logo

Genes within 1Mb (chr6:138066790:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 3.18e-01 -0.145 0.145 0.062 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 1.68e-01 -0.195 0.141 0.062 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 2.96e-01 0.116 0.111 0.062 B L1
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 7.88e-02 -0.195 0.11 0.062 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 6.36e-01 0.0424 0.0894 0.062 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 1.85e-01 -0.166 0.125 0.062 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 2.36e-01 0.0871 0.0733 0.062 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0496 0.141 0.062 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 5.95e-01 0.0856 0.161 0.062 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0649 0.094 0.062 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 9.94e-01 0.000856 0.108 0.062 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 1.17e-01 -0.159 0.101 0.062 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 5.08e-01 0.0632 0.0952 0.062 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0625 0.105 0.062 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 4.11e-01 0.0636 0.0772 0.062 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0148 0.12 0.062 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 4.05e-01 0.146 0.175 0.062 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0184 0.107 0.062 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 2.57e-01 0.13 0.114 0.062 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 8.71e-01 0.0191 0.117 0.062 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 3.53e-01 0.0839 0.0901 0.062 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 5.87e-01 0.0642 0.118 0.062 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 4.02e-01 0.0563 0.0671 0.062 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0448 0.132 0.062 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 6.91e-02 0.323 0.177 0.059 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 3.63e-01 -0.12 0.132 0.059 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 6.23e-01 0.0617 0.125 0.059 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 9.80e-01 0.00363 0.141 0.059 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -625781 sc-eQTL 5.20e-01 -0.105 0.163 0.059 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 1.68e-01 -0.199 0.144 0.059 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 2.37e-01 0.167 0.141 0.059 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -625758 sc-eQTL 8.18e-01 0.0394 0.171 0.059 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 3.64e-01 -0.131 0.144 0.059 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 3.93e-02 0.261 0.126 0.062 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 6.35e-01 0.0514 0.108 0.062 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 2.50e-01 -0.101 0.0876 0.062 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 7.42e-01 0.0303 0.0918 0.062 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -625781 sc-eQTL 8.43e-01 0.0329 0.166 0.062 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 5.56e-03 -0.267 0.0954 0.062 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 1.35e-01 0.189 0.126 0.062 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -625758 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0799 0.173 0.062 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 3.23e-01 0.112 0.114 0.062 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 8.70e-01 0.0254 0.156 0.062 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0739 0.12 0.062 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 1.45e-01 0.2 0.136 0.062 NK L1
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 2.45e-01 0.135 0.116 0.062 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 2.39e-01 0.117 0.0993 0.062 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 2.67e-01 -0.142 0.128 0.062 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 8.26e-01 0.0206 0.0935 0.062 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0902 0.141 0.062 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 2.15e-01 0.23 0.185 0.062 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 4.96e-01 0.077 0.113 0.062 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0118 0.12 0.062 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 9.08e-01 0.0171 0.148 0.062 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 2.05e-01 0.0893 0.0701 0.062 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 4.70e-02 -0.286 0.143 0.062 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 3.09e-01 0.0964 0.0945 0.062 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 3.36e-01 0.134 0.139 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 8.24e-01 0.0445 0.2 0.066 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 5.14e-02 -0.346 0.176 0.066 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 2.30e-02 0.395 0.172 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0764 0.0906 0.066 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0845 0.176 0.066 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0484 0.199 0.066 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 1.67e-02 0.428 0.177 0.066 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 7.22e-01 0.0549 0.154 0.066 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00309 0.181 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 3.88e-01 -0.144 0.167 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 2.84e-01 0.134 0.125 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 5.54e-01 0.0945 0.159 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0823 0.125 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 7.45e-01 -0.055 0.169 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 1.11e-01 -0.229 0.143 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0279 0.177 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0177 0.188 0.062 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 6.17e-01 -0.093 0.185 0.062 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 8.05e-01 -0.035 0.141 0.062 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 5.41e-01 -0.108 0.176 0.062 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 4.49e-01 0.0918 0.121 0.062 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 3.90e-01 0.151 0.176 0.062 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 4.00e-01 0.117 0.139 0.062 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 3.46e-01 0.17 0.18 0.062 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 2.41e-01 -0.201 0.171 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 