logo

Genes within 1Mb (chr6:138049796:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 1.44e-02 -0.275 0.111 0.115 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 2.23e-01 0.134 0.11 0.115 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 2.72e-01 0.0947 0.086 0.115 B L1
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 8.88e-01 0.0122 0.0861 0.115 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0865 0.0691 0.115 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 3.08e-01 0.0991 0.0969 0.115 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 2.56e-01 0.0647 0.0569 0.115 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0357 0.109 0.115 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 4.28e-02 -0.256 0.126 0.115 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 3.80e-01 0.0651 0.074 0.115 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 8.22e-01 0.0191 0.0851 0.115 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0859 0.08 0.115 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 1.33e-01 -0.113 0.0748 0.115 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 6.06e-01 0.0429 0.083 0.115 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 1.04e-01 0.0988 0.0606 0.115 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0375 0.0946 0.115 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 9.11e-04 -0.44 0.131 0.115 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 3.80e-01 0.0722 0.082 0.115 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0116 0.088 0.115 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 2.63e-01 -0.1 0.0893 0.115 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0317 0.0691 0.115 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 6.26e-01 0.0442 0.0904 0.115 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.34e-02 0.0992 0.051 0.115 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 3.10e-01 -0.103 0.101 0.115 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 2.04e-01 -0.173 0.136 0.117 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 6.87e-01 0.0408 0.101 0.117 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0141 0.0957 0.117 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0777 0.108 0.117 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -642775 sc-eQTL 9.74e-03 -0.32 0.123 0.117 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 2.35e-02 0.249 0.109 0.117 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 6.95e-01 0.0425 0.108 0.117 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -642752 sc-eQTL 8.66e-01 0.022 0.131 0.117 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00447 0.11 0.117 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0349 0.0992 0.115 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0554 0.0845 0.115 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 7.70e-01 0.0201 0.0686 0.115 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0418 0.0717 0.115 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -642775 sc-eQTL 1.87e-01 -0.171 0.129 0.115 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 2.55e-01 0.0863 0.0757 0.115 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0697 0.0987 0.115 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -642752 sc-eQTL 3.58e-01 0.124 0.135 0.115 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0586 0.0888 0.115 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 1.03e-02 -0.306 0.118 0.116 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 1.25e-01 -0.142 0.0919 0.116 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 7.91e-01 0.0281 0.106 0.116 NK L1
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 2.48e-02 -0.201 0.0888 0.116 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0588 0.0768 0.116 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 9.12e-02 0.167 0.0982 0.116 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00122 0.0722 0.116 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0659 0.109 0.116 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 5.42e-01 0.0866 0.142 0.115 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 2.04e-01 -0.11 0.086 0.115 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 9.54e-02 0.152 0.091 0.115 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 2.47e-01 -0.131 0.113 0.115 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0488 0.0537 0.115 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0322 0.11 0.115 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0177 0.0723 0.115 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 2.75e-01 -0.116 0.106 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 5.89e-01 0.0882 0.163 0.115 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 2.03e-02 -0.336 0.143 0.115 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 6.09e-02 -0.267 0.141 0.115 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0459 0.0741 0.115 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 2.83e-01 0.154 0.143 0.115 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 1.23e-01 0.25 0.161 0.115 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0428 0.147 0.115 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 3.57e-01 -0.116 0.125 0.115 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 3.44e-02 -0.294 0.138 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 3.60e-02 0.27 0.128 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 7.76e-01 0.0276 0.0967 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 4.02e-02 -0.252 0.122 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 8.07e-01 0.0236 0.0966 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 4.38e-01 0.101 0.13 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 3.18e-01 0.111 0.111 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 3.79e-01 0.121 0.137 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 8.90e-02 -0.244 0.143 0.114 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000829 0.142 0.114 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 8.99e-01 0.0138 0.108 0.114 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 9.13e-01 0.0149 0.135 0.114 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 9.65e-01 0.00405 0.093 0.114 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 1.65e-01 0.187 0.134 0.114 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 3.27e-01 -0.105 0.107 0.114 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 2.36e-02 0.312 0.137 0.114 