logo

Genes within 1Mb (chr6:138120249:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 1.45e-01 -0.118 0.0809 0.214 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0329 0.079 0.214 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0161 0.062 0.214 B L1
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 9.35e-01 0.00504 0.0619 0.214 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00173 0.0499 0.214 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 3.09e-01 0.0711 0.0697 0.214 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 8.67e-01 0.00688 0.041 0.214 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 7.85e-02 0.138 0.0779 0.214 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0125 0.091 0.214 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0528 0.0531 0.214 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00127 0.0611 0.214 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 7.03e-02 -0.104 0.0571 0.214 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0796 0.0537 0.214 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 9.12e-01 0.00658 0.0596 0.214 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0683 0.0435 0.214 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0602 0.0678 0.214 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00848 0.0987 0.214 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 3.79e-01 0.0531 0.0602 0.214 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00434 0.0646 0.214 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0987 0.0655 0.214 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0392 0.0507 0.214 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 4.49e-02 0.133 0.0658 0.214 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 5.30e-01 0.0238 0.0378 0.214 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 3.15e-01 -0.075 0.0744 0.214 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 4.93e-02 -0.192 0.0972 0.214 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0132 0.0728 0.214 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 7.68e-01 0.0203 0.069 0.214 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 3.76e-01 0.069 0.0777 0.214 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -572322 sc-eQTL 8.98e-02 -0.152 0.0893 0.214 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 1.26e-01 0.122 0.0791 0.214 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 6.30e-01 0.0376 0.0779 0.214 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -572299 sc-eQTL 7.20e-01 0.0338 0.0941 0.214 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0383 0.0793 0.214 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 7.16e-01 0.0264 0.0725 0.214 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0651 0.0617 0.214 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 1.22e-01 0.0776 0.0499 0.214 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0502 0.0524 0.214 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -572322 sc-eQTL 2.48e-01 -0.109 0.0945 0.214 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 4.66e-01 0.0405 0.0554 0.214 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0116 0.0723 0.214 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -572299 sc-eQTL 2.52e-01 0.113 0.0983 0.214 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 9.54e-01 0.00377 0.065 0.214 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 9.94e-01 0.000701 0.0871 0.215 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00482 0.067 0.215 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 7.04e-01 0.0292 0.0767 0.215 NK L1
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 6.73e-01 0.0275 0.0651 0.215 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 9.48e-02 -0.093 0.0554 0.215 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0326 0.0717 0.215 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 6.68e-01 0.0225 0.0523 0.215 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 1.46e-01 -0.115 0.0786 0.215 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 2.25e-01 -0.125 0.103 0.214 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 5.22e-02 -0.122 0.0624 0.214 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00819 0.0668 0.214 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 6.71e-01 0.035 0.0823 0.214 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 8.63e-01 0.00675 0.0392 0.214 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 8.47e-01 0.0156 0.0805 0.214 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 8.76e-01 0.00824 0.0527 0.214 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0593 0.0777 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 4.67e-01 0.0844 0.116 0.219 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 2.92e-01 -0.109 0.103 0.219 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0976 0.101 0.219 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0501 0.0526 0.219 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 1.89e-01 0.134 0.102 0.219 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 3.40e-01 0.11 0.115 0.219 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0262 0.105 0.219 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 9.14e-01 0.00964 0.0893 0.219 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 5.27e-01 0.0642 0.101 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 1.24e-02 0.233 0.0924 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0308 0.0703 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0218 0.0895 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 6.08e-01 0.0361 0.0702 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 8.05e-01 0.0235 0.0948 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 3.07e-01 0.0825 0.0805 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 1.17e-02 0.25 0.0981 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 3.06e-01 -0.106 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 8.27e-01 0.0224 0.102 0.216 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 2.80e-01 -0.084 0.0776 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 5.24e-01 0.0619 0.0969 0.216 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 5.45e-01 0.0404 0.0667 0.216 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 7.57e-01 0.03 0.0969 0.216 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 1.32e-01 -0.115 0.0763 0.216 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0181 0.0994 0.216 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0382 0.0966 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0738 0.0797 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0416 0.0679 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 6.50e-01 0.0418 0.0921 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 8.34e-02 0.0923 0.0531 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0166 0.078 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00453 0.0545 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 2.30e-02 0.189 0.0827 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 8.56e-02 -0.161 0.0932 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 2.35e-01 -0.115 0.0964 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 7.85e-01 0.0175 0.0642 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 5.81e-01 0.0426 0.0771 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0435 0.077 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 2.36e-01 0.1 0.084 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 8.19e-01 0.0142 0.062 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0201 0.0996 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 2.49e-01 -0.116 0.1 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0985 0.0941 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 3.68e-01 0.0783 0.0869 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0399 0.106 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0121 0.0618 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 8.04e-01 0.0245 0.0987 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 1.47e-01 0.13 0.0895 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 8.54e-01 0.0177 0.0962 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0514 0.0949 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0103 0.0502 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 9.28e-01 0.00537 0.0592 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0346 0.0782 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 1.77e-01 -0.074 0.0546 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 9.26e-01 0.00605 0.0655 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0667 0.0438 