logo

Genes within 1Mb (chr6:138027639:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0761 0.116 0.098 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0143 0.113 0.098 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 3.63e-02 -0.185 0.0879 0.098 B L1
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 7.76e-01 0.0253 0.0887 0.098 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0326 0.0714 0.098 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 3.13e-01 -0.101 0.0998 0.098 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 6.57e-01 0.0499 0.112 0.098 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 9.29e-01 0.0116 0.129 0.098 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 2.48e-01 0.0876 0.0755 0.098 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 4.35e-01 0.0679 0.0868 0.098 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0894 0.0817 0.098 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 1.78e-01 -0.103 0.0764 0.098 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 1.35e-01 -0.127 0.0844 0.098 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 8.79e-01 0.0147 0.0966 0.098 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0816 0.142 0.098 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 5.12e-01 0.0569 0.0867 0.098 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 5.44e-01 0.0565 0.0928 0.098 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 7.23e-01 0.0336 0.0946 0.098 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 6.98e-01 0.0284 0.073 0.098 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0638 0.0954 0.098 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 6.30e-01 0.0517 0.107 0.098 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00122 0.141 0.095 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 2.64e-01 0.117 0.104 0.095 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0762 0.0991 0.095 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 1.79e-01 -0.15 0.111 0.095 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -664932 sc-eQTL 3.18e-01 0.129 0.129 0.095 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 7.16e-02 -0.206 0.113 0.095 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -664909 sc-eQTL 2.55e-01 0.154 0.135 0.095 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 6.47e-01 0.0523 0.114 0.095 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0315 0.105 0.098 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 7.87e-01 0.0242 0.0893 0.098 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00731 0.0725 0.098 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 3.21e-01 0.0752 0.0756 0.098 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -664932 sc-eQTL 6.41e-01 0.0639 0.137 0.098 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 1.60e-01 -0.112 0.0798 0.098 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -664909 sc-eQTL 4.53e-01 0.107 0.142 0.098 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 2.12e-01 0.117 0.0936 0.098 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 4.78e-01 0.0892 0.125 0.097 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00867 0.0966 0.097 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 9.34e-01 0.00914 0.111 0.097 NK L1
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0382 0.0939 0.097 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0608 0.0803 0.097 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 5.74e-01 0.0581 0.103 0.097 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0555 0.114 0.097 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0887 0.151 0.098 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 8.34e-01 0.0192 0.0918 0.098 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0617 0.0972 0.098 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 2.66e-01 0.133 0.12 0.098 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 4.74e-01 0.0409 0.0571 0.098 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 1.59e-01 0.165 0.117 0.098 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0836 0.113 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 5.94e-01 0.0938 0.176 0.097 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 5.67e-01 -0.09 0.157 0.097 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 4.23e-01 -0.123 0.154 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 4.71e-01 0.0577 0.0799 0.097 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 5.36e-02 -0.298 0.154 0.097 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 9.88e-01 0.00257 0.175 0.097 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00135 0.136 0.097 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 6.79e-01 0.0601 0.145 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 6.35e-01 0.0638 0.134 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 7.49e-01 0.0322 0.101 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 1.71e-01 0.175 0.128 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 5.25e-01 -0.064 0.1 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 3.44e-01 -0.128 0.136 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 9.46e-01 0.00973 0.143 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 2.98e-02 0.318 0.145 0.099 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 3.87e-01 0.125 0.145 0.099 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 2.64e-01 -0.123 0.11 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 4.30e-01 -0.109 0.137 0.099 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 1.65e-01 -0.132 0.0943 0.099 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 7.34e-01 0.0468 0.138 0.099 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0748 0.141 0.099 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 1.91e-01 -0.18 0.137 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0539 0.114 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0959 0.0966 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0222 0.131 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0823 0.076 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 9.09e-01 0.0128 0.111 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 5.44e-01 0.0724 0.119 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 8.95e-01 0.0182 0.138 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 3.86e-01 -0.123 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0989 0.0942 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0285 0.114 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0975 0.113 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 1.70e-01 -0.17 0.124 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 9.29e-01 -0.013 0.147 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 7.47e-01 0.0445 0.138 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0229 0.129 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 6.89e-01 0.0478 0.119 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 6.55e-01 0.0649 0.145 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0399 0.0847 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 2.28e-01 0.163 0.135 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00765 0.132 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0225 0.137 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 2.03e-01 0.0921 0.0722 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 9.29e-01 0.00768 0.0855 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 4.44e-01 0.0865 0.113 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0493 0.0791 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0723 0.0943 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 