logo

Genes within 1Mb (chr6:138049585:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0371 0.118 0.1 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0255 0.114 0.1 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 1.32e-01 -0.135 0.0892 0.1 B L1
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 8.35e-01 0.0186 0.0896 0.1 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 8.68e-01 -0.012 0.0722 0.1 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 1.22e-01 -0.156 0.1 0.1 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0708 0.0591 0.1 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0303 0.114 0.1 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00917 0.132 0.1 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 5.16e-02 0.149 0.0763 0.1 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 6.85e-01 0.0359 0.0882 0.1 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 1.58e-01 -0.117 0.0828 0.1 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0573 0.0779 0.1 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 1.65e-01 -0.12 0.0858 0.1 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0551 0.0631 0.1 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 8.26e-01 0.0216 0.0982 0.1 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0968 0.144 0.1 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 1.32e-01 0.133 0.0878 0.1 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 6.21e-01 0.0467 0.0945 0.1 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0172 0.0963 0.1 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 6.28e-01 0.0361 0.0743 0.1 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 1.22e-01 -0.15 0.0967 0.1 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 3.39e-01 0.053 0.0552 0.1 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 6.79e-01 0.0452 0.109 0.1 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0178 0.145 0.095 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 4.73e-01 0.0774 0.108 0.095 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 2.60e-01 -0.115 0.102 0.095 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0508 0.115 0.095 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -642986 sc-eQTL 1.11e-01 0.212 0.132 0.095 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 8.19e-02 -0.204 0.117 0.095 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 2.86e-01 0.123 0.115 0.095 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -642963 sc-eQTL 1.47e-01 0.202 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 7.24e-01 0.0414 0.117 0.095 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0347 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 3.40e-01 0.0874 0.0914 0.1 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0356 0.0743 0.1 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 8.08e-02 0.135 0.0771 0.1 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -642986 sc-eQTL 9.40e-01 0.0106 0.14 0.1 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0196 0.0822 0.1 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 4.65e-01 0.0782 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -642963 sc-eQTL 2.71e-01 0.161 0.146 0.1 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 8.02e-02 0.168 0.0956 0.1 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 8.84e-01 0.0188 0.128 0.099 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 5.35e-01 0.0612 0.0986 0.099 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0691 0.113 0.099 NK L1
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0774 0.0958 0.099 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 8.77e-01 0.0127 0.0821 0.099 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 4.04e-01 0.0881 0.105 0.099 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 3.30e-02 0.164 0.0762 0.099 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0778 0.116 0.099 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 2.64e-01 -0.169 0.151 0.1 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 3.22e-01 0.0911 0.0919 0.1 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0722 0.0975 0.1 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 1.58e-01 0.17 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 1.13e-01 0.0906 0.057 0.1 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 6.28e-01 0.057 0.118 0.1 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 9.40e-01 0.00581 0.0771 0.1 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 3.18e-01 -0.114 0.113 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 4.48e-01 0.128 0.169 0.102 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 2.31e-01 -0.181 0.15 0.102 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 4.24e-01 -0.118 0.148 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0482 0.0768 0.102 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 1.58e-01 -0.21 0.148 0.102 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 3.56e-01 -0.155 0.168 0.102 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0639 0.152 0.102 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 7.36e-01 -0.044 0.13 0.102 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 5.54e-01 0.0869 0.147 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0113 0.136 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00492 0.102 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 1.39e-02 0.317 0.128 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 9.44e-01 0.00711 0.102 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 4.02e-01 -0.115 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0459 0.117 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0677 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 1.17e-01 0.231 0.147 0.101 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 5.84e-01 0.0798 0.146 0.101 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 3.43e-01 -0.105 0.111 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 2.59e-01 -0.156 0.138 0.101 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0289 0.0953 0.101 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 3.66e-01 0.125 0.138 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 5.22e-01 0.0701 0.109 0.101 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 3.44e-01 -0.134 0.141 0.101 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 3.60e-01 -0.128 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 8.15e-01 -0.027 0.115 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0386 0.098 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 