logo

Genes within 1Mb (chr6:138048165:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 2.29e-02 -0.237 0.104 0.13 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 1.16e-01 0.16 0.101 0.13 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 1.82e-01 0.107 0.0796 0.13 B L1
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000583 0.0798 0.13 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 4.32e-02 -0.13 0.0637 0.13 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 2.47e-01 0.104 0.0898 0.13 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 3.15e-01 0.0532 0.0528 0.13 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0771 0.101 0.13 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 1.60e-01 -0.164 0.117 0.13 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 1.62e-01 0.0956 0.0682 0.13 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 7.91e-01 0.0208 0.0786 0.13 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0554 0.074 0.13 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 7.26e-02 -0.124 0.0689 0.13 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 3.75e-01 0.0681 0.0766 0.13 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 1.39e-01 0.0832 0.056 0.13 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0808 0.0872 0.13 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 5.80e-03 -0.34 0.122 0.13 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 2.16e-01 0.0938 0.0756 0.13 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0433 0.0812 0.13 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0764 0.0826 0.13 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0596 0.0637 0.13 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 5.57e-01 0.0491 0.0835 0.13 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 5.59e-02 0.0906 0.0471 0.13 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 2.12e-01 -0.117 0.0935 0.13 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0929 0.125 0.133 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 4.87e-01 0.0645 0.0925 0.133 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 9.83e-01 0.00188 0.0878 0.133 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0187 0.099 0.133 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -644406 sc-eQTL 1.41e-02 -0.279 0.113 0.133 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 9.83e-04 0.33 0.0985 0.133 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 2.51e-01 0.114 0.0988 0.133 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -644383 sc-eQTL 6.09e-01 0.0612 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0127 0.101 0.133 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00479 0.0916 0.13 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 9.73e-01 0.00261 0.0781 0.13 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 4.87e-01 0.0441 0.0633 0.13 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 8.69e-01 -0.011 0.0663 0.13 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -644406 sc-eQTL 1.33e-01 -0.179 0.119 0.13 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 2.36e-01 0.083 0.0699 0.13 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0501 0.0912 0.13 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -644383 sc-eQTL 2.06e-01 0.157 0.124 0.13 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0637 0.082 0.13 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 1.97e-02 -0.257 0.11 0.131 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 3.13e-01 -0.086 0.0851 0.131 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 8.46e-01 -0.019 0.0977 0.131 NK L1
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 4.06e-02 -0.169 0.0821 0.131 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0882 0.0707 0.131 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 9.15e-02 0.154 0.0907 0.131 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 7.43e-01 0.0219 0.0666 0.131 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0473 0.101 0.131 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 3.36e-01 0.126 0.131 0.13 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0895 0.0796 0.13 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 1.07e-01 0.136 0.0842 0.13 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 2.59e-01 -0.118 0.104 0.13 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0554 0.0496 0.13 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 9.69e-01 0.00397 0.102 0.13 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0231 0.0669 0.13 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 2.23e-01 -0.12 0.0983 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0303 0.147 0.133 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 1.46e-02 -0.319 0.129 0.133 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 3.83e-02 -0.266 0.127 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0494 0.0669 0.133 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 9.33e-01 0.0109 0.13 0.133 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 7.08e-02 0.264 0.145 0.133 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 8.36e-01 0.0276 0.133 0.133 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0852 0.113 0.133 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 1.28e-01 -0.195 0.128 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 1.65e-02 0.283 0.117 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 9.07e-01 0.0104 0.0891 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 2.20e-02 -0.258 0.112 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00788 0.0889 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 4.52e-01 0.0904 0.12 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 3.92e-01 0.0876 0.102 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 7.91e-01 0.0334 0.126 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 2.69e-02 -0.29 0.13 0.129 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 7.91e-01 0.0345 0.13 0.129 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 7.26e-01 0.0347 0.0989 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 4.46e-01 0.0941 0.123 0.129 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 9.04e-01 0.0103 0.0849 0.129 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 3.33e-02 0.261 0.122 0.129 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 1.69e-01 -0.134 0.097 0.129 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 5.26e-02 0.244 0.125 0.129 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0878 0.126 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 1.17e-01 0.162 0.103 