logo

Genes within 1Mb (chr6:138059841:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 2.05e-02 -0.259 0.111 0.118 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 2.25e-01 0.133 0.109 0.118 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 2.25e-01 0.104 0.0854 0.118 B L1
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 7.77e-01 0.0243 0.0856 0.118 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0879 0.0687 0.118 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 3.29e-01 0.0942 0.0963 0.118 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 2.94e-01 0.0595 0.0566 0.118 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0669 0.108 0.118 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 3.87e-02 -0.26 0.125 0.118 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 2.85e-01 0.0789 0.0736 0.118 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 7.74e-01 0.0243 0.0846 0.118 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0709 0.0796 0.118 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 1.59e-01 -0.105 0.0744 0.118 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 7.71e-01 0.0241 0.0826 0.118 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 1.07e-01 0.0976 0.0602 0.118 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0366 0.0941 0.118 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 9.05e-04 -0.438 0.13 0.118 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 4.22e-01 0.0656 0.0816 0.118 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0162 0.0875 0.118 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0678 0.089 0.118 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0279 0.0688 0.118 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 7.59e-01 0.0276 0.0899 0.118 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 6.10e-02 0.0956 0.0508 0.118 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 2.90e-01 -0.107 0.101 0.118 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 1.77e-01 -0.182 0.135 0.119 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 8.29e-01 0.0217 0.1 0.119 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0016 0.0951 0.119 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0607 0.107 0.119 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -632730 sc-eQTL 1.03e-02 -0.316 0.122 0.119 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 2.86e-02 0.239 0.108 0.119 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 6.35e-01 0.0511 0.107 0.119 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -632707 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00133 0.13 0.119 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00698 0.109 0.119 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0343 0.0988 0.118 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0513 0.0842 0.118 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 6.97e-01 0.0267 0.0683 0.118 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 6.44e-01 -0.033 0.0714 0.118 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -632730 sc-eQTL 2.50e-01 -0.148 0.129 0.118 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 2.15e-01 0.0936 0.0753 0.118 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0551 0.0983 0.118 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -632707 sc-eQTL 3.58e-01 0.123 0.134 0.118 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0411 0.0885 0.118 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 1.12e-02 -0.302 0.118 0.118 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 1.64e-01 -0.128 0.0916 0.118 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 7.94e-01 0.0275 0.105 0.118 NK L1
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 5.09e-02 -0.174 0.0886 0.118 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0568 0.0765 0.118 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 9.43e-02 0.164 0.0978 0.118 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00282 0.0719 0.118 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0632 0.108 0.118 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 5.12e-01 0.0928 0.141 0.118 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 1.98e-01 -0.111 0.0857 0.118 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 9.82e-02 0.151 0.0906 0.118 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 2.73e-01 -0.123 0.112 0.118 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0471 0.0534 0.118 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0389 0.11 0.118 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0219 0.072 0.118 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 2.32e-01 -0.127 0.106 0.118 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 4.76e-01 0.116 0.162 0.117 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 1.29e-02 -0.357 0.142 0.117 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 5.44e-02 -0.272 0.14 0.117 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0472 0.0736 0.117 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 2.26e-01 0.173 0.142 0.117 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 1.63e-01 0.225 0.161 0.117 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0353 0.146 0.117 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 3.31e-01 -0.121 0.124 0.117 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 3.16e-02 -0.297 0.137 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 3.50e-02 0.269 0.127 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 6.22e-01 0.0475 0.0961 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 4.63e-02 -0.243 0.121 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 7.44e-01 0.0314 0.096 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 5.02e-01 0.0873 0.13 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 2.63e-01 0.123 0.11 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 4.26e-01 0.109 0.136 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 1.05e-01 -0.231 0.142 0.116 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 9.89e-01 0.00187 0.141 0.116 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 8.36e-01 0.0223 0.108 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 7.50e-01 0.0429 0.134 0.116 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 9.23e-01 0.00889 0.0923 0.116 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 1.58e-01 0.189 0.133 0.116 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 2.66e-01 -0.118 0.106 0.116 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 