logo

Genes within 1Mb (chr6:138097039:TG:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 1.19e-01 -0.136 0.087 0.171 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 7.09e-01 0.0318 0.0851 0.171 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 8.00e-01 -0.017 0.0668 0.171 B L1
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 8.71e-01 0.0108 0.0667 0.171 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 6.23e-01 0.0265 0.0537 0.171 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 7.56e-01 0.0234 0.0752 0.171 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 7.27e-01 0.0154 0.0442 0.171 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 1.46e-01 0.123 0.0841 0.171 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 7.73e-01 -0.028 0.0968 0.171 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0415 0.0566 0.171 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 7.93e-01 0.0171 0.065 0.171 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0726 0.0611 0.171 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 7.96e-01 0.0149 0.0574 0.171 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0581 0.0634 0.171 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0471 0.0465 0.171 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 7.54e-01 0.0227 0.0723 0.171 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0849 0.106 0.171 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 6.23e-01 0.0318 0.0646 0.171 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 8.82e-01 0.0103 0.0692 0.171 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0673 0.0703 0.171 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 5.57e-01 0.032 0.0544 0.171 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 1.93e-01 0.0925 0.0709 0.171 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 2.42e-01 0.0474 0.0404 0.171 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00968 0.0799 0.171 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 2.98e-02 -0.224 0.102 0.173 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 9.51e-01 0.00476 0.0769 0.173 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 4.66e-01 0.0532 0.0727 0.173 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 1.31e-01 0.124 0.0817 0.173 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -595532 sc-eQTL 7.62e-02 -0.168 0.0942 0.173 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 1.41e-01 0.123 0.0835 0.173 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 6.84e-01 0.0335 0.0822 0.173 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -595509 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0138 0.0993 0.173 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00756 0.0837 0.173 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 7.78e-01 0.0217 0.0771 0.171 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 5.43e-01 -0.04 0.0657 0.171 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 2.48e-01 0.0616 0.0532 0.171 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 8.07e-01 0.0137 0.0557 0.171 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -595532 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0457 0.101 0.171 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 6.12e-02 0.11 0.0585 0.171 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0396 0.0767 0.171 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -595509 sc-eQTL 9.17e-01 -0.011 0.105 0.171 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 1.05e-01 0.112 0.0686 0.171 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0453 0.0945 0.172 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00378 0.0727 0.172 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 4.61e-01 0.0614 0.0832 0.172 NK L1
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0244 0.0707 0.172 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0133 0.0605 0.172 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0334 0.0778 0.172 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 7.43e-01 0.0186 0.0568 0.172 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0776 0.0856 0.172 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 2.12e-01 -0.139 0.111 0.171 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 7.10e-02 -0.122 0.0673 0.171 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 9.73e-01 0.00243 0.072 0.171 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 7.50e-01 0.0283 0.0888 0.171 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 2.12e-01 0.0527 0.0421 0.171 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0629 0.0867 0.171 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 4.70e-01 0.0411 0.0567 0.171 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0194 0.0838 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 4.31e-01 0.098 0.124 0.179 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0336 0.111 0.179 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0941 0.109 0.179 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0542 0.0564 0.179 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 1.00e-02 0.28 0.108 0.179 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 5.74e-01 0.0697 0.124 0.179 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 7.97e-01 -0.029 0.112 0.179 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0876 0.0956 0.179 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0445 0.109 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 4.88e-03 0.281 0.0989 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0937 0.0753 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 9.79e-01 0.00253 0.0962 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 7.65e-02 0.133 0.0749 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 7.93e-01 0.0268 0.102 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 5.27e-01 0.0549 0.0867 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 1.97e-02 0.248 0.106 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0826 0.11 0.172 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 7.43e-01 0.0355 0.108 0.172 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0942 0.0823 0.172 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 8.84e-01 -0.015 0.103 0.172 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 1.10e-01 0.113 0.0704 0.172 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 8.41e-01 0.0207 0.103 0.172 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 1.60e-01 -0.114 0.081 0.172 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 5.28e-01 0.0667 0.105 0.172 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 1.64e-01 -0.143 0.103 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 7.57e-01 