4.78e-01 -0.1 0.141 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 2.43e-01 0.14 0.12 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 6.01e-01 0.0854 0.163 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 8.02e-02 0.165 0.0939 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0885 0.138 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 1.76e-01 0.131 0.0961 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 3.16e-01 -0.149 0.148 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0305 0.167 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 4.48e-01 0.131 0.172 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 1.66e-01 0.158 0.114 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 6.93e-01 0.0542 0.137 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 7.46e-02 0.244 0.136 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 2.29e-01 -0.181 0.149 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 4.23e-01 0.0886 0.11 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 8.65e-01 0.0302 0.177 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0503 0.173 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 9.62e-01 0.0078 0.162 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 3.07e-01 0.152 0.149 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0685 0.182 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0417 0.106 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 8.59e-01 0.0301 0.169 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 4.55e-01 -0.116 0.154 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 5.56e-01 0.0975 0.165 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 9.76e-01 0.00501 0.169 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 2.19e-01 -0.11 0.0888 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0607 0.105 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 5.01e-02 -0.271 0.138 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 6.62e-01 0.0427 0.0974 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 5.12e-01 0.0762 0.116 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 3.10e-01 0.0795 0.0781 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0103 0.126 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 1.90e-01 0.217 0.165 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00203 0.125 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 4.18e-01 0.0999 0.123 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 5.67e-01 0.0887 0.155 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 5.53e-01 0.0533 0.0898 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 7.03e-01 -0.048 0.126 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 8.96e-02 0.164 0.096 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 2.75e-01 0.137 0.126 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 1.63e-01 0.257 0.184 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00647 0.14 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0248 0.126 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 7.34e-01 0.0498 0.146 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 5.98e-01 -0.049 0.0929 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 7.50e-02 -0.278 0.155 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 1.94e-02 0.26 0.11 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0725 0.149 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 5.17e-02 0.366 0.187 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 3.46e-01 0.12 0.127 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 1.67e-01 0.186 0.134 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 3.67e-01 -0.152 0.168 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 8.51e-01 0.0201 0.107 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 8.39e-01 -0.03 0.147 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 7.68e-01 -0.035 0.119 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 5.60e-01 0.0877 0.15 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 1.08e-01 0.294 0.182 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0661 0.128 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 3.19e-01 0.117 0.117 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0261 0.141 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 8.19e-01 0.0229 0.1 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 1.38e-01 0.21 0.141 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 9.17e-02 0.125 0.0739 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0105 0.148 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 3.70e-01 -0.189 0.21 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 4.60e-01 0.128 0.174 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 1.12e-01 0.235 0.147 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 4.92e-02 0.383 0.194 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 5.79e-01 0.0523 0.0942 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 2.01e-01 -0.205 0.159 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 5.25e-01 -0.101 0.159 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0221 0.172 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 5.30e-01 -0.116 0.185 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0752 0.16 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 4.62e-01 0.124 0.168 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0819 0.192 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 9.00e-01 0.0148 0.118 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 8.84e-01 0.0263 0.18 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 7.34e-01 0.0472 0.139 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 1.84e-01 -0.233 0.174 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 3.02e-01 0.208 0.201 0.063 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 8.36e-01 0.0271 0.131 0.063 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 9.31e-01 0.0121 0.14 0.063 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 5.80e-01 0.102 0.185 0.063 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 1.46e-01 0.128 0.0876 0.063 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 4.83e-02 -0.325 0.164 0.063 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0602 0.121 0.063 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 5.57e-01 0.0957 0.163 0.063 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 7.51e-01 0.0575 0.181 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 5.63e-01 0.0819 0.141 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 9.67e-02 0.256 0.153 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 4.11e-01 0.136 0.165 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0351 