logo

Genes within 1Mb (chr6:138037755:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 3.05e-01 0.155 0.151 0.058 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0556 0.147 0.058 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 1.81e-01 0.154 0.115 0.058 B L1
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0474 0.115 0.058 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 1.87e-01 -0.122 0.0925 0.058 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0475 0.13 0.058 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 9.16e-01 0.00807 0.0764 0.058 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 8.97e-02 -0.247 0.145 0.058 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 1.27e-01 0.254 0.166 0.058 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 9.86e-01 0.00172 0.0977 0.058 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 3.97e-01 0.095 0.112 0.058 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 6.34e-01 0.0504 0.106 0.058 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 5.18e-01 -0.064 0.0989 0.058 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 3.45e-01 -0.103 0.109 0.058 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0889 0.08 0.058 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 8.03e-01 0.0311 0.125 0.058 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 1.77e-01 0.249 0.184 0.058 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 6.60e-01 0.0497 0.113 0.058 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 8.62e-01 0.021 0.121 0.058 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 9.88e-02 -0.203 0.122 0.058 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0889 0.0948 0.058 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0284 0.124 0.058 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0832 0.0705 0.058 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 9.55e-01 0.00785 0.139 0.058 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 3.85e-01 0.159 0.183 0.056 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 2.87e-01 0.144 0.135 0.056 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 9.76e-01 0.0039 0.129 0.056 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 6.71e-01 0.0617 0.145 0.056 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -654816 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0205 0.168 0.056 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 5.58e-02 0.283 0.147 0.056 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 3.83e-01 -0.127 0.145 0.056 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -654793 sc-eQTL 1.36e-01 0.261 0.174 0.056 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 3.75e-01 -0.131 0.147 0.056 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 6.24e-01 0.0642 0.131 0.058 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 2.25e-01 0.135 0.111 0.058 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 2.13e-01 -0.113 0.0901 0.058 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0536 0.0945 0.058 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -654816 sc-eQTL 2.00e-01 -0.219 0.17 0.058 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0344 0.1 0.058 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0116 0.13 0.058 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -654793 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0859 0.178 0.058 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0569 0.117 0.058 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0348 0.159 0.058 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 8.01e-01 -0.031 0.123 0.058 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0545 0.14 0.058 NK L1
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0253 0.119 0.058 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 9.18e-01 0.0105 0.102 0.058 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 2.60e-01 -0.148 0.131 0.058 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0175 0.0958 0.058 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 5.66e-01 0.0831 0.145 0.058 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 1.72e-01 0.261 0.19 0.058 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 5.72e-01 0.0658 0.116 0.058 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 6.49e-01 0.0563 0.123 0.058 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 2.12e-01 0.19 0.152 0.058 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0656 0.0724 0.058 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 9.72e-01 0.00529 0.149 0.058 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 9.17e-01 0.0102 0.0975 0.058 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 4.44e-01 0.11 0.144 0.058 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 4.45e-01 0.157 0.205 0.064 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0931 0.183 0.064 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0564 0.18 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 2.54e-01 -0.107 0.093 0.064 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 2.99e-01 -0.188 0.181 0.064 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 9.27e-01 0.0187 0.205 0.064 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 4.89e-01 0.128 0.185 0.064 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 3.50e-01 0.148 0.158 0.064 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 4.06e-01 0.157 0.189 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0141 0.175 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 4.74e-01 0.0938 0.131 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 3.14e-01 -0.168 0.166 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 5.88e-01 -0.071 0.131 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 2.36e-01 -0.209 0.176 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 3.63e-01 -0.137 0.15 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 2.49e-01 -0.214 0.185 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 2.47e-01 -0.22 0.19 0.058 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0364 0.188 0.058 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 7.30e-01 0.0494 0.143 0.058 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 2.67e-01 0.198 0.178 0.058 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00879 0.123 0.058 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 