logo

Genes within 1Mb (chr6:138025448:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0737 0.113 0.1 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0115 0.11 0.1 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 4.03e-02 -0.176 0.0855 0.1 B L1
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 7.99e-01 0.0219 0.0862 0.1 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0321 0.0694 0.1 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0758 0.0971 0.1 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 7.93e-01 0.0287 0.109 0.1 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 9.35e-01 0.0102 0.126 0.1 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 2.95e-01 0.0771 0.0734 0.1 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 4.30e-01 0.0666 0.0842 0.1 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0754 0.0794 0.1 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 1.61e-01 -0.104 0.0742 0.1 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 1.02e-01 -0.135 0.0819 0.1 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00388 0.0938 0.1 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0679 0.138 0.1 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 6.17e-01 0.0422 0.0842 0.1 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 5.45e-01 0.0546 0.0901 0.1 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 6.65e-01 0.0399 0.0918 0.1 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 7.93e-01 0.0186 0.0709 0.1 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0654 0.0926 0.1 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 7.48e-01 0.0336 0.104 0.1 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 9.94e-01 0.00109 0.137 0.097 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 3.51e-01 0.0945 0.101 0.097 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0771 0.0959 0.097 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 1.50e-01 -0.156 0.108 0.097 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -667123 sc-eQTL 1.86e-01 0.166 0.125 0.097 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 6.43e-02 -0.204 0.11 0.097 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -667100 sc-eQTL 2.14e-01 0.163 0.13 0.097 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 6.30e-01 0.0533 0.11 0.097 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0287 0.102 0.1 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 8.53e-01 0.0162 0.087 0.1 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000268 0.0706 0.1 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 4.69e-01 0.0535 0.0738 0.1 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -667123 sc-eQTL 6.68e-01 0.0572 0.133 0.1 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0864 0.0779 0.1 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -667100 sc-eQTL 4.07e-01 0.115 0.139 0.1 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 2.68e-01 0.101 0.0912 0.1 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 5.56e-01 0.072 0.122 0.099 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0135 0.0939 0.099 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 7.39e-01 0.0359 0.108 0.099 NK L1
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0258 0.0913 0.099 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 4.21e-01 -0.063 0.078 0.099 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 5.56e-01 0.0592 0.1 0.099 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 6.33e-01 -0.053 0.111 0.099 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 3.87e-01 -0.127 0.146 0.1 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 9.08e-01 0.0103 0.0892 0.1 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0576 0.0945 0.1 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 2.04e-01 0.148 0.116 0.1 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 4.30e-01 0.0439 0.0554 0.1 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 2.16e-01 0.141 0.114 0.1 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0642 0.11 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 8.48e-01 0.0327 0.17 0.099 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 4.48e-01 -0.115 0.152 0.099 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 4.31e-01 -0.117 0.149 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 5.49e-01 0.0464 0.0772 0.099 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 1.07e-01 -0.241 0.149 0.099 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 9.32e-01 0.0145 0.169 0.099 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0101 0.131 0.099 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 5.20e-01 0.0909 0.141 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 6.26e-01 0.0636 0.13 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 7.40e-01 0.0324 0.0976 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 2.22e-01 0.152 0.124 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0533 0.0975 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0983 0.132 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 9.33e-01 0.0116 0.138 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 4.42e-02 0.286 0.141 0.101 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 4.35e-01 0.11 0.14 0.101 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 2.42e-01 -0.125 0.107 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0947 0.134 0.101 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 2.19e-01 -0.113 0.0917 0.101 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 5.43e-01 0.0812 0.133 0.101 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 4.88e-01 -0.095 0.137 0.101 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 2.04e-01 -0.17 0.133 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0557 0.11 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0871 0.0938 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0254 0.127 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 2.79e-01 -0.08 0.0737 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 9.56e-01 0.006 0.108 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 6.38e-01 0.0545 0.116 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 9.57e-01 0.00728 0.134 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 4.21e-01 -0.111 0.138 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0893 0.0912 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00919 0.11 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 3.62e-01 -0.1 0.11 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 2.40e-01 -0.141 0.12 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0272 0.142 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 7.08e-01 0.0502 0.134 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0485 0.125 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 6.09e-01 0.0592 0.116 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 5.65e-01 0.0812 0.141 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0335 0.0822 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 2.29e-01 0.158 0.131 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 9.95e-01 0.000814 0.128 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0298 0.133 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 2.02e-01 0.0897 0.0701 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 8.55e-01 0.0152 0.083 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 4.89e-01 0.0758 0.109 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0531 0.0768 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0784 0.0916 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 8.72e-01 0.0161 0.0996 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0257 