logo

Genes within 1Mb (chr6:138052423:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0371 0.118 0.1 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0255 0.114 0.1 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 1.32e-01 -0.135 0.0892 0.1 B L1
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 8.35e-01 0.0186 0.0896 0.1 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 8.68e-01 -0.012 0.0722 0.1 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 1.22e-01 -0.156 0.1 0.1 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0708 0.0591 0.1 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0303 0.114 0.1 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00917 0.132 0.1 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 5.16e-02 0.149 0.0763 0.1 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 6.85e-01 0.0359 0.0882 0.1 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 1.58e-01 -0.117 0.0828 0.1 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0573 0.0779 0.1 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 1.65e-01 -0.12 0.0858 0.1 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0551 0.0631 0.1 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 8.26e-01 0.0216 0.0982 0.1 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0968 0.144 0.1 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 1.32e-01 0.133 0.0878 0.1 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 6.21e-01 0.0467 0.0945 0.1 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0172 0.0963 0.1 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 6.28e-01 0.0361 0.0743 0.1 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 1.22e-01 -0.15 0.0967 0.1 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 3.39e-01 0.053 0.0552 0.1 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 6.79e-01 0.0452 0.109 0.1 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0178 0.145 0.095 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 4.73e-01 0.0774 0.108 0.095 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 2.60e-01 -0.115 0.102 0.095 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0508 0.115 0.095 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -640148 sc-eQTL 1.11e-01 0.212 0.132 0.095 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 8.19e-02 -0.204 0.117 0.095 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 2.86e-01 0.123 0.115 0.095 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -640125 sc-eQTL 1.47e-01 0.202 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 7.24e-01 0.0414 0.117 0.095 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0347 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 3.40e-01 0.0874 0.0914 0.1 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0356 0.0743 0.1 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 8.08e-02 0.135 0.0771 0.1 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -640148 sc-eQTL 9.40e-01 0.0106 0.14 0.1 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0196 0.0822 0.1 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 4.65e-01 0.0782 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -640125 sc-eQTL 2.71e-01 0.161 0.146 0.1 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 8.02e-02 0.168 0.0956 0.1 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 8.84e-01 0.0188 0.128 0.099 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 5.35e-01 0.0612 0.0986 0.099 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0691 0.113 0.099 NK L1
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0774 0.0958 0.099 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 8.77e-01 0.0127 0.0821 0.099 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 4.04e-01 0.0881 0.105 0.099 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 3.30e-02 0.164 0.0762 0.099 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0778 0.116 0.099 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 2.64e-01 -0.169 0.151 0.1 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 3.22e-01 0.0911 0.0919 0.1 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0722 0.0975 0.1 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 1.58e-01 0.17 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 1.13e-01 0.0906 0.057 0.1 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 6.28e-01 0.057 0.118 0.1 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 9.40e-01 0.00581 0.0771 0.1 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 3.18e-01 -0.114 0.113 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 4.48e-01 0.128 0.169 0.102 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 2.31e-01 -0.181 0.15 0.102 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 4.24e-01 -0.118 0.148 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0482 0.0768 0.102 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 1.58e-01 -0.21 0.148 0.102 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 3.56e-01 -0.155 0.168 0.102 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0639 0.152 0.102 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 7.36e-01 -0.044 0.13 0.102 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 5.54e-01 0.0869 0.147 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0113 0.136 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00492 0.102 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 1.39e-02 0.317 0.128 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 9.44e-01 0.00711 0.102 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 4.02e-01 -0.115 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0459 0.117 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0677 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 1.17e-01 0.231 0.147 0.101 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 5.84e-01 0.0798 0.146 0.101 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 3.43e-01 -0.105 0.111 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 2.59e-01 -0.156 0.138 0.101 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0289 0.0953 0.101 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 3.66e-01 0.125 0.138 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 5.22e-01 0.0701 0.109 0.101 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 3.44e-01 -0.134 0.141 0.101 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 3.60e-01 -0.128 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 8.15e-01 -0.027 0.115 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0386 0.098 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 