7.40e-01 0.034 0.103 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0399 0.135 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0376 0.101 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 1.63e-01 0.14 0.0998 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0929 0.126 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0699 0.0728 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0324 0.102 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 7.70e-01 0.0299 0.102 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 6.32e-01 0.0722 0.15 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 4.41e-02 0.228 0.113 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 7.89e-01 0.0275 0.102 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0249 0.119 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 8.38e-02 -0.13 0.0751 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00879 0.127 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0265 0.121 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 4.36e-01 -0.119 0.153 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0309 0.103 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 9.99e-01 0.000197 0.109 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0754 0.136 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 1.84e-01 0.115 0.0865 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0589 0.119 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 7.01e-01 0.047 0.122 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 6.35e-01 0.0693 0.146 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 4.81e-01 0.0718 0.102 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 4.28e-01 0.074 0.0931 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 5.68e-01 0.0641 0.112 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0831 0.0794 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 6.05e-01 0.0584 0.113 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 3.10e-01 0.119 0.117 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 1.77e-01 -0.217 0.16 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0965 0.132 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 5.56e-01 0.0666 0.113 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 3.06e-01 0.153 0.149 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0334 0.0718 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 1.81e-03 -0.377 0.119 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 2.61e-01 0.148 0.131 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 4.24e-01 0.118 0.147 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 8.15e-01 0.0299 0.128 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 2.07e-01 -0.169 0.134 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 9.37e-01 0.0122 0.153 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 1.72e-01 0.129 0.0939 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 9.09e-01 0.0165 0.144 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0156 0.14 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0226 0.163 0.097 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 6.94e-01 0.0417 0.106 0.097 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0512 0.113 0.097 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 5.50e-01 0.0894 0.149 0.097 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 8.28e-01 0.0155 0.0712 0.097 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 1.28e-01 0.203 0.133 0.097 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0687 0.132 0.097 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 8.48e-02 0.248 0.143 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 4.25e-01 0.09 0.113 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0915 0.123 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 2.80e-01 -0.142 0.131 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0077 0.0839 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 3.18e-02 0.261 0.121 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0724 0.134 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 3.95e-01 -0.115 0.136 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0802 0.089 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 4.02e-01 -0.101 0.12 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0331 0.108 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0773 0.0838 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 9.66e-01 0.00472 0.111 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 1.32e-01 -0.189 0.125 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 8.79e-01 0.0237 0.155 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 9.95e-01 0.000778 0.114 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 9.21e-01 0.013 0.132 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0322 0.117 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0614 0.0899 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 8.21e-01 0.0324 0.143 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0405 0.145 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 4.23e-01 0.111 0.138 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 8.37e-01 0.0193 0.0934 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 1.13e-01 0.189 0.119 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 4.89e-01 0.077 0.111 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0876 0.0832 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 3.39e-01 -0.118 0.123 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 4.26e-01 0.1 0.126 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0619 0.161 0.107 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 6.64e-01 0.0742 0.17 0.107 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 5.13e-01 0.0939 0.143 0.107 PB L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0502 0.109 0.107 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0927 0.132 0.107 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0231 0.156 0.107 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0896 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 9.11e-01 0.0172 0.154 0.098 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 2.82e-01 0.127 0.117 0.098 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 3.48e-01 0.116 0.123 0.098 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 2.46e-01 0.132 0.113 0.098 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 4.15e-01 0.0586 0.0717 0.098 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 3.72e-01 -0.128 0.143 0.098 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 5.66e-01 0.08 0.139 0.098 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 2.95e-01 0.153 0.145 0.098 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 8.47e-02 0.236 0.136 0.098 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00884 0.0995 0.098 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 2.27e-01 -0.189 0.156 0.098 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0155 0.0871 0.098 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0025 0.125 0.098 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 7.19e-01 0.0479 0.133 0.098 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 7.19e-01 0.0522 0.145 0.09 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0321 0.118 0.09 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0428 0.104 0.09 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 2.42e-01 -0.136 0.116 0.09 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664932 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0995 0.134 0.09 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 2.33e-02 -0.35 0.153 0.09 