0.131 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0527 0.0982 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 1.91e-01 0.127 0.0968 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0744 0.122 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0751 0.0706 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0403 0.099 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 9.09e-01 0.0114 0.0992 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 7.77e-01 0.0415 0.146 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 4.84e-02 0.217 0.109 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 8.13e-01 0.0235 0.0994 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0281 0.116 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 1.06e-01 -0.118 0.073 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0324 0.124 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0501 0.118 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 4.49e-01 -0.113 0.149 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0475 0.1 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 9.16e-01 0.0112 0.106 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0529 0.133 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 1.99e-01 0.108 0.0841 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0464 0.116 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 7.46e-01 0.0385 0.119 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 5.80e-01 0.0786 0.142 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 5.32e-01 0.0619 0.0988 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 4.70e-01 0.0655 0.0905 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 5.06e-01 0.0725 0.109 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0886 0.0771 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 7.43e-01 0.036 0.11 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 3.97e-01 0.0969 0.114 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 2.54e-01 -0.177 0.155 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 3.88e-01 -0.111 0.128 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 6.24e-01 0.0536 0.109 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 2.18e-01 0.178 0.144 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0462 0.0695 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 1.74e-03 -0.366 0.115 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 2.51e-01 0.146 0.127 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 4.08e-01 0.118 0.143 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 9.59e-01 0.00639 0.124 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 2.43e-01 -0.152 0.13 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00457 0.148 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 1.99e-01 0.117 0.091 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 9.08e-01 0.0161 0.139 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0107 0.136 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 6.77e-01 -0.066 0.158 0.1 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 7.13e-01 0.0378 0.103 0.1 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0536 0.11 0.1 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 5.07e-01 0.0964 0.145 0.1 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 6.81e-01 0.0284 0.069 0.1 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 1.79e-01 0.174 0.129 0.1 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0423 0.128 0.1 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 8.03e-02 0.244 0.139 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 3.72e-01 0.0975 0.109 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0561 0.119 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 3.16e-01 -0.128 0.127 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00532 0.0813 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 3.17e-02 0.253 0.117 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0771 0.13 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 3.78e-01 -0.116 0.132 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0895 0.0865 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0728 0.117 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 8.86e-01 -0.015 0.105 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0815 0.0815 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 9.08e-01 0.0125 0.108 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 1.57e-01 -0.173 0.122 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 9.16e-01 0.0158 0.15 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 9.77e-01 0.00316 0.11 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 8.42e-01 0.0256 0.128 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00983 0.114 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0671 0.0872 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 7.41e-01 0.0459 0.138 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0425 0.141 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 5.72e-01 0.0761 0.134 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 8.76e-01 0.0141 0.0907 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 5.49e-02 0.222 0.115 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 3.97e-01 0.0916 0.108 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0848 0.0807 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 2.88e-01 -0.127 0.119 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 4.25e-01 0.0974 0.122 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0384 0.157 0.111 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 6.51e-01 0.0752 0.166 0.111 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 5.59e-01 0.0817 0.139 0.111 PB L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0484 0.106 0.111 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0313 0.129 0.111 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 9.89e-01 0.00218 0.152 0.111 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0284 0.155 0.111 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00356 0.15 0.1 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 2.60e-01 0.129 0.114 0.1 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 3.10e-01 0.121 0.119 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 2.17e-01 0.136 0.11 0.1 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 4.40e-01 0.0537 0.0695 0.1 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 3.62e-01 -0.127 0.139 0.1 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 5.43e-01 0.0823 0.135 0.1 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 2.90e-01 0.149 0.141 0.1 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 9.57e-02 0.221 0.132 0.1 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 9.70e-01 0.00368 0.0964 0.1 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 2.54e-01 -0.173 0.151 0.1 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0258 0.0845 0.1 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 9.98e-01 0.000368 0.121 0.1 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 7.40e-01 0.0427 0.129 0.1 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 6.44e-01 0.0645 0.14 0.093 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0353 0.114 0.093 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0555 0.1 0.093 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 1.75e-01 -0.152 0.112 0.093 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -667123 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0466 0.13 0.093 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 2.11e-02 -0.343 0.148 0.093 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -667100 