2.46e-02 0.307 0.136 0.116 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 4.18e-01 -0.11 0.135 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 3.31e-01 0.109 0.112 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 9.60e-01 0.00478 0.0951 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 3.11e-01 -0.131 0.129 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0313 0.0748 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 5.10e-01 -0.072 0.109 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 6.77e-01 0.0318 0.0763 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 4.68e-01 0.0851 0.117 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0756 0.132 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0798 0.136 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 2.37e-02 0.203 0.0893 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 2.90e-01 -0.115 0.108 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 2.12e-01 -0.135 0.108 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 5.62e-01 0.0689 0.119 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000278 0.0873 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 1.13e-01 -0.222 0.139 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0342 0.139 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 4.15e-01 -0.106 0.13 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 6.46e-01 0.0551 0.12 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 7.41e-01 0.0483 0.146 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 8.08e-01 0.0207 0.0851 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 5.16e-01 0.0884 0.136 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 3.84e-02 0.255 0.123 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 3.32e-01 -0.129 0.132 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0658 0.131 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 8.42e-01 0.0139 0.0695 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 4.97e-01 0.0557 0.0819 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0588 0.108 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0652 0.0758 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0197 0.0906 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 3.04e-01 0.0627 0.0609 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000451 0.0984 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 3.35e-03 -0.368 0.124 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 6.06e-02 0.178 0.0943 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 9.74e-01 0.00307 0.0941 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0671 0.118 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0752 0.0684 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 9.47e-01 0.00635 0.0959 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 7.00e-01 0.0284 0.0737 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 1.20e-01 -0.149 0.0955 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 2.95e-01 -0.152 0.145 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0355 0.11 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 5.26e-01 0.0628 0.099 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 9.24e-01 0.011 0.115 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0755 0.073 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0191 0.123 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0485 0.0879 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0917 0.117 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 5.16e-04 -0.502 0.142 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 5.62e-01 0.0572 0.0985 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 5.40e-01 0.0641 0.104 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0794 0.13 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0577 0.0829 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 3.56e-01 0.105 0.114 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 4.45e-01 0.0706 0.0922 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0437 0.117 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 5.21e-01 -0.091 0.142 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00731 0.0989 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0192 0.0907 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0301 0.109 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0429 0.0773 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0685 0.11 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 5.68e-01 0.0329 0.0576 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 8.72e-03 -0.298 0.113 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 4.38e-02 -0.333 0.164 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 2.07e-01 -0.173 0.136 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 3.31e-01 -0.113 0.116 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0709 0.154 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 3.51e-01 0.0691 0.0739 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 9.46e-01 0.00847 0.126 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 6.43e-02 0.231 0.124 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 2.85e-01 -0.145 0.135 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0841 0.148 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 3.43e-01 -0.122 0.128 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 6.36e-01 0.0637 0.134 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0719 0.153 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 6.25e-01 0.0463 0.0944 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 7.91e-02 -0.252 0.143 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 4.25e-01 0.0887 0.111 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 4.94e-01 0.096 0.14 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 7.65e-01 0.0465 0.155 0.119 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 1.74e-02 -0.238 0.0994 0.119 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 2.67e-02 0.238 0.106 0.119 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 9.75e-02 -0.236 0.142 0.119 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0739 0.0676 0.119 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 7.86e-01 0.0345 0.127 0.119 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 5.30e-01 0.0588 0.0934 0.119 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 1.38e-01 -0.186 0.125 0.119 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0126 0.146 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 