4.01e-01 0.15 0.178 0.058 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 5.17e-01 0.0914 0.141 0.058 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 4.76e-01 0.13 0.182 0.058 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 8.20e-01 0.0414 0.182 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 7.63e-01 0.0454 0.15 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 7.02e-01 0.049 0.128 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 2.74e-01 -0.19 0.173 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0642 0.101 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0692 0.147 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 5.07e-01 0.0682 0.103 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 3.12e-01 -0.16 0.157 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 2.03e-02 0.422 0.18 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 5.39e-01 0.116 0.188 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 1.49e-01 0.18 0.124 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 3.82e-01 0.131 0.15 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0245 0.15 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 2.77e-01 0.178 0.164 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00883 0.121 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 2.62e-01 -0.217 0.193 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 9.85e-01 0.00342 0.179 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 8.56e-01 0.0303 0.167 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 5.12e-01 0.101 0.154 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 2.56e-01 0.213 0.187 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0744 0.11 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 4.39e-01 -0.136 0.175 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 9.70e-02 -0.264 0.158 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 7.23e-02 -0.306 0.169 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 2.96e-01 0.184 0.175 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 9.00e-01 0.0117 0.093 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 3.99e-01 0.0926 0.11 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 8.47e-02 0.249 0.144 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0577 0.102 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 6.68e-01 0.052 0.121 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0861 0.0814 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 3.87e-01 0.114 0.131 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 2.65e-01 0.19 0.17 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0979 0.128 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 5.54e-01 0.0751 0.127 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 4.37e-01 0.123 0.159 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0275 0.0922 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 1.76e-01 -0.174 0.129 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 6.19e-01 0.0494 0.0992 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 8.39e-01 0.0264 0.129 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 8.10e-01 0.0467 0.194 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 9.46e-01 0.00994 0.147 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0321 0.132 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 7.27e-01 0.0536 0.153 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0612 0.0974 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0449 0.164 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0274 0.117 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 3.16e-01 0.157 0.156 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 1.43e-01 0.291 0.198 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0366 0.134 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0941 0.142 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 2.98e-01 -0.185 0.177 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 4.74e-01 0.081 0.113 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 5.17e-01 -0.101 0.155 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0514 0.126 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 6.56e-01 0.0708 0.159 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 1.68e-01 0.264 0.191 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 3.39e-01 0.128 0.133 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 9.42e-01 0.00893 0.123 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 3.26e-02 -0.313 0.146 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 1.48e-01 -0.151 0.104 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0595 0.148 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0993 0.0775 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 7.02e-01 0.0592 0.155 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0293 0.212 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 5.62e-01 0.102 0.175 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 2.66e-01 -0.165 0.148 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0923 0.196 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 8.78e-01 0.0145 0.0947 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0582 0.161 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 7.74e-02 0.282 0.159 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 3.03e-01 -0.179 0.173 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 1.55e-01 0.276 0.193 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 3.18e-01 0.168 0.168 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 2.76e-01 0.192 0.176 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 3.32e-01 -0.195 0.201 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 4.95e-01 0.0846 0.124 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 3.43e-01 0.179 0.189 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 9.73e-01 0.0049 0.146 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 4.07e-01 -0.152 0.183 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 6.02e-01 0.112 0.214 0.056 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 6.98e-01 0.0539 0.139 0.056 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 2.57e-01 0.168 0.148 0.056 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 3.04e-01 0.202 0.196 0.056 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0395 0.0935 