logo

Genes within 1Mb (chr6:138046799:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 1.51e-02 -0.255 0.104 0.126 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 1.18e-01 0.16 0.102 0.126 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 1.27e-01 0.123 0.08 0.126 B L1
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0222 0.0803 0.126 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 9.00e-02 -0.109 0.0642 0.126 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 1.41e-01 0.133 0.0901 0.126 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 1.26e-01 0.0813 0.0529 0.126 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0573 0.102 0.126 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 1.36e-01 -0.175 0.117 0.126 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 2.66e-01 0.0765 0.0686 0.126 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 5.44e-01 0.0479 0.0789 0.126 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0584 0.0743 0.126 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 6.72e-02 -0.127 0.0692 0.126 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 3.82e-01 0.0674 0.077 0.126 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 1.70e-01 0.0775 0.0563 0.126 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0884 0.0876 0.126 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 4.29e-03 -0.355 0.123 0.126 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 2.71e-01 0.0843 0.0764 0.126 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0168 0.082 0.126 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0837 0.0834 0.126 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0733 0.0643 0.126 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 5.34e-01 0.0525 0.0843 0.126 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 3.67e-02 0.0999 0.0475 0.126 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 1.54e-01 -0.135 0.0943 0.126 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0935 0.125 0.131 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 5.46e-01 0.0563 0.0931 0.131 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 7.33e-01 0.0302 0.0882 0.131 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00514 0.0996 0.131 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -645772 sc-eQTL 1.46e-02 -0.279 0.113 0.131 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 8.75e-04 0.335 0.099 0.131 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 2.10e-01 0.125 0.0993 0.131 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -645749 sc-eQTL 6.34e-01 0.0573 0.12 0.131 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0171 0.101 0.131 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0264 0.0921 0.126 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 9.67e-01 0.0033 0.0785 0.126 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 3.67e-01 0.0575 0.0636 0.126 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0165 0.0666 0.126 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -645772 sc-eQTL 1.32e-01 -0.181 0.12 0.126 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 5.25e-01 0.0448 0.0704 0.126 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 4.79e-01 -0.065 0.0916 0.126 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -645749 sc-eQTL 1.71e-01 0.171 0.125 0.126 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0667 0.0824 0.126 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 1.67e-02 -0.266 0.11 0.127 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0927 0.0857 0.127 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 7.09e-01 0.0369 0.0985 0.127 NK L1
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 3.78e-02 -0.173 0.0827 0.127 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0916 0.0713 0.127 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 1.23e-01 0.142 0.0915 0.127 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 7.67e-01 0.0199 0.0671 0.127 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0376 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 2.84e-01 0.142 0.132 0.126 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 1.56e-01 -0.114 0.0802 0.126 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 5.70e-02 0.162 0.0847 0.126 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 2.29e-01 -0.127 0.105 0.126 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0628 0.05 0.126 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 8.39e-01 0.021 0.103 0.126 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00697 0.0675 0.126 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 1.42e-01 -0.146 0.099 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 8.44e-01 -0.029 0.148 0.128 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 2.92e-02 -0.286 0.13 0.128 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 4.82e-02 -0.255 0.128 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0486 0.0671 0.128 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 8.98e-01 0.0168 0.13 0.128 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 1.05e-01 0.238 0.146 0.128 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 8.47e-01 0.0257 0.133 0.128 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0763 0.114 0.128 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 5.36e-02 -0.248 0.128 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 2.30e-02 0.27 0.118 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 7.35e-01 0.0303 0.0894 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 2.06e-02 -0.262 0.112 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 9.74e-01 0.00294 0.0894 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 2.86e-01 0.129 0.12 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 4.70e-01 0.0743 0.103 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 7.44e-01 0.0415 0.127 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 1.69e-02 -0.314 0.131 0.125 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 7.02e-01 0.0501 0.131 0.125 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 4.92e-01 0.0685 0.0995 0.125 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 4.61e-01 0.0916 0.124 0.125 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 9.44e-01 0.00602 0.0854 0.125 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 5.30e-02 0.239 0.123 0.125 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 2.43e-01 -0.115 0.0978 0.125 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 5.48e-02 0.243 0.126 0.125 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0865 0.126 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 