8.85e-01 0.0192 0.133 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0538 0.077 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0458 0.112 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 1.09e-02 -0.199 0.0775 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 8.40e-01 0.0244 0.121 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 3.19e-01 0.14 0.14 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 2.85e-01 -0.154 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0755 0.0956 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0508 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0869 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 8.48e-02 -0.216 0.125 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 8.06e-02 -0.161 0.0919 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 6.03e-01 0.0774 0.149 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 5.42e-01 0.0856 0.14 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 7.35e-01 0.0445 0.131 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0631 0.121 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 5.41e-01 0.0902 0.147 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0299 0.0861 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 8.32e-01 0.0293 0.137 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0727 0.125 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0711 0.134 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0242 0.139 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 6.13e-02 0.137 0.0726 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 9.99e-01 9.94e-05 0.0864 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 7.87e-01 0.0309 0.114 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 7.36e-01 -0.027 0.08 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0857 0.0953 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0525 0.0642 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 9.66e-01 0.00446 0.104 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0701 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0672 0.103 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 2.69e-01 0.112 0.101 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 1.85e-01 -0.169 0.127 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0694 0.0738 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 2.37e-01 -0.122 0.103 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0224 0.0796 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 8.96e-01 0.0136 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00378 0.153 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 5.50e-02 0.222 0.115 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 9.18e-01 0.0108 0.104 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0672 0.121 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0858 0.0767 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0105 0.13 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 2.75e-01 -0.101 0.0922 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 4.37e-01 0.0958 0.123 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 3.33e-01 -0.152 0.156 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 7.38e-01 0.0353 0.105 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0916 0.112 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 2.73e-01 -0.153 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 5.52e-02 0.17 0.0879 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 2.75e-01 -0.133 0.122 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 9.63e-02 0.164 0.098 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0235 0.125 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0105 0.147 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 4.13e-01 0.0842 0.103 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 5.57e-01 0.0554 0.0941 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00242 0.113 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0811 0.0802 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 3.26e-01 -0.112 0.114 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0324 0.0598 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 3.13e-01 0.12 0.119 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 2.21e-01 -0.201 0.163 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0468 0.135 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 9.16e-01 0.0122 0.115 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 1.47e-01 0.221 0.151 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0105 0.0734 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 1.46e-02 -0.303 0.123 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 2.33e-01 -0.148 0.124 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 1.66e-01 0.186 0.134 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 3.65e-01 0.136 0.15 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 5.47e-01 0.0782 0.13 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 2.82e-01 -0.147 0.136 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 7.13e-01 0.0572 0.155 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 6.98e-02 0.173 0.0949 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 4.36e-01 0.114 0.146 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 7.45e-01 0.0367 0.112 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 7.18e-01 0.0513 0.142 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0641 0.166 0.097 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 2.86e-01 0.115 0.108 0.097 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 3.19e-01 -0.115 0.115 0.097 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 6.75e-01 0.0641 0.153 0.097 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 3.41e-01 0.0692 0.0725 0.097 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 5.16e-01 0.0886 0.136 0.097 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0205 0.1 0.097 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0884 0.134 0.097 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 1.76e-01 0.197 0.145 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 2.77e-01 0.124 0.114 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 2.36e-01 -0.147 0.124 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 4.18e-01 -0.108 0.133 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 8.17e-01 0.0196 0.0848 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 4.38e-02 0.248 0.122 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00635 0.114 