logo

Genes within 1Mb (chr6:138042012:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 1.51e-02 -0.255 0.104 0.126 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 1.18e-01 0.16 0.102 0.126 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 1.27e-01 0.123 0.08 0.126 B L1
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0222 0.0803 0.126 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 9.00e-02 -0.109 0.0642 0.126 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 1.41e-01 0.133 0.0901 0.126 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 1.26e-01 0.0813 0.0529 0.126 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0573 0.102 0.126 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 1.36e-01 -0.175 0.117 0.126 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 2.66e-01 0.0765 0.0686 0.126 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 5.44e-01 0.0479 0.0789 0.126 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0584 0.0743 0.126 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 6.72e-02 -0.127 0.0692 0.126 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 3.82e-01 0.0674 0.077 0.126 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 1.70e-01 0.0775 0.0563 0.126 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0884 0.0876 0.126 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 4.29e-03 -0.355 0.123 0.126 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 2.71e-01 0.0843 0.0764 0.126 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0168 0.082 0.126 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0837 0.0834 0.126 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0733 0.0643 0.126 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 5.34e-01 0.0525 0.0843 0.126 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 3.67e-02 0.0999 0.0475 0.126 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 1.54e-01 -0.135 0.0943 0.126 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0935 0.125 0.131 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 5.46e-01 0.0563 0.0931 0.131 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 7.33e-01 0.0302 0.0882 0.131 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00514 0.0996 0.131 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -650559 sc-eQTL 1.46e-02 -0.279 0.113 0.131 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 8.75e-04 0.335 0.099 0.131 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 2.10e-01 0.125 0.0993 0.131 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -650536 sc-eQTL 6.34e-01 0.0573 0.12 0.131 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0171 0.101 0.131 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0264 0.0921 0.126 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 9.67e-01 0.0033 0.0785 0.126 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 3.67e-01 0.0575 0.0636 0.126 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0165 0.0666 0.126 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -650559 sc-eQTL 1.32e-01 -0.181 0.12 0.126 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 5.25e-01 0.0448 0.0704 0.126 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 4.79e-01 -0.065 0.0916 0.126 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -650536 sc-eQTL 1.71e-01 0.171 0.125 0.126 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0667 0.0824 0.126 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 1.67e-02 -0.266 0.11 0.127 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0927 0.0857 0.127 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 7.09e-01 0.0369 0.0985 0.127 NK L1
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 3.78e-02 -0.173 0.0827 0.127 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0916 0.0713 0.127 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 1.23e-01 0.142 0.0915 0.127 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 7.67e-01 0.0199 0.0671 0.127 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0376 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 2.84e-01 0.142 0.132 0.126 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 1.56e-01 -0.114 0.0802 0.126 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 5.70e-02 0.162 0.0847 0.126 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 2.29e-01 -0.127 0.105 0.126 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0628 0.05 0.126 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 8.39e-01 0.021 0.103 0.126 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00697 0.0675 0.126 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 1.42e-01 -0.146 0.099 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 8.44e-01 -0.029 0.148 0.128 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 2.92e-02 -0.286 0.13 0.128 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 4.82e-02 -0.255 0.128 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0486 0.0671 0.128 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 8.98e-01 0.0168 0.13 0.128 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 1.05e-01 0.238 0.146 0.128 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 8.47e-01 0.0257 0.133 0.128 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0763 0.114 0.128 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 5.36e-02 -0.248 0.128 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 2.30e-02 0.27 0.118 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 7.35e-01 0.0303 0.0894 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 2.06e-02 -0.262 0.112 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 9.74e-01 0.00294 0.0894 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 2.86e-01 0.129 0.12 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 4.70e-01 0.0743 0.103 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 7.44e-01 0.0415 0.127 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 1.69e-02 -0.314 0.131 0.125 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 7.02e-01 0.0501 0.131 0.125 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 4.92e-01 0.0685 0.0995 0.125 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 4.61e-01 0.0916 0.124 0.125 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 9.44e-01 0.00602 0.0854 0.125 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 5.30e-02 0.239 0.123 0.125 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 2.43e-01 -0.115 0.0978 0.125 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 5.48e-02 0.243 0.126 0.125 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0865 0.126 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 