2.73e-01 -0.125 0.113 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 3.58e-01 -0.114 0.124 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 4.44e-01 0.102 0.132 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 4.36e-01 -0.066 0.0844 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 7.37e-01 0.0413 0.123 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 7.26e-01 0.0398 0.113 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 6.49e-02 -0.248 0.134 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 2.55e-01 -0.147 0.129 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0879 0.0849 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 3.21e-01 0.114 0.115 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 9.35e-03 -0.266 0.101 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0771 0.08 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 3.25e-01 0.104 0.105 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00129 0.0715 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 7.71e-01 -0.035 0.12 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 1.69e-01 -0.212 0.154 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 3.19e-01 -0.113 0.113 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0144 0.131 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 8.35e-01 0.0244 0.117 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 1.17e-01 -0.141 0.0893 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 6.93e-01 0.0563 0.142 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 5.12e-01 0.0769 0.117 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0996 0.145 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 8.37e-02 -0.235 0.135 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0759 0.0916 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 2.05e-01 0.148 0.117 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 3.37e-01 -0.105 0.109 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0304 0.0818 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 8.18e-01 0.0278 0.121 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0495 0.0779 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0623 0.123 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 5.27e-01 -0.102 0.16 0.13 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 1.42e-02 0.412 0.165 0.13 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 2.28e-02 0.322 0.14 0.13 PB L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 1.12e-01 -0.172 0.108 0.13 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 4.43e-02 -0.264 0.13 0.13 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 9.53e-02 0.258 0.153 0.13 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 5.95e-01 0.0579 0.109 0.13 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 1.23e-01 -0.243 0.157 0.13 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 2.49e-01 0.172 0.148 0.115 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0516 0.113 0.115 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 3.03e-01 0.122 0.118 0.115 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 8.17e-01 0.0255 0.11 0.115 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 5.93e-02 -0.13 0.0685 0.115 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 2.89e-01 -0.146 0.138 0.115 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0883 0.0888 0.115 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 1.42e-01 -0.197 0.133 0.115 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 4.66e-02 -0.272 0.136 0.118 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 1.52e-01 -0.185 0.129 0.118 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 7.06e-01 0.0354 0.0938 0.118 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 9.11e-01 0.0165 0.148 0.118 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0588 0.0821 0.118 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 5.19e-02 -0.229 0.117 0.118 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0276 0.101 0.118 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0751 0.125 0.118 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 2.71e-01 -0.149 0.135 0.12 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0745 0.11 0.12 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 9.53e-01 0.00573 0.0969 0.12 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0549 0.108 0.12 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -632730 sc-eQTL 4.63e-03 -0.353 0.123 0.12 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 8.75e-01 0.0228 0.145 0.12 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 9.73e-01 0.00395 0.119 0.12 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -632707 sc-eQTL 4.55e-01 -0.104 0.139 0.12 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 5.93e-01 0.0756 0.141 0.12 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 2.63e-01 -0.12 0.107 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 9.99e-01 6.03e-05 0.078 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 7.15e-01 0.0281 0.0769 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0131 0.084 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -632730 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0168 0.129 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 7.23e-01 0.0408 0.115 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0135 0.0968 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -632707 sc-eQTL 2.14e-01 0.167 0.134 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00305 0.0897 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 9.30e-01 0.0108 0.124 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0198 0.091 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 6.62e-01 0.0371 0.0848 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0287 0.0809 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -632730 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0388 0.133 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 7.20e-02 0.225 0.125 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0507 0.109 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -632707 sc-eQTL 4.73e-01 0.104 0.145 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 9.70e-01 0.00435 0.116 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0379 0.173 0.112 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 3.20e-02 -0.296 0.136 0.112 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 5.84e-01 0.0906 0.165 0.112 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 