0.056 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 8.03e-01 0.0437 0.175 0.056 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 5.25e-01 0.082 0.129 0.056 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0409 0.173 0.056 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 3.35e-01 -0.178 0.184 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 6.86e-01 0.0583 0.144 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0749 0.157 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0705 0.168 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0846 0.107 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 5.98e-01 0.0825 0.156 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 4.21e-01 0.116 0.144 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 4.04e-01 0.143 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 1.00e+00 -3.96e-05 0.172 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 8.64e-01 0.0194 0.113 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 7.57e-01 0.0473 0.152 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 6.34e-01 0.0651 0.137 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0131 0.106 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 3.62e-01 -0.128 0.14 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 7.14e-01 0.0348 0.0948 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 6.96e-01 0.0623 0.159 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 3.93e-01 -0.164 0.191 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 1.00e+00 -8.74e-05 0.141 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 4.04e-01 -0.136 0.163 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 2.30e-01 -0.174 0.145 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 1.48e-01 0.161 0.111 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 1.52e-01 -0.253 0.176 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 9.02e-01 0.018 0.146 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 7.98e-01 0.0462 0.18 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 9.00e-01 0.0223 0.177 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 8.33e-01 0.0252 0.119 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 3.19e-01 -0.152 0.152 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 9.03e-01 0.0173 0.142 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 8.40e-01 0.0215 0.106 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 5.14e-01 -0.103 0.157 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0492 0.101 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 5.53e-01 0.0951 0.16 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 6.11e-01 0.121 0.238 0.056 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 5.36e-03 0.69 0.243 0.056 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 1.80e-01 -0.283 0.21 0.056 PB L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 5.00e-02 0.314 0.158 0.056 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 6.18e-01 0.0977 0.195 0.056 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 5.55e-01 0.136 0.23 0.056 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0334 0.161 0.056 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0699 0.235 0.056 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 6.54e-01 0.0897 0.2 0.059 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 2.46e-01 0.177 0.152 0.059 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0407 0.159 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 9.05e-01 0.0176 0.147 0.059 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0512 0.0928 0.059 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 2.90e-01 -0.196 0.185 0.059 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 7.67e-01 0.0354 0.12 0.059 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 8.57e-01 0.0326 0.18 0.059 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 1.92e-04 0.68 0.179 0.058 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 1.21e-01 -0.27 0.173 0.058 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 7.39e-01 0.0421 0.126 0.058 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 1.58e-01 -0.281 0.198 0.058 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0564 0.111 0.058 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0242 0.159 0.058 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 7.18e-01 0.049 0.135 0.058 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 9.57e-01 0.00915 0.169 0.058 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 5.59e-01 0.109 0.186 0.054 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 4.14e-01 0.124 0.152 0.054 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 6.97e-01 0.0521 0.134 0.054 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0316 0.15 0.054 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -654816 sc-eQTL 8.23e-01 0.039 0.174 0.054 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 8.44e-02 0.344 0.198 0.054 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0147 0.164 0.054 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -654793 sc-eQTL 3.63e-01 0.174 0.191 0.054 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 3.49e-01 0.183 0.195 0.054 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 8.55e-01 0.0264 0.144 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 3.51e-01 0.0977 0.105 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 5.94e-01 0.0551 0.103 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0897 0.113 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -654816 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0659 0.173 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 4.78e-01 0.11 0.154 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0605 0.13 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -654793 sc-eQTL 6.52e-01 0.0819 0.181 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0542 0.12 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 4.25e-01 0.133 0.166 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 4.87e-01 0.085 0.122 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0599 0.114 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0689 0.108 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -654816 sc-eQTL 3.82e-01 -0.156 0.178 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 2.15e-01 -0.209 0.168 