logo

Genes within 1Mb (chr6:138064918:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 3.74e-01 -0.124 0.14 0.064 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 1.35e-01 -0.203 0.135 0.064 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 2.78e-01 0.116 0.106 0.064 B L1
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 6.31e-02 -0.197 0.106 0.064 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 5.81e-01 0.0475 0.0858 0.064 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 2.34e-01 -0.143 0.12 0.064 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 3.39e-01 0.0675 0.0704 0.064 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0594 0.135 0.064 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 6.81e-01 0.0632 0.154 0.064 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0754 0.0898 0.064 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 9.76e-01 0.00308 0.103 0.064 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 1.85e-01 -0.129 0.0969 0.064 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 4.48e-01 0.0692 0.091 0.064 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0645 0.101 0.064 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 4.56e-01 0.0551 0.0738 0.064 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 9.58e-01 0.00602 0.115 0.064 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 5.42e-01 0.103 0.168 0.064 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0335 0.103 0.064 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 3.03e-01 0.113 0.11 0.064 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 9.00e-01 0.0141 0.112 0.064 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 3.01e-01 0.0894 0.0863 0.064 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 4.71e-01 0.0817 0.113 0.064 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 4.15e-01 0.0525 0.0643 0.064 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 7.77e-01 -0.036 0.127 0.064 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 9.05e-02 0.287 0.169 0.061 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0884 0.126 0.061 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 6.40e-01 0.056 0.12 0.061 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 9.63e-01 0.00634 0.135 0.061 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -627653 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0547 0.156 0.061 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 1.81e-01 -0.185 0.137 0.061 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 1.91e-01 0.177 0.135 0.061 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -627630 sc-eQTL 7.67e-01 0.0483 0.163 0.061 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 2.48e-01 -0.159 0.137 0.061 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 2.34e-02 0.275 0.12 0.064 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 7.02e-01 0.0398 0.104 0.064 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 2.04e-01 -0.107 0.0839 0.064 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 8.00e-01 0.0223 0.0881 0.064 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -627653 sc-eQTL 7.65e-01 0.0477 0.159 0.064 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 4.37e-03 -0.263 0.0914 0.064 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 1.78e-01 0.163 0.121 0.064 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -627630 sc-eQTL 4.17e-01 -0.134 0.165 0.064 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 3.53e-01 0.101 0.109 0.064 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 9.07e-01 0.0175 0.149 0.064 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0771 0.115 0.064 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 1.23e-01 0.202 0.131 0.064 NK L1
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 2.79e-01 0.121 0.111 0.064 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 2.20e-01 0.117 0.0952 0.064 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 3.27e-01 -0.12 0.123 0.064 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 8.21e-01 0.0203 0.0896 0.064 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0552 0.135 0.064 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 1.77e-01 0.24 0.177 0.064 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.77e-01 0.0605 0.108 0.064 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 9.35e-01 0.00934 0.115 0.064 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00628 0.142 0.064 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 2.39e-01 0.0794 0.0672 0.064 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 2.85e-02 -0.302 0.137 0.064 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 4.07e-01 0.0752 0.0905 0.064 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 3.40e-01 0.128 0.134 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 6.50e-01 0.0864 0.19 0.069 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.15e-02 -0.33 0.168 0.069 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 1.99e-02 0.386 0.164 0.069 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0731 0.0864 0.069 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 5.13e-01 -0.11 0.168 0.069 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0491 0.19 0.069 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 2.31e-02 0.387 0.169 0.069 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 4.12e-01 0.12 0.146 0.069 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 8.66e-01 0.0292 0.173 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 2.39e-01 -0.188 0.159 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 2.85e-01 0.128 0.119 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 7.61e-01 0.0463 0.152 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0853 0.119 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0753 0.161 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 4.56e-02 -0.274 0.136 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0233 0.17 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00692 0.18 0.065 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 4.46e-01 -0.135 0.177 0.065 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 6.97e-01 0.0527 0.135 0.065 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0957 0.168 0.065 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 5.05e-01 0.0773 0.116 0.065 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 5.02e-01 0.113 0.168 0.065 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 3.68e-01 0.12 0.133 0.065 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 1.77e-01 0.232 0.172 0.065 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 2.03e-01 -0.209 0.164 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.46e-01 -0.082 