logo

Genes within 1Mb (chr6:138055368:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 2.05e-02 -0.259 0.111 0.118 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 2.25e-01 0.133 0.109 0.118 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 2.25e-01 0.104 0.0854 0.118 B L1
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 7.77e-01 0.0243 0.0856 0.118 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0879 0.0687 0.118 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 3.29e-01 0.0942 0.0963 0.118 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 2.94e-01 0.0595 0.0566 0.118 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0669 0.108 0.118 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 3.87e-02 -0.26 0.125 0.118 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 2.85e-01 0.0789 0.0736 0.118 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 7.74e-01 0.0243 0.0846 0.118 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0709 0.0796 0.118 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 1.59e-01 -0.105 0.0744 0.118 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 7.71e-01 0.0241 0.0826 0.118 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 1.07e-01 0.0976 0.0602 0.118 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0366 0.0941 0.118 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 9.05e-04 -0.438 0.13 0.118 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 4.22e-01 0.0656 0.0816 0.118 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0162 0.0875 0.118 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0678 0.089 0.118 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0279 0.0688 0.118 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 7.59e-01 0.0276 0.0899 0.118 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 6.10e-02 0.0956 0.0508 0.118 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 2.90e-01 -0.107 0.101 0.118 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 1.77e-01 -0.182 0.135 0.119 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 8.29e-01 0.0217 0.1 0.119 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0016 0.0951 0.119 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0607 0.107 0.119 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -637203 sc-eQTL 1.03e-02 -0.316 0.122 0.119 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 2.86e-02 0.239 0.108 0.119 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 6.35e-01 0.0511 0.107 0.119 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -637180 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00133 0.13 0.119 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00698 0.109 0.119 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0343 0.0988 0.118 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0513 0.0842 0.118 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 6.97e-01 0.0267 0.0683 0.118 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 6.44e-01 -0.033 0.0714 0.118 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -637203 sc-eQTL 2.50e-01 -0.148 0.129 0.118 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 2.15e-01 0.0936 0.0753 0.118 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0551 0.0983 0.118 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -637180 sc-eQTL 3.58e-01 0.123 0.134 0.118 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0411 0.0885 0.118 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 1.12e-02 -0.302 0.118 0.118 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 1.64e-01 -0.128 0.0916 0.118 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 7.94e-01 0.0275 0.105 0.118 NK L1
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 5.09e-02 -0.174 0.0886 0.118 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0568 0.0765 0.118 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 9.43e-02 0.164 0.0978 0.118 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00282 0.0719 0.118 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0632 0.108 0.118 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 5.12e-01 0.0928 0.141 0.118 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 1.98e-01 -0.111 0.0857 0.118 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 9.82e-02 0.151 0.0906 0.118 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 2.73e-01 -0.123 0.112 0.118 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0471 0.0534 0.118 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0389 0.11 0.118 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0219 0.072 0.118 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 2.32e-01 -0.127 0.106 0.118 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 4.76e-01 0.116 0.162 0.117 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 1.29e-02 -0.357 0.142 0.117 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 5.44e-02 -0.272 0.14 0.117 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0472 0.0736 0.117 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 2.26e-01 0.173 0.142 0.117 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 1.63e-01 0.225 0.161 0.117 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0353 0.146 0.117 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 3.31e-01 -0.121 0.124 0.117 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 3.16e-02 -0.297 0.137 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 3.50e-02 0.269 0.127 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 6.22e-01 0.0475 0.0961 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 4.63e-02 -0.243 0.121 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 7.44e-01 0.0314 0.096 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 5.02e-01 0.0873 0.13 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 2.63e-01 0.123 0.11 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 4.26e-01 0.109 0.136 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 1.05e-01 -0.231 0.142 0.116 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 9.89e-01 0.00187 0.141 0.116 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 8.36e-01 0.0223 0.108 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 7.50e-01 0.0429 0.134 0.116 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 9.23e-01 0.00889 0.0923 0.116 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 1.58e-01 0.189 0.133 0.116 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 2.66e-01 -0.118 0.106 0.116 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 