0.105 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 2.89e-01 -0.162 0.153 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 8.68e-01 0.0234 0.141 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 2.90e-01 -0.178 0.167 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 6.74e-01 0.0706 0.167 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0608 0.11 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 7.33e-02 0.266 0.148 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0475 0.133 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 3.93e-01 0.0886 0.103 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 2.26e-01 -0.165 0.136 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 2.61e-01 0.104 0.0922 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 3.57e-01 -0.143 0.155 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 3.27e-01 -0.188 0.192 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 1.82e-01 -0.188 0.141 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 2.80e-01 0.177 0.163 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 6.15e-01 0.0733 0.145 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 5.91e-02 0.211 0.111 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 9.13e-01 0.0194 0.177 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 2.68e-01 -0.162 0.145 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0609 0.18 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 6.11e-01 0.0878 0.173 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0387 0.116 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 7.81e-01 0.0415 0.149 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 1.45e-01 0.202 0.138 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 2.19e-01 0.128 0.104 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0216 0.154 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0237 0.0989 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 5.98e-01 0.0826 0.157 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 7.39e-01 0.0809 0.243 0.056 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 4.46e-01 0.195 0.256 0.056 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 6.83e-01 0.0882 0.216 0.056 PB L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0489 0.164 0.056 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 2.97e-01 -0.208 0.198 0.056 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 3.58e-01 -0.216 0.234 0.056 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 9.94e-01 0.0012 0.164 0.056 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 3.24e-02 -0.508 0.235 0.056 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00111 0.188 0.063 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0134 0.143 0.063 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0797 0.149 0.063 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 1.26e-01 -0.211 0.137 0.063 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 9.36e-01 -0.007 0.0872 0.063 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 1.50e-01 -0.25 0.173 0.063 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0266 0.112 0.063 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 4.47e-01 0.129 0.169 0.063 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 3.73e-02 0.37 0.177 0.062 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 6.72e-01 0.0713 0.168 0.062 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 8.15e-01 0.0286 0.122 0.062 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 1.18e-01 -0.3 0.191 0.062 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 1.13e-01 0.169 0.106 0.062 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 9.38e-01 0.0119 0.154 0.062 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 2.11e-01 0.164 0.13 0.062 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 5.36e-01 -0.101 0.163 0.062 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 9.54e-02 0.301 0.18 0.063 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0999 0.147 0.063 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0599 0.13 0.063 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 4.75e-01 0.104 0.145 0.063 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625781 sc-eQTL 5.28e-01 0.107 0.168 0.063 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 3.68e-01 -0.175 0.194 0.063 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 2.41e-01 0.186 0.158 0.063 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625758 sc-eQTL 6.19e-01 0.0926 0.186 0.063 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 3.87e-01 -0.164 0.189 0.063 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 2.10e-02 0.325 0.14 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0143 0.103 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0362 0.102 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 8.51e-01 0.0209 0.111 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625781 sc-eQTL 2.51e-01 0.195 0.17 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 6.46e-02 -0.28 0.151 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 4.19e-01 0.103 0.128 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625758 sc-eQTL 1.15e-01 -0.281 0.177 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 4.45e-01 0.0906 0.118 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 5.91e-01 0.086 0.16 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 2.75e-01 0.128 0.117 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0817 0.109 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 3.82e-01 0.0913 0.104 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625781 sc-eQTL 5.39e-01 0.105 0.171 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 4.81e-01 -0.114 0.162 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 2.75e-01 0.154 0.141 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625758 sc-eQTL 2.02e-01 0.24 0.187 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 8.23e-01 0.0335 0.15 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 4.11e-01 -0.176 0.213 0.061 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 4.99e-01 0.116 0.171 0.061 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 8.48e-01 0.0391 0.204 0.061 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 7.43e-01 0.0622 0.189 0.061 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 1.72e-02 0.249 0.103 0.061 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0841 0.21 0.061 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 3.33e-01 -0.153 0.157 0.061 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 5.98e-01 0.101 0.19 0.061 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 5.56e-02 0.355 0.184 0.06 