logo

Genes within 1Mb (chr6:138082911:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0199 0.0908 0.199 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0553 0.0883 0.199 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0516 0.0692 0.199 B L1
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0902 0.0689 0.199 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0364 0.0557 0.199 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 2.18e-02 -0.178 0.0771 0.199 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0608 0.0456 0.199 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0494 0.0876 0.199 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 8.95e-01 0.0134 0.101 0.199 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 6.93e-01 0.0234 0.0592 0.199 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 5.38e-01 0.0418 0.0679 0.199 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 7.39e-02 -0.114 0.0635 0.199 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 9.50e-01 0.00376 0.06 0.199 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0766 0.0661 0.199 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0178 0.0486 0.199 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 4.12e-01 0.062 0.0754 0.199 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0644 0.112 0.199 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 1.72e-01 0.0935 0.0683 0.199 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 5.88e-01 0.0398 0.0734 0.199 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0201 0.0748 0.199 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 5.38e-01 0.0356 0.0577 0.199 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0848 0.0753 0.199 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 6.51e-01 0.0195 0.043 0.199 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 8.68e-01 0.0141 0.0848 0.199 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0342 0.113 0.194 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0784 0.084 0.194 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 4.27e-01 0.0634 0.0796 0.194 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 8.97e-01 0.0117 0.0899 0.194 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -609660 sc-eQTL 1.93e-01 -0.135 0.104 0.194 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 3.62e-02 -0.192 0.0909 0.194 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 6.94e-03 0.241 0.0884 0.194 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -609637 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0107 0.109 0.194 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 5.95e-01 0.0488 0.0916 0.194 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 6.52e-01 0.0364 0.0806 0.199 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 5.70e-01 0.0391 0.0687 0.199 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 6.70e-01 0.0238 0.0558 0.199 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 5.45e-02 0.112 0.0578 0.199 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -609660 sc-eQTL 3.17e-01 0.105 0.105 0.199 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00288 0.0617 0.199 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 3.52e-01 0.0747 0.0801 0.199 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -609637 sc-eQTL 9.93e-01 0.000915 0.11 0.199 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 2.00e-01 0.0926 0.072 0.199 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 7.17e-01 0.0356 0.098 0.197 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0242 0.0754 0.197 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 8.81e-01 0.0129 0.0864 0.197 NK L1
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0639 0.0732 0.197 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00919 0.0628 0.197 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 1.81e-01 0.108 0.0804 0.197 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 3.99e-01 0.0497 0.0588 0.197 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0685 0.0888 0.197 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 3.47e-01 0.11 0.117 0.199 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0439 0.0715 0.199 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 8.00e-01 0.0192 0.0758 0.199 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 9.06e-01 0.0111 0.0936 0.199 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 1.75e-01 0.0603 0.0443 0.199 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 9.85e-01 0.00173 0.0914 0.199 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 6.68e-01 0.0257 0.0599 0.199 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0208 0.0884 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 6.82e-01 -0.055 0.134 0.202 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 1.71e-02 -0.283 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 2.23e-01 -0.143 0.117 0.202 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0701 0.0607 0.202 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 2.09e-01 -0.148 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 2.47e-01 -0.154 0.133 0.202 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 3.88e-01 0.104 0.121 0.202 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 2.39e-01 -0.121 0.103 0.202 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 7.75e-01 0.0321 0.112 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 6.45e-01 0.0478 0.104 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 9.74e-01 0.0025 0.0777 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 2.96e-01 0.104 0.0987 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 9.01e-01 0.00965 0.0776 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0307 0.105 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 8.31e-01 0.019 0.0893 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0685 0.11 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 3.09e-01 0.119 0.117 0.2 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 7.62e-01 0.0351 0.116 0.2 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0701 0.0879 0.2 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0531 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 6.82e-01 0.031 0.0755 0.2 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 6.23e-01 0.0539 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 5.98e-01 0.0458 0.0867 0.2 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 8.06e-01 0.0277 0.112 0.2 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0248 