1.61e-01 0.146 0.104 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 4.07e-01 0.0737 0.0888 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 4.26e-02 -0.244 0.119 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0576 0.0698 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0532 0.102 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 3.11e-01 0.0723 0.0712 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 2.77e-01 0.119 0.109 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 3.82e-01 -0.108 0.124 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0104 0.128 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 2.60e-03 0.253 0.083 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0138 0.102 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 1.33e-01 -0.153 0.101 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 5.65e-01 0.0641 0.111 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 7.49e-01 0.0262 0.0819 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 2.00e-01 -0.168 0.131 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0299 0.128 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0679 0.12 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 1.77e-01 0.149 0.11 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 6.51e-01 0.0612 0.135 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0164 0.0787 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 4.68e-01 0.0912 0.125 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 2.19e-01 0.141 0.114 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 3.97e-01 -0.104 0.122 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0234 0.124 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 8.67e-01 0.0109 0.0654 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 3.28e-01 0.0756 0.077 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 7.93e-01 0.0267 0.102 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0971 0.0712 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 5.29e-01 0.0538 0.0853 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 2.87e-01 0.0611 0.0573 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0222 0.0926 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 2.94e-02 -0.258 0.118 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 1.83e-01 0.119 0.0892 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 9.61e-01 0.00432 0.0886 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0535 0.111 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0729 0.0643 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 7.47e-01 0.0291 0.0902 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 5.68e-01 0.0396 0.0694 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 5.94e-02 -0.17 0.0897 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 2.25e-01 -0.165 0.136 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 8.24e-01 0.0229 0.103 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 3.13e-01 0.0935 0.0924 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 7.83e-01 0.0297 0.108 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0915 0.0681 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0174 0.115 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 3.75e-01 -0.073 0.0821 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 3.58e-01 -0.101 0.109 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 6.78e-03 -0.367 0.134 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 2.41e-01 0.108 0.0918 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 6.16e-01 0.0491 0.0976 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 5.22e-01 -0.078 0.122 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0959 0.0772 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 9.47e-02 0.178 0.106 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 2.30e-01 0.103 0.0859 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0269 0.109 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0326 0.132 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 9.69e-01 0.00355 0.0924 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 8.59e-01 0.015 0.0846 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0766 0.102 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0775 0.072 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0406 0.102 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 3.35e-01 0.0519 0.0537 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 7.67e-03 -0.283 0.105 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 9.39e-02 -0.26 0.154 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 3.98e-01 -0.109 0.128 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 2.07e-01 -0.138 0.109 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0155 0.144 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 3.55e-01 0.0644 0.0694 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0535 0.118 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 3.80e-02 0.243 0.117 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 9.83e-02 -0.21 0.126 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0586 0.136 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0665 0.118 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 6.04e-01 0.0644 0.124 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 2.54e-01 -0.161 0.141 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0158 0.0872 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 8.86e-02 -0.226 0.132 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 2.11e-01 0.128 0.102 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0667 0.129 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 5.59e-01 0.0835 0.143 0.128 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 3.23e-02 -0.198 0.0917 0.128 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 4.00e-03 0.283 0.0971 0.128 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 2.77e-01 -0.143 0.131 0.128 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0807 0.0621 0.128 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 6.03e-01 0.0609 0.117 0.128 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 5.94e-01 0.0458 0.0859 0.128 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 1.59e-01 -0.162 0.115 0.128 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0668 0.135 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 2.23e-01 -0.128 0.105 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0568 0.115 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 3.46e-01 0.116 0.122 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0863 0.078 