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 5.82e-01 0.0487 0.0883 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 2.45e-02 -0.268 0.118 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0679 0.0693 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0771 0.101 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 5.60e-01 0.0413 0.0709 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 2.50e-01 0.125 0.108 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0837 0.123 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0296 0.127 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 5.61e-03 0.231 0.0827 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0331 0.101 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 5.53e-02 -0.193 0.1 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 6.68e-01 0.0474 0.111 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 9.52e-01 0.00492 0.0814 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 1.59e-01 -0.184 0.13 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 7.54e-01 -0.04 0.127 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0531 0.119 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 3.74e-01 0.0977 0.11 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 6.05e-01 0.0693 0.134 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 8.78e-01 -0.012 0.0781 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 6.05e-01 0.0645 0.125 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 1.32e-01 0.171 0.113 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 2.23e-01 -0.148 0.121 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00426 0.123 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 6.41e-01 0.0304 0.0651 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 4.81e-01 0.0541 0.0767 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 7.50e-01 0.0324 0.101 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0948 0.0709 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 4.87e-01 0.059 0.0848 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 1.96e-01 0.0738 0.057 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 8.28e-01 -0.02 0.0922 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 4.97e-02 -0.231 0.117 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 1.21e-01 0.137 0.0884 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0278 0.0879 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0661 0.11 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0683 0.0639 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 8.31e-01 0.0191 0.0896 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 5.30e-01 0.0433 0.0688 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 6.47e-02 -0.165 0.089 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 2.66e-01 -0.15 0.134 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 9.29e-01 0.00904 0.102 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 6.17e-01 0.0459 0.0917 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 8.46e-01 0.0208 0.107 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0938 0.0675 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00801 0.114 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0775 0.0813 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0854 0.109 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 3.54e-03 -0.392 0.133 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 2.08e-01 0.115 0.091 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 9.79e-01 0.00253 0.0968 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0783 0.121 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0761 0.0767 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 1.21e-01 0.164 0.105 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 2.57e-01 0.0969 0.0852 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0282 0.108 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0302 0.132 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00617 0.0919 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00796 0.0842 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0997 0.101 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0664 0.0717 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0644 0.102 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 4.17e-01 0.0434 0.0534 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 9.67e-03 -0.273 0.105 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 7.36e-02 -0.276 0.154 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 3.63e-01 -0.116 0.128 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 1.31e-01 -0.164 0.108 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 8.19e-01 -0.033 0.144 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 3.47e-01 0.0652 0.0691 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0428 0.118 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 4.49e-02 0.234 0.116 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 8.54e-02 -0.218 0.126 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0194 0.136 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0521 0.118 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 9.12e-01 0.0137 0.124 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 3.49e-01 -0.132 0.141 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 9.37e-01 0.00684 0.0868 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 1.28e-01 -0.201 0.132 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 2.66e-01 0.114 0.102 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 9.96e-01 0.000568 0.129 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 6.25e-01 0.0695 0.142 0.132 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 4.56e-02 -0.184 0.0913 0.132 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 1.28e-02 0.244 0.097 0.132 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 2.81e-01 -0.14 0.13 0.132 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0688 0.0618 0.132 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 7.84e-01 0.0319 0.116 0.132 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 6.21e-01 0.0423 0.0854 0.132 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 1.98e-01 -0.148 0.114 0.132 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 6.49e-01 -0.061 0.134 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 2.59e-01 -0.118 0.104 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0857 0.114 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 2.59e-01 0.137 0.122 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0894 0.0775 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 5.52e-01 0.0673 0.113 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 6.80e-01 0.043 0.104 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 1.18e-01 -0.193 0.123 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 3.92e-01 -0.103 0.12 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0318 0.079 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 6.11e-01 0.0544 0.107 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 1.76e-02 -0.226 0.0944 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0965 0.0741 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 5.25e-01 0.0624 0.098 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 7.39e-01 0.0221 0.0664 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00299 0.112 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 1.37e-01 -0.211 0.141 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00942 0.104 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0754 0.121 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0126 0.108 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 1.63e-01 -0.115 0.0824 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 4.63e-01 0.0963 0.131 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 5.68e-01 0.0617 0.108 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0457 0.133 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 9.51e-02 -0.209 0.125 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0493 0.0845 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 6.52e-01 0.0488 0.108 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 1.74e-01 -0.137 0.1 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0596 0.0754 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 6.42e-01 0.0518 0.111 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00458 0.0718 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0676 0.114 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 4.61e-01 -0.107 0.144 0.148 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 2.24e-03 0.459 0.147 0.148 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 7.24e-02 0.23 0.127 0.148 PB L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 2.06e-01 -0.124 0.0974 0.148 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 4.33e-02 -0.239 0.117 0.148 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 3.74e-02 0.289 0.137 0.148 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 6.86e-01 0.0397 0.098 0.148 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 1.04e-01 -0.231 0.141 0.148 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 2.04e-01 0.173 0.136 0.128 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0281 0.104 0.128 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 3.68e-01 0.098 0.109 0.128 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0249 0.101 0.128 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 4.51e-02 -0.127 0.0629 0.128 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 4.03e-01 -0.106 0.127 0.128 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0597 0.0816 0.128 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 1.68e-01 -0.17 0.123 0.128 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0919 0.127 0.13 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0658 0.12 0.13 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 6.71e-01 0.0369 0.0869 0.13 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0192 0.137 0.13 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0758 0.076 0.13 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 1.29e-01 -0.166 0.109 0.13 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 9.73e-01 0.0031 0.0932 0.13 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0979 0.116 0.13 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0902 0.124 0.134 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 9.86e-01 0.00175 0.101 0.134 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 8.78e-01 0.0137 0.0891 0.134 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 6.17e-01 -0.05 0.0997 0.134 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -644406 sc-eQTL 1.01e-02 -0.295 0.113 0.134 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 1.74e-01 0.181 0.133 0.134 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 4.17e-01 0.0884 0.109 0.134 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -644383 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0206 0.128 0.134 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 2.65e-01 0.145 0.129 0.134 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 2.93e-01 -0.104 0.0991 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 5.44e-01 0.044 0.0724 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 3.97e-01 0.0605 0.0713 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00718 0.078 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -644406 sc-eQTL 3.19e-01 -0.119 0.119 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 3.48e-01 0.1 0.107 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 7.81e-01 -0.025 0.0898 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -644383 sc-eQTL 4.48e-02 0.25 0.124 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0417 0.0832 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 7.69e-01 0.0337 0.115 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0142 0.0843 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 5.76e-01 0.0439 0.0784 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0313 0.0749 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -644406 sc-eQTL 9.79e-01 0.00318 0.123 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 1.97e-01 0.15 0.116 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0561 0.101 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -644383 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0108 0.135 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 9.87e-01 0.00181 0.108 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 9.04e-01 0.0193 0.161 0.127 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 5.14e-02 -0.249 0.127 0.127 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 4.89e-01 0.106 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 7.94e-01 0.0372 0.142 0.127 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 6.97e-01 0.0308 0.0791 0.127 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 6.52e-01 0.0712 0.158 0.127 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 4.60e-01 0.088 0.119 0.127 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 8.13e-01 -0.034 0.143 0.127 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 4.95e-01 0.0911 0.133 0.133 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 7.00e-01 0.0346 0.0897 0.133 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 5.97e-01 0.0473 0.0894 0.133 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00659 0.0775 0.133 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -644406 sc-eQTL 1.21e-03 -0.386 0.118 0.133 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0218 0.125 0.133 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 9.61e-01 0.00552 0.114 0.133 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -644383 sc-eQTL 4.20e-01 0.109 0.135 0.133 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 1.12e-01 -0.183 0.115 0.133 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 8.89e-01 0.0173 0.124 0.129 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0864 0.105 0.129 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 7.04e-02 0.133 0.0732 0.129 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0927 0.093 0.129 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -644406 sc-eQTL 3.22e-01 -0.118 0.119 0.129 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0476 0.0896 0.129 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000156 0.108 0.129 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -644383 sc-eQTL 6.29e-01 0.0638 0.132 0.129 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0793 0.116 0.129 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00619 0.145 0.116 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 1.76e-01 -0.166 0.122 0.116 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 9.19e-01 0.0115 0.112 0.116 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 8.49e-01 0.0217 0.114 0.116 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -644406 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0572 0.112 0.116 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 7.14e-02 0.204 0.112 0.116 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 6.97e-01 0.0483 0.124 0.116 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -644383 sc-eQTL 5.50e-02 0.215 0.111 0.116 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0332 0.115 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 3.86e-03 -0.352 0.121 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 4.44e-01 0.0805 0.105 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 7.60e-01 0.0261 0.0852 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 9.15e-01 0.0121 0.112 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 2.57e-01 -0.084 0.0739 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 9.73e-04 0.37 0.111 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 1.98e-01 -0.101 0.0784 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 7.74e-02 0.221 0.124 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 1.80e-01 -0.159 0.118 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 2.55e-01 0.126 0.111 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 1.79e-01 0.111 0.082 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 3.06e-02 -0.261 0.12 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 4.89e-02 -0.125 0.063 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0577 0.0947 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 5.57e-01 0.0391 0.0664 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 9.37e-01 -0.009 0.113 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 6.72e-01 -0.039 0.0919 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 9.24e-01 0.00701 0.0732 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 5.17e-01 0.0444 0.0685 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0346 0.0677 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -644406 sc-eQTL 3.84e-01 -0.105 0.12 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 1.33e-01 0.149 0.0987 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0479 0.0882 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -644383 sc-eQTL 2.30e-01 0.155 0.129 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0464 0.0811 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 2.99e-01 0.128 0.123 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0212 0.0863 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 1.88e-01 0.0866 0.0656 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00322 0.0806 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -644406 sc-eQTL 2.07e-03 -0.357 0.114 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0232 0.0729 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 6.46e-01 0.0491 0.107 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -644383 sc-eQTL 2.87e-01 0.138 0.129 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 3.35e-01 -0.104 0.108 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -725344 sc-eQTL 3.12e-02 -0.248 0.114 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 828716 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0498 0.0809 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 sc-eQTL 9.96e-01 0.000503 0.1 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -59254 sc-eQTL 2.48e-02 -0.189 0.0837 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 180951 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0983 0.0734 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -940096 sc-eQTL 1.39e-01 0.142 0.096 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -980580 sc-eQTL 4.15e-01 0.0508 0.0622 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 179932 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0099 0.103 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 eQTL 0.00589 0.0839 0.0304 0.0 0.0 0.11

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -355366 1.21e-06 7.46e-07 1.48e-07 3.22e-07 9.16e-08 3.24e-07 6.87e-07 1.65e-07 6.52e-07 3.16e-07 1.03e-06 4.43e-07 1.07e-06 1.56e-07 3.08e-07 2.99e-07 4.87e-07 4.39e-07 2.79e-07 1.76e-07 2.5e-07 5.37e-07 4.69e-07 2.65e-07 1.3e-06 2.68e-07 4.34e-07 2.83e-07 5.7e-07 8.38e-07 3.81e-07 6.06e-08 5.78e-08 1.69e-07 3.57e-07 1.66e-07 8.6e-08 9.84e-08 8.35e-08 2.26e-08 1.12e-07 8.45e-07 5.98e-08 1.1e-08 1.61e-07 1.52e-08 1.3e-07 1.28e-08 6.46e-08
ENSG00000118503 \N 180951 2.16e-06 2.51e-06 2.62e-07 1.7e-06 4.72e-07 7.96e-07 1.59e-06 4.45e-07 1.61e-06 7.73e-07 1.93e-06 1.45e-06 3.49e-06 9.24e-07 4.61e-07 1.15e-06 9.83e-07 1.46e-06 5.75e-07 7.22e-07 7.19e-07 2.25e-06 2.02e-06 1e-06 2.93e-06 9.49e-07 1.17e-06 1.04e-06 1.86e-06 1.67e-06 1.07e-06 2.44e-07 3.99e-07 8.53e-07 9.09e-07 6.03e-07 7.06e-07 3.45e-07 6.93e-07 1.68e-07 2.88e-07 3.06e-06 3.95e-07 1.41e-07 3.83e-07 3.22e-07 3.77e-07 1.69e-07 3e-07