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 3.45e-01 -0.129 0.136 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 3.40e-01 0.108 0.112 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 9.48e-01 0.00627 0.0958 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 2.53e-01 -0.148 0.13 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0318 0.0753 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0696 0.11 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 6.01e-01 0.0402 0.0769 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 3.62e-01 0.108 0.118 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0687 0.133 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0883 0.137 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 1.77e-02 0.215 0.0898 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 3.12e-01 -0.11 0.109 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 2.39e-01 -0.129 0.109 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 6.65e-01 0.0519 0.119 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 8.35e-01 0.0184 0.088 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 1.60e-01 -0.198 0.141 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0711 0.14 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 4.12e-01 -0.108 0.131 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 5.41e-01 0.074 0.121 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 9.27e-01 0.0136 0.147 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 8.34e-01 0.0181 0.0859 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 5.72e-01 0.0776 0.137 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 2.65e-02 0.276 0.123 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 3.20e-01 -0.133 0.133 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0488 0.132 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 9.75e-01 0.0022 0.0698 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 5.24e-01 0.0525 0.0823 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0474 0.109 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0756 0.0762 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 8.77e-01 0.0141 0.0911 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 2.46e-01 0.0711 0.0611 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 9.55e-01 0.00562 0.0989 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 4.61e-03 -0.357 0.125 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 9.60e-02 0.159 0.095 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 9.76e-01 0.00283 0.0946 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0887 0.119 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0719 0.0688 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0103 0.0964 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 8.40e-01 0.015 0.0742 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 1.08e-01 -0.155 0.096 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 2.49e-01 -0.168 0.146 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0632 0.111 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 6.00e-01 0.0522 0.0995 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0119 0.116 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 3.07e-01 -0.075 0.0733 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0271 0.124 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0557 0.0882 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0898 0.118 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 9.30e-04 -0.481 0.143 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 5.12e-01 0.0651 0.0991 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 5.87e-01 0.0572 0.105 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 3.48e-01 -0.123 0.131 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0542 0.0833 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 3.15e-01 0.115 0.114 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 4.41e-01 0.0715 0.0927 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0452 0.117 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 4.78e-01 -0.101 0.143 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00226 0.0996 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 9.13e-01 -0.01 0.0912 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0498 0.11 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0495 0.0778 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0466 0.11 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 4.93e-01 0.0398 0.0579 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 1.11e-02 -0.29 0.113 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 5.30e-02 -0.322 0.166 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 2.85e-01 -0.148 0.138 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 3.43e-01 -0.111 0.117 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0501 0.155 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 3.36e-01 0.072 0.0746 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00913 0.127 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 1.06e-01 0.205 0.126 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 1.74e-01 -0.186 0.136 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0702 0.149 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 3.53e-01 -0.12 0.129 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 5.78e-01 0.0753 0.135 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 4.94e-01 -0.106 0.154 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 6.28e-01 0.0461 0.095 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 7.04e-02 -0.262 0.144 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 4.77e-01 0.0796 0.112 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 5.72e-01 0.0799 0.141 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 7.28e-01 0.0544 0.156 0.117 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 1.76e-02 -0.239 0.0999 0.117 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 1.98e-02 0.251 0.107 0.117 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 8.43e-02 -0.247 0.142 0.117 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0668 0.068 0.117 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 8.21e-01 0.029 0.128 0.117 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.12e-01 0.0617 0.0938 0.117 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 1.58e-01 -0.178 0.125 0.117 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0544 0.146 