logo

Genes within 1Mb (chr6:138089211:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0919 0.132 0.073 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 6.64e-01 0.0558 0.128 0.073 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 8.71e-02 0.172 0.0998 0.073 B L1
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 1.42e-01 -0.147 0.0998 0.073 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 3.05e-01 0.083 0.0806 0.073 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 1.73e-01 0.154 0.113 0.073 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 1.74e-01 0.0902 0.0662 0.073 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 8.90e-01 0.0176 0.127 0.073 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 3.95e-01 -0.125 0.147 0.073 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 4.27e-02 -0.174 0.0852 0.073 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 5.36e-01 0.0611 0.0986 0.073 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0206 0.0931 0.073 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 5.68e-01 0.0498 0.0871 0.073 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0251 0.0964 0.073 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 4.21e-01 0.057 0.0706 0.073 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0624 0.11 0.073 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 7.90e-01 0.0426 0.159 0.073 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0256 0.0975 0.073 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 2.93e-01 0.11 0.104 0.073 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 5.61e-01 0.0619 0.106 0.073 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 5.66e-01 0.0472 0.082 0.073 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 7.88e-01 0.0289 0.107 0.073 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 3.10e-01 0.062 0.0609 0.073 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 2.95e-01 -0.126 0.12 0.073 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 1.51e-01 0.233 0.162 0.065 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 6.66e-01 0.0521 0.121 0.065 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0629 0.114 0.065 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00675 0.129 0.065 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -603360 sc-eQTL 7.81e-01 0.0414 0.149 0.065 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0381 0.132 0.065 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 8.21e-01 0.0293 0.129 0.065 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -603337 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0288 0.156 0.065 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 7.55e-02 -0.233 0.13 0.065 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 7.50e-01 0.0365 0.114 0.073 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 3.48e-01 0.0915 0.0973 0.073 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0212 0.0791 0.073 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0507 0.0827 0.073 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -603360 sc-eQTL 7.94e-02 0.262 0.148 0.073 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 4.28e-03 -0.248 0.0859 0.073 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 1.49e-01 0.164 0.113 0.073 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -603337 sc-eQTL 2.81e-01 0.168 0.155 0.073 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 7.86e-01 0.0278 0.103 0.073 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0844 0.139 0.073 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0992 0.107 0.073 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 2.71e-01 0.135 0.122 0.073 NK L1
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 8.57e-01 0.0188 0.104 0.073 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 7.57e-02 0.158 0.0886 0.073 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0744 0.115 0.073 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 9.67e-01 0.00349 0.0837 0.073 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 9.30e-01 0.0111 0.126 0.073 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 4.45e-01 0.126 0.165 0.073 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 3.93e-01 0.0858 0.1 0.073 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 2.95e-01 0.112 0.106 0.073 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0503 0.131 0.073 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 4.47e-01 0.0475 0.0624 0.073 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 1.25e-01 -0.197 0.128 0.073 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0564 0.084 0.073 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 7.66e-01 -0.037 0.124 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 6.17e-01 0.1 0.2 0.066 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 9.47e-01 0.0119 0.179 0.066 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 2.06e-01 0.222 0.175 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0894 0.0909 0.066 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 8.82e-01 0.0264 0.177 0.066 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 3.54e-01 -0.185 0.199 0.066 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 3.45e-01 0.171 0.18 0.066 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 2.50e-01 0.178 0.154 0.066 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 3.27e-01 0.166 0.168 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 7.58e-01 0.0482 0.156 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 1.45e-01 0.17 0.116 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 3.10e-01 0.151 0.149 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00479 0.117 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 6.70e-01 0.0673 0.158 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 1.85e-01 -0.178 0.134 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 8.14e-01 0.0391 0.166 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 5.19e-01 -0.107 0.166 0.071 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 8.62e-01 0.0285 0.164 0.071 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 2.56e-01 0.142 0.124 0.071 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 9.49e-01 -0.01 0.156 0.071 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0138 0.107 0.071 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 9.99e-02 0.255 0.154 0.071 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0491 0.123 0.071 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 5.70e-01 0.0905 0.159 0.071 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0556 0.155 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 