0.136 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 2.51e-01 0.132 0.115 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 5.84e-01 0.0858 0.156 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 4.75e-02 0.179 0.09 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0608 0.132 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 2.33e-01 0.11 0.0924 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 2.22e-01 -0.174 0.142 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 9.41e-01 0.0118 0.16 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.43e-01 0.1 0.165 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 1.89e-01 0.144 0.109 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 7.89e-01 0.0353 0.132 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 9.81e-02 0.217 0.131 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 3.12e-01 -0.145 0.143 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 3.88e-01 0.0913 0.106 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 9.48e-01 0.0111 0.17 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0472 0.165 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00556 0.155 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 2.80e-01 0.154 0.142 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0617 0.174 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00977 0.101 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 9.48e-01 0.0105 0.162 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 4.95e-01 -0.101 0.147 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 6.22e-01 0.078 0.158 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 9.99e-01 0.000106 0.161 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 2.01e-01 -0.109 0.085 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0554 0.101 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 5.89e-02 -0.25 0.132 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 6.03e-01 0.0486 0.0932 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 6.20e-01 0.0552 0.111 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 3.76e-01 0.0663 0.0748 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 9.57e-01 0.00659 0.121 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 2.97e-01 0.165 0.158 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0102 0.119 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 4.22e-01 0.0947 0.118 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 4.87e-01 0.103 0.148 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 5.18e-01 0.0556 0.0858 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0402 0.12 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 8.88e-02 0.157 0.0918 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 2.50e-01 0.139 0.12 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 1.71e-01 0.242 0.176 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0419 0.134 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 9.15e-01 -0.013 0.121 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 6.90e-01 0.056 0.14 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0378 0.089 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 9.37e-02 -0.251 0.149 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 2.82e-02 0.234 0.106 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0456 0.143 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 1.05e-01 0.292 0.18 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.33e-01 0.0759 0.122 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 2.15e-01 0.16 0.129 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 4.00e-01 -0.136 0.161 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 7.27e-01 0.0359 0.102 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0341 0.141 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0215 0.114 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 5.44e-01 0.0876 0.144 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 1.42e-01 0.257 0.175 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0795 0.122 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 3.69e-01 0.101 0.112 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0415 0.135 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 7.63e-01 0.029 0.0957 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 1.04e-01 0.22 0.135 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 1.10e-01 0.114 0.0708 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00667 0.142 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 3.06e-01 -0.205 0.2 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.02e-01 0.111 0.165 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 1.26e-01 0.215 0.14 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 7.74e-02 0.327 0.184 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 5.39e-01 0.0551 0.0895 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 2.26e-01 -0.184 0.152 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 5.01e-01 -0.102 0.152 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0151 0.164 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 5.30e-01 -0.111 0.176 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0844 0.153 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 4.38e-01 0.124 0.16 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 5.42e-01 -0.112 0.183 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 9.21e-01 0.0112 0.113 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 8.11e-01 0.0411 0.172 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 7.58e-01 0.0409 0.133 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 1.81e-01 -0.224 0.167 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 2.51e-01 0.221 0.192 0.065 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 9.21e-01 0.0125 0.125 0.065 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 7.64e-01 0.0403 0.134 0.065 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 6.65e-01 0.0766 0.177 0.065 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 2.06e-01 0.106 0.0839 0.065 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 4.38e-02 -0.317 0.156 0.065 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0717 0.116 0.065 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 5.16e-01 0.101 0.156 0.065 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 8.34e-01 0.0365 0.174 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 7.11e-01 0.0502 0.135 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 8.75e-02 0.252 0.147 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 5.17e-01 0.103 0.158 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0169 0.101 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 2.39e-01 -0.173 