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0221 0.143 0.093 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 9.34e-01 0.0121 0.146 0.093 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0518 0.11 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 9.51e-01 0.00496 0.0806 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 6.69e-01 -0.034 0.0794 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 4.03e-01 0.0726 0.0866 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -667123 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0862 0.133 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 1.59e-02 -0.285 0.117 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -667100 sc-eQTL 5.77e-01 0.0777 0.139 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 1.06e-01 0.15 0.092 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 5.38e-01 0.0785 0.127 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 6.10e-01 0.0478 0.0936 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 9.53e-01 0.00518 0.0872 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 1.88e-01 0.11 0.0829 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -667123 sc-eQTL 4.74e-01 0.0978 0.136 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0448 0.129 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -667100 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00137 0.15 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 9.73e-01 0.00407 0.12 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 7.47e-01 0.0553 0.171 0.097 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 5.76e-01 0.0766 0.137 0.097 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0394 0.163 0.097 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00956 0.151 0.097 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0791 0.0839 0.097 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 5.52e-01 -0.1 0.168 0.097 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 1.64e-01 0.212 0.151 0.097 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 3.26e-01 0.144 0.146 0.1 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 1.48e-01 0.143 0.0983 0.1 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00984 0.0985 0.1 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 7.04e-01 0.0325 0.0853 0.1 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -667123 sc-eQTL 7.69e-01 0.039 0.133 0.1 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 8.06e-02 -0.239 0.136 0.1 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -667100 sc-eQTL 8.99e-01 0.0189 0.149 0.1 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00205 0.127 0.1 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00351 0.144 0.095 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 7.16e-01 0.0446 0.122 0.095 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0576 0.0855 0.095 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 4.44e-01 0.0828 0.108 0.095 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -667123 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0199 0.138 0.095 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0279 0.104 0.095 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -667100 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0438 0.153 0.095 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0759 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 2.83e-01 0.164 0.153 0.099 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 3.82e-01 0.114 0.13 0.099 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 2.84e-01 0.127 0.119 0.099 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0993 0.12 0.099 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -667123 sc-eQTL 1.38e-01 0.175 0.118 0.099 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 8.17e-01 0.0278 0.12 0.099 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -667100 sc-eQTL 1.28e-02 0.294 0.117 0.099 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 5.24e-01 0.078 0.122 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 2.97e-01 0.143 0.137 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 4.58e-01 0.0871 0.117 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0904 0.095 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 7.99e-01 0.0319 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0796 0.0826 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0327 0.127 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 4.75e-01 -0.1 0.14 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 3.48e-01 -0.117 0.125 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0448 0.117 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 2.42e-01 -0.101 0.0864 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0273 0.127 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0388 0.0669 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 7.26e-01 -0.035 0.0996 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 5.51e-01 0.0711 0.119 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0143 0.102 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 9.26e-01 0.00756 0.0811 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0157 0.0759 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 2.93e-01 0.0788 0.0748 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -667123 sc-eQTL 9.06e-01 0.0158 0.134 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 1.10e-01 -0.175 0.109 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -667100 sc-eQTL 8.60e-01 0.0252 0.143 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 2.35e-01 0.107 0.0896 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0849 0.14 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 8.69e-01 0.0162 0.0979 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0123 0.0747 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0743 0.0913 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -667123 sc-eQTL 5.41e-01 0.0814 0.133 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0404 0.0827 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -667100 sc-eQTL 3.87e-01 0.127 0.147 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0132 0.123 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -748061 sc-eQTL 9.07e-01 0.0149 0.127 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0599 0.0886 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 sc-eQTL 6.35e-01 0.0523 0.11 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -81971 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00663 0.0928 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 158234 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0624 0.0807 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -962813 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0393 0.106 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 157215 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0384 0.113 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 805999 eQTL 0.205 -0.0294 0.0232 0.00342 0.0 0.0996
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 eQTL 0.0425 -0.0669 0.033 0.0 0.0 0.0996
ENSG00000237499 AL357060.1 157215 eQTL 0.0175 -0.0508 0.0214 0.00203 0.0 0.0996

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -378083 7.76e-07 3.35e-07 7e-08 3.58e-07 1.05e-07 1.5e-07 4.05e-07 6.75e-08 2.35e-07 1.37e-07 3.47e-07 1.91e-07 5.39e-07 8.85e-08 1.01e-07 1.14e-07 8.64e-08 2.75e-07 9.69e-08 7.54e-08 1.34e-07 2.3e-07 2.56e-07 7.36e-08 4.67e-07 1.82e-07 1.57e-07 1.61e-07 2.03e-07 2.89e-07 1.76e-07 3.68e-08 4.34e-08 1.02e-07 2.32e-07 3.57e-08 6.57e-08 7.68e-08 5.25e-08 8.61e-08 2.81e-08 3.26e-07 3.65e-08 1.57e-08 4.36e-08 1.03e-08 8.93e-08 2.13e-09 4.67e-08