logo

Genes within 1Mb (chr6:138024389:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 9.12e-01 0.0114 0.103 0.154 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 2.71e-02 0.221 0.0991 0.154 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 5.42e-01 -0.048 0.0786 0.154 B L1
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0196 0.0785 0.154 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0467 0.0632 0.154 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0385 0.0886 0.154 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0094 0.0996 0.154 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0351 0.112 0.154 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00605 0.0658 0.154 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0554 0.0753 0.154 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0745 0.0709 0.154 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0366 0.0666 0.154 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 4.33e-01 0.0578 0.0736 0.154 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 9.09e-02 -0.141 0.0833 0.154 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 2.55e-01 -0.137 0.12 0.154 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 4.36e-01 0.0571 0.0733 0.154 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0299 0.0785 0.154 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 7.05e-01 0.0303 0.08 0.154 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0714 0.0616 0.154 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0915 0.0805 0.154 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 1.43e-02 -0.221 0.0894 0.154 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0364 0.123 0.155 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 7.25e-01 0.0322 0.0915 0.155 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 8.78e-01 0.0133 0.0867 0.155 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 2.33e-01 0.116 0.0974 0.155 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -668182 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0231 0.113 0.155 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 6.70e-03 0.269 0.0982 0.155 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -668159 sc-eQTL 8.36e-01 0.0244 0.118 0.155 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 2.72e-01 0.109 0.0993 0.155 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 9.04e-01 0.0107 0.0889 0.154 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0264 0.0758 0.154 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0638 0.0613 0.154 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 6.30e-01 -0.031 0.0643 0.154 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -668182 sc-eQTL 1.46e-01 -0.169 0.116 0.154 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0596 0.0679 0.154 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -668159 sc-eQTL 3.25e-01 -0.119 0.121 0.154 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0969 0.0794 0.154 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00733 0.109 0.155 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 2.10e-01 -0.105 0.0832 0.155 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0999 0.0955 0.155 NK L1
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 9.67e-01 0.00337 0.0812 0.155 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0643 0.0694 0.155 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0305 0.0894 0.155 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 2.52e-02 -0.22 0.0974 0.155 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 3.96e-01 0.11 0.129 0.154 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 6.30e-01 -0.038 0.0787 0.154 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0116 0.0834 0.154 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 1.55e-01 -0.146 0.102 0.154 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 3.47e-01 -0.046 0.0489 0.154 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0472 0.101 0.154 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 9.33e-02 -0.163 0.0966 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0837 0.147 0.153 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 8.59e-01 0.0233 0.131 0.153 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 2.79e-01 -0.139 0.128 0.153 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0439 0.0668 0.153 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 2.94e-01 0.136 0.129 0.153 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 9.08e-01 -0.017 0.146 0.153 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 2.64e-01 0.126 0.113 0.153 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 4.20e-01 -0.104 0.129 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 3.77e-02 0.247 0.118 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0804 0.0892 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 8.29e-01 0.0246 0.114 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 7.04e-01 0.0339 0.0892 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0796 0.12 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 7.67e-01 0.0375 0.127 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0622 0.13 0.149 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 9.86e-01 0.0023 0.129 0.149 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 9.66e-01 0.00421 0.0982 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 5.11e-01 0.0805 0.122 0.149 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0155 0.0842 0.149 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 7.65e-01 0.0367 0.122 0.149 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 4.31e-01 0.0989 0.125 0.149 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 7.01e-01 0.0481 0.125 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 7.43e-02 0.184 0.102 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0751 0.0877 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 3.55e-01 -0.11 0.119 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 7.62e-01 0.021 0.0691 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 6.75e-02 -0.184 0.1 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 6.32e-01 0.0518 0.108 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 9.99e-01 0.000202 0.122 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 6.49e-01 0.0572 0.125 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 2.29e-01 0.0999 0.0829 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 9.73e-01 0.00344 0.0999 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0992 0.0996 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 4.15e-01 0.089 0.109 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0469 0.129 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0593 0.122 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 7.17e-01 0.0414 0.114 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 1.58e-01 -0.148 0.105 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0332 0.128 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0126 0.0749 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 6.20e-01 0.0593 0.119 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 7.61e-03 -0.309 0.114 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 7.32e-01 0.0403 0.117 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00439 0.0621 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0488 0.0731 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 1.31e-01 -0.146 0.0962 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0457 0.0678 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 8.78e-01 0.0124 0.0809 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 2.10e-01 -0.11 0.0875 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 9.36e-02 -0.195 0.116 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0346 0.0876 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0465 0.0866 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 2.98e-01 -0.113 0.108 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0375 0.0631 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0662 0.0882 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 6.76e-02 -0.161 0.0877 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 5.16e-02 -0.257 0.131 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 9.23e-01 0.00968 0.1 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 2.05e-01 0.114 0.0898 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 5.27e-01 0.0663 0.105 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 6.86e-02 -0.121 0.066 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0271 0.112 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 8.05e-01 0.0263 0.107 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 5.24e-02 -0.254 0.13 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 7.96e-01 0.0229 0.0885 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 4.49e-01 -0.071 0.0937 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 8.11e-01 0.028 0.117 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0783 0.0743 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 4.82e-01 -0.072 0.102 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 2.83e-02 -0.229 0.103 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 9.14e-01 0.0137 0.127 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 1.76e-01 0.119 0.088 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 4.82e-01 -0.057 0.0809 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 5.09e-02 0.189 0.0965 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0479 0.069 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 2.56e-01 -0.111 0.0977 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 3.81e-03 -0.293 0.1 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0397 0.148 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 5.25e-02 -0.236 0.121 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 6.98e-02 -0.188 0.103 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0274 0.137 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0503 0.0661 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 1.33e-01 -0.169 0.112 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 9.92e-02 -0.199 0.12 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 2.93e-01 -0.132 0.125 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 3.31e-01 -0.106 0.108 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00791 0.114 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0242 0.13 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0693 0.08 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 7.66e-02 -0.216 0.121 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 2.67e-01 -0.132 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 2.71e-01 -0.152 0.138 0.156 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 1.69e-01 -0.123 0.0894 0.156 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 6.09e-01 0.0491 0.0959 0.156 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 3.25e-01 -0.125 0.127 0.156 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0857 0.0601 0.156 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0543 0.113 0.156 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 1.50e-02 -0.27 0.11 0.156 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 5.52e-01 0.0767 0.129 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 4.37e-02 -0.202 0.0995 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0745 0.11 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 9.55e-01 0.0066 0.117 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 5.73e-01 0.0422 0.0748 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 3.19e-01 -0.109 0.109 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 1.49e-01 -0.172 0.119 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 4.96e-01 0.0805 0.118 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 7.09e-01 -0.029 0.0776 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 8.12e-01 -0.025 0.105 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 8.01e-01 0.0237 0.094 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0538 0.073 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 9.88e-01 0.00147 0.0963 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 1.39e-01 -0.162 0.109 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0425 0.138 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0921 0.101 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0291 0.117 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 3.89e-01 0.09 0.104 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 8.09e-02 -0.14 0.0797 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 4.36e-02 0.256 0.126 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 2.19e-01 -0.159 0.129 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 9.70e-01 0.00468 0.124 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0997 0.0833 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0939 0.107 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0463 0.0995 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0535 0.0745 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0682 0.11 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 1.70e-01 -0.154 0.112 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0739 0.144 0.159 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 4.76e-02 0.299 0.149 0.159 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 3.90e-01 -0.11 0.127 0.159 PB L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0954 0.0969 0.159 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0655 0.118 0.159 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 7.93e-01 0.0366 0.139 0.159 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 8.30e-01 0.0305 0.142 0.159 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 5.79e-01 0.0731 0.132 0.152 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 7.19e-01 0.0362 0.1 0.152 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0155 0.105 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 1.72e-01 -0.132 0.0965 0.152 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0721 0.0609 0.152 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 8.60e-01 0.0216 0.122 0.152 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 3.12e-01 0.12 0.118 0.152 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0557 0.128 0.154 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 3.88e-01 -0.104 0.12 0.154 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0858 0.0871 0.154 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 6.29e-01 0.0665 0.137 0.154 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0794 0.0763 0.154 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 3.50e-01 0.103 0.11 0.154 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0376 0.117 0.154 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00289 0.127 0.154 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 6.72e-01 0.0437 0.103 0.154 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0276 0.0907 0.154 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 5.88e-01 0.0551 0.102 0.154 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -668182 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0977 0.118 0.154 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 