0.0264 0.0852 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0509 0.0724 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 2.10e-01 0.123 0.0979 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 3.55e-02 0.119 0.0564 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0179 0.0832 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00765 0.0582 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 2.27e-02 0.202 0.0882 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 2.63e-01 -0.113 0.1 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 2.35e-01 -0.123 0.104 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 8.60e-01 0.0121 0.0689 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 8.63e-01 0.0143 0.0828 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 9.66e-01 0.00357 0.0827 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 7.24e-01 0.0319 0.0905 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 4.89e-01 0.0461 0.0665 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 2.75e-01 -0.117 0.107 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 1.87e-01 -0.139 0.105 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 1.78e-01 -0.133 0.0982 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 4.22e-01 0.0731 0.0909 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 8.01e-01 0.0279 0.111 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 3.07e-01 0.066 0.0645 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0121 0.103 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 4.83e-01 0.066 0.094 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0271 0.101 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0444 0.101 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0233 0.0536 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 7.65e-01 0.0189 0.0632 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 5.05e-01 0.0556 0.0834 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 6.77e-01 0.0244 0.0585 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0485 0.0698 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0436 0.0469 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 4.63e-01 0.0557 0.0758 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0162 0.0986 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0389 0.0741 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 5.94e-01 0.0391 0.0733 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 1.98e-01 -0.118 0.0917 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 9.97e-01 0.000204 0.0535 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 4.99e-03 -0.208 0.0734 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0805 0.0573 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 9.56e-01 0.00416 0.0749 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 1.66e-01 0.155 0.111 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 7.88e-02 -0.148 0.084 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 2.26e-01 0.0922 0.0759 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0109 0.0885 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 2.27e-01 0.0679 0.056 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 4.94e-01 0.0648 0.0946 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 6.92e-02 -0.122 0.067 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0681 0.09 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 1.48e-01 -0.166 0.114 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 3.82e-01 0.0675 0.0771 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 2.68e-01 0.0907 0.0817 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 8.77e-02 -0.174 0.102 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0438 0.065 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 7.38e-01 0.0299 0.0894 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 3.09e-01 0.0736 0.0722 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 9.13e-01 -0.01 0.0914 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 5.51e-01 0.065 0.109 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0757 0.0758 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 5.58e-01 0.0408 0.0696 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0286 0.0837 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 1.72e-01 0.081 0.0592 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 3.15e-01 0.0847 0.0841 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00585 0.0442 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 9.40e-01 0.00662 0.0878 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 7.94e-01 -0.032 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 2.79e-01 -0.109 0.101 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0813 0.0859 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0885 0.114 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0465 0.0547 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 7.91e-02 0.163 0.0924 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 1.46e-01 -0.135 0.0923 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0321 0.1 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0861 0.113 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0227 0.0982 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0372 0.103 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0978 0.117 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 5.27e-01 0.0458 0.0723 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 9.93e-01 0.00097 0.11 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 2.97e-01 0.0887 0.0849 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0741 0.107 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 5.00e-02 -0.233 0.118 0.171 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 2.90e-02 -0.168 0.0766 0.171 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 9.09e-01 0.00945 0.0828 0.171 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0111 0.11 0.171 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 1.19e-01 0.0812 0.0518 0.171 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0638 0.0976 0.171 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 4.67e-01 0.0522 0.0718 0.171 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0749 0.0963 0.171 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 3.84e-01 0.0965 0.111 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0775 0.0863 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 3.05e-01 0.0967 0.0941 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0104 0.101 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 9.27e-01 0.00592 0.0644 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0888 0.0935 