8.85e-01 0.0192 0.133 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0538 0.077 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0458 0.112 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 1.09e-02 -0.199 0.0775 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 8.40e-01 0.0244 0.121 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 3.19e-01 0.14 0.14 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 2.85e-01 -0.154 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0755 0.0956 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0508 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0869 0.115 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 8.48e-02 -0.216 0.125 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 8.06e-02 -0.161 0.0919 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 6.03e-01 0.0774 0.149 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 5.42e-01 0.0856 0.14 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 7.35e-01 0.0445 0.131 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0631 0.121 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 5.41e-01 0.0902 0.147 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0299 0.0861 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 8.32e-01 0.0293 0.137 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0727 0.125 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0711 0.134 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0242 0.139 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 6.13e-02 0.137 0.0726 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 9.99e-01 9.94e-05 0.0864 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 7.87e-01 0.0309 0.114 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 7.36e-01 -0.027 0.08 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0857 0.0953 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0525 0.0642 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 9.66e-01 0.00446 0.104 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0701 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0672 0.103 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 2.69e-01 0.112 0.101 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 1.85e-01 -0.169 0.127 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0694 0.0738 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 2.37e-01 -0.122 0.103 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0224 0.0796 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 8.96e-01 0.0136 0.104 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00378 0.153 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 5.50e-02 0.222 0.115 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 9.18e-01 0.0108 0.104 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0672 0.121 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0858 0.0767 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0105 0.13 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 2.75e-01 -0.101 0.0922 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 4.37e-01 0.0958 0.123 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 3.33e-01 -0.152 0.156 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 7.38e-01 0.0353 0.105 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0916 0.112 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 2.73e-01 -0.153 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 5.52e-02 0.17 0.0879 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 2.75e-01 -0.133 0.122 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 9.63e-02 0.164 0.098 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0235 0.125 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0105 0.147 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 4.13e-01 0.0842 0.103 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 5.57e-01 0.0554 0.0941 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00242 0.113 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0811 0.0802 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 3.26e-01 -0.112 0.114 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0324 0.0598 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 3.13e-01 0.12 0.119 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 2.21e-01 -0.201 0.163 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0468 0.135 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 9.16e-01 0.0122 0.115 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 1.47e-01 0.221 0.151 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0105 0.0734 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 1.46e-02 -0.303 0.123 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 2.33e-01 -0.148 0.124 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 1.66e-01 0.186 0.134 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 3.65e-01 0.136 0.15 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 5.47e-01 0.0782 0.13 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 2.82e-01 -0.147 0.136 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 7.13e-01 0.0572 0.155 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 6.98e-02 0.173 0.0949 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 4.36e-01 0.114 0.146 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 7.45e-01 0.0367 0.112 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 7.18e-01 0.0513 0.142 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0641 0.166 0.097 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 2.86e-01 0.115 0.108 0.097 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 3.19e-01 -0.115 0.115 0.097 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 6.75e-01 0.0641 0.153 0.097 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 3.41e-01 0.0692 0.0725 0.097 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 5.16e-01 0.0886 0.136 0.097 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0205 0.1 0.097 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0884 0.134 0.097 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 1.76e-01 0.197 0.145 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 2.77e-01 0.124 0.114 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 2.36e-01 -0.147 0.124 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 4.18e-01 -0.108 0.133 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 8.17e-01 0.0196 0.0848 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 4.38e-02 0.248 0.122 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00635 0.114 