logo

Genes within 1Mb (chr6:138066776:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 3.18e-01 -0.145 0.145 0.062 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 1.68e-01 -0.195 0.141 0.062 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 2.96e-01 0.116 0.111 0.062 B L1
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 7.88e-02 -0.195 0.11 0.062 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 6.36e-01 0.0424 0.0894 0.062 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 1.85e-01 -0.166 0.125 0.062 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 2.36e-01 0.0871 0.0733 0.062 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0496 0.141 0.062 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 5.95e-01 0.0856 0.161 0.062 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0649 0.094 0.062 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 9.94e-01 0.000856 0.108 0.062 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 1.17e-01 -0.159 0.101 0.062 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 5.08e-01 0.0632 0.0952 0.062 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0625 0.105 0.062 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 4.11e-01 0.0636 0.0772 0.062 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0148 0.12 0.062 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 4.05e-01 0.146 0.175 0.062 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0184 0.107 0.062 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 2.57e-01 0.13 0.114 0.062 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 8.71e-01 0.0191 0.117 0.062 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 3.53e-01 0.0839 0.0901 0.062 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 5.87e-01 0.0642 0.118 0.062 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 4.02e-01 0.0563 0.0671 0.062 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0448 0.132 0.062 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 6.91e-02 0.323 0.177 0.059 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 3.63e-01 -0.12 0.132 0.059 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 6.23e-01 0.0617 0.125 0.059 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 9.80e-01 0.00363 0.141 0.059 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -625795 sc-eQTL 5.20e-01 -0.105 0.163 0.059 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 1.68e-01 -0.199 0.144 0.059 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 2.37e-01 0.167 0.141 0.059 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -625772 sc-eQTL 8.18e-01 0.0394 0.171 0.059 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 3.64e-01 -0.131 0.144 0.059 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 3.93e-02 0.261 0.126 0.062 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 6.35e-01 0.0514 0.108 0.062 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 2.50e-01 -0.101 0.0876 0.062 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 7.42e-01 0.0303 0.0918 0.062 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -625795 sc-eQTL 8.43e-01 0.0329 0.166 0.062 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 5.56e-03 -0.267 0.0954 0.062 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 1.35e-01 0.189 0.126 0.062 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -625772 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0799 0.173 0.062 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 3.23e-01 0.112 0.114 0.062 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 8.70e-01 0.0254 0.156 0.062 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0739 0.12 0.062 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 1.45e-01 0.2 0.136 0.062 NK L1
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 2.45e-01 0.135 0.116 0.062 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 2.39e-01 0.117 0.0993 0.062 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 2.67e-01 -0.142 0.128 0.062 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 8.26e-01 0.0206 0.0935 0.062 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0902 0.141 0.062 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 2.15e-01 0.23 0.185 0.062 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 4.96e-01 0.077 0.113 0.062 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0118 0.12 0.062 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 9.08e-01 0.0171 0.148 0.062 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 2.05e-01 0.0893 0.0701 0.062 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 4.70e-02 -0.286 0.143 0.062 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 3.09e-01 0.0964 0.0945 0.062 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 3.36e-01 0.134 0.139 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 8.24e-01 0.0445 0.2 0.066 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 5.14e-02 -0.346 0.176 0.066 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 2.30e-02 0.395 0.172 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0764 0.0906 0.066 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0845 0.176 0.066 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0484 0.199 0.066 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 1.67e-02 0.428 0.177 0.066 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 7.22e-01 0.0549 0.154 0.066 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00309 0.181 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 3.88e-01 -0.144 0.167 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 2.84e-01 0.134 0.125 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 5.54e-01 0.0945 0.159 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0823 0.125 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 7.45e-01 -0.055 0.169 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 1.11e-01 -0.229 0.143 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0279 0.177 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0177 0.188 0.062 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 6.17e-01 -0.093 0.185 0.062 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 8.05e-01 -0.035 0.141 0.062 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 5.41e-01 -0.108 0.176 0.062 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 4.49e-01 0.0918 0.121 0.062 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 3.90e-01 0.151 0.176 0.062 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 4.00e-01 0.117 0.139 0.062 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 3.46e-01 0.17 0.18 0.062 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 2.41e-01 -0.201 0.171 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 4.78e-01 -0.1 0.141 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 2.43e-01 0.14 0.12 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 6.01e-01 0.0854 0.163 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 8.02e-02 0.165 0.0939 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0885 0.138 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 1.76e-01 0.131 0.0961 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 3.16e-01 -0.149 0.148 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0305 0.167 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 4.48e-01 0.131 0.172 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 1.66e-01 0.158 0.114 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 6.93e-01 0.0542 0.137 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 7.46e-02 0.244 0.136 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 2.29e-01 -0.181 0.149 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 4.23e-01 0.0886 0.11 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 8.65e-01 0.0302 0.177 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0503 0.173 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 9.62e-01 0.0078 0.162 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 3.07e-01 0.152 0.149 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0685 0.182 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0417 0.106 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 8.59e-01 0.0301 0.169 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 4.55e-01 -0.116 0.154 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 5.56e-01 0.0975 0.165 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 9.76e-01 0.00501 0.169 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 2.19e-01 -0.11 0.0888 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0607 0.105 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 5.01e-02 -0.271 0.138 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 6.62e-01 0.0427 0.0974 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 5.12e-01 0.0762 0.116 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 3.10e-01 0.0795 0.0781 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0103 0.126 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 1.90e-01 0.217 0.165 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00203 0.125 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 4.18e-01 0.0999 0.123 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 5.67e-01 0.0887 0.155 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 5.53e-01 0.0533 0.0898 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 7.03e-01 -0.048 0.126 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 8.96e-02 0.164 0.096 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 2.75e-01 0.137 0.126 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 1.63e-01 0.257 0.184 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00647 0.14 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0248 0.126 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 7.34e-01 0.0498 0.146 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 5.98e-01 -0.049 0.0929 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 7.50e-02 -0.278 0.155 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 1.94e-02 0.26 0.11 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0725 0.149 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 5.17e-02 0.366 0.187 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 3.46e-01 0.12 0.127 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 1.67e-01 0.186 0.134 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 3.67e-01 -0.152 0.168 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 8.51e-01 0.0201 0.107 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 8.39e-01 -0.03 0.147 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 7.68e-01 -0.035 0.119 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 5.60e-01 0.0877 0.15 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 1.08e-01 0.294 0.182 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0661 0.128 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 3.19e-01 0.117 0.117 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0261 0.141 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 8.19e-01 0.0229 0.1 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 1.38e-01 0.21 0.141 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 9.17e-02 0.125 0.0739 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0105 0.148 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 3.70e-01 -0.189 0.21 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 4.60e-01 0.128 0.174 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 1.12e-01 0.235 0.147 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 4.92e-02 0.383 0.194 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 5.79e-01 0.0523 0.0942 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 2.01e-01 -0.205 0.159 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 5.25e-01 -0.101 0.159 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0221 0.172 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 5.30e-01 -0.116 0.185 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0752 0.16 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 4.62e-01 0.124 0.168 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0819 0.192 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 9.00e-01 0.0148 0.118 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 8.84e-01 0.0263 0.18 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 7.34e-01 0.0472 0.139 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 1.84e-01 -0.233 0.174 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 3.02e-01 0.208 0.201 0.063 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 8.36e-01 0.0271 0.131 0.063 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 9.31e-01 0.0121 0.14 0.063 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 5.80e-01 0.102 0.185 0.063 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 1.46e-01 0.128 0.0876 0.063 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 4.83e-02 -0.325 0.164 0.063 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0602 0.121 0.063 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 5.57e-01 0.0957 0.163 0.063 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 7.51e-01 0.0575 0.181 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 5.63e-01 0.0819 0.141 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 9.67e-02 0.256 0.153 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 4.11e-01 0.136 0.165 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0351 0.105 