0.107 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 7.62e-01 -0.027 0.0888 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0456 0.0755 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 6.70e-01 0.0437 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000244 0.0594 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 8.88e-02 -0.147 0.0861 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 4.85e-02 -0.119 0.0601 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 7.83e-01 0.0256 0.0931 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 9.16e-01 0.0112 0.107 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 2.21e-01 -0.135 0.11 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 7.91e-01 0.0194 0.0731 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00959 0.0878 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 2.48e-01 -0.101 0.0875 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 6.46e-02 -0.177 0.0952 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 1.22e-01 -0.109 0.0702 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 9.42e-01 0.0083 0.113 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 6.36e-01 0.0513 0.108 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0775 0.101 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 3.47e-01 0.0881 0.0935 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 8.12e-01 0.0272 0.114 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 5.79e-01 -0.037 0.0666 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 8.08e-01 0.0259 0.106 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 6.16e-01 0.0486 0.0968 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 3.23e-01 -0.103 0.103 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 5.81e-01 0.0587 0.106 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0286 0.0562 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 7.45e-01 0.0216 0.0663 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0584 0.0875 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 5.16e-01 0.0399 0.0614 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0534 0.0732 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0299 0.0493 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 3.70e-01 0.0713 0.0794 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0133 0.105 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0028 0.0791 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 2.83e-01 0.0841 0.0781 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 7.13e-02 -0.177 0.0975 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00409 0.057 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0681 0.0797 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0106 0.0614 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0049 0.0799 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 7.71e-01 0.0343 0.118 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 3.31e-01 0.0867 0.0891 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0154 0.0803 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0337 0.0934 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0336 0.0593 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0554 0.0999 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0874 0.071 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 2.23e-01 0.116 0.0948 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0533 0.121 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 6.16e-01 0.0411 0.0818 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 7.83e-01 0.0239 0.0867 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0974 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 5.71e-01 0.0391 0.0688 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 9.46e-01 0.0064 0.0947 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 7.47e-01 0.0247 0.0766 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 7.62e-01 0.0293 0.0968 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 7.96e-01 0.0295 0.114 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 9.20e-01 0.00804 0.0796 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 1.28e-01 0.111 0.0725 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 2.32e-01 -0.105 0.0874 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 8.70e-01 0.0102 0.0622 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0835 0.0881 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 9.70e-01 0.00173 0.0463 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 1.43e-01 0.135 0.0916 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 1.63e-01 -0.185 0.132 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0336 0.11 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 7.29e-01 0.0324 0.0934 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 9.06e-01 0.0146 0.123 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0148 0.0595 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 5.60e-01 -0.059 0.101 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0546 0.101 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 3.57e-01 -0.1 0.109 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0713 0.116 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0945 0.101 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0314 0.106 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 8.06e-01 0.0296 0.121 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 4.48e-02 0.148 0.0735 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 3.18e-01 0.113 0.113 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 9.59e-01 0.00446 0.0873 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 9.52e-01 0.00663 0.11 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 8.81e-01 0.0189 0.126 0.197 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 1.70e-01 -0.112 0.0814 0.197 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00308 0.0874 0.197 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0623 0.116 0.197 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 1.76e-01 0.0744 0.0548 0.197 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0802 0.103 0.197 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0529 0.0757 0.197 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 7.46e-01 -0.033 0.102 0.197 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 4.25e-01 0.0918 0.115 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 8.87e-01 0.0128 0.0899 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0657 0.098 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 9.87e-01 0.00174 0.105 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0568 0.0668 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 1.13e-02 0.245 0.0958 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 9.44e-01 0.00633 0.0897 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0262 0.107 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 2.92e-01 -0.111 0.105 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0904 0.069 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 8.93e-01 0.0126 0.0936 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 1.09e-01 -0.134 0.0834 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00837 0.0652 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 9.52e-01 0.00522 0.0859 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 2.09e-01 0.073 0.058 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 8.28e-02 -0.169 0.097 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 3.98e-01 0.102 0.12 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 9.83e-01 0.00189 0.0885 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 7.63e-01 0.031 0.103 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 4.18e-01 0.0738 0.091 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 8.93e-01 0.00945 0.0701 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 1.96e-01 0.144 0.111 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 5.91e-01 0.0491 0.0913 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 1.93e-01 0.147 0.113 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 1.29e-01 0.163 0.107 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 6.84e-01 0.0296 0.0726 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 4.34e-01 0.0727 0.0927 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 6.46e-01 0.0398 0.0865 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 6.66e-01 -0.028 0.0648 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 9.06e-01 0.0113 0.0958 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 8.75e-01 0.00969 0.0617 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 8.24e-01 0.0218 0.0978 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00043 0.141 0.219 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 8.71e-03 0.386 0.145 0.219 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 1.21e-01 0.194 0.124 0.219 PB L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0838 0.0953 0.219 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 4.67e-02 -0.229 0.114 0.219 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0192 0.137 0.219 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 9.06e-01 0.0113 0.0956 0.219 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 1.13e-01 -0.22 0.138 0.219 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 8.59e-01 0.0212 0.119 0.198 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 8.11e-01 0.0217 0.091 0.198 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 1.56e-01 0.135 0.0947 0.198 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 3.75e-01 0.078 0.0878 0.198 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 1.92e-01 0.0723 0.0552 0.198 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 2.80e-01 -0.119 0.11 0.198 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0185 0.0714 0.198 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 8.05e-01 0.0266 0.108 0.198 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 6.75e-01 0.0475 0.113 0.199 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 8.99e-02 0.18 0.106 0.199 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 8.56e-01 0.0141 0.0773 0.199 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 5.65e-01 -0.07 0.122 0.199 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 2.30e-01 0.0812 0.0675 0.199 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0123 0.0973 0.199 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0519 0.0828 0.199 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0196 0.103 0.199 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0985 0.113 0.19 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 7.63e-01 -0.028 0.0925 0.19 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 6.63e-01 0.0356 0.0814 0.19 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 6.59e-01 0.0403 0.0911 0.19 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -609660 sc-eQTL 1.86e-02 -0.247 0.104 0.19 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 1.93e-02 -0.283 0.12 0.19 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 1.84e-01 0.132 0.0991 0.19 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -609637 sc-eQTL 5.66e-01 -0.067 0.117 0.19 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 9.26e-01 0.0111 0.119 0.19 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 8.94e-01 0.0117 0.088 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 2.21e-01 0.0784 0.0639 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 6.34e-01 0.0301 0.0632 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 1.99e-01 0.0885 0.0688 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -609660 sc-eQTL 8.48e-01 0.0203 0.106 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0696 0.0944 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 7.74e-01 0.0228 0.0795 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -609637 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0204 0.111 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 4.15e-01 0.0601 0.0736 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0805 0.101 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 7.48e-01 0.0239 0.0743 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 7.08e-01 0.0259 0.0692 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 1.02e-01 0.108 0.0656 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -609660 sc-eQTL 9.01e-01 0.0135 0.108 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 3.60e-01 0.0937 0.102 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 1.55e-01 0.127 0.0887 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -609637 sc-eQTL 8.03e-01 0.0297 0.119 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 7.38e-01 0.0317 0.0948 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 4.18e-01 0.115 0.142 0.179 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0327 0.114 0.179 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 7.63e-01 0.0408 0.135 0.179 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0944 