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0948 0.135 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 1.10e-01 -0.221 0.138 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0342 0.0912 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 2.96e-01 -0.129 0.123 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0354 0.11 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 8.88e-01 0.0122 0.0859 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 6.18e-01 0.0565 0.113 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 6.82e-02 0.139 0.0761 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 1.15e-01 -0.203 0.128 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 5.13e-01 0.103 0.158 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 8.17e-01 0.0269 0.116 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 4.46e-01 -0.103 0.134 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000428 0.12 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 7.02e-01 0.0352 0.0919 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 9.19e-01 0.0148 0.146 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 1.76e-01 0.162 0.119 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0363 0.148 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 4.16e-01 0.114 0.14 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 3.66e-01 0.0855 0.0945 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 3.67e-01 0.109 0.121 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 4.25e-01 0.0899 0.113 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0239 0.0845 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 1.53e-01 -0.178 0.124 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 1.84e-01 0.107 0.0801 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 3.97e-01 0.108 0.127 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 3.82e-01 -0.149 0.17 0.104 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 6.29e-01 0.087 0.18 0.104 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 6.91e-01 0.0602 0.151 0.104 PB L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0438 0.115 0.104 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0581 0.14 0.104 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0677 0.164 0.104 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0569 0.115 0.104 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 3.84e-01 -0.146 0.167 0.104 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 4.50e-01 -0.117 0.154 0.098 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 2.82e-01 0.127 0.118 0.098 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 2.23e-01 0.15 0.123 0.098 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 1.48e-01 0.165 0.113 0.098 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 1.03e-01 0.117 0.0714 0.098 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 1.80e-01 -0.192 0.143 0.098 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 8.80e-01 0.0139 0.0925 0.098 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 4.24e-01 0.111 0.139 0.098 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 4.47e-01 0.113 0.148 0.1 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 2.84e-02 0.305 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0224 0.101 0.1 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 7.42e-02 -0.284 0.158 0.1 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 7.22e-01 0.0316 0.0888 0.1 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00724 0.128 0.1 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0481 0.109 0.1 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 5.78e-01 0.0753 0.135 0.1 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 7.05e-01 0.0568 0.15 0.088 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0104 0.122 0.088 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0619 0.107 0.088 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0781 0.12 0.088 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642986 sc-eQTL 7.73e-01 0.0402 0.14 0.088 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 1.85e-01 -0.213 0.16 0.088 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 8.34e-01 0.0277 0.132 0.088 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642963 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00692 0.154 0.088 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00298 0.157 0.088 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 6.61e-01 -0.051 0.116 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 2.97e-01 0.0883 0.0844 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 3.95e-01 -0.071 0.0833 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 1.02e-01 0.149 0.0906 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642986 sc-eQTL 2.75e-01 -0.152 0.139 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 2.82e-02 -0.273 0.123 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 8.57e-01 0.0189 0.105 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642963 sc-eQTL 5.66e-01 0.0841 0.146 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 1.03e-01 0.158 0.0967 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0923 0.134 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 4.77e-01 0.0701 0.0983 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0326 0.0916 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 4.28e-02 0.177 0.0866 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642986 sc-eQTL 8.96e-01 0.0187 0.143 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 6.28e-01 0.0658 0.136 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 1.93e-01 0.153 0.118 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642963 sc-eQTL 6.02e-01 0.0821 0.157 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 3.24e-01 0.124 0.125 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 6.14e-01 0.0893 0.177 0.1 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 1.89e-01 0.186 0.141 0.1 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0178 0.169 0.1 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 8.34e-01 0.0329 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0324 0.087 0.1 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 4.59e-01 -0.129 0.173 0.1 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 1.46e-01 -0.19 0.13 0.1 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 3.49e-01 0.148 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 1.56e-01 0.216 0.152 0.1 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 2.54e-01 0.117 0.102 0.1 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0361 