logo

Genes within 1Mb (chr6:138027609:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0836 0.117 0.096 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0266 0.114 0.096 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 3.43e-02 -0.189 0.0885 0.096 B L1
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 8.12e-01 0.0212 0.0893 0.096 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0279 0.0719 0.096 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 2.79e-01 -0.109 0.1 0.096 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 6.12e-01 0.0574 0.113 0.096 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00874 0.13 0.096 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 2.07e-01 0.0962 0.076 0.096 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 4.93e-01 0.0601 0.0874 0.096 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 2.30e-01 -0.099 0.0822 0.096 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 1.17e-01 -0.121 0.0769 0.096 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 1.68e-01 -0.118 0.0851 0.096 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 9.43e-01 0.00698 0.0973 0.096 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0877 0.143 0.096 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 4.22e-01 0.0702 0.0873 0.096 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 5.65e-01 0.0539 0.0935 0.096 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 7.68e-01 0.0281 0.0953 0.096 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 8.94e-01 0.00978 0.0736 0.096 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0575 0.0961 0.096 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 7.64e-01 0.0324 0.108 0.096 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00695 0.142 0.092 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 2.33e-01 0.126 0.105 0.092 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 5.89e-01 -0.054 0.0998 0.092 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 1.28e-01 -0.171 0.112 0.092 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -664962 sc-eQTL 2.32e-01 0.156 0.13 0.092 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 1.16e-01 -0.181 0.114 0.092 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -664939 sc-eQTL 3.52e-01 0.127 0.136 0.092 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 8.77e-01 0.0178 0.115 0.092 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 8.07e-01 -0.026 0.106 0.096 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 9.87e-01 0.00143 0.0904 0.096 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 9.77e-01 0.00215 0.0734 0.096 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 3.86e-01 0.0666 0.0766 0.096 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -664962 sc-eQTL 5.55e-01 0.082 0.139 0.096 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 2.32e-01 -0.097 0.0809 0.096 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -664939 sc-eQTL 4.61e-01 0.106 0.144 0.096 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 2.23e-01 0.116 0.0947 0.096 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 4.90e-01 0.0875 0.127 0.094 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0114 0.0975 0.094 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0112 0.112 0.094 NK L1
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0075 0.0948 0.094 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0706 0.081 0.094 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 5.90e-01 0.0563 0.104 0.094 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0724 0.115 0.094 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 4.60e-01 -0.112 0.152 0.096 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 8.76e-01 0.0144 0.0924 0.096 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0653 0.0979 0.096 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 2.82e-01 0.13 0.121 0.096 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 6.03e-01 0.0299 0.0575 0.096 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 1.12e-01 0.187 0.117 0.096 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0824 0.114 0.096 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 4.46e-01 0.135 0.176 0.094 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 8.00e-01 -0.04 0.158 0.094 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0318 0.155 0.094 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 4.39e-01 0.0624 0.0803 0.094 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 4.72e-02 -0.308 0.154 0.094 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 7.03e-01 0.0672 0.176 0.094 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 9.23e-01 0.0132 0.136 0.094 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 8.25e-01 0.0325 0.147 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 6.87e-01 0.0547 0.136 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 9.49e-01 0.0065 0.102 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 1.54e-01 0.184 0.129 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0559 0.101 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 3.99e-01 -0.116 0.137 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 7.20e-01 0.0516 0.144 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 2.66e-02 0.326 0.146 0.097 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 3.51e-01 0.136 0.146 0.097 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 3.09e-01 -0.113 0.111 0.097 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0952 0.139 0.097 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 1.56e-01 -0.135 0.095 0.097 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 9.67e-01 0.00581 0.139 0.097 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 4.16e-01 -0.116 0.142 0.097 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 1.83e-01 -0.185 0.138 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0637 0.115 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0978 0.0974 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0316 0.132 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0766 0.0766 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000738 0.112 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 5.72e-01 0.0679 0.12 0.096 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 9.52e-01 0.00831 0.139 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 3.63e-01 -0.131 0.143 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 2.54e-01 -0.109 0.0949 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0219 0.114 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 3.62e-01 -0.104 0.114 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 2.51e-01 -0.144 0.125 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 9.79e-01 0.00388 0.148 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 8.43e-01 0.0275 0.139 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0166 0.13 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 7.62e-01 0.0365 0.12 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 7.05e-01 0.0555 0.147 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0399 0.0855 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 1.50e-01 0.196 0.136 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00929 0.133 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0454 0.138 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 1.41e-01 0.107 0.0726 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00324 0.0861 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 5.37e-01 0.0703 0.114 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0669 0.0796 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0639 0.0951 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 