-01 0.0614 0.0816 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0258 0.0428 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0146 0.0851 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 6.00e-01 0.0617 0.118 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0428 0.0971 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 1.59e-01 -0.116 0.0823 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0971 0.109 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0214 0.0526 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 1.24e-01 0.137 0.0889 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 3.73e-03 -0.256 0.0872 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 5.08e-01 0.0638 0.0962 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0368 0.11 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 7.63e-01 0.0287 0.0951 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0671 0.0997 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0815 0.114 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 8.67e-01 0.0118 0.0701 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 8.46e-01 0.0208 0.107 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 8.38e-01 0.0169 0.0825 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 2.85e-01 -0.111 0.104 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0746 0.115 0.21 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 9.36e-02 -0.125 0.074 0.21 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0568 0.0796 0.21 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 9.20e-01 0.0106 0.105 0.21 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 4.95e-01 0.0342 0.0501 0.21 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0189 0.094 0.21 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0573 0.069 0.21 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0474 0.0927 0.21 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 2.43e-01 0.126 0.108 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0266 0.0844 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 4.63e-01 0.0677 0.092 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 4.29e-01 0.078 0.0984 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0661 0.0627 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0189 0.0914 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00649 0.0842 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 9.32e-01 0.00851 0.1 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00438 0.0968 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000108 0.0636 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 8.58e-01 0.0154 0.0859 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0027 0.077 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0788 0.0597 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 1.41e-01 -0.116 0.0785 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 8.29e-01 0.0115 0.0534 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0597 0.0897 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0956 0.112 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0672 0.0825 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 6.84e-01 -0.039 0.0957 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 6.45e-01 0.0392 0.0851 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 4.37e-01 -0.051 0.0654 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 2.38e-01 0.122 0.103 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 8.07e-01 0.0208 0.0853 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0547 0.105 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 4.09e-01 0.0831 0.1 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 8.81e-01 0.0102 0.0678 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 3.73e-01 0.0772 0.0865 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 5.82e-01 0.0445 0.0807 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0265 0.0605 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00354 0.0895 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 2.89e-02 -0.125 0.057 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 9.81e-01 0.00218 0.0913 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0929 0.126 0.219 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 9.28e-01 0.0121 0.133 0.219 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 3.95e-01 0.0952 0.112 0.219 PB L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 6.32e-03 -0.23 0.0825 0.219 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 8.78e-01 0.016 0.103 0.219 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 1.94e-01 0.158 0.121 0.219 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 6.75e-02 0.155 0.084 0.219 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 2.43e-01 0.145 0.123 0.219 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0786 0.11 0.211 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 2.19e-01 -0.103 0.084 0.211 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 9.26e-01 0.00821 0.0881 0.211 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 2.73e-01 0.0893 0.0812 0.211 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0139 0.0513 0.211 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00807 0.103 0.211 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0338 0.0661 0.211 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 6.25e-01 0.0488 0.0996 0.211 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 3.32e-01 -0.101 0.104 0.209 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0028 0.0979 0.209 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 9.65e-01 0.00312 0.0711 0.209 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 2.82e-01 -0.12 0.112 0.209 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0245 0.0622 0.209 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 6.79e-01 0.0371 0.0894 0.209 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0769 0.076 0.209 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000361 0.0949 0.209 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 1.46e-02 -0.25 0.101 0.217 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0518 0.0837 0.217 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 5.30e-01 0.0464 0.0737 0.217 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 7.18e-01 0.0299 0.0826 0.217 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -565598 sc-eQTL 3.69e-02 -0.199 0.0946 0.217 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 2.65e-01 0.123 0.11 0.217 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 9.23e-01 0.00873 0.0902 0.217 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -565575 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0776 0.105 0.217 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0242 0.108 0.217 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 8.44e-01 0.0159 0.0807 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0711 0.0586 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 7.68e-02 0.102 0.0575 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0508 0.0632 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -565598 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00584 0.0971 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 6.12e-01 -0.044 0.0866 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0166 0.0729 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -565575 sc-eQTL 2.60e-01 0.115 0.101 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 3.46e-01 0.0637 0.0675 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 2.14e-01 -0.116 0.0928 