logo

Genes within 1Mb (chr6:138123793:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 1.45e-01 -0.118 0.0809 0.214 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0329 0.079 0.214 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0161 0.062 0.214 B L1
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 9.35e-01 0.00504 0.0619 0.214 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00173 0.0499 0.214 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 3.09e-01 0.0711 0.0697 0.214 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 8.67e-01 0.00688 0.041 0.214 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 7.85e-02 0.138 0.0779 0.214 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0125 0.091 0.214 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0528 0.0531 0.214 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00127 0.0611 0.214 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 7.03e-02 -0.104 0.0571 0.214 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0796 0.0537 0.214 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 9.12e-01 0.00658 0.0596 0.214 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0683 0.0435 0.214 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0602 0.0678 0.214 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00848 0.0987 0.214 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 3.79e-01 0.0531 0.0602 0.214 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00434 0.0646 0.214 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0987 0.0655 0.214 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0392 0.0507 0.214 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 4.49e-02 0.133 0.0658 0.214 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 5.30e-01 0.0238 0.0378 0.214 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 3.15e-01 -0.075 0.0744 0.214 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 4.93e-02 -0.192 0.0972 0.214 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0132 0.0728 0.214 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 7.68e-01 0.0203 0.069 0.214 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 3.76e-01 0.069 0.0777 0.214 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -568778 sc-eQTL 8.98e-02 -0.152 0.0893 0.214 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 1.26e-01 0.122 0.0791 0.214 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 6.30e-01 0.0376 0.0779 0.214 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -568755 sc-eQTL 7.20e-01 0.0338 0.0941 0.214 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0383 0.0793 0.214 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 7.16e-01 0.0264 0.0725 0.214 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0651 0.0617 0.214 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 1.22e-01 0.0776 0.0499 0.214 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0502 0.0524 0.214 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -568778 sc-eQTL 2.48e-01 -0.109 0.0945 0.214 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 4.66e-01 0.0405 0.0554 0.214 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0116 0.0723 0.214 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -568755 sc-eQTL 2.52e-01 0.113 0.0983 0.214 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 9.54e-01 0.00377 0.065 0.214 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 9.94e-01 0.000701 0.0871 0.215 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00482 0.067 0.215 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 7.04e-01 0.0292 0.0767 0.215 NK L1
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 6.73e-01 0.0275 0.0651 0.215 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 9.48e-02 -0.093 0.0554 0.215 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0326 0.0717 0.215 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 6.68e-01 0.0225 0.0523 0.215 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 1.46e-01 -0.115 0.0786 0.215 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 2.25e-01 -0.125 0.103 0.214 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 5.22e-02 -0.122 0.0624 0.214 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00819 0.0668 0.214 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 6.71e-01 0.035 0.0823 0.214 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 8.63e-01 0.00675 0.0392 0.214 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 8.47e-01 0.0156 0.0805 0.214 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 8.76e-01 0.00824 0.0527 0.214 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0593 0.0777 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 4.67e-01 0.0844 0.116 0.219 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 2.92e-01 -0.109 0.103 0.219 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0976 0.101 0.219 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0501 0.0526 0.219 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 1.89e-01 0.134 0.102 0.219 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 3.40e-01 0.11 0.115 0.219 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0262 0.105 0.219 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 9.14e-01 0.00964 0.0893 0.219 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 5.27e-01 0.0642 0.101 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 1.24e-02 0.233 0.0924 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0308 0.0703 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0218 0.0895 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 6.08e-01 0.0361 0.0702 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 8.05e-01 0.0235 0.0948 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 3.07e-01 0.0825 0.0805 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 1.17e-02 0.25 0.0981 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 3.06e-01 -0.106 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 8.27e-01 0.0224 0.102 0.216 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 2.80e-01 -0.084 0.0776 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 5.24e-01 0.0619 0.0969 0.216 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 5.45e-01 0.0404 0.0667 0.216 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 7.57e-01 0.03 0.0969 0.216 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 1.32e-01 -0.115 0.0763 0.216 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0181 0.0994 0.216 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0382 0.0966 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0738 0.0797 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0416 0.0679 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 6.50e-01 0.0418 0.0921 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 8.34e-02 0.0923 0.0531 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0166 0.078 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00453 0.0545 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 2.30e-02 0.189 0.0827 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 8.56e-02 -0.161 0.0932 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 2.35e-01 -0.115 0.0964 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 7.85e-01 0.0175 0.0642 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 5.81e-01 0.0426 0.0771 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0435 0.077 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 2.36e-01 0.1 0.084 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 8.19e-01 0.0142 0.062 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0201 0.0996 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 2.49e-01 -0.116 0.1 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0985 0.0941 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 3.68e-01 0.0783 0.0869 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0399 0.106 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0121 0.0618 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 8.04e-01 0.0245 0.0987 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 1.47e-01 0.13 0.0895 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 8.54e-01 0.0177 0.0962 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0514 0.0949 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0103 0.0502 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 9.28e-01 0.00537 0.0592 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0346 0.0782 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 1.77e-01 -0.074 0.0546 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 9.26e-01 0.00605 0.0655 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0667 0.0438 