logo

Genes within 1Mb (chr6:138095451:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 4.11e-01 -0.128 0.155 0.06 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 7.66e-01 0.045 0.151 0.06 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0173 0.118 0.06 B L1
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 4.55e-02 -0.235 0.117 0.06 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0594 0.0951 0.06 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 2.94e-02 -0.289 0.132 0.06 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 9.51e-01 0.00486 0.0783 0.06 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 4.91e-01 -0.103 0.15 0.06 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 8.28e-01 0.0378 0.174 0.06 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00764 0.102 0.06 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 7.66e-01 0.0349 0.117 0.06 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 5.25e-01 0.0701 0.11 0.06 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 8.16e-01 0.024 0.103 0.06 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00721 0.114 0.06 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0361 0.0837 0.06 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 4.16e-01 -0.106 0.13 0.06 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0692 0.19 0.06 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 6.47e-01 0.0532 0.116 0.06 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 9.09e-01 0.0143 0.124 0.06 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 3.41e-01 -0.121 0.126 0.06 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00487 0.0977 0.06 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 2.24e-01 -0.155 0.127 0.06 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 2.05e-01 -0.092 0.0724 0.06 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0184 0.143 0.06 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 1.44e-01 0.29 0.198 0.061 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 3.03e-02 -0.318 0.146 0.061 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 3.51e-01 0.13 0.139 0.061 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 6.12e-01 0.0799 0.158 0.061 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -597120 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0579 0.182 0.061 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 1.91e-01 -0.211 0.161 0.061 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 2.43e-02 0.354 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -597097 sc-eQTL 5.83e-02 -0.36 0.189 0.061 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 7.54e-01 0.0504 0.161 0.061 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0272 0.137 0.06 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 7.26e-01 0.041 0.117 0.06 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0465 0.0947 0.06 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 5.59e-01 0.0579 0.0989 0.06 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -597120 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00288 0.179 0.06 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0712 0.105 0.06 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 8.95e-01 -0.018 0.136 0.06 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -597097 sc-eQTL 7.93e-02 -0.326 0.185 0.06 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 5.95e-01 0.0653 0.123 0.06 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 2.96e-01 0.178 0.17 0.06 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 3.50e-01 -0.122 0.131 0.06 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 7.36e-01 0.0507 0.15 0.06 NK L1
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0493 0.127 0.06 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0108 0.109 0.06 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 1.35e-01 0.209 0.14 0.06 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 1.00e-01 -0.168 0.102 0.06 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 2.67e-01 -0.172 0.154 0.06 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 7.09e-02 0.365 0.201 0.06 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0242 0.123 0.06 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 9.57e-01 0.00706 0.131 0.06 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0279 0.161 0.06 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0243 0.0768 0.06 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 1.24e-01 -0.243 0.157 0.06 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 7.45e-01 0.0336 0.103 0.06 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0486 0.152 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 4.58e-01 -0.163 0.219 0.064 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 3.68e-01 -0.177 0.196 0.064 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 5.84e-01 0.105 0.192 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0695 0.0998 0.064 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0595 0.194 0.064 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 2.85e-01 -0.234 0.218 0.064 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 5.90e-02 0.373 0.196 0.064 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 2.82e-01 -0.182 0.169 0.064 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 2.40e-01 -0.227 0.193 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 2.66e-01 0.199 0.178 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 9.71e-02 -0.222 0.133 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 4.31e-01 -0.134 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 7.95e-02 0.234 0.133 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 9.80e-01 0.0046 0.181 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 9.18e-01 0.0159 0.154 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 4.13e-01 -0.155 0.189 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0311 0.198 0.06 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 5.48e-02 0.374 0.194 0.06 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 8.91e-01 0.0205 0.149 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 8.78e-01 0.0286 0.186 0.06 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 5.43e-01 0.0779 0.128 0.06 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0592 0.186 0.06 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0382 0.147 0.06 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 4.13e-01 0.156 0.19 0.06 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 3.18e-01 -0.187 0.187 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 5.07e-01 -0.103 0.155 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000269 0.132 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 4.53e-01 -0.134 0.178 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00309 0.104 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 2.04e-02 -0.349 0.149 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 2.24e-01 0.128 0.105 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0707 0.162 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 4.95e-01 -0.127 0.186 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 1.17e-01 0.3 0.19 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0367 0.127 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 4.22e-01 0.123 0.152 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 3.93e-01 0.13 0.152 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 1.18e-01 -0.26 0.166 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 7.08e-02 0.221 0.122 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0999 0.197 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 4.81e-01 -0.134 0.19 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 2.38e-01 -0.21 0.177 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 3.98e-01 0.139 0.164 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 5.44e-01 0.121 0.2 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 7.97e-01 0.0301 0.117 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 1.24e-01 0.286 0.185 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 2.61e-01 -0.191 0.169 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 2.60e-02 -0.403 0.179 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 2.88e-01 0.194 0.182 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 1.82e-01 -0.129 0.0961 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 7.29e-01 0.0395 0.114 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 4.81e-01 -0.106 0.15 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 8.68e-01 0.0175 0.105 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 7.13e-01 0.0463 0.126 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0697 0.0846 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 4.09e-01 -0.113 0.136 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 9.04e-01 0.022 0.181 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 5.11e-01 0.0896 0.136 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0201 0.135 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0181 0.169 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 9.11e-01 0.0109 0.0981 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 5.36e-01 -0.085 0.137 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0364 0.106 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0624 0.137 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0128 0.203 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 5.93e-02 0.289 0.152 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 7.41e-01 0.0457 0.138 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 9.73e-01 0.00553 0.161 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 5.24e-01 0.0651 0.102 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 1.80e-01 -0.23 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0316 0.123 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0867 0.163 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 5.30e-01 -0.133 0.212 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00852 0.143 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0267 0.152 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 3.69e-01 -0.17 0.189 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0424 0.12 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0442 0.165 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 2.25e-01 -0.162 0.133 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 8.63e-01 0.0293 0.169 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 1.44e-01 0.294 0.201 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0536 0.141 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 7.44e-02 0.229 0.128 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 2.09e-01 -0.195 0.154 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 6.41e-01 0.0514 0.11 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0256 0.156 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00802 0.0819 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 5.32e-01 0.102 0.163 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 6.73e-01 0.0944 0.223 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 2.37e-01 0.218 0.184 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 8.63e-01 0.0272 0.157 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0028 0.207 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 6.88e-01 0.0401 0.0998 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 1.28e-01 0.258 0.169 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 6.25e-01 0.0827 0.169 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 1.74e-01 -0.248 0.182 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 1.44e-01 -0.287 0.196 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 2.40e-01 -0.2 0.17 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 1.42e-01 0.262 0.178 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 5.91e-01 0.11 0.204 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 4.15e-01 -0.103 0.125 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 1.74e-01 -0.26 0.191 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0118 0.148 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0795 0.186 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 5.56e-01 0.131 0.223 0.061 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 1.20e-01 -0.225 0.144 0.061 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0483 0.155 0.061 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 4.82e-01 0.144 0.205 0.061 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0369 0.0974 0.061 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 3.97e-02 -0.374 0.181 0.061 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 1.77e-01 -0.181 0.134 0.061 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 3.48e-01 -0.169 0.18 0.061 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 3.66e-01 0.181 0.2 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 9.12e-01 0.0172 0.156 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 4.82e-01 -0.12 0.17 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0558 0.182 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 1.86e-01 -0.153 0.116 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 3.36e-01 0.163 0.169 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 2.80e-01 0.168 0.155 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 8.94e-01 0.0246 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 4.10e-01 0.152 0.185 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 3.75e-01 -0.108 0.121 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 3.21e-01 0.163 0.164 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 3.34e-01 -0.142 0.147 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 6.16e-01 0.0574 0.114 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 3.02e-01 0.155 0.15 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 7.54e-02 -0.181 0.101 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 4.37e-01 -0.133 0.171 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 5.57e-01 0.124 0.21 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 2.79e-01 -0.168 0.154 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 4.03e-01 0.15 0.179 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 8.91e-01 0.0218 0.159 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0394 0.123 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 3.07e-01 0.198 0.194 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00668 0.16 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 7.52e-01 0.0624 0.197 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 8.36e-01 0.0389 0.188 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 2.30e-01 -0.152 0.126 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0704 0.162 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 7.01e-01 0.058 0.151 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0407 0.113 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 1.26e-01 0.255 0.166 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0379 0.108 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 2.12e-01 -0.213 0.17 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 7.64e-01 0.068 0.226 0.067 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 4.54e-02 0.475 0.235 0.067 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 9.52e-01 0.0121 0.201 0.067 PB L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 8.02e-01 0.0384 0.153 0.067 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 9.22e-02 -0.311 0.183 0.067 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00365 0.219 0.067 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0023 0.153 0.067 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 4.14e-01 -0.182 0.222 0.067 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 6.90e-01 0.0824 0.206 0.061 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 1.95e-01 0.204 0.157 0.061 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 4.28e-01 0.13 0.164 0.061 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 1.44e-01 -0.222 0.151 0.061 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00377 0.0958 0.061 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0366 0.191 0.061 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0422 0.123 0.061 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0114 0.186 0.061 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 6.02e-01 0.102 0.195 0.06 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 2.06e-01 0.232 0.183 0.06 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 5.23e-01 -0.085 0.133 0.06 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 