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0948 0.135 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 1.10e-01 -0.221 0.138 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0342 0.0912 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 2.96e-01 -0.129 0.123 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0354 0.11 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 8.88e-01 0.0122 0.0859 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 6.18e-01 0.0565 0.113 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 6.82e-02 0.139 0.0761 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 1.15e-01 -0.203 0.128 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 5.13e-01 0.103 0.158 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 8.17e-01 0.0269 0.116 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 4.46e-01 -0.103 0.134 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000428 0.12 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 7.02e-01 0.0352 0.0919 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 9.19e-01 0.0148 0.146 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 1.76e-01 0.162 0.119 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0363 0.148 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 4.16e-01 0.114 0.14 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 3.66e-01 0.0855 0.0945 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 3.67e-01 0.109 0.121 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 4.25e-01 0.0899 0.113 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0239 0.0845 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 1.53e-01 -0.178 0.124 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 1.84e-01 0.107 0.0801 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 3.97e-01 0.108 0.127 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 3.82e-01 -0.149 0.17 0.104 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 6.29e-01 0.087 0.18 0.104 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 6.91e-01 0.0602 0.151 0.104 PB L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0438 0.115 0.104 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0581 0.14 0.104 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0677 0.164 0.104 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0569 0.115 0.104 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 3.84e-01 -0.146 0.167 0.104 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 4.50e-01 -0.117 0.154 0.098 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 2.82e-01 0.127 0.118 0.098 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 2.23e-01 0.15 0.123 0.098 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 1.48e-01 0.165 0.113 0.098 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 1.03e-01 0.117 0.0714 0.098 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 1.80e-01 -0.192 0.143 0.098 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 8.80e-01 0.0139 0.0925 0.098 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 4.24e-01 0.111 0.139 0.098 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 4.47e-01 0.113 0.148 0.1 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 2.84e-02 0.305 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0224 0.101 0.1 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 7.42e-02 -0.284 0.158 0.1 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 7.22e-01 0.0316 0.0888 0.1 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00724 0.128 0.1 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0481 0.109 0.1 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 5.78e-01 0.0753 0.135 0.1 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 7.05e-01 0.0568 0.15 0.088 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0104 0.122 0.088 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0619 0.107 0.088 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0781 0.12 0.088 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -640148 sc-eQTL 7.73e-01 0.0402 0.14 0.088 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 1.85e-01 -0.213 0.16 0.088 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 8.34e-01 0.0277 0.132 0.088 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -640125 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00692 0.154 0.088 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00298 0.157 0.088 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 6.61e-01 -0.051 0.116 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 2.97e-01 0.0883 0.0844 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 3.95e-01 -0.071 0.0833 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 1.02e-01 0.149 0.0906 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -640148 sc-eQTL 2.75e-01 -0.152 0.139 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 2.82e-02 -0.273 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 8.57e-01 0.0189 0.105 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -640125 sc-eQTL 5.66e-01 0.0841 0.146 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 1.03e-01 0.158 0.0967 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0923 0.134 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 4.77e-01 0.0701 0.0983 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0326 0.0916 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 4.28e-02 0.177 0.0866 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -640148 sc-eQTL 8.96e-01 0.0187 0.143 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 6.28e-01 0.0658 0.136 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 1.93e-01 0.153 0.118 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -640125 sc-eQTL 6.02e-01 0.0821 0.157 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 3.24e-01 0.124 0.125 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 6.14e-01 0.0893 0.177 0.1 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 1.89e-01 0.186 0.141 0.1 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0178 0.169 0.1 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 8.34e-01 0.0329 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0324 0.087 0.1 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 4.59e-01 -0.129 0.173 0.1 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 1.46e-01 -0.19 0.13 0.1 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 3.49e-01 0.148 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 1.56e-01 0.216 0.152 0.1 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 2.54e-01 0.117 0.102 0.1 