7.74e-01 0.0297 0.103 0.096 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 7.46e-01 -0.044 0.136 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0344 0.102 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 1.53e-01 0.144 0.1 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0793 0.126 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0829 0.0733 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0182 0.103 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 8.64e-01 0.0177 0.103 0.096 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 6.04e-01 0.0787 0.152 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 3.29e-02 0.244 0.114 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 8.09e-01 0.0251 0.103 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0292 0.12 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 7.73e-02 -0.134 0.0757 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00101 0.129 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0113 0.122 0.096 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 3.89e-01 -0.133 0.154 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0364 0.104 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 9.70e-01 0.00421 0.11 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0655 0.138 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 1.81e-01 0.117 0.0872 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0329 0.12 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 6.31e-01 0.0591 0.123 0.096 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 6.70e-01 0.0628 0.147 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 3.86e-01 0.0889 0.102 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 4.33e-01 0.0738 0.0939 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 5.82e-01 0.0623 0.113 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0984 0.08 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 6.00e-01 0.0598 0.114 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 4.00e-01 0.0999 0.118 0.096 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 2.69e-01 -0.179 0.162 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 4.39e-01 -0.104 0.134 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 6.26e-01 0.0555 0.114 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 4.20e-01 0.121 0.15 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0403 0.0725 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 2.71e-03 -0.366 0.12 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 2.86e-01 0.142 0.132 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 4.60e-01 0.11 0.149 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 7.67e-01 0.0383 0.129 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 1.62e-01 -0.189 0.135 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 8.40e-01 0.0312 0.154 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 2.80e-01 0.103 0.0949 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 9.86e-01 0.00256 0.145 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0611 0.141 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0402 0.165 0.095 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 7.99e-01 0.0272 0.107 0.095 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0614 0.114 0.095 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 6.33e-01 0.0721 0.151 0.095 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 9.45e-01 0.00498 0.0719 0.095 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 1.59e-01 0.189 0.134 0.095 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0769 0.133 0.095 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 7.65e-02 0.257 0.145 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 3.18e-01 0.114 0.113 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 3.78e-01 -0.11 0.124 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 3.62e-01 -0.121 0.133 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0206 0.0847 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 5.11e-02 0.24 0.122 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0897 0.135 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0827 0.137 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0821 0.0899 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 2.94e-01 -0.128 0.121 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00965 0.109 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0913 0.0846 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0132 0.112 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 8.88e-02 -0.216 0.126 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 9.58e-01 0.00826 0.156 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0183 0.115 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0324 0.133 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00663 0.118 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0616 0.0907 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 6.84e-01 0.0586 0.144 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0188 0.146 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 5.44e-01 0.085 0.14 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 7.99e-01 0.024 0.0943 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 1.42e-01 0.177 0.12 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 4.34e-01 0.0879 0.112 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0879 0.0839 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0966 0.124 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 4.96e-01 0.0863 0.127 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0619 0.161 0.107 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 6.64e-01 0.0742 0.17 0.107 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 5.13e-01 0.0939 0.143 0.107 PB L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0502 0.109 0.107 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0927 0.132 0.107 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0231 0.156 0.107 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0896 0.159 0.107 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0243 0.156 0.096 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 2.29e-01 0.143 0.118 0.096 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 3.85e-01 0.108 0.124 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 1.43e-01 0.168 0.114 0.096 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 4.68e-01 0.0526 0.0723 0.096 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 4.53e-01 -0.108 0.144 0.096 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 8.77e-01 0.0218 0.141 0.096 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 3.66e-01 0.133 0.147 0.096 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 1.08e-01 0.222 0.137 0.096 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00951 0.1 0.096 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 1.94e-01 -0.205 0.157 0.096 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0239 0.0879 0.096 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0111 0.126 0.096 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 8.03e-01 0.0335 0.134 0.096 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 7.19e-01 0.0522 0.145 0.09 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0321 0.118 0.09 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0428 0.104 0.09 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 2.42e-01 -0.136 0.116 0.09 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664962 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0995 0.134 0.09 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 2.33e-02 -0.35 0.153 0.09 