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 6.53e-01 -0.032 0.071 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 7.78e-01 0.0261 0.0922 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0654 0.0692 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 8.56e-01 0.0125 0.0686 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 1.76e-02 -0.203 0.0849 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0783 0.0497 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 1.32e-01 -0.105 0.0695 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 8.25e-02 -0.0932 0.0534 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0469 0.07 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 2.18e-01 0.129 0.104 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 1.18e-01 -0.123 0.0786 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 5.74e-01 0.04 0.0711 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0187 0.0827 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 8.68e-01 0.00875 0.0525 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 9.70e-01 0.00328 0.0885 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 1.88e-02 -0.148 0.0623 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 1.51e-01 -0.121 0.0838 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0636 0.107 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 3.37e-01 0.0692 0.0719 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00211 0.0764 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 4.37e-02 -0.192 0.0944 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0817 0.0604 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 8.51e-02 0.143 0.0828 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 2.41e-01 0.079 0.0673 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0719 0.0851 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 4.44e-01 0.0787 0.103 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 8.07e-02 -0.125 0.0711 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 6.24e-01 0.0322 0.0656 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 9.53e-01 0.00462 0.0789 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0218 0.056 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 3.98e-01 0.0672 0.0793 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0243 0.0417 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0225 0.0828 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 6.37e-01 0.0539 0.114 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0334 0.0942 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0831 0.08 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 3.09e-01 -0.108 0.106 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0432 0.051 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 1.19e-01 0.135 0.0862 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 1.34e-02 -0.213 0.0851 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 7.16e-01 0.034 0.0934 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 9.40e-01 0.00808 0.107 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0172 0.0926 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0982 0.097 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 1.60e-01 -0.156 0.11 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 8.30e-01 0.0146 0.0683 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 8.29e-01 0.0226 0.104 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 5.57e-01 0.0472 0.0802 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 2.25e-01 -0.123 0.101 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 1.65e-01 -0.155 0.111 0.214 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 3.59e-02 -0.152 0.0718 0.214 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0117 0.0775 0.214 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0113 0.103 0.214 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 3.29e-01 0.0477 0.0487 0.214 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 7.43e-01 -0.03 0.0915 0.214 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0138 0.0673 0.214 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0929 0.09 0.214 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 8.96e-02 0.177 0.104 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0448 0.0816 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 4.13e-01 0.0731 0.089 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 3.35e-01 0.092 0.0952 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0601 0.0607 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0322 0.0885 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00822 0.0815 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0576 0.0969 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0478 0.0937 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0153 0.0616 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 8.51e-01 0.0157 0.0832 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0262 0.0746 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0751 0.0578 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 1.78e-01 -0.103 0.0761 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 3.67e-01 0.0467 0.0517 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 1.86e-01 -0.115 0.0866 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0545 0.108 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0649 0.0795 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0538 0.0923 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 5.81e-01 0.0453 0.082 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0338 0.0631 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 1.39e-01 0.148 0.0995 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 4.96e-01 0.0561 0.0822 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0796 0.102 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 5.39e-01 0.0601 0.0977 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 9.61e-01 0.00327 0.0659 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 3.39e-01 0.0805 0.0841 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 6.82e-01 0.0322 0.0785 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0281 0.0588 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 4.55e-01 -0.065 0.0868 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0759 0.0558 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0403 0.0887 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0835 0.12 0.222 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 8.39e-01 0.026 0.127 0.222 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 6.40e-01 0.0503 0.107 0.222 PB L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 5.04e-04 -0.277 0.0774 0.222 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0291 0.099 0.222 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 1.83e-01 0.155 0.116 0.222 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 2.32e-01 0.0974 0.0812 0.222 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 4.91e-01 0.082 0.119 0.222 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0479 0.108 0.213 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 4.35e-02 -0.165 0.0815 0.213 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 8.88e-01 0.0121 0.086 0.213 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 2.67e-01 0.0882 0.0792 0.213 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00667 0.0501 0.213 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 8.54e-01 0.0184 0.1 0.213 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0166 0.0645 0.213 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 8.74e-01 0.0155 0.0973 0.213 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0355 0.101 0.214 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 7.92e-01 0.025 0.095 0.214 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 8.64e-01 0.0118 0.0689 0.214 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 1.87e-01 -0.143 0.108 0.214 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0338 0.0603 0.214 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 8.66e-01 0.0147 0.0867 0.214 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0518 0.0738 0.214 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00309 0.0921 0.214 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 1.68e-02 -0.24 0.0996 0.22 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0756 0.0822 0.22 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 8.28e-01 0.0158 0.0726 0.22 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 9.41e-01 0.00604 0.0812 0.22 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -568778 sc-eQTL 3.71e-02 -0.195 0.093 0.22 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 