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664909 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0547 0.149 0.09 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00133 0.151 0.09 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0517 0.114 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 8.90e-01 0.0115 0.0829 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0421 0.0816 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 3.52e-01 0.083 0.089 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664932 sc-eQTL 4.64e-01 -0.1 0.137 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 7.90e-03 -0.322 0.12 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664909 sc-eQTL 6.29e-01 0.0694 0.143 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 9.57e-02 0.158 0.0946 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 5.05e-01 0.0874 0.131 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 5.44e-01 0.0585 0.0962 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00718 0.0897 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 1.23e-01 0.132 0.0851 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664932 sc-eQTL 4.60e-01 0.104 0.14 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0617 0.133 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664909 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00797 0.154 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 9.03e-01 0.0151 0.123 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 7.24e-01 0.0632 0.179 0.094 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 3.27e-01 0.14 0.143 0.094 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0814 0.17 0.094 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0445 0.158 0.094 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0791 0.0877 0.094 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 5.64e-01 -0.101 0.175 0.094 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 1.56e-01 0.226 0.158 0.094 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 3.65e-01 0.137 0.151 0.098 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 1.44e-01 0.148 0.101 0.098 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0164 0.101 0.098 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 5.43e-01 0.0534 0.0877 0.098 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664932 sc-eQTL 8.30e-01 0.0294 0.137 0.098 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 3.81e-02 -0.292 0.14 0.098 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664909 sc-eQTL 9.58e-01 0.00804 0.153 0.098 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 9.14e-01 0.0141 0.131 0.098 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00362 0.148 0.093 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 7.54e-01 0.0396 0.126 0.093 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0497 0.0884 0.093 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 3.14e-01 0.113 0.112 0.093 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664932 sc-eQTL 9.52e-01 0.00855 0.143 0.093 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0245 0.107 0.093 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664909 sc-eQTL 9.44e-01 -0.011 0.158 0.093 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0512 0.14 0.093 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 2.32e-01 0.19 0.158 0.096 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 2.46e-01 0.157 0.134 0.096 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 3.36e-01 0.119 0.123 0.096 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 2.74e-01 -0.137 0.125 0.096 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664932 sc-eQTL 1.08e-01 0.198 0.122 0.096 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 7.76e-01 0.0355 0.125 0.096 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664909 sc-eQTL 7.20e-03 0.329 0.121 0.096 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 5.02e-01 0.0853 0.127 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 3.40e-01 0.135 0.141 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 4.25e-01 0.0963 0.121 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0854 0.0977 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 8.06e-01 0.0318 0.129 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0967 0.0849 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0769 0.13 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 5.28e-01 -0.091 0.144 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 3.40e-01 -0.123 0.129 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0553 0.12 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 2.20e-01 -0.11 0.089 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0344 0.131 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0405 0.0689 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 6.54e-01 -0.046 0.103 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 4.39e-01 0.0951 0.123 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0119 0.105 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 8.45e-01 0.0163 0.0833 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0248 0.078 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 2.21e-01 0.0943 0.0768 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -664932 sc-eQTL 9.35e-01 0.0111 0.137 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 6.94e-02 -0.204 0.112 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -664909 sc-eQTL 9.11e-01 0.0166 0.147 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 2.06e-01 0.117 0.092 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 5.05e-01 -0.096 0.144 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 9.04e-01 0.0121 0.101 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0135 0.0769 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0571 0.0941 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -664932 sc-eQTL 4.92e-01 0.094 0.137 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0564 0.085 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -664909 sc-eQTL 3.33e-01 0.146 0.151 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 9.29e-01 0.0113 0.126 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -745870 sc-eQTL 7.98e-01 0.0334 0.13 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0523 0.0912 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 sc-eQTL 7.93e-01 0.0298 0.113 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -79780 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0219 0.0955 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 160425 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0576 0.083 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -960622 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0438 0.109 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 159406 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0412 0.116 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 808190 eQTL 0.151 -0.0334 0.0232 0.0037 0.0 0.0986
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 eQTL 0.0289 -0.0723 0.033 0.0 0.0 0.0986
ENSG00000237499 AL357060.1 159406 eQTL 0.0251 -0.048 0.0214 0.00168 0.0 0.0986

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -375892 1.01e-06 6.97e-07 1.59e-07 4.39e-07 1.07e-07 3.11e-07 6.09e-07 2.07e-07 6.62e-07 3.1e-07 9.92e-07 5.15e-07 9.97e-07 1.56e-07 3.27e-07 3.57e-07 5.41e-07 4.25e-07 2.92e-07 2.27e-07 2.39e-07 5.18e-07 4.4e-07 2.92e-07 1.14e-06 2.64e-07 4.37e-07 3.89e-07 5.9e-07 7.63e-07 3.77e-07 3.28e-08 1.04e-07 2.08e-07 3.46e-07 2.59e-07 1.44e-07 1.21e-07 8.26e-08 1.79e-08 1.44e-07 7.54e-07 5.03e-08 5.77e-09 1.89e-07 3.54e-08 1.37e-07 5.73e-08 5.32e-08