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664939 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0547 0.149 0.09 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00133 0.151 0.09 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0627 0.115 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00505 0.0838 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 7.16e-01 -0.03 0.0825 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 4.67e-01 0.0656 0.0901 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664962 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0866 0.138 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 8.18e-03 -0.324 0.121 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664939 sc-eQTL 6.40e-01 0.0678 0.145 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 1.22e-01 0.149 0.0957 0.096 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 3.57e-01 0.122 0.132 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 6.26e-01 0.0474 0.0972 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00952 0.0906 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 1.39e-01 0.128 0.086 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664962 sc-eQTL 3.67e-01 0.128 0.142 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0459 0.134 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664939 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0302 0.155 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 7.06e-01 0.0469 0.124 0.096 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 7.49e-01 0.058 0.181 0.091 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 3.63e-01 0.132 0.144 0.091 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0847 0.172 0.091 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0653 0.16 0.091 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0959 0.0887 0.091 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0708 0.178 0.091 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 1.46e-01 0.234 0.16 0.091 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 5.25e-01 0.0973 0.153 0.096 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 3.19e-01 0.103 0.103 0.096 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00228 0.103 0.096 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 5.24e-01 0.0567 0.0888 0.096 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664962 sc-eQTL 7.40e-01 0.046 0.138 0.096 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 5.46e-02 -0.274 0.142 0.096 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664939 sc-eQTL 9.75e-01 0.00483 0.155 0.096 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00321 0.133 0.096 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 7.90e-01 0.04 0.15 0.09 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 7.83e-01 0.0353 0.128 0.09 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0365 0.0895 0.09 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 2.89e-01 0.12 0.113 0.09 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664962 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0464 0.144 0.09 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00587 0.109 0.09 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664939 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000154 0.16 0.09 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0592 0.141 0.09 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 2.32e-01 0.19 0.158 0.096 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 2.46e-01 0.157 0.134 0.096 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 3.36e-01 0.119 0.123 0.096 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 2.74e-01 -0.137 0.125 0.096 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -664962 sc-eQTL 1.08e-01 0.198 0.122 0.096 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 7.76e-01 0.0355 0.125 0.096 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -664939 sc-eQTL 7.20e-03 0.329 0.121 0.096 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 5.02e-01 0.0853 0.127 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 3.92e-01 0.122 0.142 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 4.44e-01 0.0932 0.121 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0924 0.0984 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 7.14e-01 0.0477 0.13 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0913 0.0856 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0858 0.131 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0848 0.145 0.096 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 3.26e-01 -0.127 0.129 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0648 0.121 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 2.03e-01 -0.114 0.0896 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0461 0.132 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0343 0.0694 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0482 0.103 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 4.51e-01 0.0933 0.123 0.096 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00735 0.106 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 9.87e-01 0.00136 0.0842 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0193 0.0788 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 2.65e-01 0.0867 0.0777 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -664962 sc-eQTL 7.78e-01 0.0391 0.139 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 8.85e-02 -0.194 0.113 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -664939 sc-eQTL 9.62e-01 0.00719 0.149 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 2.08e-01 0.118 0.093 0.096 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0883 0.146 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 8.14e-01 -0.024 0.102 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 9.95e-01 0.000444 0.0779 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0593 0.0952 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -664962 sc-eQTL 5.73e-01 0.078 0.138 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0403 0.0861 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -664939 sc-eQTL 2.99e-01 0.159 0.153 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00135 0.128 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -745900 sc-eQTL 8.31e-01 0.0281 0.132 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0569 0.092 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 sc-eQTL 9.40e-01 0.00859 0.114 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -79810 sc-eQTL 9.94e-01 0.000738 0.0963 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 160395 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0669 0.0838 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -960652 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0319 0.11 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 159376 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0567 0.117 0.095 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 808160 eQTL 0.151 -0.0334 0.0232 0.0037 0.0 0.0986
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 eQTL 0.0289 -0.0723 0.033 0.0 0.0 0.0986
ENSG00000237499 AL357060.1 159376 eQTL 0.0251 -0.048 0.0214 0.00168 0.0 0.0986

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -375922 1.26e-06 8.34e-07 3.03e-07 4.36e-07 1.81e-07 3.22e-07 7e-07 2.98e-07 8.46e-07 2.67e-07 1.07e-06 5.69e-07 1.15e-06 2.06e-07 4.01e-07 4.96e-07 7.79e-07 5.12e-07 3.98e-07 3.42e-07 2.86e-07 6.91e-07 5.77e-07 4.22e-07 1.35e-06 2.54e-07 5.43e-07 4.11e-07 7e-07 8.63e-07 4.32e-07 3.77e-08 1.32e-07 2.74e-07 3.46e-07 2.91e-07 2.46e-07 1.41e-07 1.23e-07 1.84e-08 1.91e-07 7.45e-07 5.54e-08 5.77e-09 1.82e-07 4.38e-08 1.71e-07 8.49e-08 9.13e-08