1.31e-02 0.334 0.133 0.154 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -668159 sc-eQTL 6.99e-01 0.0503 0.13 0.154 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 8.38e-01 0.0272 0.132 0.154 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0407 0.097 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 6.83e-01 0.0289 0.0707 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0903 0.0694 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0235 0.0761 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -668182 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0928 0.117 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 3.80e-01 0.0916 0.104 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -668159 sc-eQTL 5.87e-01 0.0665 0.122 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 1.05e-01 -0.132 0.0808 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0213 0.112 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 3.17e-01 0.0819 0.0817 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0609 0.0762 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00315 0.0728 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -668182 sc-eQTL 3.54e-01 -0.111 0.119 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 7.23e-01 -0.04 0.113 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -668159 sc-eQTL 1.63e-01 -0.182 0.13 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 5.60e-01 -0.061 0.104 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 7.78e-01 0.0438 0.155 0.142 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0634 0.124 0.142 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 4.32e-01 0.116 0.147 0.142 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 6.35e-02 -0.254 0.136 0.142 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 9.17e-01 0.00796 0.0763 0.142 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 2.49e-01 -0.175 0.152 0.142 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 6.95e-03 -0.369 0.135 0.142 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 2.92e-01 0.137 0.13 0.151 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 4.88e-01 0.0609 0.0876 0.151 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0814 0.0873 0.151 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 7.81e-01 0.0211 0.0757 0.151 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -668182 sc-eQTL 8.70e-01 0.0193 0.118 0.151 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0786 0.122 0.151 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -668159 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0388 0.132 0.151 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00434 0.113 0.151 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 8.70e-01 0.0199 0.121 0.154 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0857 0.103 0.154 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 6.29e-01 0.035 0.0723 0.154 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 8.69e-02 0.156 0.0907 0.154 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -668182 sc-eQTL 9.23e-01 0.0113 0.116 0.154 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 5.76e-02 -0.166 0.087 0.154 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -668159 sc-eQTL 3.35e-01 -0.125 0.129 0.154 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 2.76e-01 0.124 0.114 0.154 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 2.09e-01 -0.18 0.142 0.153 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 2.83e-01 -0.13 0.121 0.153 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 1.48e-01 -0.161 0.111 0.153 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 4.47e-01 0.0857 0.112 0.153 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -668182 sc-eQTL 7.59e-02 0.196 0.11 0.153 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 3.06e-01 0.115 0.112 0.153 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -668159 sc-eQTL 7.59e-01 0.0342 0.111 0.153 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 1.13e-01 0.181 0.113 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 2.82e-01 -0.131 0.122 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 1.20e-01 0.162 0.104 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 5.47e-01 -0.051 0.0845 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 8.49e-01 0.0213 0.111 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0345 0.0736 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 9.22e-01 -0.011 0.113 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 2.91e-01 0.131 0.124 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 9.00e-01 0.0148 0.118 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 2.48e-01 0.127 0.11 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0421 0.0815 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 3.31e-01 -0.116 0.119 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 4.46e-01 -0.048 0.0628 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 3.70e-01 -0.084 0.0935 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0178 0.112 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0432 0.0903 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 4.49e-01 0.0545 0.0719 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0595 0.0672 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0872 0.0663 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -668182 sc-eQTL 8.66e-02 -0.203 0.118 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 6.91e-01 0.0387 0.0974 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -668159 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0476 0.127 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 3.65e-02 -0.166 0.0789 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 4.54e-01 0.0907 0.121 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0479 0.0847 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0094 0.0647 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 1.02e-01 0.129 0.0787 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -668182 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0306 0.115 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 5.90e-02 -0.135 0.071 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -668159 sc-eQTL 1.49e-01 -0.183 0.127 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 2.94e-01 0.111 0.106 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -749120 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0026 0.114 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0481 0.0794 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0698 0.0984 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -83030 sc-eQTL 7.01e-01 0.032 0.0831 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 157175 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0885 0.0721 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -963872 sc-eQTL 9.07e-01 0.0111 0.0947 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 156156 sc-eQTL 5.60e-02 -0.193 0.1 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 804940 eQTL 0.0324 0.0357 0.0167 0.0 0.0 0.191
ENSG00000051620 HEBP2 -379142 eQTL 0.0166 0.0569 0.0237 0.0 0.0 0.191

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135540 \N -668182 3.53e-07 1.7e-07 6.45e-08 2.27e-07 1.07e-07 7.75e-08 2.4e-07 5.84e-08 1.94e-07 1.05e-07 1.86e-07 1.52e-07 2.45e-07 8.15e-08 6.27e-08 9.35e-08 5.27e-08 2.15e-07 7.36e-08 6.03e-08 1.24e-07 1.81e-07 1.75e-07 4.17e-08 2.36e-07 1.56e-07 1.31e-07 1.28e-07 1.34e-07 1.39e-07 1.26e-07 4.4e-08 3.74e-08 9.72e-08 5.16e-08 3.18e-08 3.91e-08 7.49e-08 6.35e-08 6.07e-08 4.92e-08 1.6e-07 3.4e-08 1.1e-08 3.34e-08 6.53e-09 7e-08 2.05e-09 4.67e-08