2.46e-02 0.307 0.136 0.116 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 4.18e-01 -0.11 0.135 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 3.31e-01 0.109 0.112 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 9.60e-01 0.00478 0.0951 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 3.11e-01 -0.131 0.129 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0313 0.0748 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 5.10e-01 -0.072 0.109 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 6.77e-01 0.0318 0.0763 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 4.68e-01 0.0851 0.117 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0756 0.132 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0798 0.136 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 2.37e-02 0.203 0.0893 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 2.90e-01 -0.115 0.108 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 2.12e-01 -0.135 0.108 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 5.62e-01 0.0689 0.119 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000278 0.0873 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 1.13e-01 -0.222 0.139 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0342 0.139 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 4.15e-01 -0.106 0.13 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 6.46e-01 0.0551 0.12 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 7.41e-01 0.0483 0.146 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 8.08e-01 0.0207 0.0851 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 5.16e-01 0.0884 0.136 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 3.84e-02 0.255 0.123 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 3.32e-01 -0.129 0.132 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0658 0.131 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 8.42e-01 0.0139 0.0695 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 4.97e-01 0.0557 0.0819 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0588 0.108 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0652 0.0758 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0197 0.0906 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 3.04e-01 0.0627 0.0609 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000451 0.0984 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 3.35e-03 -0.368 0.124 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 6.06e-02 0.178 0.0943 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 9.74e-01 0.00307 0.0941 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0671 0.118 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0752 0.0684 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 9.47e-01 0.00635 0.0959 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 7.00e-01 0.0284 0.0737 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 1.20e-01 -0.149 0.0955 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 2.95e-01 -0.152 0.145 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0355 0.11 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 5.26e-01 0.0628 0.099 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 9.24e-01 0.011 0.115 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0755 0.073 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0191 0.123 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0485 0.0879 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0917 0.117 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 5.16e-04 -0.502 0.142 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 5.62e-01 0.0572 0.0985 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 5.40e-01 0.0641 0.104 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0794 0.13 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0577 0.0829 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 3.56e-01 0.105 0.114 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 4.45e-01 0.0706 0.0922 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0437 0.117 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 5.21e-01 -0.091 0.142 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00731 0.0989 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0192 0.0907 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0301 0.109 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0429 0.0773 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0685 0.11 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 5.68e-01 0.0329 0.0576 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 8.72e-03 -0.298 0.113 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 4.38e-02 -0.333 0.164 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 2.07e-01 -0.173 0.136 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 3.31e-01 -0.113 0.116 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0709 0.154 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 3.51e-01 0.0691 0.0739 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 9.46e-01 0.00847 0.126 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 6.43e-02 0.231 0.124 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 2.85e-01 -0.145 0.135 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0841 0.148 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 3.43e-01 -0.122 0.128 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 6.36e-01 0.0637 0.134 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0719 0.153 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 6.25e-01 0.0463 0.0944 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 7.91e-02 -0.252 0.143 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 4.25e-01 0.0887 0.111 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 4.94e-01 0.096 0.14 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 7.65e-01 0.0465 0.155 0.119 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 1.74e-02 -0.238 0.0994 0.119 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 2.67e-02 0.238 0.106 0.119 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 9.75e-02 -0.236 0.142 0.119 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0739 0.0676 0.119 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 7.86e-01 0.0345 0.127 0.119 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 5.30e-01 0.0588 0.0934 0.119 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 1.38e-01 -0.186 0.125 0.119 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0126 0.146 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 