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 2.89e-01 -0.162 0.153 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 8.68e-01 0.0234 0.141 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 2.90e-01 -0.178 0.167 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 6.74e-01 0.0706 0.167 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0608 0.11 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 7.33e-02 0.266 0.148 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0475 0.133 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 3.93e-01 0.0886 0.103 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 2.26e-01 -0.165 0.136 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 2.61e-01 0.104 0.0922 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 3.57e-01 -0.143 0.155 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 3.27e-01 -0.188 0.192 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 1.82e-01 -0.188 0.141 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 2.80e-01 0.177 0.163 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 6.15e-01 0.0733 0.145 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 5.91e-02 0.211 0.111 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 9.13e-01 0.0194 0.177 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 2.68e-01 -0.162 0.145 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0609 0.18 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 6.11e-01 0.0878 0.173 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0387 0.116 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 7.81e-01 0.0415 0.149 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 1.45e-01 0.202 0.138 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 2.19e-01 0.128 0.104 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0216 0.154 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0237 0.0989 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 5.98e-01 0.0826 0.157 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 7.39e-01 0.0809 0.243 0.056 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 4.46e-01 0.195 0.256 0.056 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 6.83e-01 0.0882 0.216 0.056 PB L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0489 0.164 0.056 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 2.97e-01 -0.208 0.198 0.056 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 3.58e-01 -0.216 0.234 0.056 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 9.94e-01 0.0012 0.164 0.056 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 3.24e-02 -0.508 0.235 0.056 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00111 0.188 0.063 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0134 0.143 0.063 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0797 0.149 0.063 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 1.26e-01 -0.211 0.137 0.063 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 9.36e-01 -0.007 0.0872 0.063 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 1.50e-01 -0.25 0.173 0.063 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0266 0.112 0.063 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 4.47e-01 0.129 0.169 0.063 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 3.73e-02 0.37 0.177 0.062 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 6.72e-01 0.0713 0.168 0.062 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 8.15e-01 0.0286 0.122 0.062 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 1.18e-01 -0.3 0.191 0.062 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 1.13e-01 0.169 0.106 0.062 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 9.38e-01 0.0119 0.154 0.062 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 2.11e-01 0.164 0.13 0.062 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 5.36e-01 -0.101 0.163 0.062 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 9.54e-02 0.301 0.18 0.063 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0999 0.147 0.063 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0599 0.13 0.063 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 4.75e-01 0.104 0.145 0.063 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625795 sc-eQTL 5.28e-01 0.107 0.168 0.063 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 3.68e-01 -0.175 0.194 0.063 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 2.41e-01 0.186 0.158 0.063 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625772 sc-eQTL 6.19e-01 0.0926 0.186 0.063 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 3.87e-01 -0.164 0.189 0.063 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 2.10e-02 0.325 0.14 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0143 0.103 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0362 0.102 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 8.51e-01 0.0209 0.111 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625795 sc-eQTL 2.51e-01 0.195 0.17 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 6.46e-02 -0.28 0.151 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 4.19e-01 0.103 0.128 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625772 sc-eQTL 1.15e-01 -0.281 0.177 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 4.45e-01 0.0906 0.118 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 5.91e-01 0.086 0.16 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 2.75e-01 0.128 0.117 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0817 0.109 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 3.82e-01 0.0913 0.104 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625795 sc-eQTL 5.39e-01 0.105 0.171 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 4.81e-01 -0.114 0.162 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 2.75e-01 0.154 0.141 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625772 sc-eQTL 2.02e-01 0.24 0.187 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 8.23e-01 0.0335 0.15 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 4.11e-01 -0.176 0.213 0.061 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 4.99e-01 0.116 0.171 0.061 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 8.48e-01 0.0391 0.204 0.061 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 7.43e-01 0.0622 0.189 0.061 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 1.72e-02 0.249 0.103 0.061 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0841 0.21 0.061 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 3.33e-01 -0.153 0.157 0.061 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 5.98e-01 0.101 0.19 0.061 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 5.56e-02 0.355 0.184 0.06 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0371 