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 3.34e-01 0.141 0.146 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -654793 sc-eQTL 1.64e-01 -0.271 0.194 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 2.73e-01 -0.171 0.155 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 4.01e-01 0.183 0.218 0.058 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 9.53e-01 0.0104 0.175 0.058 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 5.78e-01 0.116 0.208 0.058 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 8.99e-01 0.0245 0.193 0.058 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0403 0.107 0.058 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 4.17e-01 -0.174 0.214 0.058 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 4.47e-01 -0.123 0.161 0.058 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 1.87e-02 0.454 0.191 0.058 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 9.46e-01 0.0132 0.195 0.058 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 1.57e-01 -0.185 0.13 0.058 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0737 0.131 0.058 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 2.77e-01 -0.123 0.113 0.058 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -654816 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0381 0.176 0.058 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 1.11e-01 -0.29 0.181 0.058 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0525 0.166 0.058 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -654793 sc-eQTL 6.43e-01 0.0917 0.198 0.058 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 9.10e-01 0.0191 0.169 0.058 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 7.30e-01 0.0614 0.177 0.059 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 5.69e-01 -0.086 0.151 0.059 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 4.60e-01 0.0783 0.106 0.059 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0817 0.134 0.059 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -654816 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0794 0.17 0.059 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 4.58e-01 0.0954 0.128 0.059 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 7.41e-02 -0.276 0.154 0.059 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -654793 sc-eQTL 5.89e-01 -0.102 0.189 0.059 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 4.31e-01 0.132 0.167 0.059 ncMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 8.84e-01 0.0266 0.181 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 4.43e-01 -0.119 0.155 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 2.97e-01 0.131 0.125 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 1.35e-01 0.247 0.165 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 3.51e-01 -0.102 0.109 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0379 0.167 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0223 0.116 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 4.76e-01 -0.132 0.185 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 1.94e-01 0.221 0.169 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 6.59e-01 0.0702 0.159 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 2.86e-01 0.126 0.118 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 4.34e-01 -0.135 0.173 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0896 0.0907 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0249 0.135 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 5.47e-01 0.0573 0.0949 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 2.16e-01 -0.2 0.161 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 7.55e-01 0.0412 0.132 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 2.04e-01 0.133 0.105 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0248 0.0983 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0809 0.097 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -654816 sc-eQTL 3.25e-01 -0.17 0.173 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 6.63e-01 -0.062 0.142 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 9.56e-01 0.00697 0.127 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -654793 sc-eQTL 8.47e-01 0.0358 0.186 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0934 0.116 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 2.22e-01 0.215 0.176 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0824 0.123 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0318 0.0942 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 7.75e-01 -0.033 0.115 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -654816 sc-eQTL 5.30e-01 -0.105 0.167 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00956 0.104 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 2.42e-01 -0.178 0.152 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -654793 sc-eQTL 8.42e-01 0.0369 0.185 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 1.65e-01 0.215 0.154 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -735754 sc-eQTL 7.55e-01 0.0518 0.166 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 818306 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0284 0.116 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0614 0.144 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -69664 sc-eQTL 6.21e-01 -0.06 0.121 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 170541 sc-eQTL 8.59e-01 0.0188 0.105 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -950506 sc-eQTL 1.78e-01 -0.186 0.137 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -990990 sc-eQTL 8.68e-01 0.0148 0.089 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 169522 sc-eQTL 5.82e-01 0.0814 0.148 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -365776 eQTL 0.000721 -0.138 0.0406 0.0 0.0 0.0554
ENSG00000226004 AL591468.1 91953 eQTL 0.00301 -0.141 0.0475 0.0 0.0 0.0554

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226004 AL591468.1 91953 4.83e-06 5.09e-06 6.82e-07 3.06e-06 1.52e-06 1.5e-06 6.18e-06 1.09e-06 4.98e-06 2.99e-06 6.38e-06 3.29e-06 7.82e-06 1.92e-06 1.12e-06 4.09e-06 1.89e-06 3.95e-06 1.49e-06 1.5e-06 2.71e-06 4.98e-06 4.67e-06 1.92e-06 8.14e-06 2.16e-06 2.24e-06 1.55e-06 5.08e-06 5.83e-06 2.87e-06 4.15e-07 7.87e-07 2.26e-06 2.05e-06 1.32e-06 1.07e-06 5e-07 9.26e-07 6.69e-07 8.23e-07 6.44e-06 4.73e-07 1.65e-07 7.99e-07 1.21e-06 1.16e-06 6.84e-07 6.13e-07