2.73e-01 -0.125 0.113 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 3.58e-01 -0.114 0.124 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 4.44e-01 0.102 0.132 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 4.36e-01 -0.066 0.0844 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 7.37e-01 0.0413 0.123 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 7.26e-01 0.0398 0.113 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 6.49e-02 -0.248 0.134 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 2.55e-01 -0.147 0.129 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0879 0.0849 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 3.21e-01 0.114 0.115 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 9.35e-03 -0.266 0.101 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0771 0.08 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 3.25e-01 0.104 0.105 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00129 0.0715 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 7.71e-01 -0.035 0.12 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 1.69e-01 -0.212 0.154 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 3.19e-01 -0.113 0.113 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0144 0.131 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 8.35e-01 0.0244 0.117 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 1.17e-01 -0.141 0.0893 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 6.93e-01 0.0563 0.142 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 5.12e-01 0.0769 0.117 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0996 0.145 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 8.37e-02 -0.235 0.135 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0759 0.0916 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 2.05e-01 0.148 0.117 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 3.37e-01 -0.105 0.109 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0304 0.0818 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 8.18e-01 0.0278 0.121 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0495 0.0779 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0623 0.123 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 5.27e-01 -0.102 0.16 0.13 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 1.42e-02 0.412 0.165 0.13 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 2.28e-02 0.322 0.14 0.13 PB L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 1.12e-01 -0.172 0.108 0.13 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 4.43e-02 -0.264 0.13 0.13 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 9.53e-02 0.258 0.153 0.13 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 5.95e-01 0.0579 0.109 0.13 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 1.23e-01 -0.243 0.157 0.13 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 2.49e-01 0.172 0.148 0.115 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0516 0.113 0.115 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 3.03e-01 0.122 0.118 0.115 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 8.17e-01 0.0255 0.11 0.115 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 5.93e-02 -0.13 0.0685 0.115 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 2.89e-01 -0.146 0.138 0.115 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0883 0.0888 0.115 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 1.42e-01 -0.197 0.133 0.115 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 4.66e-02 -0.272 0.136 0.118 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 1.52e-01 -0.185 0.129 0.118 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 7.06e-01 0.0354 0.0938 0.118 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 9.11e-01 0.0165 0.148 0.118 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0588 0.0821 0.118 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 5.19e-02 -0.229 0.117 0.118 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0276 0.101 0.118 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0751 0.125 0.118 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 2.71e-01 -0.149 0.135 0.12 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0745 0.11 0.12 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 9.53e-01 0.00573 0.0969 0.12 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0549 0.108 0.12 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -637203 sc-eQTL 4.63e-03 -0.353 0.123 0.12 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 8.75e-01 0.0228 0.145 0.12 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 9.73e-01 0.00395 0.119 0.12 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -637180 sc-eQTL 4.55e-01 -0.104 0.139 0.12 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 5.93e-01 0.0756 0.141 0.12 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 2.63e-01 -0.12 0.107 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 9.99e-01 6.03e-05 0.078 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 7.15e-01 0.0281 0.0769 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0131 0.084 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -637203 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0168 0.129 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 7.23e-01 0.0408 0.115 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0135 0.0968 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -637180 sc-eQTL 2.14e-01 0.167 0.134 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00305 0.0897 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 9.30e-01 0.0108 0.124 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0198 0.091 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 6.62e-01 0.0371 0.0848 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0287 0.0809 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -637203 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0388 0.133 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 7.20e-02 0.225 0.125 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0507 0.109 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -637180 sc-eQTL 4.73e-01 0.104 0.145 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 9.70e-01 0.00435 0.116 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0379 0.173 0.112 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 3.20e-02 -0.296 0.136 0.112 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 5.84e-01 0.0906 0.165 0.112 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 