0.146 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 8.18e-01 0.0311 0.135 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 3.47e-01 -0.151 0.161 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 5.68e-01 0.0918 0.16 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0662 0.105 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 6.27e-02 0.264 0.141 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0201 0.128 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 4.41e-01 0.0766 0.0992 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 3.08e-01 -0.133 0.131 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 3.05e-01 0.091 0.0884 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 4.22e-01 -0.12 0.149 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 3.22e-01 -0.182 0.184 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 1.19e-01 -0.211 0.134 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 3.28e-01 0.153 0.156 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 5.94e-01 0.0744 0.139 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 6.82e-02 0.195 0.106 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 8.61e-01 0.0298 0.17 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 3.38e-01 -0.134 0.139 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 6.15e-01 -0.087 0.173 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 7.14e-01 0.0606 0.165 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0255 0.111 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 6.30e-01 0.0687 0.142 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 1.60e-01 0.186 0.132 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 2.10e-01 0.125 0.0991 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0145 0.147 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0196 0.0947 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 4.32e-01 0.118 0.15 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 7.39e-01 0.0809 0.243 0.056 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 4.46e-01 0.195 0.256 0.056 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 6.83e-01 0.0882 0.216 0.056 PB L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0489 0.164 0.056 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 2.97e-01 -0.208 0.198 0.056 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 3.58e-01 -0.216 0.234 0.056 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 9.94e-01 0.0012 0.164 0.056 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 3.24e-02 -0.508 0.235 0.056 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00309 0.18 0.065 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0262 0.137 0.065 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0582 0.143 0.065 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 1.28e-01 -0.201 0.132 0.065 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 7.33e-01 0.0285 0.0835 0.065 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 1.18e-01 -0.26 0.166 0.065 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0279 0.107 0.065 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 6.22e-01 0.0799 0.162 0.065 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 4.74e-02 0.338 0.169 0.064 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 8.20e-01 0.0368 0.161 0.064 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 7.30e-01 0.0403 0.117 0.064 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 1.05e-01 -0.298 0.183 0.064 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 1.27e-01 0.156 0.102 0.064 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 9.14e-01 0.0159 0.147 0.064 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 3.36e-01 0.12 0.125 0.064 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 6.31e-01 -0.075 0.156 0.064 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 1.34e-01 0.258 0.172 0.066 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0353 0.141 0.066 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0622 0.124 0.066 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 3.93e-01 0.119 0.139 0.066 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -627653 sc-eQTL 3.31e-01 0.156 0.16 0.066 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 4.45e-01 -0.142 0.185 0.066 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 1.96e-01 0.196 0.151 0.066 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -627630 sc-eQTL 5.69e-01 0.101 0.177 0.066 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 2.71e-01 -0.199 0.18 0.066 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 1.26e-02 0.336 0.133 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0246 0.0987 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0506 0.0973 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 9.50e-01 0.00666 0.106 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -627653 sc-eQTL 1.76e-01 0.22 0.162 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 8.57e-02 -0.25 0.145 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 3.97e-01 0.104 0.122 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -627630 sc-eQTL 8.17e-02 -0.296 0.169 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 4.23e-01 0.091 0.113 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 5.54e-01 0.091 0.153 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 2.94e-01 0.118 0.112 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0745 0.105 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 4.51e-01 0.0756 0.1 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -627653 sc-eQTL 7.33e-01 0.0561 0.164 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 4.05e-01 -0.13 0.155 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 4.44e-01 0.104 0.135 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -627630 sc-eQTL 3.47e-01 0.17 0.18 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00196 0.144 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 5.63e-01 -0.117 0.202 0.064 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 6.53e-01 0.0728 0.162 0.064 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 6.31e-01 0.0925 0.192 0.064 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 9.43e-01 0.0127 0.179 0.064 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 4.42e-02 0.199 0.098 0.064 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 4.91e-01 -0.137 0.198 0.064 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 1.54e-01 -0.212 0.148 0.064 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 6.76e-01 0.0754 0.18 0.064 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 8.52e-02 0.306 0.177 0.062 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 9.01e-01 -0.015 0.12 0.062 