0.125 0.06 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 9.00e-01 0.0157 0.125 0.06 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 7.38e-01 0.0362 0.108 0.06 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625795 sc-eQTL 4.86e-01 0.117 0.168 0.06 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 3.13e-01 -0.175 0.174 0.06 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 7.86e-01 0.0431 0.159 0.06 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625772 sc-eQTL 3.73e-01 0.168 0.188 0.06 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 3.67e-02 0.335 0.159 0.06 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 8.67e-02 0.29 0.169 0.063 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 8.57e-01 0.0261 0.145 0.063 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 5.96e-01 0.0537 0.101 0.063 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00691 0.128 0.063 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625795 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0967 0.163 0.063 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 1.23e-01 -0.189 0.122 0.063 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0272 0.148 0.063 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625772 sc-eQTL 5.74e-01 -0.102 0.181 0.063 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 7.89e-01 0.0429 0.16 0.063 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 3.73e-01 0.179 0.2 0.059 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 4.61e-01 0.126 0.17 0.059 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 4.64e-01 0.114 0.156 0.059 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 5.70e-01 0.0899 0.158 0.059 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -625795 sc-eQTL 1.13e-01 -0.246 0.154 0.059 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 6.37e-02 -0.291 0.156 0.059 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 3.01e-01 0.178 0.172 0.059 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -625772 sc-eQTL 8.67e-01 0.0262 0.156 0.059 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 8.48e-01 0.0309 0.16 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 7.72e-01 -0.051 0.176 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 1.57e-01 -0.212 0.149 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 5.14e-01 0.0794 0.121 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 9.12e-01 0.0177 0.16 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 6.00e-01 0.0555 0.106 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0145 0.162 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 3.72e-01 0.1 0.112 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 8.77e-01 0.0278 0.179 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 4.82e-01 -0.112 0.158 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0692 0.148 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 2.20e-01 0.135 0.11 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 4.55e-01 0.121 0.161 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 1.19e-01 0.132 0.0844 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 2.41e-01 -0.148 0.126 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 2.32e-01 0.106 0.0884 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0881 0.151 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 6.75e-02 0.234 0.127 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 5.50e-01 0.0611 0.102 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0732 0.0956 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 8.02e-01 0.0238 0.0946 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -625795 sc-eQTL 4.12e-01 0.138 0.168 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 1.80e-02 -0.326 0.137 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 3.30e-01 0.12 0.123 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -625772 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0263 0.181 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 5.14e-01 0.0741 0.113 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 1.10e-02 0.435 0.169 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 7.00e-01 0.0465 0.12 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 8.25e-01 0.0204 0.0919 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 7.37e-01 0.0379 0.113 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -625795 sc-eQTL 4.09e-01 -0.135 0.163 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 6.91e-02 -0.184 0.101 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 4.41e-01 0.115 0.149 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -625772 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00711 0.181 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 1.66e-01 0.209 0.15 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -706733 sc-eQTL 7.23e-01 0.0574 0.161 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 847327 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0713 0.113 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -336755 sc-eQTL 2.68e-01 0.155 0.14 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -40643 sc-eQTL 3.47e-01 0.111 0.118 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 199562 sc-eQTL 1.81e-01 0.137 0.102 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -921485 sc-eQTL 3.20e-01 -0.134 0.134 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -961969 sc-eQTL 5.02e-01 0.0583 0.0868 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 198543 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0586 0.144 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000279968 GVQW2 -706876 eQTL 0.0111 0.207 0.0811 0.0025 0.0 0.0746

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 \N 847327 2.67e-07 1.34e-07 5.14e-08 1.9e-07 9.79e-08 9.48e-08 1.61e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.55e-07 9.19e-08 1.59e-07 7.13e-08 5.91e-08 7.36e-08 4.09e-08 1.33e-07 5.97e-08 4.89e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.64e-08 1.55e-07 1.25e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.16e-07 1e-07 1.02e-07 2.9e-08 3.96e-08 8.23e-08 3.63e-08 3.49e-08 5.22e-08 8.76e-08 6.43e-08 3.92e-08 5.24e-08 1.33e-07 5.2e-08 1.61e-08 3.83e-08 1.89e-08 1.18e-07 1.88e-09 4.88e-08
ENSG00000135540 \N -625795 3.53e-07 1.78e-07 6.57e-08 2.35e-07 1.1e-07 9.31e-08 2.5e-07 5.84e-08 1.89e-07 1.03e-07 1.86e-07 1.48e-07 2.94e-07 8.44e-08 6.27e-08 9.6e-08 5.42e-08 2.04e-07 7.36e-08 7.83e-08 1.24e-07 1.81e-07 1.75e-07 4.37e-08 2.36e-07 1.56e-07 1.25e-07 1.28e-07 1.39e-07 1.58e-07 1.26e-07 4.43e-08 3.8e-08 1.02e-07 7.44e-08 3.11e-08 4.84e-08 6.11e-08 5.27e-08 6.55e-08 5.39e-08 1.6e-07 3.02e-08 1.43e-08 3.71e-08 9.65e-09 7.12e-08 2.2e-09 4.94e-08