9.26e-01 0.012 0.128 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 4.47e-01 0.0826 0.109 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0286 0.147 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 2.04e-01 0.109 0.0852 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 8.44e-01 0.0246 0.125 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 2.65e-01 0.0972 0.087 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0981 0.134 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 1.31e-01 -0.232 0.154 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 3.32e-01 0.154 0.159 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 2.64e-01 0.118 0.105 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 4.12e-01 -0.104 0.127 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 2.63e-01 0.142 0.126 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 6.31e-01 0.0667 0.139 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00033 0.102 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 1.19e-01 0.255 0.163 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 2.20e-01 0.191 0.156 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 1.46e-01 0.212 0.145 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 4.29e-01 0.107 0.135 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 1.55e-01 -0.233 0.163 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 9.70e-01 0.00363 0.0959 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 4.82e-01 -0.108 0.153 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 8.17e-01 0.0323 0.139 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 4.43e-01 -0.114 0.149 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 3.61e-01 -0.141 0.153 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 1.15e-01 -0.128 0.0808 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 5.91e-01 0.0515 0.0958 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0876 0.127 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0106 0.0889 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0354 0.106 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 4.05e-01 0.0595 0.0713 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 8.44e-01 0.0227 0.115 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0627 0.153 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 6.81e-02 -0.209 0.114 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 6.00e-01 0.0597 0.113 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 7.05e-02 0.257 0.141 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 6.21e-01 0.041 0.0827 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 4.20e-01 0.0933 0.116 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 4.00e-01 0.075 0.0888 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0156 0.116 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 4.92e-01 0.116 0.169 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0105 0.128 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 4.04e-01 0.0964 0.115 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 1.98e-01 0.173 0.134 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 8.82e-01 0.0127 0.0852 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 3.96e-01 -0.122 0.143 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 2.43e-02 0.229 0.101 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 1.88e-01 -0.18 0.136 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 9.52e-02 0.286 0.17 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 7.91e-01 0.0306 0.116 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 8.73e-01 0.0196 0.123 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0229 0.153 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 4.59e-01 0.0721 0.0971 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 3.72e-01 0.119 0.133 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 7.42e-01 0.0356 0.108 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 8.99e-01 0.0173 0.137 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 7.04e-01 0.063 0.166 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0735 0.115 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 1.02e-01 0.173 0.105 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 2.94e-02 0.276 0.126 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 6.95e-01 0.0355 0.0903 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 4.99e-01 0.0868 0.128 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 4.95e-01 0.0459 0.0672 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 2.58e-01 -0.151 0.133 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 2.30e-01 -0.219 0.182 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 2.85e-01 -0.161 0.15 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 9.94e-01 0.000917 0.128 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 2.73e-01 0.186 0.169 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 7.46e-01 0.0265 0.0816 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 4.24e-01 -0.111 0.139 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0883 0.138 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 2.05e-01 -0.189 0.149 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 5.01e-01 -0.114 0.169 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 1.83e-01 0.195 0.146 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0122 0.154 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00814 0.176 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0715 0.108 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0837 0.165 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 5.45e-01 0.0771 0.127 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 3.10e-01 -0.163 0.16 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 3.14e-01 0.181 0.179 0.071 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 3.62e-01 0.106 0.116 0.071 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 2.45e-01 0.145 0.124 0.071 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0201 0.165 0.071 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 3.36e-01 0.0755 0.0782 0.071 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 1.69e-01 -0.202 0.146 0.071 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 9.26e-01 0.0101 0.108 0.071 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 7.13e-01 0.0534 0.145 0.071 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0452 0.163 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 3.80e-01 -0.112 0.127 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 3.21e-01 0.138 0.139 