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0361 0.102 0.1 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 4.82e-01 0.0625 0.0886 0.1 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -640148 sc-eQTL 9.91e-01 0.00153 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 3.42e-01 -0.135 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 3.04e-01 0.134 0.13 0.1 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -640125 sc-eQTL 4.56e-01 0.116 0.155 0.1 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 7.65e-01 0.0395 0.132 0.1 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 6.30e-01 0.0747 0.155 0.095 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 5.72e-01 0.0746 0.132 0.095 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 2.06e-01 -0.117 0.0921 0.095 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 1.77e-01 0.158 0.116 0.095 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -640148 sc-eQTL 9.95e-01 0.000914 0.149 0.095 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0438 0.112 0.095 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0396 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -640125 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0278 0.165 0.095 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 8.97e-01 0.0189 0.146 0.095 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 5.70e-01 0.0959 0.168 0.088 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 7.11e-01 0.0531 0.143 0.088 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0334 0.131 0.088 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 3.39e-01 -0.127 0.132 0.088 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -640148 sc-eQTL 1.08e-01 0.209 0.129 0.088 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 7.77e-01 0.0376 0.132 0.088 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 7.36e-02 0.258 0.143 0.088 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -640125 sc-eQTL 1.42e-01 0.192 0.13 0.088 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 4.39e-01 0.104 0.134 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 4.26e-01 0.113 0.141 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 8.75e-01 0.0191 0.121 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0673 0.0979 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 7.36e-01 0.0435 0.129 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0117 0.0853 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0472 0.131 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 2.34e-01 0.108 0.0902 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 1.97e-01 -0.186 0.144 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0577 0.13 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0643 0.122 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0521 0.0903 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0381 0.133 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0274 0.0697 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 2.28e-01 -0.125 0.104 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 4.82e-03 -0.204 0.0715 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 6.37e-01 0.0586 0.124 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0794 0.107 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 3.41e-01 0.0812 0.0851 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0549 0.0798 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 5.10e-02 0.153 0.0782 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -640148 sc-eQTL 5.36e-01 -0.087 0.14 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0919 0.115 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 5.33e-01 0.0642 0.103 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -640125 sc-eQTL 7.10e-01 0.0561 0.151 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 1.23e-01 0.146 0.094 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 8.51e-01 0.0276 0.147 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00918 0.103 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0645 0.0785 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 6.86e-01 0.0389 0.0962 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -640148 sc-eQTL 4.97e-01 0.0949 0.14 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0258 0.087 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0236 0.127 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -640125 sc-eQTL 2.30e-01 0.185 0.154 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 3.90e-01 0.111 0.129 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -721086 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0329 0.134 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0129 0.0934 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0425 0.116 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -54996 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0508 0.0976 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 185209 sc-eQTL 7.87e-01 0.023 0.0851 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -935838 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0115 0.111 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -976322 sc-eQTL 3.51e-02 0.151 0.0711 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 184190 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0623 0.119 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 832974 eQTL 0.0588 -0.0433 0.0229 0.00546 0.0 0.0972
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 eQTL 0.0473 -0.0646 0.0325 0.0 0.0 0.0972
ENSG00000220412 AL356234.1 345222 eQTL 0.0353 -0.0857 0.0407 0.00144 0.0 0.0972

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -351108 2.91e-06 9.03e-07 1.96e-07 3.16e-07 1.07e-07 5.26e-07 6.51e-07 7.46e-08 8.61e-07 2.98e-07 9.46e-07 5.95e-07 1.58e-06 1.97e-07 5.28e-07 2.36e-07 8.74e-08 5.16e-07 3.64e-07 3.11e-07 1.91e-07 8.19e-07 7.08e-07 1.03e-07 1.79e-06 2.6e-07 2.72e-07 2.57e-07 5.7e-07 9.25e-07 5.1e-07 3.87e-08 5.64e-08 6.68e-07 3.67e-07 6.83e-08 1.23e-07 1.26e-07 6.58e-08 7.65e-08 4.58e-08 9.58e-07 3.77e-07 1.78e-07 3.87e-08 1.11e-07 8.93e-08 2.8e-09 4.83e-08
ENSG00000237499 \N 184190 4.58e-06 2.16e-06 2.32e-07 1.27e-06 3.4e-07 8.24e-07 1.44e-06 2.74e-07 1.74e-06 6.98e-07 2.01e-06 1.49e-06 2.84e-06 5.06e-07 9.86e-07 9.51e-07 7.7e-07 1.18e-06 5.55e-07 5.44e-07 8.02e-07 2.19e-06 1.64e-06 5.82e-07 2.61e-06 6.01e-07 8.99e-07 7.59e-07 1.63e-06 1.32e-06 8.36e-07 6.04e-08 1.34e-07 1.33e-06 6.01e-07 4.74e-07 6.77e-07 2.88e-07 3.6e-07 8.98e-08 8.42e-08 1.8e-06 2.39e-06 1.59e-07 1.84e-07 3.08e-07 1.3e-07 4.91e-08 5.47e-08