3.16e-01 0.109 0.108 0.22 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00217 0.0887 0.22 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -568755 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0178 0.104 0.22 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 8.58e-01 -0.019 0.106 0.22 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 6.58e-01 0.0348 0.0785 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0329 0.0572 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 1.01e-01 0.0922 0.0561 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0302 0.0616 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -568778 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0704 0.0944 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0286 0.0843 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 7.37e-01 0.0238 0.071 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -568755 sc-eQTL 2.89e-01 0.105 0.0987 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 3.62e-01 0.06 0.0657 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 1.87e-01 -0.119 0.0902 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0725 0.0663 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 7.62e-01 0.0188 0.0619 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 1.65e-01 -0.082 0.0588 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -568778 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0915 0.0968 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 9.73e-02 0.152 0.0912 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 8.76e-01 0.0124 0.0798 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -568755 sc-eQTL 4.03e-01 0.0888 0.106 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0333 0.0848 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 4.11e-01 -0.103 0.124 0.224 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 3.37e-02 -0.211 0.0983 0.224 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 6.91e-02 0.215 0.118 0.224 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 2.69e-01 -0.122 0.11 0.224 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 4.90e-01 0.0424 0.0613 0.224 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 7.05e-02 0.221 0.121 0.224 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 2.50e-01 0.106 0.0918 0.224 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 5.48e-01 -0.067 0.111 0.224 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 8.13e-01 0.025 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0499 0.0709 0.22 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 1.57e-02 0.17 0.0697 0.22 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 3.38e-01 0.0587 0.0611 0.22 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -568778 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0554 0.0953 0.22 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 8.05e-01 0.0244 0.0985 0.22 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 5.35e-01 0.0558 0.0898 0.22 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -568755 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0288 0.107 0.22 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 1.56e-01 -0.129 0.0908 0.22 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0152 0.0998 0.215 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0413 0.0849 0.215 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 9.65e-02 0.0987 0.0591 0.215 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00871 0.0752 0.215 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -568778 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0625 0.0958 0.215 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 1.58e-01 -0.102 0.0719 0.215 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 6.10e-01 0.0444 0.087 0.215 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -568755 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0271 0.106 0.215 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0757 0.0939 0.215 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0308 0.111 0.22 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0682 0.0938 0.22 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 6.27e-01 0.0419 0.0861 0.22 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 1.09e-01 0.139 0.0864 0.22 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -568778 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0576 0.0856 0.22 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 1.02e-01 0.142 0.0861 0.22 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 5.62e-01 -0.055 0.0948 0.22 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -568755 sc-eQTL 2.13e-02 0.197 0.0846 0.22 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0311 0.0884 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 7.60e-01 0.0297 0.0971 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 1.19e-01 0.129 0.0824 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0523 0.0672 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 7.48e-01 0.0285 0.0886 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00755 0.0585 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 3.42e-01 0.0851 0.0894 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0512 0.062 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 2.97e-02 0.214 0.0978 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 1.92e-01 -0.117 0.0896 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 2.25e-01 -0.102 0.0838 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0189 0.0624 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 5.75e-01 0.0514 0.0916 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 3.26e-01 0.0473 0.0481 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 5.24e-01 0.0457 0.0717 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 9.18e-01 0.0052 0.0503 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 1.05e-01 0.139 0.0852 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0215 0.0725 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0528 0.0576 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 1.99e-01 0.0693 0.0538 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0382 0.0533 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -568778 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0817 0.0949 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 4.19e-01 0.0632 0.0781 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 9.52e-01 0.0042 0.0695 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -568755 sc-eQTL 3.95e-01 0.0869 0.102 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 6.68e-01 0.0275 0.0639 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0307 0.0992 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0742 0.0692 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 3.28e-02 0.113 0.0524 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 9.01e-01 0.00805 0.0649 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -568778 sc-eQTL 1.94e-01 -0.122 0.0938 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00154 0.0587 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 4.69e-01 0.0622 0.0857 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -568755 sc-eQTL 8.60e-01 0.0184 0.104 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 8.37e-02 -0.15 0.0863 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -649716 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0606 0.0904 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 904344 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00836 0.0633 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -279738 sc-eQTL 9.49e-01 0.00498 0.0785 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 16374 sc-eQTL 7.97e-01 0.017 0.0662 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 256579 sc-eQTL 1.12e-01 -0.0913 0.0573 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -864468 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0364 0.0753 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -904952 sc-eQTL 5.68e-01 0.0278 0.0486 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 255560 sc-eQTL 1.79e-01 -0.108 0.0803 0.216 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N 16374 1.77e-05 2.13e-05 4.17e-06 1.24e-05 3.64e-06 9.46e-06 2.91e-05 3.48e-06 1.87e-05 9.43e-06 2.45e-05 9.41e-06 3.56e-05 8.78e-06 5.36e-06 1.14e-05 1.05e-05 1.7e-05 6.31e-06 5.35e-06 9.59e-06 2.02e-05 2.09e-05 7.63e-06 3.11e-05 5.72e-06 8.36e-06 8.09e-06 2.25e-05 2.4e-05 1.29e-05 1.63e-06 2.29e-06 6.29e-06 8.64e-06 4.68e-06 2.77e-06 2.97e-06 4e-06 3.13e-06 1.72e-06 2.55e-05 2.67e-06 3.73e-07 2.06e-06 2.96e-06 3.42e-06 1.5e-06 1.35e-06