logo

Genes within 1Mb (chr6:138040702:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0225 0.113 0.107 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 7.71e-01 -0.032 0.11 0.107 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 7.04e-02 -0.155 0.0853 0.107 B L1
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 5.73e-01 0.0484 0.0858 0.107 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0206 0.0691 0.107 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 6.72e-02 -0.177 0.096 0.107 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0527 0.0567 0.107 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 6.94e-01 0.0429 0.109 0.107 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 7.69e-01 0.037 0.126 0.107 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 6.70e-02 0.135 0.0731 0.107 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 7.05e-01 0.032 0.0845 0.107 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 1.61e-01 -0.112 0.0793 0.107 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0639 0.0746 0.107 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 2.98e-01 -0.086 0.0824 0.107 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0371 0.0605 0.107 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 6.13e-01 0.0475 0.094 0.107 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0673 0.138 0.107 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 1.95e-01 0.109 0.0842 0.107 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 8.39e-01 0.0184 0.0905 0.107 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00237 0.0922 0.107 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 6.24e-01 0.0349 0.0711 0.107 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 1.08e-01 -0.149 0.0925 0.107 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 2.44e-01 0.0617 0.0528 0.107 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 8.06e-01 0.0257 0.105 0.107 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0124 0.138 0.101 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 5.00e-01 0.0689 0.102 0.101 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0654 0.0966 0.101 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 6.08e-01 -0.056 0.109 0.101 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -651869 sc-eQTL 1.41e-01 0.185 0.125 0.101 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 7.85e-02 -0.196 0.111 0.101 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 2.40e-01 0.128 0.109 0.101 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -651846 sc-eQTL 1.16e-01 0.207 0.131 0.101 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 5.08e-01 0.0737 0.111 0.101 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0197 0.103 0.107 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 4.06e-01 0.0729 0.0874 0.107 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0164 0.0711 0.107 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 8.88e-02 0.126 0.0738 0.107 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -651869 sc-eQTL 9.40e-01 0.0101 0.134 0.107 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0404 0.0786 0.107 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 2.98e-01 0.107 0.102 0.107 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -651846 sc-eQTL 1.56e-01 0.198 0.139 0.107 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 1.66e-01 0.127 0.0917 0.107 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 5.96e-01 0.0648 0.122 0.105 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 8.37e-01 0.0194 0.094 0.105 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 6.37e-01 -0.051 0.108 0.105 NK L1
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0856 0.0913 0.105 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00799 0.0783 0.105 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 2.54e-01 0.115 0.1 0.105 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 1.42e-02 0.179 0.0724 0.105 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0916 0.111 0.105 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0588 0.145 0.107 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 5.21e-01 0.0565 0.088 0.107 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0691 0.0933 0.107 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 1.94e-01 0.149 0.115 0.107 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 1.70e-01 0.0751 0.0546 0.107 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 5.03e-01 0.0754 0.112 0.107 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 7.10e-01 0.0275 0.0737 0.107 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 2.76e-01 -0.118 0.108 0.107 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 3.79e-01 0.147 0.167 0.105 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 3.11e-01 -0.152 0.149 0.105 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 3.12e-01 -0.148 0.146 0.105 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 6.47e-01 0.0349 0.0761 0.105 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 7.53e-02 -0.262 0.146 0.105 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 6.32e-01 -0.08 0.167 0.105 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0772 0.151 0.105 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0492 0.129 0.105 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 5.19e-01 0.0902 0.14 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0577 0.129 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 9.34e-01 0.00809 0.0969 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 1.88e-02 0.288 0.122 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 9.37e-01 0.00764 0.0968 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 3.86e-01 -0.113 0.131 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 9.02e-01 0.0138 0.111 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 9.09e-01 0.0157 0.137 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 3.98e-02 0.29 0.14 0.108 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 7.19e-01 0.0504 0.14 0.108 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0784 0.106 0.108 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 3.25e-01 -0.131 0.132 0.108 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0404 0.0912 0.108 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 5.42e-01 0.0809 0.132 0.108 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 5.74e-01 0.0589 0.105 0.108 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 4.23e-01 -0.109 0.136 0.108 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 2.79e-01 -0.144 0.133 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0367 0.11 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0653 0.0937 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0232 0.127 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0551 0.0737 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0805 0.107 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 3.89e-02 -0.155 0.0745 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 6.95e-01 0.0453 0.116 0.107 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 3.21e-01 0.132 0.133 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 1.71e-01 -0.188 0.137 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 2.24e-01 -0.11 0.0907 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0348 0.109 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 3.55e-01 -0.101 0.109 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 9.65e-02 -0.198 0.119 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 1.29e-01 -0.133 0.0875 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 2.54e-01 0.161 0.141 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 8.05e-01 0.033 0.133 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 6.76e-01 0.0522 0.125 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 4.41e-01 -0.089 0.115 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 7.08e-01 0.0527 0.14 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0163 0.0819 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 8.64e-01 0.0225 0.131 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0631 0.119 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0519 0.127 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 8.35e-01 0.0277 0.133 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 8.83e-02 0.119 0.0696 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00129 0.0827 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 8.35e-01 0.0228 0.109 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0318 0.0766 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 4.84e-01 -0.064 0.0913 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0362 0.0615 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 8.05e-01 0.0245 0.0992 0.107 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0566 0.131 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 3.05e-01 -0.101 0.0983 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 2.74e-01 0.107 0.0972 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 2.00e-01 -0.156 0.122 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0696 0.0708 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0574 0.0992 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0196 0.0764 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00813 0.0995 0.107 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 7.65e-01 0.0437 0.146 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 4.25e-02 0.224 0.11 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0146 0.0996 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0657 0.116 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0878 0.0733 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0205 0.124 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0882 0.0881 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 3.98e-01 0.0997 0.118 0.107 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 3.99e-01 -0.126 0.149 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00818 0.101 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0919 0.107 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 4.46e-01 -0.102 0.133 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 8.18e-02 0.147 0.0842 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 3.06e-01 -0.119 0.116 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 6.12e-02 0.176 0.0935 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0225 0.119 0.107 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 9.44e-01 0.00991 0.141 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 2.41e-01 0.115 0.098 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 7.70e-01 0.0264 0.0901 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 7.77e-01 0.0307 0.108 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0837 0.0767 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 3.24e-01 -0.108 0.109 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0113 0.0572 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 3.51e-01 0.106 0.113 0.107 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 3.32e-01 -0.151 0.156 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 5.05e-01 -0.086 0.129 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 9.78e-01 0.00296 0.11 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 1.91e-01 0.19 0.144 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0234 0.0699 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 9.61e-03 -0.305 0.117 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 2.67e-01 -0.131 0.118 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 1.31e-01 0.193 0.127 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 2.35e-01 0.171 0.143 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 5.11e-01 0.0819 0.124 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 2.05e-01 -0.165 0.13 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 8.99e-01 0.0189 0.149 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 1.10e-01 0.147 0.0912 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 5.75e-01 0.0787 0.14 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 9.07e-01 0.0127 0.108 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 6.81e-01 -0.056 0.136 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0327 0.158 0.104 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 4.65e-01 0.075 0.102 0.104 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 3.17e-01 -0.11 0.109 0.104 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 8.56e-01 0.0263 0.145 0.104 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 4.55e-01 0.0516 0.0689 0.104 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 5.25e-01 0.0823 0.129 0.104 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 8.17e-01 -0.022 0.0951 0.104 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0788 0.128 0.104 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 1.92e-01 0.183 0.139 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 5.74e-01 0.0616 0.109 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 3.31e-01 -0.116 0.119 