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 6.53e-01 -0.032 0.071 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 7.78e-01 0.0261 0.0922 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0654 0.0692 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 8.56e-01 0.0125 0.0686 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 1.76e-02 -0.203 0.0849 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0783 0.0497 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 1.32e-01 -0.105 0.0695 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 8.25e-02 -0.0932 0.0534 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0469 0.07 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 2.18e-01 0.129 0.104 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 1.18e-01 -0.123 0.0786 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 5.74e-01 0.04 0.0711 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0187 0.0827 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 8.68e-01 0.00875 0.0525 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 9.70e-01 0.00328 0.0885 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 1.88e-02 -0.148 0.0623 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 1.51e-01 -0.121 0.0838 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0636 0.107 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 3.37e-01 0.0692 0.0719 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00211 0.0764 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 4.37e-02 -0.192 0.0944 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0817 0.0604 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 8.51e-02 0.143 0.0828 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 2.41e-01 0.079 0.0673 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0719 0.0851 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 4.44e-01 0.0787 0.103 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 8.07e-02 -0.125 0.0711 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 6.24e-01 0.0322 0.0656 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 9.53e-01 0.00462 0.0789 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0218 0.056 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 3.98e-01 0.0672 0.0793 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0243 0.0417 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0225 0.0828 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 6.37e-01 0.0539 0.114 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0334 0.0942 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0831 0.08 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 3.09e-01 -0.108 0.106 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0432 0.051 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 1.19e-01 0.135 0.0862 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 1.34e-02 -0.213 0.0851 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 7.16e-01 0.034 0.0934 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 9.40e-01 0.00808 0.107 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0172 0.0926 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0982 0.097 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 1.60e-01 -0.156 0.11 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 8.30e-01 0.0146 0.0683 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 8.29e-01 0.0226 0.104 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 5.57e-01 0.0472 0.0802 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 2.25e-01 -0.123 0.101 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 1.65e-01 -0.155 0.111 0.214 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 3.59e-02 -0.152 0.0718 0.214 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0117 0.0775 0.214 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0113 0.103 0.214 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 3.29e-01 0.0477 0.0487 0.214 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 7.43e-01 -0.03 0.0915 0.214 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0138 0.0673 0.214 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0929 0.09 0.214 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 8.96e-02 0.177 0.104 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0448 0.0816 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 4.13e-01 0.0731 0.089 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 3.35e-01 0.092 0.0952 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0601 0.0607 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0322 0.0885 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00822 0.0815 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0576 0.0969 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0478 0.0937 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0153 0.0616 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 8.51e-01 0.0157 0.0832 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0262 0.0746 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0751 0.0578 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 1.78e-01 -0.103 0.0761 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 3.67e-01 0.0467 0.0517 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 1.86e-01 -0.115 0.0866 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0545 0.108 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0649 0.0795 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0538 0.0923 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 5.81e-01 0.0453 0.082 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0338 0.0631 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 1.39e-01 0.148 0.0995 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 4.96e-01 0.0561 0.0822 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0796 0.102 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 5.39e-01 0.0601 0.0977 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 9.61e-01 0.00327 0.0659 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 3.39e-01 0.0805 0.0841 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 6.82e-01 0.0322 0.0785 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0281 0.0588 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 4.55e-01 -0.065 0.0868 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0759 0.0558 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0403 0.0887 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0835 0.12 0.222 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 8.39e-01 0.026 0.127 0.222 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 6.40e-01 0.0503 0.107 0.222 PB L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 5.04e-04 -0.277 0.0774 0.222 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0291 0.099 0.222 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 1.83e-01 0.155 0.116 0.222 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 2.32e-01 0.0974 0.0812 0.222 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 4.91e-01 0.082 0.119 0.222 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0479 0.108 0.213 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 4.35e-02 -0.165 0.0815 0.213 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 8.88e-01 0.0121 0.086 0.213 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 2.67e-01 0.0882 0.0792 0.213 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00667 0.0501 0.213 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 8.54e-01 0.0184 0.1 0.213 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0166 0.0645 0.213 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 8.74e-01 0.0155 0.0973 0.213 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0355 0.101 0.214 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 7.92e-01 0.025 0.095 0.214 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 8.64e-01 0.0118 0.0689 0.214 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 1.87e-01 -0.143 0.108 0.214 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0338 0.0603 0.214 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 8.66e-01 0.0147 0.0867 0.214 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0518 0.0738 0.214 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00309 0.0921 0.214 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 1.68e-02 -0.24 0.0996 0.22 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0756 0.0822 0.22 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 8.28e-01 0.0158 0.0726 0.22 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 9.41e-01 0.00604 0.0812 0.22 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -572322 sc-eQTL 3.71e-02 -0.195 0.093 0.22 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 