0.102 0.1 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 4.82e-01 0.0625 0.0886 0.1 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642986 sc-eQTL 9.91e-01 0.00153 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 3.42e-01 -0.135 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 3.04e-01 0.134 0.13 0.1 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642963 sc-eQTL 4.56e-01 0.116 0.155 0.1 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 7.65e-01 0.0395 0.132 0.1 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 6.30e-01 0.0747 0.155 0.095 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 5.72e-01 0.0746 0.132 0.095 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 2.06e-01 -0.117 0.0921 0.095 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 1.77e-01 0.158 0.116 0.095 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642986 sc-eQTL 9.95e-01 0.000914 0.149 0.095 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0438 0.112 0.095 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0396 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642963 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0278 0.165 0.095 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 8.97e-01 0.0189 0.146 0.095 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 5.70e-01 0.0959 0.168 0.088 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 7.11e-01 0.0531 0.143 0.088 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0334 0.131 0.088 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 3.39e-01 -0.127 0.132 0.088 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -642986 sc-eQTL 1.08e-01 0.209 0.129 0.088 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 7.77e-01 0.0376 0.132 0.088 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 7.36e-02 0.258 0.143 0.088 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -642963 sc-eQTL 1.42e-01 0.192 0.13 0.088 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 4.39e-01 0.104 0.134 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 4.26e-01 0.113 0.141 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 8.75e-01 0.0191 0.121 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0673 0.0979 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 7.36e-01 0.0435 0.129 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0117 0.0853 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0472 0.131 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 2.34e-01 0.108 0.0902 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 1.97e-01 -0.186 0.144 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0577 0.13 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0643 0.122 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0521 0.0903 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0381 0.133 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0274 0.0697 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 2.28e-01 -0.125 0.104 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 4.82e-03 -0.204 0.0715 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 6.37e-01 0.0586 0.124 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0794 0.107 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 3.41e-01 0.0812 0.0851 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0549 0.0798 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 5.10e-02 0.153 0.0782 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -642986 sc-eQTL 5.36e-01 -0.087 0.14 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0919 0.115 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 5.33e-01 0.0642 0.103 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -642963 sc-eQTL 7.10e-01 0.0561 0.151 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 1.23e-01 0.146 0.094 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 8.51e-01 0.0276 0.147 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00918 0.103 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0645 0.0785 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 6.86e-01 0.0389 0.0962 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -642986 sc-eQTL 4.97e-01 0.0949 0.14 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0258 0.087 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0236 0.127 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -642963 sc-eQTL 2.30e-01 0.185 0.154 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 3.90e-01 0.111 0.129 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -723924 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0329 0.134 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0129 0.0934 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -353946 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0425 0.116 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -57834 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0508 0.0976 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 182371 sc-eQTL 7.87e-01 0.023 0.0851 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -938676 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0115 0.111 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -979160 sc-eQTL 3.51e-02 0.151 0.0711 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 181352 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0623 0.119 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 830136 eQTL 0.0559 -0.044 0.023 0.00485 0.0 0.0967
ENSG00000220412 AL356234.1 342384 eQTL 0.0309 -0.0883 0.0409 0.00158 0.0 0.0967
ENSG00000237499 AL357060.1 181352 eQTL 0.06 -0.0399 0.0212 0.00105 0.0 0.0967

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -353946 1.21e-06 8.16e-07 1.85e-07 3.81e-07 9.9e-08 3.08e-07 7.1e-07 1.65e-07 6.52e-07 3.04e-07 1.02e-06 4.55e-07 1.05e-06 1.98e-07 3.35e-07 4.14e-07 3.93e-07 4.44e-07 3.06e-07 2.37e-07 2.49e-07 5.11e-07 5.49e-07 2.92e-07 1.47e-06 2.49e-07 4.7e-07 3.51e-07 5.78e-07 8.89e-07 3.95e-07 5.88e-08 5.95e-08 1.88e-07 3.23e-07 2.54e-07 1.44e-07 1.26e-07 7.81e-08 2.22e-08 1.03e-07 7.45e-07 5.44e-08 5.89e-09 1.84e-07 1.52e-08 1.32e-07 5.66e-08 5.02e-08
ENSG00000237499 AL357060.1 181352 1.97e-06 2.43e-06 2.32e-07 1.62e-06 4.37e-07 7.18e-07 1.63e-06 4.04e-07 1.75e-06 7.98e-07 1.86e-06 1.25e-06 3.2e-06 9.24e-07 4.63e-07 1.19e-06 1.07e-06 1.55e-06 5.95e-07 7.62e-07 6.56e-07 1.95e-06 2.1e-06 9.16e-07 3.15e-06 1.08e-06 1.19e-06 1.05e-06 1.86e-06 1.86e-06 8.36e-07 2.62e-07 3.79e-07 8.18e-07 9.38e-07 8.66e-07 7.29e-07 3.84e-07 4.96e-07 2.27e-07 3.68e-07 2.82e-06 3.74e-07 1.66e-07 3.39e-07 3.25e-07 3.5e-07 2.49e-07 2e-07