1.61e-01 0.146 0.104 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 4.07e-01 0.0737 0.0888 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 4.26e-02 -0.244 0.119 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0576 0.0698 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0532 0.102 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 3.11e-01 0.0723 0.0712 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 2.77e-01 0.119 0.109 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 3.82e-01 -0.108 0.124 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0104 0.128 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 2.60e-03 0.253 0.083 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0138 0.102 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 1.33e-01 -0.153 0.101 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 5.65e-01 0.0641 0.111 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 7.49e-01 0.0262 0.0819 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 2.00e-01 -0.168 0.131 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0299 0.128 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0679 0.12 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 1.77e-01 0.149 0.11 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 6.51e-01 0.0612 0.135 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0164 0.0787 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 4.68e-01 0.0912 0.125 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 2.19e-01 0.141 0.114 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 3.97e-01 -0.104 0.122 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0234 0.124 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 8.67e-01 0.0109 0.0654 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 3.28e-01 0.0756 0.077 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 7.93e-01 0.0267 0.102 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0971 0.0712 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 5.29e-01 0.0538 0.0853 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 2.87e-01 0.0611 0.0573 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0222 0.0926 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 2.94e-02 -0.258 0.118 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 1.83e-01 0.119 0.0892 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 9.61e-01 0.00432 0.0886 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0535 0.111 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0729 0.0643 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 7.47e-01 0.0291 0.0902 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 5.68e-01 0.0396 0.0694 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 5.94e-02 -0.17 0.0897 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 2.25e-01 -0.165 0.136 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 8.24e-01 0.0229 0.103 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 3.13e-01 0.0935 0.0924 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 7.83e-01 0.0297 0.108 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0915 0.0681 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0174 0.115 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 3.75e-01 -0.073 0.0821 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 3.58e-01 -0.101 0.109 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 6.78e-03 -0.367 0.134 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 2.41e-01 0.108 0.0918 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 6.16e-01 0.0491 0.0976 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 5.22e-01 -0.078 0.122 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0959 0.0772 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 9.47e-02 0.178 0.106 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 2.30e-01 0.103 0.0859 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0269 0.109 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0326 0.132 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 9.69e-01 0.00355 0.0924 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 8.59e-01 0.015 0.0846 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0766 0.102 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0775 0.072 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0406 0.102 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 3.35e-01 0.0519 0.0537 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 7.67e-03 -0.283 0.105 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 9.39e-02 -0.26 0.154 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 3.98e-01 -0.109 0.128 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 2.07e-01 -0.138 0.109 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0155 0.144 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 3.55e-01 0.0644 0.0694 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0535 0.118 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 3.80e-02 0.243 0.117 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 9.83e-02 -0.21 0.126 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0586 0.136 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0665 0.118 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 6.04e-01 0.0644 0.124 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 2.54e-01 -0.161 0.141 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0158 0.0872 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 8.86e-02 -0.226 0.132 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 2.11e-01 0.128 0.102 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0667 0.129 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 5.59e-01 0.0835 0.143 0.128 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 3.23e-02 -0.198 0.0917 0.128 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 4.00e-03 0.283 0.0971 0.128 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 2.77e-01 -0.143 0.131 0.128 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0807 0.0621 0.128 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 6.03e-01 0.0609 0.117 0.128 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 5.94e-01 0.0458 0.0859 0.128 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 1.59e-01 -0.162 0.115 0.128 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0668 0.135 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 2.23e-01 -0.128 0.105 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0568 0.115 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 3.46e-01 0.116 0.122 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0863 0.078 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 6.37e-01 0.0537 0.114 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 4.19e-01 0.0847 0.105 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 1.05e-01 -0.201 0.124 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0914 0.121 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0391 0.0796 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 2.95e-01 0.113 0.107 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 1.67e-02 -0.23 0.0952 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 1.47e-01 -0.109 0.0747 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 6.70e-01 0.0422 0.0989 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 7.21e-01 0.0239 0.0669 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 9.76e-01 0.00334 0.112 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 1.03e-01 -0.233 0.142 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0236 0.105 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0346 0.122 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0451 0.109 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 1.13e-01 -0.132 0.083 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 6.00e-01 0.0695 0.132 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 5.19e-01 0.0702 0.109 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 5.93e-01 -0.072 0.135 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 4.44e-02 -0.253 0.125 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0444 0.0851 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 3.93e-01 0.093 0.109 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 1.31e-01 -0.153 0.101 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 3.78e-01 -0.067 0.0759 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 5.72e-01 0.0635 0.112 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0145 0.0723 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0724 0.114 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 4.35e-01 -0.113 0.144 0.141 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 2.02e-03 0.463 0.147 0.141 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 6.39e-02 0.237 0.127 0.141 PB L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 2.86e-01 -0.104 0.0975 0.141 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 4.65e-02 -0.235 0.117 0.141 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 3.15e-02 0.299 0.137 0.141 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 4.93e-01 0.0672 0.0978 0.141 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 1.03e-01 -0.232 0.141 0.141 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 1.80e-01 0.183 0.136 0.126 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0347 0.104 0.126 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 4.99e-01 0.0738 0.109 0.126 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0255 0.101 0.126 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 4.11e-02 -0.129 0.0629 0.126 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0981 0.127 0.126 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0426 0.0817 0.126 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 1.74e-01 -0.168 0.123 0.126 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 4.22e-01 -0.103 0.128 0.126 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0586 0.12 0.126 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 6.17e-01 0.0438 0.0874 0.126 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 9.53e-01 0.00813 0.138 0.126 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0857 0.0763 0.126 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 1.98e-01 -0.142 0.11 0.126 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00833 0.0937 0.126 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 2.43e-01 -0.136 0.116 0.126 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 4.57e-01 -0.093 0.125 0.132 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00798 0.102 0.132 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 6.47e-01 0.0411 0.0895 0.132 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 7.72e-01 -0.029 0.1 0.132 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -645772 sc-eQTL 9.26e-03 -0.3 0.114 0.132 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 1.68e-01 0.184 0.133 0.132 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 3.95e-01 0.0933 0.109 0.132 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -645749 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0238 0.128 0.132 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 2.82e-01 0.14 0.13 0.132 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 2.25e-01 -0.121 0.0997 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 6.78e-01 0.0303 0.0729 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 3.57e-01 0.0662 0.0718 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00396 0.0785 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -645772 sc-eQTL 2.78e-01 -0.131 0.12 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 5.32e-01 0.0673 0.107 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0398 0.0904 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -645749 sc-eQTL 2.98e-02 0.273 0.125 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0393 0.0838 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 8.10e-01 0.0277 0.115 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 9.45e-01 0.00584 0.0846 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 4.27e-01 0.0626 0.0787 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0252 0.0752 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -645772 sc-eQTL 7.92e-01 0.0326 0.123 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 4.75e-01 0.0834 0.117 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0626 0.101 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -645749 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0368 0.135 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 9.32e-01 0.00923 0.108 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0248 0.163 0.121 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 3.31e-02 -0.276 0.128 0.121 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 2.84e-01 0.166 0.155 0.121 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 9.90e-01 0.00182 0.144 0.121 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 6.26e-01 0.0392 0.0802 0.121 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 6.16e-01 0.0803 0.16 0.121 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 1.64e-01 0.167 0.12 0.121 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0657 0.145 0.121 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 6.01e-01 0.07 0.134 0.129 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 7.19e-01 0.0324 0.09 0.129 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 4.59e-01 0.0665 0.0896 0.129 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 8.73e-01 0.0124 0.0777 0.129 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -645772 sc-eQTL 5.05e-03 -0.336 0.119 0.129 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0755 0.125 0.129 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0104 0.114 0.129 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -645749 sc-eQTL 4.04e-01 0.113 0.135 0.129 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 1.62e-01 -0.162 0.115 0.129 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 9.26e-01 0.0115 0.124 0.124 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0795 0.106 0.124 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 2.11e-02 0.17 0.073 0.124 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0713 0.0934 0.124 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -645772 sc-eQTL 2.64e-01 -0.133 0.119 0.124 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0354 0.0898 0.124 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 9.17e-01 0.0112 0.108 0.124 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -645749 sc-eQTL 6.33e-01 0.0634 0.132 0.124 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0819 0.117 0.124 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 9.70e-01 0.00554 0.146 0.113 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 1.52e-01 -0.177 0.123 0.113 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 6.62e-01 0.0497 0.113 0.113 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 8.49e-01 0.0219 0.115 0.113 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -645772 sc-eQTL 6.97e-01 -0.044 0.113 0.113 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 6.50e-02 0.21 0.113 0.113 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 5.87e-01 0.0679 0.125 0.113 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -645749 sc-eQTL 3.97e-02 0.232 0.112 0.113 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0446 0.116 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 1.21e-03 -0.397 0.121 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 4.05e-01 0.0881 0.106 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 6.20e-01 0.0426 0.0857 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 9.31e-01 0.00986 0.113 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0753 0.0745 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 5.96e-04 0.387 0.111 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 1.90e-01 -0.104 0.0789 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 6.91e-02 0.229 0.125 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 1.63e-01 -0.166 0.118 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 2.55e-01 0.126 0.111 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 1.17e-01 0.129 0.082 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 6.08e-02 -0.226 0.12 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0992 0.0633 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0355 0.0948 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 2.81e-01 0.0717 0.0663 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 9.51e-01 0.00697 0.113 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0561 0.0924 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 9.79e-01 0.00197 0.0736 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 4.19e-01 0.0558 0.0688 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0307 0.068 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -645772 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0935 0.121 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 4.12e-01 0.0819 0.0996 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0633 0.0886 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -645749 sc-eQTL 2.23e-01 0.159 0.13 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0455 0.0815 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 4.61e-01 0.0916 0.124 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 8.99e-01 -0.011 0.0868 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 8.10e-02 0.115 0.0658 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00297 0.0811 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -645772 sc-eQTL 2.79e-03 -0.349 0.115 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0426 0.0733 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 5.71e-01 0.0609 0.107 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -645749 sc-eQTL 2.84e-01 0.14 0.13 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 3.26e-01 -0.107 0.109 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -726710 sc-eQTL 2.86e-02 -0.254 0.115 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 827350 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0544 0.0815 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 sc-eQTL 5.54e-01 0.0599 0.101 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -60620 sc-eQTL 2.35e-02 -0.192 0.0843 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 179585 sc-eQTL 1.57e-01 -0.105 0.074 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -941462 sc-eQTL 1.84e-01 0.129 0.0968 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -981946 sc-eQTL 4.64e-01 0.046 0.0626 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 178566 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00203 0.104 0.125 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 eQTL 0.00527 0.0846 0.0303 0.0 0.0 0.112

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -356732 4.68e-07 4.24e-07 7.6e-08 3.48e-07 1.07e-07 1.54e-07 6.52e-07 5.89e-08 2.01e-07 1.11e-07 3.25e-07 1.46e-07 5.62e-07 8.85e-08 1.07e-07 1.01e-07 1.38e-07 2.87e-07 8e-08 7.49e-08 1.39e-07 1.9e-07 4e-07 5.01e-08 6.18e-07 2.36e-07 1.29e-07 1.17e-07 4.39e-07 2.75e-07 1.52e-07 4.69e-08 3.74e-08 1.23e-07 1.22e-07 2.99e-08 5.96e-08 6.78e-08 5.27e-08 6.79e-08 5.77e-08 2.43e-07 3.13e-08 4.2e-08 7.26e-08 1.01e-08 7e-08 1.89e-09 4.67e-08
ENSG00000118503 \N 179585 1.35e-06 2.37e-06 2.75e-07 1.22e-06 3.75e-07 6.47e-07 2.53e-06 3.41e-07 1.59e-06 4.7e-07 2.09e-06 6.58e-07 2.79e-06 3.26e-07 4.96e-07 9.19e-07 1.14e-06 1.1e-06 8.61e-07 5.21e-07 8.02e-07 1.72e-06 2.87e-06 5.66e-07 2.59e-06 9.36e-07 9.09e-07 7.2e-07 2.76e-06 1.29e-06 8e-07 1.3e-07 2.29e-07 7.04e-07 5.6e-07 2.76e-07 4.54e-07 1.92e-07 3.93e-07 9.18e-08 2.38e-07 1.86e-06 8.26e-08 1.75e-07 2.16e-07 1.24e-07 2.3e-07 5.66e-08 9.5e-08