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 2.06e-01 -0.145 0.114 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 3.79e-01 -0.11 0.124 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 3.48e-01 0.125 0.133 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0756 0.0849 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 7.95e-01 0.0322 0.124 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 6.31e-01 0.0549 0.114 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 5.33e-02 -0.261 0.134 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 3.07e-01 -0.133 0.13 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0955 0.0853 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 3.65e-01 0.105 0.115 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 4.35e-03 -0.293 0.102 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0804 0.0804 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 3.57e-01 0.0978 0.106 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000264 0.0719 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0307 0.121 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 1.98e-01 -0.2 0.155 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 2.89e-01 -0.121 0.114 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0136 0.132 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00223 0.118 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 1.02e-01 -0.148 0.0899 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 6.63e-01 0.0626 0.143 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.07e-01 0.0783 0.118 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0946 0.146 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 5.82e-02 -0.258 0.136 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0891 0.092 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 1.80e-01 0.158 0.117 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 2.25e-01 -0.133 0.109 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0252 0.0823 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 7.10e-01 0.0452 0.122 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.32e-01 -0.049 0.0783 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0749 0.124 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 5.27e-01 -0.102 0.16 0.13 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 1.42e-02 0.412 0.165 0.13 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 2.28e-02 0.322 0.14 0.13 PB L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 1.12e-01 -0.172 0.108 0.13 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 4.43e-02 -0.264 0.13 0.13 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 9.53e-02 0.258 0.153 0.13 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.95e-01 0.0579 0.109 0.13 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 1.23e-01 -0.243 0.157 0.13 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 2.58e-01 0.169 0.149 0.113 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0571 0.114 0.113 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 2.73e-01 0.131 0.119 0.113 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 9.71e-01 0.00406 0.11 0.113 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 7.61e-02 -0.123 0.0689 0.113 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 3.76e-01 -0.123 0.138 0.113 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0791 0.0893 0.113 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 1.28e-01 -0.205 0.134 0.113 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 5.00e-02 -0.269 0.137 0.115 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 1.62e-01 -0.181 0.129 0.115 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 7.39e-01 0.0314 0.0942 0.115 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 7.94e-01 0.0387 0.148 0.115 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0589 0.0824 0.115 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 5.71e-02 -0.225 0.118 0.115 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0259 0.101 0.115 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0872 0.126 0.115 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 2.81e-01 -0.147 0.136 0.117 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0483 0.111 0.117 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0102 0.0975 0.117 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0768 0.109 0.117 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642775 sc-eQTL 3.77e-03 -0.363 0.124 0.117 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 7.11e-01 0.0541 0.146 0.117 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 9.87e-01 0.00198 0.119 0.117 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642752 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0844 0.14 0.117 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 5.74e-01 0.08 0.142 0.117 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 3.19e-01 -0.107 0.107 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00118 0.0784 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 8.25e-01 0.0171 0.0773 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0239 0.0844 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642775 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0252 0.129 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 8.21e-01 0.0261 0.116 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0276 0.0972 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642752 sc-eQTL 2.27e-01 0.164 0.135 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0104 0.0901 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0048 0.125 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0293 0.0915 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 6.79e-01 0.0353 0.0852 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0354 0.0813 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642775 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0582 0.133 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 5.08e-02 0.246 0.125 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0683 0.11 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642752 sc-eQTL 4.67e-01 0.106 0.146 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0248 0.117 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0504 0.175 0.109 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 3.20e-02 -0.299 0.138 0.109 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 5.68e-01 0.0955 