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0861 0.149 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 3.68e-01 0.0854 0.0947 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 3.54e-02 -0.289 0.137 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 8.63e-01 0.0219 0.127 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 4.49e-01 -0.115 0.151 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0227 0.152 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000752 0.0996 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 2.77e-01 0.146 0.134 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0771 0.12 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 1.56e-01 0.133 0.0933 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 9.60e-01 0.00628 0.124 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 6.65e-01 0.0363 0.0836 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 6.31e-01 0.0675 0.14 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0825 0.173 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0575 0.127 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0218 0.148 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0977 0.131 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 6.24e-02 0.188 0.1 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 4.49e-01 -0.121 0.16 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 2.40e-01 -0.155 0.131 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 2.54e-01 0.186 0.162 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0326 0.154 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0603 0.104 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0397 0.133 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 7.62e-01 0.0377 0.124 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 4.62e-02 0.185 0.0921 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 3.96e-01 -0.117 0.137 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0746 0.0883 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 9.96e-01 0.000647 0.14 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 5.01e-01 0.151 0.223 0.056 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 1.66e-01 -0.327 0.235 0.056 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 8.73e-01 0.0318 0.199 0.056 PB L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0969 0.151 0.056 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 5.13e-01 0.121 0.184 0.056 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 5.32e-01 -0.135 0.216 0.056 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0658 0.151 0.056 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 1.05e-01 -0.357 0.218 0.056 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 9.34e-01 0.0141 0.169 0.074 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00135 0.129 0.074 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 3.38e-01 -0.129 0.134 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0533 0.124 0.074 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0674 0.0784 0.074 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 2.01e-01 -0.2 0.156 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00283 0.101 0.074 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 2.57e-01 0.173 0.152 0.074 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 3.38e-01 0.158 0.165 0.073 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0786 0.155 0.073 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 5.63e-01 0.0652 0.113 0.073 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0307 0.177 0.073 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 3.01e-01 0.102 0.0985 0.073 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 2.58e-01 -0.161 0.141 0.073 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 8.40e-01 0.0245 0.121 0.073 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0881 0.151 0.073 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 1.45e-01 0.235 0.16 0.071 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0152 0.131 0.071 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0543 0.116 0.071 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 8.17e-01 0.0301 0.129 0.071 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -603360 sc-eQTL 1.67e-01 0.207 0.149 0.071 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 6.23e-01 0.0852 0.173 0.071 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 4.04e-01 -0.118 0.141 0.071 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -603337 sc-eQTL 8.63e-01 0.0286 0.166 0.071 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 6.61e-02 -0.309 0.167 0.071 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 4.21e-01 0.102 0.127 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00808 0.0925 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 6.90e-01 0.0364 0.0912 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0524 0.0996 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -603360 sc-eQTL 2.30e-03 0.461 0.149 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 4.30e-03 -0.386 0.134 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 5.24e-01 0.0731 0.115 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -603337 sc-eQTL 8.28e-01 0.0348 0.16 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 7.40e-01 0.0353 0.106 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 6.49e-01 0.0669 0.147 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 8.35e-02 0.186 0.107 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0199 0.1 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 5.56e-01 0.0565 0.0957 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -603360 sc-eQTL 6.78e-02 0.286 0.156 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 4.24e-01 -0.119 0.149 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 9.18e-02 0.218 0.128 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -603337 sc-eQTL 1.89e-02 0.402 0.17 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 7.27e-01 0.048 0.138 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0938 0.176 0.082 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 4.49e-01 0.107 0.141 0.082 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 9.01e-01 -0.021 0.168 0.082 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 4.24e-01 0.125 0.156 0.082 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 2.71e-01 0.0955 0.0865 0.082 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0384 0.173 0.082 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 2.19e-01 -0.16 0.13 0.082 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 3.66e-01 0.142 0.157 0.082 