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 6.37e-01 0.0537 0.114 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 4.19e-01 0.0847 0.105 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 1.05e-01 -0.201 0.124 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0914 0.121 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0391 0.0796 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 2.95e-01 0.113 0.107 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 1.67e-02 -0.23 0.0952 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 1.47e-01 -0.109 0.0747 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 6.70e-01 0.0422 0.0989 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 7.21e-01 0.0239 0.0669 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 9.76e-01 0.00334 0.112 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 1.03e-01 -0.233 0.142 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0236 0.105 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0346 0.122 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0451 0.109 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 1.13e-01 -0.132 0.083 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 6.00e-01 0.0695 0.132 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 5.19e-01 0.0702 0.109 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 5.93e-01 -0.072 0.135 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 4.44e-02 -0.253 0.125 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0444 0.0851 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 3.93e-01 0.093 0.109 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 1.31e-01 -0.153 0.101 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 3.78e-01 -0.067 0.0759 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 5.72e-01 0.0635 0.112 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0145 0.0723 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0724 0.114 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 4.35e-01 -0.113 0.144 0.141 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 2.02e-03 0.463 0.147 0.141 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 6.39e-02 0.237 0.127 0.141 PB L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 2.86e-01 -0.104 0.0975 0.141 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 4.65e-02 -0.235 0.117 0.141 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 3.15e-02 0.299 0.137 0.141 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 4.93e-01 0.0672 0.0978 0.141 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 1.03e-01 -0.232 0.141 0.141 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 1.80e-01 0.183 0.136 0.126 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0347 0.104 0.126 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 4.99e-01 0.0738 0.109 0.126 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0255 0.101 0.126 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 4.11e-02 -0.129 0.0629 0.126 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0981 0.127 0.126 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0426 0.0817 0.126 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 1.74e-01 -0.168 0.123 0.126 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 4.22e-01 -0.103 0.128 0.126 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0586 0.12 0.126 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 6.17e-01 0.0438 0.0874 0.126 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 9.53e-01 0.00813 0.138 0.126 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0857 0.0763 0.126 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 1.98e-01 -0.142 0.11 0.126 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00833 0.0937 0.126 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 2.43e-01 -0.136 0.116 0.126 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 4.57e-01 -0.093 0.125 0.132 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00798 0.102 0.132 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 6.47e-01 0.0411 0.0895 0.132 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 7.72e-01 -0.029 0.1 0.132 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -650559 sc-eQTL 9.26e-03 -0.3 0.114 0.132 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 1.68e-01 0.184 0.133 0.132 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 3.95e-01 0.0933 0.109 0.132 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -650536 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0238 0.128 0.132 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 2.82e-01 0.14 0.13 0.132 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 2.25e-01 -0.121 0.0997 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 6.78e-01 0.0303 0.0729 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 3.57e-01 0.0662 0.0718 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00396 0.0785 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -650559 sc-eQTL 2.78e-01 -0.131 0.12 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 5.32e-01 0.0673 0.107 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0398 0.0904 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -650536 sc-eQTL 2.98e-02 0.273 0.125 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0393 0.0838 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 8.10e-01 0.0277 0.115 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 9.45e-01 0.00584 0.0846 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 4.27e-01 0.0626 0.0787 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0252 0.0752 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -650559 sc-eQTL 7.92e-01 0.0326 0.123 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 4.75e-01 0.0834 0.117 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0626 0.101 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -650536 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0368 0.135 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 9.32e-01 0.00923 0.108 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0248 0.163 0.121 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 3.31e-02 -0.276 0.128 0.121 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 2.84e-01 0.166 0.155 0.121 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 9.90e-01 0.00182 0.144 0.121 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 6.26e-01 0.0392 0.0802 0.121 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 6.16e-01 0.0803 0.16 0.121 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 1.64e-01 0.167 0.12 0.121 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0657 