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0976 0.127 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 9.08e-01 0.00941 0.0814 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 6.33e-02 0.219 0.117 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 7.38e-01 0.0365 0.109 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0655 0.13 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 2.28e-01 -0.159 0.132 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0819 0.0867 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 3.01e-01 -0.121 0.117 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0454 0.105 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0115 0.0818 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 5.24e-01 0.0688 0.108 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 3.25e-02 0.155 0.0722 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 9.55e-02 -0.204 0.122 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 8.27e-01 0.0329 0.15 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 9.31e-01 0.00961 0.11 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0795 0.128 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 7.72e-01 -0.033 0.114 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 9.28e-01 0.0079 0.0874 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 6.99e-01 0.0537 0.138 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 1.55e-01 0.162 0.113 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0767 0.141 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 3.01e-01 0.139 0.134 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 5.63e-01 0.0523 0.0902 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 3.45e-01 0.109 0.115 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 4.19e-01 0.0869 0.107 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0561 0.0805 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 2.80e-01 -0.129 0.119 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 1.12e-01 0.122 0.0763 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 5.04e-01 0.0813 0.121 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 4.94e-01 -0.111 0.162 0.107 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 8.23e-01 0.0386 0.172 0.107 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 9.93e-01 0.00125 0.145 0.107 PB L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0414 0.11 0.107 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0662 0.133 0.107 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0599 0.157 0.107 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0515 0.11 0.107 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0887 0.16 0.107 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0385 0.148 0.104 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 3.29e-01 0.111 0.113 0.104 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 2.81e-01 0.128 0.118 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 1.30e-01 0.165 0.109 0.104 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 6.00e-02 0.129 0.0684 0.104 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 4.06e-01 -0.115 0.137 0.104 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 4.75e-01 0.0635 0.0887 0.104 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 4.30e-01 0.106 0.134 0.104 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 3.35e-01 0.136 0.141 0.107 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 5.96e-02 0.249 0.132 0.107 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 9.83e-01 0.00208 0.0963 0.107 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 1.11e-01 -0.241 0.151 0.107 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 7.30e-01 0.0292 0.0844 0.107 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 9.87e-01 0.00193 0.121 0.107 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0191 0.103 0.107 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 4.83e-01 0.0903 0.129 0.107 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 6.25e-01 0.0689 0.141 0.095 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 9.37e-01 0.00905 0.115 0.095 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0438 0.101 0.095 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0668 0.113 0.095 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -651869 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0216 0.131 0.095 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 1.75e-01 -0.205 0.151 0.095 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 6.35e-01 0.0589 0.124 0.095 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -651846 sc-eQTL 9.26e-01 0.0136 0.145 0.095 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 7.08e-01 0.0553 0.147 0.095 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 5.88e-01 -0.06 0.111 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 3.82e-01 0.0706 0.0806 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0376 0.0796 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 9.52e-02 0.145 0.0864 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -651869 sc-eQTL 3.82e-01 -0.117 0.133 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 1.89e-02 -0.278 0.117 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 7.11e-01 0.0372 0.1 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -651846 sc-eQTL 5.24e-01 0.0891 0.139 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 1.64e-01 0.129 0.0924 0.107 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 7.79e-01 -0.036 0.128 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 4.09e-01 0.0777 0.0939 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0223 0.0876 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 3.16e-02 0.179 0.0826 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -651869 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00982 0.137 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 6.22e-01 0.064 0.13 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 1.09e-01 0.18 0.112 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -651846 sc-eQTL 3.81e-01 0.132 0.15 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 4.53e-01 0.0901 0.12 0.107 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 2.32e-01 0.2 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 3.85e-01 0.117 0.134 0.109 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0466 0.16 0.109 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 9.01e-01 0.0184 0.148 0.109 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 1.83e-01 -0.11 0.0819 0.109 