9.35e-01 0.0125 0.153 0.112 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 6.90e-01 0.0341 0.0853 0.112 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 7.28e-01 0.0593 0.17 0.112 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 5.83e-01 0.0704 0.128 0.112 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 4.33e-01 -0.121 0.154 0.112 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 3.27e-01 0.14 0.143 0.12 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 8.71e-01 0.0156 0.0962 0.12 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 5.48e-01 0.0577 0.0958 0.12 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 9.17e-01 0.00867 0.0831 0.12 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -632730 sc-eQTL 1.38e-03 -0.409 0.126 0.12 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0187 0.134 0.12 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 6.13e-01 0.0617 0.122 0.12 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -632707 sc-eQTL 4.33e-01 0.114 0.145 0.12 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0999 0.124 0.12 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0482 0.135 0.115 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 3.52e-01 -0.107 0.115 0.115 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 1.58e-01 0.114 0.0802 0.115 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0945 0.102 0.115 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -632730 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0933 0.13 0.115 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0755 0.0977 0.115 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0571 0.118 0.115 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -632707 sc-eQTL 8.70e-01 0.0235 0.144 0.115 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 3.51e-01 -0.119 0.127 0.115 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0868 0.158 0.107 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 1.98e-01 -0.172 0.133 0.107 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 9.91e-01 0.00137 0.123 0.107 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0597 0.124 0.107 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -632730 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0383 0.122 0.107 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 4.09e-02 0.252 0.122 0.107 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 8.14e-01 0.0318 0.135 0.107 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -632707 sc-eQTL 6.82e-02 0.223 0.121 0.107 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0306 0.126 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 9.27e-03 -0.342 0.13 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 5.65e-01 0.0651 0.113 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 6.66e-01 0.0396 0.0917 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0424 0.121 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0435 0.0797 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 5.80e-03 0.334 0.12 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0615 0.0846 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 1.20e-02 0.337 0.133 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 1.92e-01 -0.166 0.127 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 5.34e-01 0.0743 0.119 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 4.10e-01 0.073 0.0884 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 1.51e-01 -0.186 0.129 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0889 0.0681 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0385 0.102 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 6.35e-01 0.034 0.0714 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0431 0.122 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0628 0.0991 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0409 0.0789 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 7.68e-01 0.0218 0.0739 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0392 0.073 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -632730 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0367 0.13 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 2.05e-01 0.135 0.107 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0402 0.0951 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -632707 sc-eQTL 4.10e-01 0.115 0.139 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0247 0.0875 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 5.54e-01 0.0787 0.133 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0674 0.0929 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 2.36e-01 0.084 0.0707 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 9.81e-01 0.00203 0.0869 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -632730 sc-eQTL 1.87e-03 -0.388 0.123 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0341 0.0785 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 8.91e-01 0.0158 0.115 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -632707 sc-eQTL 4.59e-01 0.103 0.139 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0645 0.116 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -713668 sc-eQTL 1.39e-02 -0.305 0.123 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 840392 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0906 0.087 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 sc-eQTL 5.67e-01 0.062 0.108 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -47578 sc-eQTL 2.85e-02 -0.199 0.0903 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 192627 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0644 0.0794 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -928420 sc-eQTL 1.21e-01 0.161 0.103 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -968904 sc-eQTL 6.40e-01 0.0314 0.0671 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 191608 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0188 0.111 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 eQTL 0.000612 0.11 0.0319 0.0 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -343690 2.64e-06 3.13e-06 3.1e-07 1.7e-06 4.37e-07 7.82e-07 1.3e-06 4.27e-07 1.78e-06 7.41e-07 1.84e-06 1.32e-06 3.42e-06 1.36e-06 9.27e-07 9.79e-07 1.13e-06 1.29e-06 9.43e-07 4.68e-07 6.41e-07 2.51e-06 1.79e-06 5.72e-07 3.16e-06 8.9e-07 1.12e-06 1.05e-06 1.8e-06 1.72e-06 9.07e-07 7.24e-08 2.76e-07 5.66e-07 8.76e-07 6.18e-07 6.99e-07 2.46e-07 4.67e-07 2.04e-07 1.44e-07 4.15e-06 6.27e-07 2.68e-08 2.5e-07 2.95e-07 2.22e-07 1.27e-07 2.87e-07