3.16e-01 0.109 0.108 0.22 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00217 0.0887 0.22 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -572299 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0178 0.104 0.22 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 8.58e-01 -0.019 0.106 0.22 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 6.58e-01 0.0348 0.0785 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0329 0.0572 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 1.01e-01 0.0922 0.0561 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0302 0.0616 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -572322 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0704 0.0944 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0286 0.0843 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 7.37e-01 0.0238 0.071 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -572299 sc-eQTL 2.89e-01 0.105 0.0987 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 3.62e-01 0.06 0.0657 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 1.87e-01 -0.119 0.0902 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0725 0.0663 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 7.62e-01 0.0188 0.0619 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 1.65e-01 -0.082 0.0588 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -572322 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0915 0.0968 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 9.73e-02 0.152 0.0912 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 8.76e-01 0.0124 0.0798 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -572299 sc-eQTL 4.03e-01 0.0888 0.106 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0333 0.0848 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 4.11e-01 -0.103 0.124 0.224 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 3.37e-02 -0.211 0.0983 0.224 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 6.91e-02 0.215 0.118 0.224 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 2.69e-01 -0.122 0.11 0.224 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 4.90e-01 0.0424 0.0613 0.224 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 7.05e-02 0.221 0.121 0.224 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 2.50e-01 0.106 0.0918 0.224 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 5.48e-01 -0.067 0.111 0.224 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 8.13e-01 0.025 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0499 0.0709 0.22 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 1.57e-02 0.17 0.0697 0.22 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 3.38e-01 0.0587 0.0611 0.22 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -572322 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0554 0.0953 0.22 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 8.05e-01 0.0244 0.0985 0.22 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 5.35e-01 0.0558 0.0898 0.22 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -572299 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0288 0.107 0.22 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 1.56e-01 -0.129 0.0908 0.22 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0152 0.0998 0.215 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0413 0.0849 0.215 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 9.65e-02 0.0987 0.0591 0.215 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00871 0.0752 0.215 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -572322 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0625 0.0958 0.215 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 1.58e-01 -0.102 0.0719 0.215 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 6.10e-01 0.0444 0.087 0.215 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -572299 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0271 0.106 0.215 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0757 0.0939 0.215 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0308 0.111 0.22 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0682 0.0938 0.22 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 6.27e-01 0.0419 0.0861 0.22 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 1.09e-01 0.139 0.0864 0.22 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -572322 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0576 0.0856 0.22 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 1.02e-01 0.142 0.0861 0.22 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 5.62e-01 -0.055 0.0948 0.22 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -572299 sc-eQTL 2.13e-02 0.197 0.0846 0.22 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0311 0.0884 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 7.60e-01 0.0297 0.0971 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 1.19e-01 0.129 0.0824 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0523 0.0672 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 7.48e-01 0.0285 0.0886 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00755 0.0585 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 3.42e-01 0.0851 0.0894 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0512 0.062 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 2.97e-02 0.214 0.0978 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 1.92e-01 -0.117 0.0896 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 2.25e-01 -0.102 0.0838 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0189 0.0624 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 5.75e-01 0.0514 0.0916 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 3.26e-01 0.0473 0.0481 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 5.24e-01 0.0457 0.0717 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 9.18e-01 0.0052 0.0503 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 1.05e-01 0.139 0.0852 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0215 0.0725 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0528 0.0576 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 1.99e-01 0.0693 0.0538 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0382 0.0533 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -572322 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0817 0.0949 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 4.19e-01 0.0632 0.0781 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 9.52e-01 0.0042 0.0695 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -572299 sc-eQTL 3.95e-01 0.0869 0.102 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 6.68e-01 0.0275 0.0639 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0307 0.0992 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0742 0.0692 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 3.28e-02 0.113 0.0524 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 9.01e-01 0.00805 0.0649 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -572322 sc-eQTL 1.94e-01 -0.122 0.0938 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00154 0.0587 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 4.69e-01 0.0622 0.0857 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -572299 sc-eQTL 8.60e-01 0.0184 0.104 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 8.37e-02 -0.15 0.0863 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -653260 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0606 0.0904 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 900800 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00836 0.0633 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -283282 sc-eQTL 9.49e-01 0.00498 0.0785 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 12830 sc-eQTL 7.97e-01 0.017 0.0662 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 253035 sc-eQTL 1.12e-01 -0.0913 0.0573 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -868012 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0364 0.0753 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -908496 sc-eQTL 5.68e-01 0.0278 0.0486 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 252016 sc-eQTL 1.79e-01 -0.108 0.0803 0.216 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N 12830 2.17e-05 2.32e-05 4.47e-06 1.29e-05 4.03e-06 1.07e-05 3.06e-05 3.72e-06 2e-05 1.05e-05 2.74e-05 1.09e-05 3.66e-05 1e-05 5.5e-06 1.25e-05 1.19e-05 1.89e-05 6.06e-06 5.37e-06 1.01e-05 2.24e-05 2.31e-05 6.97e-06 3.21e-05 5.98e-06 9.09e-06 9.46e-06 2.43e-05 2.14e-05 1.29e-05 1.58e-06 2.24e-06 6.44e-06 8.71e-06 4.59e-06 2.65e-06 2.79e-06 3.62e-06 2.77e-06 1.63e-06 2.78e-05 2.68e-06 2.64e-07 2.05e-06 3e-06 3.38e-06 1.49e-06 1.33e-06