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 9.55e-01 0.00876 0.155 0.109 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 7.57e-01 0.0268 0.0863 0.109 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 6.92e-01 0.0685 0.172 0.109 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.36e-01 0.0804 0.13 0.109 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 4.45e-01 -0.12 0.156 0.109 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 3.41e-01 0.137 0.143 0.118 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 7.95e-01 0.0252 0.0967 0.118 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 4.74e-01 0.0692 0.0963 0.118 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 9.11e-01 0.00933 0.0835 0.118 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642775 sc-eQTL 4.46e-04 -0.45 0.126 0.118 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0234 0.134 0.118 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.99e-01 0.0646 0.122 0.118 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642752 sc-eQTL 4.91e-01 0.1 0.146 0.118 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 3.21e-01 -0.124 0.124 0.118 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0554 0.136 0.113 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 3.31e-01 -0.112 0.115 0.113 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 1.14e-01 0.128 0.0806 0.113 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 3.21e-01 -0.102 0.102 0.113 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642775 sc-eQTL 3.96e-01 -0.111 0.13 0.113 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0971 0.0982 0.113 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.67e-01 -0.068 0.118 0.113 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642752 sc-eQTL 7.52e-01 0.0459 0.145 0.113 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 2.78e-01 -0.139 0.128 0.113 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0365 0.159 0.105 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 1.61e-01 -0.189 0.134 0.105 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 8.83e-01 0.0182 0.124 0.105 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0592 0.125 0.105 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642775 sc-eQTL 7.89e-01 -0.033 0.123 0.105 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 6.48e-02 0.229 0.123 0.105 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 8.92e-01 0.0186 0.136 0.105 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642752 sc-eQTL 6.44e-02 0.228 0.122 0.105 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0319 0.127 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 8.09e-03 -0.35 0.131 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 5.51e-01 0.068 0.114 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 7.89e-01 0.0247 0.0923 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0701 0.122 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0545 0.0802 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 3.63e-03 0.354 0.121 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0645 0.0851 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 8.83e-03 0.353 0.134 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 1.65e-01 -0.178 0.128 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 5.38e-01 0.0739 0.12 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 4.15e-01 0.0726 0.0889 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 1.20e-01 -0.203 0.13 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0828 0.0685 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0465 0.102 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.15e-01 0.0467 0.0717 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0061 0.122 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 5.41e-01 -0.061 0.0996 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0457 0.0793 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 8.59e-01 0.0132 0.0743 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0513 0.0733 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -642775 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0528 0.131 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 2.14e-01 0.134 0.107 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0569 0.0955 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -642752 sc-eQTL 4.13e-01 0.115 0.14 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0381 0.0879 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 6.02e-01 0.0696 0.133 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0652 0.0933 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 1.85e-01 0.0945 0.071 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 9.72e-01 0.00305 0.0873 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -642775 sc-eQTL 7.45e-04 -0.422 0.123 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0474 0.0789 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 9.07e-01 0.0135 0.116 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -642752 sc-eQTL 4.52e-01 0.105 0.14 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 4.42e-01 -0.09 0.117 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -723713 sc-eQTL 1.50e-02 -0.303 0.124 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 830347 sc-eQTL 2.38e-01 -0.103 0.0874 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 sc-eQTL 5.69e-01 0.062 0.109 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -57623 sc-eQTL 1.22e-02 -0.228 0.0904 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 182582 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0659 0.0797 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -938465 sc-eQTL 1.14e-01 0.165 0.104 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -978949 sc-eQTL 6.47e-01 0.0309 0.0674 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 181563 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0205 0.112 0.114 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 eQTL 0.000644 0.109 0.0317 0.0 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -353735 1.31e-06 9.01e-07 1.27e-07 3.54e-07 1.05e-07 3.39e-07 7.22e-07 1.78e-07 8.36e-07 3.17e-07 1.07e-06 5.22e-07 1.49e-06 2.1e-07 3.86e-07 3.57e-07 6.29e-07 4.39e-07 2.87e-07 2.68e-07 2.43e-07 6.2e-07 4.77e-07 2.65e-07 1.72e-06 2.4e-07 4.37e-07 4.11e-07 5.78e-07 8.5e-07 4.55e-07 5.99e-08 1.27e-07 2.06e-07 3.29e-07 1.82e-07 2.59e-07 1.27e-07 7.41e-08 1.57e-08 1.67e-07 1.26e-06 5.38e-08 1.11e-08 1.25e-07 4.28e-08 1.29e-07 3.13e-08 6.36e-08