6.85e-02 0.381 0.208 0.06 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 1.77e-01 0.157 0.116 0.06 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 7.28e-01 0.0583 0.167 0.06 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0112 0.143 0.06 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0822 0.178 0.06 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 3.89e-01 -0.172 0.199 0.061 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 3.82e-01 -0.142 0.162 0.061 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0772 0.143 0.061 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 2.50e-01 0.184 0.16 0.061 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -597120 sc-eQTL 4.12e-01 -0.152 0.185 0.061 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 3.67e-01 -0.193 0.214 0.061 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 1.39e-01 0.259 0.174 0.061 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -597097 sc-eQTL 6.90e-02 -0.371 0.203 0.061 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0234 0.209 0.061 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0195 0.148 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00499 0.108 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0379 0.106 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0554 0.116 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -597120 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0213 0.178 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000325 0.159 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0623 0.134 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -597097 sc-eQTL 9.44e-01 0.0131 0.186 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0664 0.124 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 2.98e-01 -0.178 0.17 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 3.75e-01 0.112 0.125 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 9.59e-01 0.00606 0.117 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0404 0.112 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -597120 sc-eQTL 4.84e-01 -0.128 0.183 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 5.29e-01 0.109 0.173 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 9.22e-01 0.0147 0.151 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -597097 sc-eQTL 8.89e-03 -0.521 0.197 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 8.38e-01 0.0327 0.16 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 5.41e-03 0.549 0.195 0.062 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 5.59e-01 0.0783 0.134 0.062 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 1.36e-01 -0.199 0.133 0.062 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 2.33e-01 0.138 0.115 0.062 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -597120 sc-eQTL 1.28e-01 0.274 0.179 0.062 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0589 0.186 0.062 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0512 0.17 0.062 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -597097 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0631 0.202 0.062 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 2.80e-02 0.377 0.17 0.062 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 2.61e-01 0.214 0.19 0.061 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 4.22e-01 0.13 0.162 0.061 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 4.71e-01 0.0818 0.113 0.061 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 5.86e-01 0.0781 0.143 0.061 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -597120 sc-eQTL 1.51e-01 -0.262 0.182 0.061 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0859 0.138 0.061 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0533 0.166 0.061 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -597097 sc-eQTL 5.54e-01 -0.12 0.203 0.061 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 4.09e-01 0.148 0.179 0.061 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 5.00e-01 0.158 0.234 0.054 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 7.85e-02 -0.348 0.197 0.054 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 5.44e-01 0.111 0.182 0.054 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0569 0.184 0.054 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -597120 sc-eQTL 7.37e-01 0.061 0.181 0.054 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 5.19e-01 -0.119 0.183 0.054 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 1.48e-01 0.289 0.199 0.054 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -597097 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0721 0.182 0.054 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 4.92e-01 0.129 0.187 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 4.91e-01 -0.128 0.186 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 2.79e-01 0.172 0.158 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0939 0.128 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 7.76e-01 0.0483 0.169 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 4.12e-01 0.0917 0.112 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0522 0.171 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 7.86e-01 0.0322 0.119 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 5.92e-01 -0.101 0.189 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 1.79e-01 -0.235 0.174 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0561 0.164 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0332 0.121 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0467 0.178 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0456 0.0937 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 3.99e-03 -0.399 0.137 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 2.72e-01 0.108 0.0977 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0674 0.167 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 2.65e-01 -0.153 0.137 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 6.38e-01 0.0514 0.109 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 5.50e-01 -0.061 0.102 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0211 0.101 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -597120 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0715 0.18 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00823 0.148 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000325 0.131 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -597097 sc-eQTL 1.60e-01 -0.271 0.192 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0246 0.121 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 2.85e-02 0.409 0.185 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 3.11e-01 0.133 0.131 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 9.39e-01 0.00772 0.1 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 4.85e-01 0.0856 0.122 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -597120 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0613 0.178 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00642 0.111 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0722 0.162 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -597097 sc-eQTL 3.70e-01 -0.177 0.196 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 1.05e-01 0.266 0.163 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 sc-eQTL 1.90e-01 0.233 0.177 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 876002 sc-eQTL 3.15e-01 -0.125 0.124 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 sc-eQTL 7.33e-01 0.0526 0.154 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -11968 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0554 0.13 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 228237 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00183 0.113 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -892810 sc-eQTL 1.85e-01 0.196 0.147 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -933294 sc-eQTL 9.80e-02 -0.158 0.0949 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 227218 sc-eQTL 2.50e-01 -0.182 0.158 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -678058 eQTL 0.0469 0.0476 0.0239 0.0 0.0 0.115
ENSG00000051620 HEBP2 -308080 eQTL 0.0274 0.0648 0.0293 0.0 0.0 0.115
ENSG00000279968 GVQW2 -678201 eQTL 0.00624 0.184 0.067 0.0 0.0 0.115

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina