logo

Genes within 1Mb (chr6:138043648:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 1.76e-02 -0.249 0.104 0.124 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 1.35e-01 0.153 0.102 0.124 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 1.30e-01 0.122 0.0801 0.124 B L1
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 7.94e-01 -0.021 0.0804 0.124 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 9.61e-02 -0.108 0.0644 0.124 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 1.13e-01 0.144 0.0901 0.124 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 1.06e-01 0.086 0.0529 0.124 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0466 0.102 0.124 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 1.45e-01 -0.171 0.117 0.124 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 2.93e-01 0.0723 0.0685 0.124 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 5.51e-01 0.0471 0.0788 0.124 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0693 0.0742 0.124 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 6.52e-02 -0.128 0.0691 0.124 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 2.45e-01 0.0894 0.0767 0.124 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 1.38e-01 0.0837 0.0562 0.124 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0821 0.0875 0.124 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 1.56e-02 -0.302 0.124 0.124 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 2.19e-01 0.0945 0.0766 0.124 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0168 0.0823 0.124 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 4.97e-01 -0.057 0.0837 0.124 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0805 0.0645 0.124 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 3.94e-01 0.0722 0.0845 0.124 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 5.46e-02 0.0923 0.0478 0.124 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 8.07e-02 -0.166 0.0944 0.124 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 3.41e-01 -0.12 0.125 0.128 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 4.38e-01 0.0724 0.0932 0.128 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 9.24e-01 0.00846 0.0884 0.128 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00781 0.0997 0.128 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -648923 sc-eQTL 6.55e-03 -0.311 0.113 0.128 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 1.62e-03 0.318 0.0995 0.128 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 1.78e-01 0.134 0.0994 0.128 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -648900 sc-eQTL 7.77e-01 0.0341 0.12 0.128 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0263 0.102 0.128 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0332 0.0922 0.124 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 9.92e-01 0.000748 0.0786 0.124 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 3.80e-01 0.056 0.0637 0.124 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0213 0.0667 0.124 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -648923 sc-eQTL 1.55e-01 -0.171 0.12 0.124 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 6.20e-01 0.035 0.0705 0.124 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0434 0.0918 0.124 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -648900 sc-eQTL 1.34e-01 0.187 0.125 0.124 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0604 0.0825 0.124 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 1.74e-02 -0.265 0.111 0.124 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0851 0.086 0.124 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 8.02e-01 0.0248 0.0988 0.124 NK L1
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 5.80e-02 -0.158 0.0831 0.124 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 1.27e-01 -0.109 0.0714 0.124 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 8.57e-02 0.158 0.0916 0.124 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 6.33e-01 0.0322 0.0673 0.124 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0539 0.102 0.124 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 3.99e-01 0.112 0.132 0.124 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 1.40e-01 -0.119 0.0804 0.124 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 6.67e-02 0.157 0.085 0.124 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 2.05e-01 -0.134 0.105 0.124 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 1.96e-01 -0.065 0.0501 0.124 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 6.20e-01 0.0513 0.103 0.124 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 9.92e-01 0.000656 0.0677 0.124 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 1.02e-01 -0.163 0.0992 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 7.31e-01 -0.051 0.148 0.125 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 2.55e-02 -0.294 0.13 0.125 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 4.84e-02 -0.255 0.128 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0468 0.0673 0.125 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 9.69e-01 0.00514 0.131 0.125 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 1.07e-01 0.237 0.147 0.125 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 9.60e-01 0.00668 0.134 0.125 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0596 0.114 0.125 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 1.42e-01 -0.19 0.129 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 4.65e-02 0.237 0.118 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 5.84e-01 0.0491 0.0895 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 2.81e-02 -0.249 0.113 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 7.37e-01 -0.03 0.0894 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 2.37e-01 0.143 0.12 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 5.04e-01 0.0687 0.103 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 6.21e-01 0.0627 0.127 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 1.19e-02 -0.331 0.131 0.123 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 5.59e-01 0.0765 0.131 0.123 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 4.47e-01 0.0759 0.0996 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 4.37e-01 0.0967 0.124 0.123 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 9.68e-01 0.00346 0.0855 0.123 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 7.75e-02 0.219 0.123 0.123 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 2.41e-01 -0.115 0.0979 0.123 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 5.39e-02 0.245 0.126 0.123 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0882 0.126 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 1.86e-01 0.138 0.104 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 3.61e-01 0.0812 0.0887 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 5.25e-02 -0.233 0.12 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0548 0.0698 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0319 0.102 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 3.68e-01 0.0642 0.0712 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 2.53e-01 0.125 0.109 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 2.69e-01 -0.136 0.123 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 9.87e-01 0.00205 0.127 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 2.53e-03 0.252 0.0826 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0101 0.101 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 1.45e-01 -0.148 0.101 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 5.26e-01 0.0703 0.111 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 8.01e-01 0.0206 0.0816 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 2.58e-01 -0.148 0.131 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00386 0.129 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0486 0.121 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 1.42e-01 0.163 0.111 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 6.16e-01 0.0682 0.136 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0191 0.0791 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 5.37e-01 0.0781 0.126 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 1.86e-01 0.152 0.115 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0682 0.123 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0241 0.124 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 8.86e-01 0.0094 0.0653 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 3.60e-01 0.0706 0.0769 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 8.08e-01 0.0248 0.102 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 1.55e-01 -0.102 0.0711 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 3.97e-01 0.0722 0.085 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 2.80e-01 0.0619 0.0572 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0163 0.0925 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 3.91e-02 -0.244 0.118 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 1.42e-01 0.131 0.089 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 9.56e-01 0.00493 0.0885 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0807 0.111 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0736 0.0643 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 4.82e-01 0.0635 0.0901 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 5.06e-01 0.0462 0.0693 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 4.61e-02 -0.18 0.0895 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 2.03e-01 -0.173 0.136 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 8.06e-01 0.0254 0.103 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 3.44e-01 0.0878 0.0925 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 7.90e-01 0.0287 0.108 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0877 0.0682 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0147 0.115 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0691 0.0821 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0953 0.11 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 1.75e-02 -0.325 0.136 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 2.21e-01 0.113 0.0922 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 6.04e-01 0.051 0.098 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0319 0.122 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 1.87e-01 -0.103 0.0776 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 7.38e-02 0.191 0.106 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 2.56e-01 0.0984 0.0864 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0524 0.109 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0279 0.132 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 8.56e-01 0.0167 0.0919 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 8.54e-01 0.0156 0.0843 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0632 0.101 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0926 0.0716 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0168 0.102 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 4.12e-01 0.044 0.0534 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 4.51e-03 -0.299 0.104 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 9.39e-02 -0.26 0.154 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 3.98e-01 -0.109 0.128 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 2.07e-01 -0.138 0.109 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0155 0.144 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 3.55e-01 0.0644 0.0694 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0535 0.118 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 3.80e-02 0.243 0.117 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 9.83e-02 -0.21 0.126 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0409 0.137 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0536 0.118 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 6.76e-01 0.052 0.124 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 2.63e-01 -0.159 0.141 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0242 0.0874 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 1.61e-01 -0.187 0.133 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 2.36e-01 0.122 0.102 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 6.49e-01 -0.059 0.13 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 6.29e-01 0.0692 0.143 0.126 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 3.71e-02 -0.193 0.092 0.126 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 3.58e-03 0.287 0.0973 0.126 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 3.33e-01 -0.127 0.131 0.126 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0734 0.0623 0.126 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 5.86e-01 0.0639 0.117 0.126 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 4.82e-01 0.0606 0.0861 0.126 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 1.57e-01 -0.164 0.115 0.126 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0957 0.135 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 2.11e-01 -0.132 0.105 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 6.15e-01 -0.058 0.115 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 2.22e-01 0.15 0.123 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0901 0.0783 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 6.55e-01 0.0511 0.114 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 3.55e-01 0.0975 0.105 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 1.99e-01 -0.161 0.125 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0995 0.121 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0327 0.0799 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 4.04e-01 0.0901 0.108 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 2.14e-02 -0.221 0.0956 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 8.62e-02 -0.129 0.0747 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 5.84e-01 0.0544 0.0991 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 6.11e-01 0.0342 0.0671 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0122 0.113 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 1.55e-01 -0.205 0.144 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 9.87e-01 0.00173 0.106 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0553 0.123 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0302 0.109 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 1.11e-01 -0.134 0.0835 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 5.15e-01 0.0868 0.133 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 5.25e-01 0.0698 0.109 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 6.90e-01 -0.054 0.135 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 5.54e-02 -0.242 0.126 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0403 0.0855 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 3.66e-01 0.0988 0.109 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 1.95e-01 -0.132 0.102 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 2.55e-01 -0.087 0.0762 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 4.92e-01 0.0776 0.113 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0064 0.0727 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0987 0.115 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0836 0.146 0.137 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 1.62e-03 0.478 0.148 0.137 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 6.14e-02 0.242 0.128 0.137 PB L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 2.30e-01 -0.119 0.0986 0.137 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 4.42e-02 -0.241 0.118 0.137 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 2.84e-02 0.308 0.139 0.137 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 3.90e-01 0.0853 0.0988 0.137 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 1.18e-01 -0.225 0.143 0.137 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 2.39e-01 0.161 0.137 0.124 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0487 0.104 0.124 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 5.13e-01 0.0715 0.109 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0317 0.101 0.124 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 3.84e-02 -0.131 0.063 0.124 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0863 0.127 0.124 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0435 0.082 0.124 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 1.57e-01 -0.175 0.123 0.124 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 4.00e-01 -0.107 0.128 0.124 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0565 0.12 0.124 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 6.06e-01 0.0451 0.0872 0.124 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00302 0.137 0.124 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0837 0.0762 0.124 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 1.99e-01 -0.141 0.109 0.124 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00517 0.0936 0.124 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 2.39e-01 -0.137 0.116 0.124 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0963 0.125 0.129 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 7.26e-01 0.0358 0.102 0.129 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 6.44e-01 0.0415 0.0898 0.129 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0208 0.101 0.129 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -648923 sc-eQTL 3.37e-03 -0.338 0.114 0.129 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 2.11e-01 0.168 0.134 0.129 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 3.08e-01 0.112 0.11 0.129 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -648900 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00808 0.129 0.129 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 2.94e-01 0.138 0.131 0.129 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 1.70e-01 -0.137 0.0999 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 7.20e-01 0.0262 0.0731 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 3.11e-01 0.073 0.0719 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 8.89e-01 -0.011 0.0787 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -648923 sc-eQTL 2.63e-01 -0.135 0.12 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 4.31e-01 0.085 0.108 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0178 0.0906 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -648900 sc-eQTL 3.09e-02 0.272 0.125 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0327 0.084 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 7.42e-01 0.038 0.115 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 9.37e-01 0.00674 0.0848 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 4.42e-01 0.0608 0.0789 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 6.43e-01 -0.035 0.0754 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -648923 sc-eQTL 6.70e-01 0.0528 0.124 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 7.15e-01 0.0428 0.117 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 5.23e-01 -0.065 0.102 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -648900 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0119 0.136 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00244 0.108 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0248 0.163 0.121 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 3.31e-02 -0.276 0.128 0.121 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 2.84e-01 0.166 0.155 0.121 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 9.90e-01 0.00182 0.144 0.121 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 6.26e-01 0.0392 0.0802 0.121 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 6.16e-01 0.0803 0.16 0.121 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 1.64e-01 0.167 0.12 0.121 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0657 0.145 0.121 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 6.46e-01 0.0617 0.134 0.127 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 7.89e-01 0.0242 0.0902 0.127 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 5.22e-01 0.0577 0.0899 0.127 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 9.16e-01 0.00818 0.0779 0.127 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -648923 sc-eQTL 6.44e-03 -0.328 0.119 0.127 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0931 0.125 0.127 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 8.13e-01 0.027 0.114 0.127 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -648900 sc-eQTL 3.99e-01 0.115 0.136 0.127 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 1.53e-01 -0.166 0.116 0.127 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 9.50e-01 0.00779 0.124 0.122 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0435 0.105 0.122 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 1.79e-02 0.174 0.0729 0.122 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0892 0.0932 0.122 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -648923 sc-eQTL 2.50e-01 -0.137 0.119 0.122 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 6.89e-01 -0.036 0.0897 0.122 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 7.28e-01 0.0377 0.108 0.122 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -648900 sc-eQTL 6.23e-01 0.0651 0.132 0.122 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0621 0.117 0.122 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 9.70e-01 0.00554 0.146 0.113 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 1.52e-01 -0.177 0.123 0.113 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 6.62e-01 0.0497 0.113 0.113 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 8.49e-01 0.0219 0.115 0.113 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -648923 sc-eQTL 6.97e-01 -0.044 0.113 0.113 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 6.50e-02 0.21 0.113 0.113 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 5.87e-01 0.0679 0.125 0.113 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -648900 sc-eQTL 3.97e-02 0.232 0.112 0.113 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0446 0.116 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 1.43e-03 -0.391 0.121 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 4.21e-01 0.0851 0.106 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 5.90e-01 0.0463 0.0857 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 9.06e-01 0.0134 0.113 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0826 0.0744 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 8.17e-04 0.378 0.111 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 1.84e-01 -0.105 0.0789 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 5.73e-02 0.239 0.125 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 1.50e-01 -0.171 0.118 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 2.80e-01 0.12 0.111 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 1.08e-01 0.132 0.0818 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 8.29e-02 -0.209 0.12 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0913 0.0632 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0158 0.0946 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 3.22e-01 0.0657 0.0662 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 8.72e-01 0.0182 0.113 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0609 0.0925 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 9.99e-01 9.95e-05 0.0737 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 3.94e-01 0.0589 0.0689 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0368 0.0681 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -648923 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0874 0.121 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 4.64e-01 0.0731 0.0997 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0492 0.0887 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -648900 sc-eQTL 1.75e-01 0.176 0.13 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0423 0.0817 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 5.40e-01 0.0763 0.124 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00757 0.0871 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 1.22e-01 0.102 0.0661 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0113 0.0813 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -648923 sc-eQTL 3.82e-03 -0.339 0.116 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0516 0.0734 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 3.29e-01 0.105 0.107 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -648900 sc-eQTL 2.90e-01 0.138 0.13 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 3.20e-01 -0.108 0.109 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -729861 sc-eQTL 3.12e-02 -0.251 0.116 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 824199 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0494 0.0816 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 sc-eQTL 6.55e-01 0.0454 0.101 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -63771 sc-eQTL 3.77e-02 -0.177 0.0846 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 176434 sc-eQTL 9.65e-02 -0.123 0.074 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -944613 sc-eQTL 1.29e-01 0.148 0.0969 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -985097 sc-eQTL 4.00e-01 0.0529 0.0627 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 175415 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0233 0.104 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 eQTL 0.00333 0.0904 0.0307 0.0 0.0 0.11

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -359883 9.47e-07 7.56e-07 1.31e-07 4.36e-07 1.12e-07 2.63e-07 6.08e-07 1.73e-07 6.03e-07 2.98e-07 9.39e-07 4.24e-07 9.97e-07 1.54e-07 2.77e-07 2.99e-07 5.06e-07 4.16e-07 2.79e-07 1.97e-07 2.48e-07 4.99e-07 4.01e-07 2.6e-07 1.13e-06 2.57e-07 3.37e-07 2.59e-07 4.33e-07 8.36e-07 3.77e-07 5.82e-08 4.42e-08 1.69e-07 3.42e-07 1.66e-07 1.83e-07 1.07e-07 8.72e-08 2.8e-08 7.48e-08 7.52e-07 4.65e-08 5.89e-09 1.69e-07 1.46e-08 1.21e-07 2.25e-08 6.46e-08
ENSG00000118503 \N 176434 1.92e-06 2.51e-06 2.86e-07 1.49e-06 4.93e-07 7.17e-07 1.29e-06 3.9e-07 1.7e-06 7.42e-07 1.86e-06 1.36e-06 3.23e-06 8.5e-07 3.66e-07 1.16e-06 9.97e-07 1.35e-06 5.91e-07 7.37e-07 6.57e-07 1.92e-06 1.82e-06 9.74e-07 2.67e-06 1.12e-06 1.12e-06 1.01e-06 1.62e-06 1.67e-06 9.62e-07 2.65e-07 3.35e-07 8.93e-07 8.75e-07 6.58e-07 7.55e-07 3.45e-07 7.29e-07 2.22e-07 3.5e-07 2.75e-06 4.42e-07 1.74e-07 3.38e-07 3.24e-07 3.5e-07 1.97e-07 2.8e-07