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 6.31e-01 0.0803 0.167 0.071 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00663 0.112 0.071 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 5.96e-01 0.0595 0.112 0.071 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0944 0.0969 0.071 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -603360 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0411 0.151 0.071 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 3.37e-01 -0.15 0.156 0.071 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 4.40e-01 0.11 0.142 0.071 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -603337 sc-eQTL 9.72e-01 0.00593 0.17 0.071 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 5.11e-01 0.0952 0.145 0.071 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 5.45e-01 0.093 0.154 0.072 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 5.45e-01 0.0793 0.131 0.072 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 8.92e-01 0.0125 0.0917 0.072 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0873 0.116 0.072 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -603360 sc-eQTL 4.50e-01 -0.112 0.147 0.072 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0686 0.111 0.072 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0918 0.134 0.072 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -603337 sc-eQTL 7.07e-01 0.0618 0.164 0.072 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 3.90e-01 -0.125 0.145 0.072 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 9.56e-01 0.00982 0.179 0.071 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 7.94e-01 0.0398 0.152 0.071 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 9.47e-01 0.00932 0.139 0.071 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 8.18e-01 0.0325 0.141 0.071 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -603360 sc-eQTL 2.08e-01 -0.175 0.138 0.071 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 1.63e-01 -0.196 0.14 0.071 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 2.31e-01 0.184 0.153 0.071 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -603337 sc-eQTL 2.43e-01 -0.163 0.139 0.071 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0978 0.143 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0641 0.158 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 8.22e-01 0.0304 0.135 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 5.56e-02 0.209 0.108 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 5.65e-01 0.0829 0.144 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 4.79e-01 0.0674 0.095 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 3.26e-01 0.143 0.145 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0488 0.101 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 3.54e-01 0.149 0.16 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 3.93e-01 -0.124 0.145 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 7.66e-01 0.0404 0.135 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 3.44e-01 0.0949 0.1 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0545 0.147 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 3.20e-01 0.0771 0.0773 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 7.52e-01 0.0366 0.115 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 4.90e-01 0.0559 0.0808 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0273 0.138 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 4.68e-01 0.0857 0.118 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 5.96e-01 0.0499 0.0939 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 5.36e-01 0.0545 0.0878 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0304 0.0868 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -603360 sc-eQTL 1.19e-03 0.496 0.151 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 5.29e-03 -0.352 0.125 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 2.87e-01 0.12 0.113 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -603337 sc-eQTL 2.31e-01 0.199 0.165 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 6.93e-01 0.0411 0.104 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 4.85e-01 0.108 0.154 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 5.58e-01 0.0634 0.108 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0092 0.0825 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0871 0.101 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -603360 sc-eQTL 2.11e-01 -0.183 0.146 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 1.42e-01 -0.134 0.0908 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 8.62e-01 0.0232 0.134 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -603337 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0108 0.162 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0689 0.135 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -684298 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0471 0.145 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 869762 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0441 0.102 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 sc-eQTL 4.55e-01 0.0942 0.126 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -18208 sc-eQTL 9.12e-01 0.0118 0.106 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 221997 sc-eQTL 5.85e-02 0.175 0.0918 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -899050 sc-eQTL 8.62e-01 -0.021 0.121 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -939534 sc-eQTL 8.56e-01 0.0142 0.0781 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 220978 sc-eQTL 6.03e-01 0.0675 0.129 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 eQTL 0.00327 -0.111 0.0376 0.0 0.0 0.0736

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -314320 1.29e-06 1.48e-06 2.73e-07 1.27e-06 3.67e-07 5.83e-07 1.51e-06 3.97e-07 1.51e-06 6.65e-07 1.86e-06 7.63e-07 2.75e-06 3.1e-07 3.86e-07 9.16e-07 9.8e-07 9.05e-07 8.2e-07 4.92e-07 6.13e-07 1.8e-06 1.03e-06 6.21e-07 2.39e-06 3.47e-07 1.04e-06 7.45e-07 1.62e-06 1.3e-06 8.35e-07 2.06e-07 1.72e-07 5.91e-07 8.23e-07 6.84e-07 7.25e-07 2.21e-07 5.97e-07 3.55e-07 2.78e-07 2.77e-06 2.9e-07 1.06e-07 2.88e-07 2.95e-07 1.77e-07 2.22e-07 2.14e-07
ENSG00000135540 \N -603360 4.21e-07 3.77e-07 1.04e-07 4.31e-07 1.07e-07 1.32e-07 4.09e-07 8.11e-08 2.66e-07 2.06e-07 6.88e-07 2.11e-07 7.93e-07 1.01e-07 2.26e-07 1.26e-07 1.38e-07 3.12e-07 1.55e-07 1.32e-07 1.33e-07 2.48e-07 2.63e-07 3.67e-08 5.15e-07 1.56e-07 2.24e-07 1.85e-07 2.03e-07 3.71e-07 2.55e-07 5.3e-08 3.65e-08 1.38e-07 3.05e-07 1.58e-07 9.77e-08 5.25e-08 6.49e-08 8.22e-09 2.87e-08 6.19e-07 1.96e-08 2.07e-08 8.59e-08 1.5e-08 8.74e-08 2.25e-08 5.93e-08