0.125 0.179 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 4.34e-01 0.0547 0.0697 0.179 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 9.24e-01 0.0132 0.139 0.179 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00639 0.105 0.179 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0312 0.127 0.179 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 6.90e-03 0.319 0.117 0.198 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 3.88e-01 0.0694 0.0801 0.198 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0802 0.0798 0.198 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 4.45e-02 0.139 0.0686 0.198 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -609660 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0156 0.108 0.198 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 1.57e-01 -0.158 0.111 0.198 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 1.68e-01 0.14 0.101 0.198 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -609637 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0213 0.121 0.198 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 2.37e-01 0.122 0.103 0.198 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 1.59e-01 0.16 0.113 0.195 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 7.64e-01 0.029 0.0965 0.195 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 5.08e-01 0.0448 0.0676 0.195 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 3.95e-01 0.0727 0.0853 0.195 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -609660 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0941 0.109 0.195 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0792 0.0819 0.195 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00719 0.0989 0.195 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -609637 sc-eQTL 9.41e-01 0.00891 0.121 0.195 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 3.77e-01 0.0944 0.107 0.195 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 5.87e-01 0.0699 0.128 0.178 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 1.90e-01 -0.143 0.109 0.178 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 3.59e-01 0.0918 0.0997 0.178 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0575 0.101 0.178 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -609660 sc-eQTL 3.39e-01 0.0952 0.0993 0.178 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 8.50e-01 0.019 0.101 0.178 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 1.07e-02 0.279 0.108 0.178 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -609637 sc-eQTL 1.31e-01 0.151 0.0993 0.178 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 5.56e-01 0.0605 0.103 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00517 0.11 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 8.81e-01 -0.014 0.0936 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0455 0.0759 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 9.77e-01 0.00293 0.1 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0376 0.066 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 8.78e-01 0.0156 0.101 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 6.62e-02 0.128 0.0695 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0955 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0448 0.1 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 2.85e-01 -0.1 0.0933 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0253 0.0694 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 8.58e-01 0.0182 0.102 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0248 0.0536 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 2.61e-02 -0.177 0.0789 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 6.10e-03 -0.152 0.055 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 7.36e-01 0.0322 0.0954 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0535 0.0811 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 2.84e-01 0.0692 0.0645 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 8.75e-01 0.00955 0.0605 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 1.03e-01 0.0973 0.0594 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -609660 sc-eQTL 8.23e-01 0.0239 0.106 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 9.48e-01 0.00569 0.0876 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 3.60e-01 0.0712 0.0777 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -609637 sc-eQTL 7.26e-01 -0.04 0.114 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 5.07e-01 0.0476 0.0716 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 4.40e-02 0.223 0.11 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0187 0.0779 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 8.55e-01 0.0109 0.0594 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 1.44e-01 0.106 0.0724 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -609660 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0324 0.106 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0263 0.0657 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 5.00e-01 0.065 0.0962 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -609637 sc-eQTL 3.50e-01 0.109 0.117 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 2.11e-01 0.122 0.0972 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -690598 sc-eQTL 7.51e-01 0.0324 0.102 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0663 0.0711 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 sc-eQTL 8.91e-01 0.0122 0.0883 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -24508 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0462 0.0744 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 sc-eQTL 9.48e-01 0.00422 0.0649 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -905350 sc-eQTL 4.64e-01 0.0622 0.0848 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -945834 sc-eQTL 3.39e-01 0.0524 0.0546 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 214678 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0599 0.0907 0.196 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 863462 eQTL 0.0518 -0.0302 0.0155 0.00303 0.0 0.245
ENSG00000051620 HEBP2 -320620 eQTL 0.0473 0.0438 0.022 0.0 0.0 0.245
ENSG00000118503 TNFAIP3 215697 eQTL 0.0395 -0.0308 0.0149 0.00105 0.0 0.245
ENSG00000220412 AL356234.1 375710 eQTL 0.0448 -0.0554 0.0276 0.00117 0.0 0.245
ENSG00000225177 AL590617.2 -609637 eQTL 0.0353 -0.072 0.0341 0.0 0.0 0.245
ENSG00000237499 AL357060.1 214678 eQTL 0.0101 -0.0368 0.0143 0.00225 0.0 0.245

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina