logo

Genes within 1Mb (chr6:138052921:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0371 0.118 0.1 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0255 0.114 0.1 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 1.32e-01 -0.135 0.0892 0.1 B L1
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 8.35e-01 0.0186 0.0896 0.1 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 8.68e-01 -0.012 0.0722 0.1 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 1.22e-01 -0.156 0.1 0.1 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0708 0.0591 0.1 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0303 0.114 0.1 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00917 0.132 0.1 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 5.16e-02 0.149 0.0763 0.1 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 6.85e-01 0.0359 0.0882 0.1 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 1.58e-01 -0.117 0.0828 0.1 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0573 0.0779 0.1 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 1.65e-01 -0.12 0.0858 0.1 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0551 0.0631 0.1 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 8.26e-01 0.0216 0.0982 0.1 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0968 0.144 0.1 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 1.32e-01 0.133 0.0878 0.1 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 6.21e-01 0.0467 0.0945 0.1 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0172 0.0963 0.1 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 6.28e-01 0.0361 0.0743 0.1 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 1.22e-01 -0.15 0.0967 0.1 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 3.39e-01 0.053 0.0552 0.1 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 6.79e-01 0.0452 0.109 0.1 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0178 0.145 0.095 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 4.73e-01 0.0774 0.108 0.095 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 2.60e-01 -0.115 0.102 0.095 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0508 0.115 0.095 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -639650 sc-eQTL 1.11e-01 0.212 0.132 0.095 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 8.19e-02 -0.204 0.117 0.095 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 2.86e-01 0.123 0.115 0.095 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -639627 sc-eQTL 1.47e-01 0.202 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 7.24e-01 0.0414 0.117 0.095 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0347 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 3.40e-01 0.0874 0.0914 0.1 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0356 0.0743 0.1 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 8.08e-02 0.135 0.0771 0.1 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -639650 sc-eQTL 9.40e-01 0.0106 0.14 0.1 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0196 0.0822 0.1 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 4.65e-01 0.0782 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -639627 sc-eQTL 2.71e-01 0.161 0.146 0.1 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 8.02e-02 0.168 0.0956 0.1 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 8.84e-01 0.0188 0.128 0.099 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 5.35e-01 0.0612 0.0986 0.099 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0691 0.113 0.099 NK L1
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0774 0.0958 0.099 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 8.77e-01 0.0127 0.0821 0.099 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 4.04e-01 0.0881 0.105 0.099 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 3.30e-02 0.164 0.0762 0.099 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0778 0.116 0.099 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 2.64e-01 -0.169 0.151 0.1 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 3.22e-01 0.0911 0.0919 0.1 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0722 0.0975 0.1 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 1.58e-01 0.17 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 1.13e-01 0.0906 0.057 0.1 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 6.28e-01 0.057 0.118 0.1 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 9.40e-01 0.00581 0.0771 0.1 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 3.18e-01 -0.114 0.113 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 4.48e-01 0.128 0.169 0.102 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 2.31e-01 -0.181 0.15 0.102 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 4.24e-01 -0.118 0.148 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0482 0.0768 0.102 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 1.58e-01 -0.21 0.148 0.102 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 3.56e-01 -0.155 0.168 0.102 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0639 0.152 0.102 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 7.36e-01 -0.044 0.13 0.102 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 5.54e-01 0.0869 0.147 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0113 0.136 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00492 0.102 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 1.39e-02 0.317 0.128 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 9.44e-01 0.00711 0.102 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 4.02e-01 -0.115 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0459 0.117 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0677 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 1.17e-01 0.231 0.147 0.101 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 5.84e-01 0.0798 0.146 0.101 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 3.43e-01 -0.105 0.111 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 2.59e-01 -0.156 0.138 0.101 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0289 0.0953 0.101 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 3.66e-01 0.125 0.138 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 5.22e-01 0.0701 0.109 0.101 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 3.44e-01 -0.134 0.141 0.101 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 3.60e-01 -0.128 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 8.15e-01 -0.027 0.115 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0386 0.098 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 8.85e-01 0.0192 0.133 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0538 0.077 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0458 0.112 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 1.09e-02 -0.199 0.0775 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 8.40e-01 0.0244 0.121 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 3.19e-01 0.14 0.14 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 2.85e-01 -0.154 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0755 0.0956 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0508 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0869 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 8.48e-02 -0.216 0.125 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 8.06e-02 -0.161 0.0919 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 6.03e-01 0.0774 0.149 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 5.42e-01 0.0856 0.14 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 7.35e-01 0.0445 0.131 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0631 0.121 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 5.41e-01 0.0902 0.147 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0299 0.0861 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 8.32e-01 0.0293 0.137 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0727 0.125 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0711 0.134 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0242 0.139 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 6.13e-02 0.137 0.0726 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 9.99e-01 9.94e-05 0.0864 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 7.87e-01 0.0309 0.114 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 7.36e-01 -0.027 0.08 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0857 0.0953 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0525 0.0642 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 9.66e-01 0.00446 0.104 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0701 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0672 0.103 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 2.69e-01 0.112 0.101 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 1.85e-01 -0.169 0.127 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0694 0.0738 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 2.37e-01 -0.122 0.103 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0224 0.0796 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 8.96e-01 0.0136 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00378 0.153 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 5.50e-02 0.222 0.115 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 9.18e-01 0.0108 0.104 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0672 0.121 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0858 0.0767 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0105 0.13 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 2.75e-01 -0.101 0.0922 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 4.37e-01 0.0958 0.123 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 3.33e-01 -0.152 0.156 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 7.38e-01 0.0353 0.105 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0916 0.112 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 2.73e-01 -0.153 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 5.52e-02 0.17 0.0879 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 2.75e-01 -0.133 0.122 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 9.63e-02 0.164 0.098 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0235 0.125 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0105 0.147 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 4.13e-01 0.0842 0.103 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 5.57e-01 0.0554 0.0941 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00242 0.113 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0811 0.0802 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 3.26e-01 -0.112 0.114 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0324 0.0598 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 3.13e-01 0.12 0.119 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 2.21e-01 -0.201 0.163 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0468 0.135 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 9.16e-01 0.0122 0.115 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 1.47e-01 0.221 0.151 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0105 0.0734 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 1.46e-02 -0.303 0.123 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 2.33e-01 -0.148 0.124 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 1.66e-01 0.186 0.134 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 3.65e-01 0.136 0.15 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 5.47e-01 0.0782 0.13 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 2.82e-01 -0.147 0.136 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 7.13e-01 0.0572 0.155 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 6.98e-02 0.173 0.0949 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 4.36e-01 0.114 0.146 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 7.45e-01 0.0367 0.112 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 7.18e-01 0.0513 0.142 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0641 0.166 0.097 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 2.86e-01 0.115 0.108 0.097 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 3.19e-01 -0.115 0.115 0.097 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 6.75e-01 0.0641 0.153 0.097 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 3.41e-01 0.0692 0.0725 0.097 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 5.16e-01 0.0886 0.136 0.097 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0205 0.1 0.097 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0884 0.134 0.097 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 1.76e-01 0.197 0.145 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 2.77e-01 0.124 0.114 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 2.36e-01 -0.147 0.124 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 4.18e-01 -0.108 0.133 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 8.17e-01 0.0196 0.0848 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 4.38e-02 0.248 0.122 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00635 0.114 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0948 0.135 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 1.10e-01 -0.221 0.138 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0342 0.0912 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 2.96e-01 -0.129 0.123 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0354 0.11 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 8.88e-01 0.0122 0.0859 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 6.18e-01 0.0565 0.113 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 6.82e-02 0.139 0.0761 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 1.15e-01 -0.203 0.128 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 5.13e-01 0.103 0.158 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 8.17e-01 0.0269 0.116 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 4.46e-01 -0.103 0.134 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000428 0.12 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 7.02e-01 0.0352 0.0919 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 9.19e-01 0.0148 0.146 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 1.76e-01 0.162 0.119 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0363 0.148 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 4.16e-01 0.114 0.14 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 3.66e-01 0.0855 0.0945 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 3.67e-01 0.109 0.121 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 4.25e-01 0.0899 0.113 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0239 0.0845 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 1.53e-01 -0.178 0.124 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 1.84e-01 0.107 0.0801 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 3.97e-01 0.108 0.127 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 3.82e-01 -0.149 0.17 0.104 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 6.29e-01 0.087 0.18 0.104 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 6.91e-01 0.0602 0.151 0.104 PB L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0438 0.115 0.104 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0581 0.14 0.104 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0677 0.164 0.104 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0569 0.115 0.104 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 3.84e-01 -0.146 0.167 0.104 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 4.50e-01 -0.117 0.154 0.098 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 2.82e-01 0.127 0.118 0.098 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 2.23e-01 0.15 0.123 0.098 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 1.48e-01 0.165 0.113 0.098 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 1.03e-01 0.117 0.0714 0.098 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 1.80e-01 -0.192 0.143 0.098 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 8.80e-01 0.0139 0.0925 0.098 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 4.24e-01 0.111 0.139 0.098 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 4.47e-01 0.113 0.148 0.1 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 2.84e-02 0.305 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0224 0.101 0.1 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 7.42e-02 -0.284 0.158 0.1 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 7.22e-01 0.0316 0.0888 0.1 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00724 0.128 0.1 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0481 0.109 0.1 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 5.78e-01 0.0753 0.135 0.1 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 7.05e-01 0.0568 0.15 0.088 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0104 0.122 0.088 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0619 0.107 0.088 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0781 0.12 0.088 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -639650 sc-eQTL 7.73e-01 0.0402 0.14 0.088 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 1.85e-01 -0.213 0.16 0.088 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 8.34e-01 0.0277 0.132 0.088 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -639627 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00692 0.154 0.088 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00298 0.157 0.088 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 6.61e-01 -0.051 0.116 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 2.97e-01 0.0883 0.0844 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 3.95e-01 -0.071 0.0833 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 1.02e-01 0.149 0.0906 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -639650 sc-eQTL 2.75e-01 -0.152 0.139 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 2.82e-02 -0.273 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 8.57e-01 0.0189 0.105 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -639627 sc-eQTL 5.66e-01 0.0841 0.146 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 1.03e-01 0.158 0.0967 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0923 0.134 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 4.77e-01 0.0701 0.0983 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0326 0.0916 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 4.28e-02 0.177 0.0866 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -639650 sc-eQTL 8.96e-01 0.0187 0.143 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 6.28e-01 0.0658 0.136 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 1.93e-01 0.153 0.118 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -639627 sc-eQTL 6.02e-01 0.0821 0.157 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 3.24e-01 0.124 0.125 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 6.14e-01 0.0893 0.177 0.1 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 1.89e-01 0.186 0.141 0.1 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0178 0.169 0.1 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 8.34e-01 0.0329 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0324 0.087 0.1 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 4.59e-01 -0.129 0.173 0.1 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 1.46e-01 -0.19 0.13 0.1 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 3.49e-01 0.148 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 1.56e-01 0.216 0.152 0.1 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 2.54e-01 0.117 0.102 0.1 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0361 0.102 0.1 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 4.82e-01 0.0625 0.0886 0.1 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -639650 sc-eQTL 9.91e-01 0.00153 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 3.42e-01 -0.135 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 3.04e-01 0.134 0.13 0.1 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -639627 sc-eQTL 4.56e-01 0.116 0.155 0.1 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 7.65e-01 0.0395 0.132 0.1 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 6.30e-01 0.0747 0.155 0.095 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 5.72e-01 0.0746 0.132 0.095 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 2.06e-01 -0.117 0.0921 0.095 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 1.77e-01 0.158 0.116 0.095 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -639650 sc-eQTL 9.95e-01 0.000914 0.149 0.095 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0438 0.112 0.095 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0396 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -639627 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0278 0.165 0.095 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 8.97e-01 0.0189 0.146 0.095 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 5.70e-01 0.0959 0.168 0.088 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 7.11e-01 0.0531 0.143 0.088 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0334 0.131 0.088 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 3.39e-01 -0.127 0.132 0.088 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -639650 sc-eQTL 1.08e-01 0.209 0.129 0.088 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 7.77e-01 0.0376 0.132 0.088 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 7.36e-02 0.258 0.143 0.088 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -639627 sc-eQTL 1.42e-01 0.192 0.13 0.088 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 4.39e-01 0.104 0.134 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 4.26e-01 0.113 0.141 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 8.75e-01 0.0191 0.121 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0673 0.0979 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 7.36e-01 0.0435 0.129 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0117 0.0853 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0472 0.131 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 2.34e-01 0.108 0.0902 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 1.97e-01 -0.186 0.144 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0577 0.13 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0643 0.122 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0521 0.0903 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0381 0.133 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0274 0.0697 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 2.28e-01 -0.125 0.104 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 4.82e-03 -0.204 0.0715 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 6.37e-01 0.0586 0.124 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0794 0.107 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 3.41e-01 0.0812 0.0851 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0549 0.0798 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 5.10e-02 0.153 0.0782 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -639650 sc-eQTL 5.36e-01 -0.087 0.14 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0919 0.115 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 5.33e-01 0.0642 0.103 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -639627 sc-eQTL 7.10e-01 0.0561 0.151 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 1.23e-01 0.146 0.094 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 8.51e-01 0.0276 0.147 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00918 0.103 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0645 0.0785 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 6.86e-01 0.0389 0.0962 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -639650 sc-eQTL 4.97e-01 0.0949 0.14 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0258 0.087 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0236 0.127 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -639627 sc-eQTL 2.30e-01 0.185 0.154 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 3.90e-01 0.111 0.129 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -720588 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0329 0.134 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0129 0.0934 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -350610 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0425 0.116 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -54498 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0508 0.0976 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 185707 sc-eQTL 7.87e-01 0.023 0.0851 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -935340 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0115 0.111 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -975824 sc-eQTL 3.51e-02 0.151 0.0711 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 184688 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0623 0.119 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 833472 eQTL 0.0611 -0.0429 0.0229 0.00477 0.0 0.0967
ENSG00000220412 AL356234.1 345720 eQTL 0.0296 -0.0887 0.0407 0.00162 0.0 0.0967
ENSG00000237499 AL357060.1 184688 eQTL 0.0605 -0.0397 0.0211 0.00104 0.0 0.0967

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -350610 1.41e-05 9.38e-06 7.74e-06 5.52e-06 2.21e-06 5.43e-06 1.03e-05 1.01e-06 7.74e-06 3.25e-06 8.9e-06 4.92e-06 1.2e-05 3.9e-06 2.94e-06 4.82e-06 4.17e-06 4.19e-06 2.72e-06 2.41e-06 5.94e-06 8.49e-06 1.03e-05 2.03e-06 1.65e-05 2.92e-06 3.51e-06 1.78e-06 1.15e-05 7.93e-06 4.13e-06 5.43e-07 5.4e-07 2.91e-06 3.88e-06 2.28e-06 1.57e-06 1.6e-06 9.42e-07 5.31e-07 4.51e-07 1.93e-05 2.95e-06 2.01e-07 6.94e-07 1.73e-06 1.14e-06 7.76e-07 4.73e-07
ENSG00000237499 AL357060.1 184688 3.39e-05 1.81e-05 1.15e-05 8.5e-06 2.5e-06 7.21e-06 2.09e-05 1.81e-06 1.44e-05 6.13e-06 1.6e-05 7.63e-06 2.52e-05 6.03e-06 5.13e-06 8.68e-06 1.02e-05 1.05e-05 5.8e-06 3.61e-06 8.21e-06 1.58e-05 2.13e-05 3.69e-06 3.13e-05 4.75e-06 7.68e-06 4.51e-06 1.93e-05 1.63e-05 7.68e-06 5.87e-07 1.07e-06 4e-06 7.58e-06 3.41e-06 1.77e-06 2e-06 2.18e-06 1.01e-06 9.75e-07 3.92e-05 4.93e-06 3.33e-07 2.05e-06 2.75e-06 1.8e-06 8.94e-07 6.34e-07