9.35e-01 0.0125 0.153 0.112 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 6.90e-01 0.0341 0.0853 0.112 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 7.28e-01 0.0593 0.17 0.112 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 5.83e-01 0.0704 0.128 0.112 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 4.33e-01 -0.121 0.154 0.112 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 3.27e-01 0.14 0.143 0.12 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 8.71e-01 0.0156 0.0962 0.12 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 5.48e-01 0.0577 0.0958 0.12 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 9.17e-01 0.00867 0.0831 0.12 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -637203 sc-eQTL 1.38e-03 -0.409 0.126 0.12 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0187 0.134 0.12 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 6.13e-01 0.0617 0.122 0.12 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -637180 sc-eQTL 4.33e-01 0.114 0.145 0.12 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0999 0.124 0.12 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0482 0.135 0.115 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 3.52e-01 -0.107 0.115 0.115 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 1.58e-01 0.114 0.0802 0.115 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0945 0.102 0.115 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -637203 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0933 0.13 0.115 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0755 0.0977 0.115 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0571 0.118 0.115 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -637180 sc-eQTL 8.70e-01 0.0235 0.144 0.115 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 3.51e-01 -0.119 0.127 0.115 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0868 0.158 0.107 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 1.98e-01 -0.172 0.133 0.107 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 9.91e-01 0.00137 0.123 0.107 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0597 0.124 0.107 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -637203 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0383 0.122 0.107 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 4.09e-02 0.252 0.122 0.107 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 8.14e-01 0.0318 0.135 0.107 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -637180 sc-eQTL 6.82e-02 0.223 0.121 0.107 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0306 0.126 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 9.27e-03 -0.342 0.13 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 5.65e-01 0.0651 0.113 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 6.66e-01 0.0396 0.0917 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0424 0.121 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0435 0.0797 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 5.80e-03 0.334 0.12 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0615 0.0846 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 1.20e-02 0.337 0.133 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 1.92e-01 -0.166 0.127 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 5.34e-01 0.0743 0.119 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 4.10e-01 0.073 0.0884 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 1.51e-01 -0.186 0.129 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0889 0.0681 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0385 0.102 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 6.35e-01 0.034 0.0714 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0431 0.122 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0628 0.0991 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0409 0.0789 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 7.68e-01 0.0218 0.0739 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0392 0.073 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -637203 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0367 0.13 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 2.05e-01 0.135 0.107 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0402 0.0951 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -637180 sc-eQTL 4.10e-01 0.115 0.139 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0247 0.0875 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 5.54e-01 0.0787 0.133 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0674 0.0929 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 2.36e-01 0.084 0.0707 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 9.81e-01 0.00203 0.0869 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -637203 sc-eQTL 1.87e-03 -0.388 0.123 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0341 0.0785 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 8.91e-01 0.0158 0.115 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -637180 sc-eQTL 4.59e-01 0.103 0.139 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0645 0.116 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -718141 sc-eQTL 1.39e-02 -0.305 0.123 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 835919 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0906 0.087 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 sc-eQTL 5.67e-01 0.062 0.108 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -52051 sc-eQTL 2.85e-02 -0.199 0.0903 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 188154 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0644 0.0794 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -932893 sc-eQTL 1.21e-01 0.161 0.103 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -973377 sc-eQTL 6.40e-01 0.0314 0.0671 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 187135 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0188 0.111 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 eQTL 0.000646 0.109 0.0317 0.0 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -348163 1.25e-06 9.23e-07 3.04e-07 5.92e-07 3.37e-07 4.53e-07 1.26e-06 3.9e-07 1.42e-06 4.48e-07 1.48e-06 6.62e-07 1.95e-06 2.68e-07 4.91e-07 8.19e-07 8.13e-07 6.21e-07 8.01e-07 6.97e-07 6.13e-07 1.36e-06 9.26e-07 6.54e-07 1.95e-06 6.16e-07 8.68e-07 7.19e-07 1.24e-06 1.21e-06 5.77e-07 1.88e-07 1.87e-07 6.95e-07 4.22e-07 4.47e-07 5.53e-07 1.66e-07 3.79e-07 2.48e-07 2.68e-07 1.44e-06 5.94e-08 2.65e-08 2.22e-07 1.17e-07 2.3e-07 7.69e-08 1.68e-07