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0798 0.0682 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 9.95e-01 0.00038 0.0637 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 9.03e-02 -0.103 0.0604 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -565598 sc-eQTL 2.89e-01 -0.106 0.0995 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 5.57e-02 0.18 0.0936 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0172 0.082 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -565575 sc-eQTL 6.59e-01 0.0482 0.109 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0323 0.0873 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 9.39e-01 0.00983 0.128 0.218 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 9.72e-02 -0.169 0.101 0.218 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 7.13e-02 0.219 0.12 0.218 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 1.45e-01 -0.165 0.112 0.218 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 8.52e-01 0.0118 0.063 0.218 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 4.08e-02 0.256 0.124 0.218 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 8.12e-01 0.0225 0.0945 0.218 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0138 0.114 0.218 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 8.87e-01 0.0155 0.108 0.216 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 3.37e-01 -0.07 0.0727 0.216 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 1.18e-02 0.182 0.0715 0.216 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 3.57e-01 0.0579 0.0628 0.216 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -565598 sc-eQTL 7.59e-01 -0.03 0.0979 0.216 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 9.16e-01 0.0107 0.101 0.216 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 8.54e-01 0.0171 0.0923 0.216 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -565575 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0294 0.11 0.216 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0913 0.0936 0.216 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00277 0.103 0.21 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 2.26e-01 -0.106 0.0873 0.21 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 2.03e-02 0.142 0.0605 0.21 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00355 0.0775 0.21 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -565598 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0653 0.0987 0.21 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 2.22e-01 -0.091 0.0742 0.21 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 9.51e-01 0.00553 0.0898 0.21 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -565575 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0759 0.11 0.21 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0619 0.0968 0.21 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 8.88e-01 0.0161 0.115 0.215 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 5.25e-01 -0.062 0.0971 0.215 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 4.26e-01 0.071 0.089 0.215 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 9.44e-02 0.15 0.0894 0.215 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -565598 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0967 0.0884 0.215 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 2.33e-01 0.107 0.0895 0.215 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0569 0.0981 0.215 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -565575 sc-eQTL 2.10e-02 0.204 0.0876 0.215 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0326 0.0915 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 5.25e-01 0.0633 0.0995 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 8.87e-02 0.144 0.0845 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0621 0.0688 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 4.74e-01 0.0651 0.0908 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0098 0.06 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 3.70e-01 0.0825 0.0917 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0742 0.0635 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 1.27e-02 0.251 0.1 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0927 0.092 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0914 0.086 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00908 0.064 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 7.78e-01 0.0265 0.0939 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 2.09e-01 0.062 0.0492 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 2.92e-01 0.0775 0.0733 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 6.86e-01 0.0209 0.0516 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 6.81e-02 0.16 0.0872 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0332 0.0745 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 1.49e-01 -0.0854 0.059 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 2.42e-01 0.0649 0.0554 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0564 0.0547 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -565598 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0412 0.0976 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 4.46e-01 0.0613 0.0803 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0327 0.0714 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -565575 sc-eQTL 5.10e-01 0.0691 0.105 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 5.82e-01 0.0362 0.0657 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0156 0.103 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 7.31e-02 -0.128 0.0713 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 9.98e-03 0.14 0.0539 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 7.90e-01 0.0179 0.0671 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -565598 sc-eQTL 2.48e-01 -0.113 0.0971 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 9.65e-01 0.00265 0.0607 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 8.02e-01 0.0223 0.0888 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -565575 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00601 0.108 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 2.41e-01 -0.105 0.0896 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -646536 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0262 0.0937 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 907524 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00903 0.0655 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -276558 sc-eQTL 9.71e-01 0.00297 0.0813 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 19554 sc-eQTL 5.35e-01 0.0425 0.0685 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 259759 sc-eQTL 9.37e-02 -0.0999 0.0593 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -861288 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0075 0.0781 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -901772 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0171 0.0504 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 258740 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0647 0.0834 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N 19554 1.37e-05 1.48e-05 2.86e-06 8.64e-06 2.41e-06 6.21e-06 1.75e-05 2.93e-06 1.42e-05 7.28e-06 1.96e-05 7.33e-06 2.55e-05 6.03e-06 4.27e-06 9.51e-06 7.74e-06 1.22e-05 3.56e-06 3.93e-06 7.4e-06 1.35e-05 1.37e-05 4.43e-06 2.42e-05 4.45e-06 7.6e-06 6.91e-06 1.48e-05 1.38e-05 1.05e-05 1.06e-06 1.43e-06 4.02e-06 6.01e-06 3.78e-06 1.73e-06 2.13e-06 2.68e-06 2.07e-06 9.63e-07 2.31e-05 2.36e-06 1.88e-07 9.39e-07 2.34e-06 2.15e-06 9.11e-07 1.02e-06