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0371 0.125 0.06 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 9.00e-01 0.0157 0.125 0.06 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 7.38e-01 0.0362 0.108 0.06 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625781 sc-eQTL 4.86e-01 0.117 0.168 0.06 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 3.13e-01 -0.175 0.174 0.06 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 7.86e-01 0.0431 0.159 0.06 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625758 sc-eQTL 3.73e-01 0.168 0.188 0.06 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 3.67e-02 0.335 0.159 0.06 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 8.67e-02 0.29 0.169 0.063 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 8.57e-01 0.0261 0.145 0.063 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 5.96e-01 0.0537 0.101 0.063 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00691 0.128 0.063 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625781 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0967 0.163 0.063 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 1.23e-01 -0.189 0.122 0.063 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0272 0.148 0.063 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625758 sc-eQTL 5.74e-01 -0.102 0.181 0.063 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 7.89e-01 0.0429 0.16 0.063 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 3.73e-01 0.179 0.2 0.059 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 4.61e-01 0.126 0.17 0.059 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 4.64e-01 0.114 0.156 0.059 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 5.70e-01 0.0899 0.158 0.059 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625781 sc-eQTL 1.13e-01 -0.246 0.154 0.059 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 6.37e-02 -0.291 0.156 0.059 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 3.01e-01 0.178 0.172 0.059 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625758 sc-eQTL 8.67e-01 0.0262 0.156 0.059 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 8.48e-01 0.0309 0.16 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 7.72e-01 -0.051 0.176 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 1.57e-01 -0.212 0.149 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 5.14e-01 0.0794 0.121 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 9.12e-01 0.0177 0.16 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 6.00e-01 0.0555 0.106 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0145 0.162 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 3.72e-01 0.1 0.112 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 8.77e-01 0.0278 0.179 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 4.82e-01 -0.112 0.158 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0692 0.148 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 2.20e-01 0.135 0.11 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 4.55e-01 0.121 0.161 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 1.19e-01 0.132 0.0844 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 2.41e-01 -0.148 0.126 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 2.32e-01 0.106 0.0884 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0881 0.151 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 6.75e-02 0.234 0.127 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 5.50e-01 0.0611 0.102 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0732 0.0956 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 8.02e-01 0.0238 0.0946 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -625781 sc-eQTL 4.12e-01 0.138 0.168 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 1.80e-02 -0.326 0.137 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 3.30e-01 0.12 0.123 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -625758 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0263 0.181 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 5.14e-01 0.0741 0.113 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 1.10e-02 0.435 0.169 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 7.00e-01 0.0465 0.12 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 8.25e-01 0.0204 0.0919 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 7.37e-01 0.0379 0.113 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -625781 sc-eQTL 4.09e-01 -0.135 0.163 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 6.91e-02 -0.184 0.101 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 4.41e-01 0.115 0.149 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -625758 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00711 0.181 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 1.66e-01 0.209 0.15 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -706719 sc-eQTL 7.23e-01 0.0574 0.161 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 847341 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0713 0.113 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -336741 sc-eQTL 2.68e-01 0.155 0.14 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -40629 sc-eQTL 3.47e-01 0.111 0.118 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 199576 sc-eQTL 1.81e-01 0.137 0.102 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -921471 sc-eQTL 3.20e-01 -0.134 0.134 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -961955 sc-eQTL 5.02e-01 0.0583 0.0868 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 198557 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0586 0.144 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000279968 GVQW2 -706862 eQTL 0.0111 0.207 0.0811 0.0025 0.0 0.0746

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 \N 847341 2.91e-07 1.35e-07 5.72e-08 1.9e-07 9.8e-08 8.45e-08 1.67e-07 5.75e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.63e-07 1.15e-07 1.69e-07 7.64e-08 5.72e-08 7.97e-08 4.18e-08 1.51e-07 6.75e-08 4.92e-08 1.25e-07 1.25e-07 1.5e-07 3.17e-08 1.65e-07 1.22e-07 1.12e-07 1.04e-07 1.24e-07 1e-07 1.08e-07 3.54e-08 3.73e-08 8.7e-08 3.52e-08 2.69e-08 5.61e-08 8.68e-08 6.43e-08 3.82e-08 5.34e-08 1.46e-07 5.39e-08 1.23e-08 3.41e-08 1.8e-08 1e-07 1.91e-09 4.8e-08
ENSG00000135540 \N -625781 4.21e-07 1.92e-07 6.99e-08 2.35e-07 1.02e-07 1.13e-07 2.86e-07 7.12e-08 2.04e-07 1.28e-07 2.18e-07 1.86e-07 3.18e-07 8.54e-08 7.79e-08 1.14e-07 6.81e-08 2.56e-07 7.76e-08 8.52e-08 1.39e-07 2.06e-07 1.89e-07 4.25e-08 2.74e-07 1.82e-07 1.37e-07 1.46e-07 1.48e-07 1.81e-07 1.39e-07 5.24e-08 4.34e-08 9.81e-08 7.55e-08 4.86e-08 6.24e-08 6.32e-08 5.8e-08 7.78e-08 5.09e-08 1.68e-07 3.46e-08 1.44e-08 5.32e-08 1.03e-08 9.1e-08 0.0 4.54e-08