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 9.60e-01 0.00435 0.0863 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 2.35e-01 -0.122 0.102 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 4.41e-01 -0.078 0.101 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0346 0.0665 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 4.58e-01 0.0667 0.0897 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0608 0.0804 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 9.83e-01 0.00131 0.0626 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0938 0.0823 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 4.56e-01 0.0417 0.0558 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0782 0.0937 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 2.68e-01 -0.129 0.116 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 4.21e-01 -0.069 0.0856 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 4.54e-01 0.0744 0.0993 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0117 0.0884 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 4.43e-01 0.0521 0.0679 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 5.61e-01 0.0627 0.108 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 1.27e-01 0.135 0.0881 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0835 0.109 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 3.61e-01 0.0963 0.105 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 8.33e-01 0.015 0.071 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 2.60e-01 0.102 0.0905 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0371 0.0846 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 5.28e-01 0.04 0.0634 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0453 0.0937 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0739 0.0602 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0307 0.0956 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0623 0.127 0.189 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 5.30e-01 0.0842 0.134 0.189 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 2.09e-01 0.141 0.112 0.189 PB L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 1.23e-02 -0.212 0.0835 0.189 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 2.85e-01 -0.111 0.104 0.189 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 1.22e-01 0.189 0.121 0.189 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 1.17e-01 0.134 0.0849 0.189 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 8.70e-01 0.0204 0.125 0.189 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 8.29e-01 0.0247 0.114 0.17 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0757 0.0871 0.17 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 8.06e-01 0.0224 0.0912 0.17 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 3.54e-01 0.0781 0.0841 0.17 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 6.52e-01 0.024 0.0531 0.17 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0175 0.106 0.17 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 9.17e-01 0.00718 0.0685 0.17 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00803 0.103 0.17 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0308 0.107 0.171 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 7.88e-01 0.0272 0.101 0.171 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 6.99e-01 0.0284 0.0733 0.171 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 1.33e-01 -0.173 0.115 0.171 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 6.44e-01 0.0297 0.0642 0.171 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 3.61e-01 0.0843 0.0921 0.171 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0849 0.0784 0.171 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 6.80e-01 0.0405 0.0979 0.171 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 4.24e-03 -0.302 0.104 0.176 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 2.42e-01 -0.102 0.0865 0.176 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 5.49e-01 0.0459 0.0764 0.176 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 4.06e-01 0.0712 0.0855 0.176 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -595532 sc-eQTL 5.88e-02 -0.187 0.0983 0.176 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 3.81e-01 0.1 0.114 0.176 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 8.48e-01 0.018 0.0935 0.176 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -595509 sc-eQTL 5.41e-01 -0.067 0.109 0.176 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0927 0.111 0.176 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 6.10e-01 0.0427 0.0837 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0172 0.061 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 3.70e-01 0.0539 0.06 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 7.25e-01 0.0231 0.0657 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -595532 sc-eQTL 9.08e-01 0.0116 0.101 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 9.81e-01 0.00218 0.09 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 7.86e-01 0.0205 0.0757 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -595509 sc-eQTL 4.32e-01 0.083 0.105 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 1.11e-01 0.112 0.0697 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 1.93e-01 -0.125 0.0957 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0298 0.0705 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 4.07e-01 0.0546 0.0656 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 8.45e-01 0.0123 0.0627 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -595532 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0779 0.103 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 2.35e-02 0.219 0.0962 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0495 0.0846 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -595509 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0546 0.113 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 1.45e-01 0.131 0.0896 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 3.21e-01 -0.129 0.13 0.17 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 2.69e-02 -0.229 0.103 0.17 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 1.96e-01 0.161 0.123 0.17 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 1.39e-01 -0.171 0.115 0.17 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 2.07e-01 0.0809 0.0638 0.17 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 1.18e-01 0.2 0.127 0.17 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 2.22e-01 0.118 0.0959 0.17 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 2.75e-01 -0.127 0.116 0.17 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0478 0.111 0.176 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0281 0.075 0.176 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 3.46e-02 0.157 0.074 0.176 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 5.23e-02 0.125 0.0642 0.176 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -595532 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0914 0.101 0.176 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 1.11e-01 0.166 0.104 0.176 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 4.58e-01 0.0707 0.095 0.176 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -595509 sc-eQTL 6.34e-01 -0.054 0.113 0.176 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0232 0.0966 0.176 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 6.63e-01 0.0459 0.105 0.174 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 7.78e-01 0.0253 0.0896 0.174 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 2.96e-01 0.0656 0.0626 0.174 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 8.88e-01 0.0112 0.0793 0.174 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -595532 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0561 0.101 0.174 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0619 0.0761 0.174 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 8.10e-01 0.0221 0.0918 0.174 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -595509 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0418 0.112 0.174 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0542 0.0991 0.174 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0366 0.12 0.172 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0451 0.102 0.172 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 7.07e-01 0.0351 0.0934 0.172 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 4.25e-01 0.0756 0.0944 0.172 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -595532 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0805 0.0928 0.172 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 8.18e-02 0.163 0.0933 0.172 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 7.93e-01 -0.027 0.103 0.172 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -595509 sc-eQTL 7.16e-01 0.034 0.0934 0.172 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0362 0.0959 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0221 0.104 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 8.69e-02 0.152 0.0886 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0913 0.0721 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00966 0.0953 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 3.60e-01 0.0577 0.0628 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 6.02e-01 0.0502 0.0963 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0761 0.0666 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 1.66e-02 0.253 0.105 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 7.08e-02 -0.173 0.0954 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0433 0.0898 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0266 0.0666 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 1.53e-01 0.14 0.0974 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 2.52e-01 0.0589 0.0513 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00843 0.0766 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 9.16e-01 0.00564 0.0537 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 2.98e-01 0.0953 0.0914 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00633 0.0774 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0266 0.0616 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 3.12e-01 0.0583 0.0575 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 6.65e-01 0.0247 0.057 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -595532 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0203 0.101 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 1.36e-01 0.124 0.083 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0243 0.0742 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -595509 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0193 0.109 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 6.21e-02 0.127 0.0678 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00194 0.104 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0431 0.0727 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 4.01e-02 0.114 0.0549 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 3.26e-01 0.0668 0.0678 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -595532 sc-eQTL 3.00e-01 -0.102 0.0984 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 2.87e-01 0.0653 0.0613 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 5.68e-01 0.0514 0.0898 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -595509 sc-eQTL 5.16e-01 -0.071 0.109 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0753 0.0909 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -676470 sc-eQTL 3.14e-01 -0.099 0.098 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 877590 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00902 0.0687 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 sc-eQTL 5.41e-01 0.0521 0.0851 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -10380 sc-eQTL 7.08e-01 -0.027 0.0718 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 229825 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00935 0.0626 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -891222 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0247 0.0818 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -931706 sc-eQTL 4.45e-01 0.0403 0.0527 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 228806 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0702 0.0874 0.172 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -306492 eQTL 0.000588 0.089 0.0258 0.0 0.0 0.156

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N -10380 0.000193 0.000178 2.66e-05 4.32e-05 2.07e-05 5.43e-05 0.000168 1.68e-05 0.000111 5.08e-05 0.000153 6.75e-05 0.000184 5.45e-05 2.73e-05 0.000104 6.85e-05 8.7e-05 2.95e-05 1.7e-05 5.47e-05 0.000164 0.000133 3.66e-05 0.000173 3.79e-05 6.53e-05 4.14e-05 0.000128 5.99e-05 8.74e-05 5.28e-06 8.02e-06 1.78e-05 3.02e-05 1.46e-05 7.72e-06 6.82e-06 1.1e-05 8.13e-06 3.25e-06 0.000205 1.62e-05 5.03e-07 7.89e-06 1.1e-05 1.59e-05 3.82e-06 3.61e-06
ENSG00000237499 \N 228806 1.96e-06 1.24e-06 3e-07 1.56e-06 9.72e-08 5.88e-07 1.24e-06 1.73e-07 1.16e-06 2.57e-07 1.26e-06 5.6e-07 2.7e-06 2.89e-07 4.3e-07 6.72e-07 5.55e-07 6.58e-07 5.26e-07 5.17e-07 4.39e-07 1.72e-06 1.25e-06 6.51e-07 2.05e-06 2.44e-07 5.24e-07 2.68e-07 1.24e-06 1.2e-06 5.66e-07 3.55e-08 1.32e-07 5.89e-07 5.3e-07 4.6e-07 6.6e-07 2.79e-07 4.92e-07 8.36e-09 2.87e-07 3.4e-06 6.27e-07 5.77e-09 8.24e-08 8.9e-08 8.46e-08 1.91e-09 4.59e-08