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00436 0.119 0.062 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 6.17e-01 0.0518 0.103 0.062 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -627653 sc-eQTL 4.45e-01 0.123 0.161 0.062 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 1.87e-01 -0.219 0.166 0.062 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 7.82e-01 0.0421 0.152 0.062 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -627630 sc-eQTL 4.46e-01 0.138 0.18 0.062 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 4.77e-02 0.304 0.153 0.062 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 4.23e-02 0.328 0.161 0.066 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00629 0.138 0.066 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 5.50e-01 0.0579 0.0967 0.066 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 9.87e-01 0.00196 0.122 0.066 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -627653 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0351 0.156 0.066 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 1.04e-01 -0.191 0.117 0.066 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0822 0.141 0.066 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -627630 sc-eQTL 4.57e-01 -0.129 0.173 0.066 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 7.26e-01 0.0536 0.153 0.066 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 3.94e-01 0.162 0.19 0.062 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 6.01e-01 0.0847 0.162 0.062 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 3.80e-01 0.13 0.148 0.062 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 5.21e-01 0.0964 0.15 0.062 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -627653 sc-eQTL 1.42e-01 -0.216 0.146 0.062 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 4.30e-02 -0.301 0.147 0.062 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 3.67e-01 0.147 0.163 0.062 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -627630 sc-eQTL 8.78e-01 0.0228 0.148 0.062 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 9.85e-01 0.00285 0.152 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0102 0.168 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.23e-02 -0.277 0.142 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 3.20e-01 0.115 0.116 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 9.42e-01 0.0111 0.153 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 6.98e-01 0.0392 0.101 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0557 0.155 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 5.57e-01 0.063 0.107 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 5.98e-01 0.0902 0.171 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0903 0.152 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0685 0.142 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 2.48e-01 0.122 0.105 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 4.69e-01 0.112 0.155 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 1.09e-01 0.131 0.0811 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 3.45e-01 -0.115 0.121 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 2.76e-01 0.0927 0.085 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 4.26e-01 -0.116 0.145 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 4.46e-02 0.246 0.122 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 6.13e-01 0.0496 0.098 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0842 0.0916 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 8.94e-01 0.0121 0.0907 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -627653 sc-eQTL 3.83e-01 0.141 0.161 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 1.81e-02 -0.312 0.131 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 3.84e-01 0.103 0.118 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -627630 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0741 0.173 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 5.65e-01 0.0626 0.109 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 9.78e-03 0.423 0.162 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 7.58e-01 0.0356 0.115 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 8.75e-01 0.0139 0.0881 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 5.89e-01 0.0583 0.108 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -627653 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0943 0.156 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 4.60e-02 -0.194 0.0966 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 6.55e-01 0.0639 0.143 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -627630 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0393 0.173 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 1.69e-01 0.199 0.144 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -708591 sc-eQTL 7.07e-01 0.0583 0.155 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 845469 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0641 0.108 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -338613 sc-eQTL 2.29e-01 0.161 0.134 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -42501 sc-eQTL 3.16e-01 0.114 0.113 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 197704 sc-eQTL 1.88e-01 0.13 0.0982 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -923343 sc-eQTL 4.39e-01 -0.1 0.129 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -963827 sc-eQTL 4.96e-01 0.0568 0.0832 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 196685 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0213 0.138 0.065 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000279968 GVQW2 -708734 eQTL 0.0111 0.207 0.0811 0.0025 0.0 0.0746

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000027697 \N 845469 2.64e-07 1.25e-07 3.65e-08 1.8e-07 8.92e-08 9.57e-08 1.73e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.62e-07 8.03e-08 1.3e-07 6.38e-08 5.84e-08 7.5e-08 3.9e-08 1.18e-07 5.75e-08 4.21e-08 1.05e-07 1.3e-07 1.5e-07 4.16e-08 1.37e-07 1.16e-07 1.12e-07 8.71e-08 1.12e-07 1.12e-07 9.58e-08 3.84e-08 2.91e-08 8.68e-08 8.87e-08 4.07e-08 4.79e-08 9.13e-08 7.63e-08 3.03e-08 2.99e-08 1.31e-07 3.91e-08 1.26e-08 6.38e-08 1.7e-08 1.24e-07 4.5e-09 4.85e-08
ENSG00000135540 \N -627653 2.8e-07 1.56e-07 4.48e-08 2.15e-07 9.24e-08 9.91e-08 3.57e-07 5.4e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.59e-07 8.55e-08 1.59e-07 7.95e-08 5.72e-08 7.36e-08 4.18e-08 1.56e-07 7.39e-08 4.92e-08 1.26e-07 1.28e-07 2.04e-07 2.87e-08 1.98e-07 1.31e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.37e-07 9.49e-08 9.92e-08 3.92e-08 3.56e-08 8.25e-08 4.92e-08 4.02e-08 5.11e-08 9.22e-08 6.37e-08 3.71e-08 4.19e-08 1.46e-07 5.22e-08 1.06e-07 3.83e-08 1.83e-08 1.19e-07 4.09e-09 4.79e-08