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 3.62e-01 -0.15 0.164 0.109 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 1.09e-01 -0.198 0.123 0.109 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 3.14e-01 0.15 0.149 0.109 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 2.41e-01 0.17 0.145 0.107 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 1.46e-01 0.142 0.0974 0.107 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00475 0.0977 0.107 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 4.04e-01 0.0705 0.0844 0.107 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -651869 sc-eQTL 9.05e-01 0.0157 0.132 0.107 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 1.27e-01 -0.207 0.135 0.107 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 2.86e-01 0.132 0.124 0.107 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -651846 sc-eQTL 5.51e-01 0.0881 0.148 0.107 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 8.89e-01 0.0176 0.126 0.107 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 5.63e-01 0.0847 0.146 0.102 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 5.72e-01 0.0705 0.124 0.102 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 2.13e-01 -0.109 0.0869 0.102 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 1.59e-01 0.155 0.11 0.102 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -651869 sc-eQTL 9.87e-01 0.00232 0.14 0.102 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 7.13e-01 -0.039 0.106 0.102 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 7.60e-01 0.039 0.127 0.102 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -651846 sc-eQTL 8.59e-01 0.0278 0.156 0.102 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00975 0.138 0.102 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 4.55e-01 0.118 0.158 0.096 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 7.98e-01 0.0344 0.134 0.096 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 7.39e-01 0.041 0.123 0.096 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 4.11e-01 -0.102 0.124 0.096 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -651869 sc-eQTL 5.06e-02 0.238 0.121 0.096 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00704 0.124 0.096 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 5.87e-02 0.255 0.134 0.096 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -651846 sc-eQTL 3.85e-02 0.253 0.121 0.096 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 4.02e-01 0.106 0.126 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 3.16e-01 0.136 0.135 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0136 0.116 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0626 0.0939 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 6.87e-01 0.05 0.124 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0321 0.0818 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0648 0.125 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 1.31e-01 0.131 0.0863 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 4.17e-01 -0.112 0.138 0.107 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0639 0.124 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0688 0.116 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 3.49e-01 -0.081 0.0862 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0576 0.127 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0279 0.0666 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 1.67e-01 -0.137 0.0989 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 1.48e-02 -0.169 0.0687 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 2.98e-01 0.123 0.118 0.107 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0593 0.102 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 4.14e-01 0.0665 0.0813 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0247 0.0762 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 5.61e-02 0.143 0.0747 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -651869 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0667 0.134 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 3.05e-01 -0.113 0.11 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 3.89e-01 0.0845 0.0979 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -651846 sc-eQTL 5.25e-01 0.0914 0.144 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 2.04e-01 0.115 0.0899 0.107 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 8.79e-01 0.0213 0.14 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000921 0.0981 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0448 0.0748 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 7.08e-01 0.0344 0.0916 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -651869 sc-eQTL 3.99e-01 0.112 0.133 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0377 0.0828 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 7.64e-01 0.0365 0.121 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -651846 sc-eQTL 1.06e-01 0.237 0.146 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 5.59e-01 0.0718 0.123 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -732807 sc-eQTL 9.16e-01 0.0134 0.127 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0443 0.0889 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -362829 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0327 0.11 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -66717 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0609 0.093 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 173488 sc-eQTL 9.95e-01 0.000505 0.0811 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -947559 sc-eQTL 7.78e-01 0.03 0.106 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -988043 sc-eQTL 1.88e-02 0.16 0.0675 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 172469 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0792 0.113 0.106 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 821253 eQTL 0.116 -0.0362 0.023 0.00282 0.0 0.0976
ENSG00000220412 AL356234.1 333501 eQTL 0.0369 -0.0856 0.0409 0.00138 0.0 0.0976
ENSG00000237499 AL357060.1 172469 eQTL 0.0613 -0.0398 0.0212 0.00101 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N -362829 1.25e-06 8.81e-07 3.06e-07 3.44e-07 1.77e-07 3.3e-07 8.7e-07 3.3e-07 1.11e-06 3.11e-07 1.19e-06 5.77e-07 1.47e-06 2.19e-07 4.21e-07 6e-07 7.43e-07 5.67e-07 3.71e-07 4.13e-07 3.07e-07 8.58e-07 6.11e-07 4.66e-07 1.66e-06 3.02e-07 6.38e-07 4.94e-07 8.4e-07 9.3e-07 4.59e-07 3.8e-08 1.49e-07 4.04e-07 3.35e-07 3.98e-07 3.79e-07 1.41e-07 1.49e-07 4.2e-08 2.99e-07 1.23e-06 6.23e-08 2.64e-08 1.82e-07 7.03e-08 1.9e-07 8.57e-08 9.13e-08