0.145 0.121 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 6.01e-01 0.07 0.134 0.129 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 7.19e-01 0.0324 0.09 0.129 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 4.59e-01 0.0665 0.0896 0.129 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 8.73e-01 0.0124 0.0777 0.129 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -650559 sc-eQTL 5.05e-03 -0.336 0.119 0.129 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0755 0.125 0.129 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0104 0.114 0.129 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -650536 sc-eQTL 4.04e-01 0.113 0.135 0.129 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 1.62e-01 -0.162 0.115 0.129 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 9.26e-01 0.0115 0.124 0.124 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0795 0.106 0.124 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 2.11e-02 0.17 0.073 0.124 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0713 0.0934 0.124 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -650559 sc-eQTL 2.64e-01 -0.133 0.119 0.124 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0354 0.0898 0.124 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 9.17e-01 0.0112 0.108 0.124 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -650536 sc-eQTL 6.33e-01 0.0634 0.132 0.124 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0819 0.117 0.124 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 9.70e-01 0.00554 0.146 0.113 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 1.52e-01 -0.177 0.123 0.113 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 6.62e-01 0.0497 0.113 0.113 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 8.49e-01 0.0219 0.115 0.113 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -650559 sc-eQTL 6.97e-01 -0.044 0.113 0.113 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 6.50e-02 0.21 0.113 0.113 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 5.87e-01 0.0679 0.125 0.113 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -650536 sc-eQTL 3.97e-02 0.232 0.112 0.113 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0446 0.116 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 1.21e-03 -0.397 0.121 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 4.05e-01 0.0881 0.106 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 6.20e-01 0.0426 0.0857 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 9.31e-01 0.00986 0.113 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0753 0.0745 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 5.96e-04 0.387 0.111 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 1.90e-01 -0.104 0.0789 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 6.91e-02 0.229 0.125 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 1.63e-01 -0.166 0.118 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 2.55e-01 0.126 0.111 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 1.17e-01 0.129 0.082 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 6.08e-02 -0.226 0.12 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0992 0.0633 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0355 0.0948 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 2.81e-01 0.0717 0.0663 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 9.51e-01 0.00697 0.113 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0561 0.0924 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 9.79e-01 0.00197 0.0736 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 4.19e-01 0.0558 0.0688 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0307 0.068 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -650559 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0935 0.121 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 4.12e-01 0.0819 0.0996 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0633 0.0886 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -650536 sc-eQTL 2.23e-01 0.159 0.13 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0455 0.0815 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 4.61e-01 0.0916 0.124 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 8.99e-01 -0.011 0.0868 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 8.10e-02 0.115 0.0658 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00297 0.0811 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -650559 sc-eQTL 2.79e-03 -0.349 0.115 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0426 0.0733 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 5.71e-01 0.0609 0.107 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -650536 sc-eQTL 2.84e-01 0.14 0.13 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 3.26e-01 -0.107 0.109 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -731497 sc-eQTL 2.86e-02 -0.254 0.115 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 822563 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0544 0.0815 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 sc-eQTL 5.54e-01 0.0599 0.101 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -65407 sc-eQTL 2.35e-02 -0.192 0.0843 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 174798 sc-eQTL 1.57e-01 -0.105 0.074 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -946249 sc-eQTL 1.84e-01 0.129 0.0968 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -986733 sc-eQTL 4.64e-01 0.046 0.0626 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 173779 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00203 0.104 0.125 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 eQTL 0.0058 0.0838 0.0303 0.0 0.0 0.112

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -361519 1.21e-06 8.34e-07 2.06e-07 4.14e-07 1.56e-07 3.36e-07 6.87e-07 2.62e-07 8.39e-07 2.85e-07 1.07e-06 5.39e-07 1.15e-06 1.97e-07 3.86e-07 4.53e-07 6.37e-07 5.02e-07 3.5e-07 3.31e-07 2.57e-07 5.66e-07 5.49e-07 3.59e-07 1.38e-06 2.44e-07 4.97e-07 4.59e-07 6.84e-07 8.47e-07 4.08e-07 4.57e-08 1.18e-07 2.46e-07 3.28e-07 3e-07 2.04e-07 1.24e-07 1.01e-07 1.83e-08 1.93e-07 9.49e-07 6.3e-08 1.23e-08 1.82e-07 4.43e-08 1.82e-07 8.16e-08 4.96e-08
ENSG00000118503 \N 174798 2.14e-06 2.62e-06 3.19e-07 1.67e-06 5.79e-07 8.1e-07 1.59e-06 6.57e-07 1.86e-06 9.51e-07 2.11e-06 1.26e-06 3.49e-06 1.15e-06 8.27e-07 1.64e-06 1.1e-06 2.26e-06 9.61e-07 1.31e-06 1.14e-06 2.82e-06 2.22e-06 9.91e-07 3.3e-06 1.26e-06 1.28e-06 1.69e-06 2e-06 1.84e-06 1.31e-06 3.27e-07 5.45e-07 1.22e-06 1e-06 9.47e-07 7.76e-07 4.03e-07 1.11e-06 3.97e-07 2.4e-07 3.27e-06 4.16e-07 1.9e-07 2.91e-07 3.34e-07 8.41e-07 2.46e-07 1.53e-07